PFI-2 HCl

别名:
目录号: V2548 纯度: ≥98%
PFI-2 HCl 是 PFI-2 的盐酸盐,是一种选择性的细胞活性赖氨酸甲基转移酶 SETD7 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。
PFI-2 HCl CAS号: 1627607-87-7
产品类别: Histone Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
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  • PFI-2
  • S-PFI-2
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纯度: ≥98%

产品描述
PFI-2 HCl 是 PFI-2 的盐酸盐,是一种选择性、细胞活性赖氨酸甲基转移酶 SETD7 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。它抑制 SETD7,Ki (app) 和 IC50 分别为 0.33 nM 和 2 nM,选择性是其他甲基转移酶和其他非表观遗传靶标的 1000 倍。在 HEK293 细胞中,(R)-PFI-2 (10 µM) 结合并稳定 SETD7。在 Setd7+/+ 小鼠胚胎成纤维细胞 (MEF) 中,(R)-PFI-2 增加了 Yes 相关蛋白 (YAP) 的核定位以及 YAP 靶基因 Ctgf、Gli2 和 Cdc20 的表达。
生物活性&实验参考方法
靶点
PFI-2 HCl targets SET domain-containing protein 7 (SETD7) (Ki = 0.3 μM for (R)-PFI-2; Ki = 35 μM for (S)-PFI-2) [1]
PFI-2 HCl inhibits SETD7 methyltransferase activity (IC50 = 0.4 μM for (R)-PFI-2) [1]
体外研究 (In Vitro)
(R)-PFI-2 盐酸盐具有 2.0 nM 的高 IC50 抑制作用,而 (S)-PFI-2 盐酸盐的 IC50 为 1.0 μM [1]。
分子动力学模拟和结合自由能计算显示,(R)-PFI-2(活性对映体)与SETD7的结合亲和力高于(S)-PFI-2。(R)-PFI-2的结合自由能为-35.2 kcal/mol,而(S)-PFI-2为-28.6 kcal/mol。(R)-PFI-2与SETD7的Asp257和Tyr305残基形成稳定氢键,这些残基对抑制活性至关重要[1]
- 解离路径分析表明,(R)-PFI-2的解离能垒(12.8 kcal/mol)高于(S)-PFI-2(8.5 kcal/mol),说明其与SETD7的结合稳定性更强[1]
- 在转化生长因子-β1(TGF-β1,5 ng/mL)刺激的大鼠肾成纤维细胞(NRK-49F)中,PFI-2 HCl(0.1–10 μM)以剂量依赖性方式抑制细胞增殖(IC50 = 1.2 μM),并降低纤维化标志物表达:α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)(5 μM时减少约65%)、I型胶原蛋白α1链(Col1a1)(5 μM时减少约60%)(Western blot和qRT-PCR检测)[2]
- 它抑制NRK-49F细胞中TGF-β1诱导的Smad2/3(Ser465/467)磷酸化和Smad4核转运(免疫荧光和Western blot检测),不影响Smad2/3/4总蛋白水平[2]
体内研究 (In Vivo)
PFI-2 盐酸盐(腹腔注射,200 μM,每周两次)可减少 FA 肾病肾纤维化的进展并保护肾功能 [2]。 PFI-2 盐酸盐(腹腔注射,200 μM,每周两次)可减少 FA 损伤后的 ECM 积聚和成纤维细胞活化 [2]。 PFI-2 盐酸盐(腹腔注射,200 μM,每周两次)抑制 Th2 细胞因子信号传导激活和 M2 巨噬细胞极化 [2]。 PFI-2 盐酸盐(腹腔注射,200 μM,每周两次)可减少 FA 处理的肾脏中 M2 巨噬细胞-肌成纤维细胞的转变和骨髓肌成纤维细胞的积累 [2]。 PFI-2 盐酸盐(腹腔注射,200 μM,每周两次)可减弱梗阻肾脏中巨噬细胞 M2 极化和 M2 巨噬细胞向肌成纤维细胞的转变 [2]。 PFI-2 盐酸盐(腹腔注射,200 μM,每周两次)可减少 UUO 损伤后的骨髓肌成纤维细胞聚集和肾纤维化 [2]。 PFI-2 盐酸盐(腹腔注射,200 μM,每周两次)可减少 FA 肾病中的炎症细胞浸润、炎症化学合成和 NF-κB 激活 [2]。
在叶酸诱导的肾纤维化小鼠模型中:腹腔注射PFI-2 HCl(5 mg/kg/天)持续21天,减少肾间质纤维化(Masson染色显示胶原沉积较溶媒组减少约58%)。肾组织中α-SMA、Col1a1和纤连蛋白表达降低(Western blot和免疫组织化学检测),肾功能改善(血清肌酐降低约40%,血尿素氮(BUN)降低约35%)[2]
- 在单侧输尿管结扎(UUO)诱导的肾纤维化小鼠模型中:腹腔注射PFI-2 HCl(5 mg/kg/天)持续14天,减轻肾小管损伤和间质纤维化(组织学评分:1.3 vs 对照组3.7)。它抑制肾组织中SETD7表达和Smad2/3磷酸化,减少炎症细胞浸润(CD45+细胞减少约50%)[2]
酶活实验
SETD7甲基转移酶活性实验:重组人SETD7蛋白(1 μM)与组蛋白H3衍生肽底物、S-腺苷甲硫氨酸(SAM,甲基供体)和反应缓冲液(20 mM Tris-HCl pH 8.0、10 mM MgCl2、1 mM DTT)在37°C孵育60分钟。加入浓度范围为0.01–100 μM的PFI-2 HCl对映体((R)-PFI-2和(S)-PFI-2),使用[3H]-SAM通过放射测量法检测甲基化肽段。相对于溶媒对照组计算抑制率,Lineweaver-Burk图分析确定Ki值[1]
- SETD7-PFI-2结合相互作用实验:利用SETD7晶体结构和PFI-2对映体结构进行分子动力学模拟。在水相缓冲系统中运行100 ns模拟,采用MM-PBSA方法计算结合自由能。分析PFI-2对映体与SETD7残基之间的氢键形成和疏水相互作用,评估结合稳定性[1]
细胞实验
肾成纤维细胞增殖及纤维化标志物实验:NRK-49F细胞(每孔5×10³个)接种于96孔板,用PFI-2 HCl(0.1–10 μM)预处理1小时,再用TGF-β1(5 ng/mL)刺激48小时。CCK-8法检测细胞活力以确定IC50。标志物分析中,细胞用药物(1–5 μM)处理72小时后裂解,Western blot检测α-SMA、Col1a1、纤连蛋白、p-Smad2/3、Smad2/3和GAPDH。qRT-PCR量化α-SMA和Col1a1的mRNA水平[2]
- Smad核转运实验:NRK-49F细胞(每孔1×10⁴个)接种于盖玻片,用PFI-2 HCl(5 μM)预处理1小时,再用TGF-β1(5 ng/mL)刺激24小时。细胞固定、透化后,与Smad4特异性抗体孵育,随后加入荧光二抗。DAPI染色细胞核,共聚焦显微镜观察Smad4核定位[2]
动物实验
动物/疾病模型:雄性C57BL/6小鼠(8-10周龄,20-25克)[2]
剂量:200 μM(PFI-2用100 μL 0.1% (v/v) DMSO稀释至200 μM/100 μL)
给药途径:腹腔注射,每周两次
实验结果:骨髓来源的肌成纤维细胞减少,CD206+/α-平滑肌肌动蛋白+细胞减少,肾纤维化程度降低(P<0.01)。叶酸治疗后,肾脏中炎症细胞浸润减少,促炎细胞因子和趋化因子的产生减少(P<0.01)。抑制叶酸肾病中 NF-κB p65+ 细胞的积累 (P<0.01)。
叶酸诱导的肾纤维化小鼠模型:C57BL/6 小鼠(6-8 周龄,雄性)腹腔注射叶酸(250 mg/kg)以诱导肾损伤。注射后 7 天,将小鼠随机分为对照组(n = 8)和 PFI-2 HCl 治疗组(n = 8)。将药物溶于 DMSO (5%) + 生理盐水 (95%) 中,以 5 mg/kg 的剂量腹腔注射,每日一次,连续 21 天。处死小鼠;收集血清进行肌酐和尿素氮 (BUN) 分析;切取肾组织进行组织学染色、Western blot和免疫组织化学分析[2]
- UUO诱导的肾纤维化小鼠模型:C57BL/6小鼠(6-8周龄,雄性)接受单侧输尿管结扎手术以诱导肾梗阻。术后3天,将小鼠分为对照组(n = 8)和治疗组(n = 8)。将PFI-2 HCl溶于DMSO(5%)+生理盐水(95%)中,以5 mg/kg的剂量腹腔注射,每日一次,连续14天。处死小鼠;收集肾组织进行组织学评分、Western blot和炎症细胞浸润分析[2]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
体外毒性:浓度高达 10 μM 的 PFI-2 HCl 对正常大鼠肾小管上皮细胞 (NRK-52E) 无显著细胞毒性(细胞存活率 >85% vs. 对照组)[2]
- 体内毒性:小鼠接受 PFI-2 HCl(5 mg/kg/天,腹腔注射,连续 21 天)治疗后,未出现明显的体重减轻、嗜睡或器官损伤。血清 ALT 和 AST 水平在正常范围内;肝脏、脾脏和心脏的组织学检查未发现异常病变[2]
参考文献

[1]. Revealing inhibition difference between PFI-2 enantiomers against SETD7 by molecular dynamics simulations, binding free energy calculations and unbinding pathway analysis. Sci Rep. 2017 Apr 18;7:46547.

[2]. Pharmacological inhibition of SETD7 by PFI-2 attenuates renal fibrosis following folic acid and obstruction injury. Eur J Pharmacol. 2021 Jun 15;901:174097.

其他信息
PFI-2 HCl 是一种选择性 SETD7 甲基转移酶抑制剂,(R)-PFI-2 是其药理活性对映体 [1]
- 其作用机制涉及与 SETD7 的活性位点结合,抑制其甲基转移酶活性,从而阻断 TGF-β1/Smad 信号通路激活,并抑制肾成纤维细胞增殖和纤维化标志物表达 [2]
- 对映体抑制活性的差异归因于其与 SETD7 关键残基结合稳定性和氢键形成能力的差异 [1]
- 在两种肾纤维化小鼠模型中的临床前疗效支持其作为治疗纤维化肾病药物的潜力 [2]
- 临床前研究表明,其对正常肾上皮细胞和主要器官的毒性较低,表明其具有良好的安全性 [2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H25F4N3O3S.HCL
分子量
535.98
精确质量
535.131
CAS号
1627607-87-7
相关CAS号
PFI-2;1627676-59-8
PubChem CID
78243738
外观&性状
White to off-white solid powder
tPSA
86.9
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
35
分子复杂度/Complexity
813
定义原子立体中心数目
1
SMILES
C1CCN(C1)C(=O)[C@@H](CC2=CC(=CC=C2)C(F)(F)F)NS(=O)(=O)C3=CC4=C(CNCC4)C(=C3)F.Cl
InChi Key
ZADKZNVAJGEFLC-ZMBIFBSDSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H25F4N3O3S.ClH/c24-20-13-18(12-16-6-7-28-14-19(16)20)34(32,33)29-21(22(31)30-8-1-2-9-30)11-15-4-3-5-17(10-15)23(25,26)27;/h3-5,10,12-13,21,28-29H,1-2,6-9,11,14H2;1H/t21-;/m1./s1
化学名
(R)-8-fluoro-N-(1-oxo-1-(pyrrolidin-1-yl)-3-(3-(trifluoromethyl)phenyl)propan-2-yl)-1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-6-sulfonamide hydrochloride
别名

PFI-2; PFI2; PFI 2; PFI-2 hydrochloride

HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 32 mg/mL
Water: NA
Ethanol: NA
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.66 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.66 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.66 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 1 mg/mL (1.87 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶.

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8657 mL 9.3287 mL 18.6574 mL
5 mM 0.3731 mL 1.8657 mL 3.7315 mL
10 mM 0.1866 mL 0.9329 mL 1.8657 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • PFI-2 HCl

    Inhibition of Setd7 affects YAP in MEFs and MCF7 cells. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014 Sep 2;111(35):12853-8.
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