PKM2-IN-1

别名: PKM2-IN-1; PKM2 IN-1; 94164-88-2; PKM2-IN-1; PKM2 inhibitor(compound 3k); PKM2 inhibitor; (3-methyl-1,4-dioxo-1,4-dihydronaphthalen-2-yl)methyl piperidine-1-carbodithioate; CHEMBL4128703; (3-methyl-1,4-dioxonaphthalen-2-yl)methyl piperidine-1-carbodithioate; PKM2-IN 1 1-哌啶二硫代甲酸 (1,4-二氢-3-甲基-1,4-二氧代-2-萘基)甲基酯

目录号: V3420 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

PKM2-IN-1 是一种新型、有效的丙酮酸激酶 M2 (PKM2) 抑制剂，IC50 为 2.95 μM。

PKM2-IN-1 CAS号: 94164-88-2
产品类别: PKM

产品仅用于科学研究，不针对患者销售

规格	价格	库存	数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
5mg
10mg
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250mg
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Nature 2025, 643(8070):192-200.

Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Science Adv 2025, 11(33):eadr5199.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

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纯度: ≥98%

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产品说明书

产品描述
生物活性&实验参考方法
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产品描述

PKM2-IN-1 是一种新型、有效的丙酮酸激酶 M2 (PKM2) 抑制剂，IC50 为 2.95 μM。丙酮酸激酶 M2 (PKM2) 是糖酵解途径的限速酶，在癌细胞中高度表达。癌细胞严重依赖 PKM2 来满足合成代谢和能量需求，因此 PKM2 的特异性靶向具有作为癌症治疗策略的潜力。 PKM2-IN-1 显示出比报道的最佳 PKM2 抑制剂紫草素更有效的 PKM2 抑制活性。 PKM2-IN-1还对一系列高表达PKM2的癌细胞系（包括HCT116、Hela和H1299）表现出纳摩尔级抗增殖活性，IC50值范围为0.18至1.56 μM。此外，PKM2-IN-1对癌细胞比正常细胞表现出更强的细胞毒性。新型强效PKM2小分子抑制剂的鉴定不仅为癌症治疗提供了候选化合物，而且还提供了深入评估PKM2功能的工具。

生物活性&实验参考方法

靶点	Pyruvate kinase M2 (PKM2) (IC50 = 2.95 μM)
体外研究 (In Vitro)	PKM2-IN-1 (compound 3k) 是丙酮酸激酶 M2 (PKM2) 的抑制剂，IC50 为 2.95±0.53 μM。根据结果，大多数研究的化合物表现出一定程度的 PKM2 抑制作用，并且某些化合物，包括化合物 3k 和化合物 6d（即 PKM2-IN-1），表现出比阳性对照紫草素更有效的活性。对 PKM2 表现出剂量依赖性抑制作用的物质的例子是 PKM2-IN-1 和 6d。相反，这些化合物对 PKM1 和 PKL 的抑制作用与紫草素一样温和。测试结果表明，3a、PKM2-IN-1和3r是针对HCT116和HeLa细胞最有效的化合物，IC50值分别为0.39至0.41μM、0.18至0.29μM和0.18至0.38μM。 1]。
酶活实验	PKM2活性测定[1] 如前所述，用荧光丙酮酸激酶-乳酸脱氢酶偶联测定法测量丙酮酸激酶活性。通过将丙酮酸激酶产生丙酮酸与乳酸脱氢酶消耗NADH结合，在动力学模式下测试所有化合物。对于PKM2，将40μL缓冲液（50 mM Tris-HCl，pH 7.5，10 mM KCl，5 mM MgCl2）、1μL化合物和5μL酶溶液分配到康宁黑色固体96孔板中，孵育15分钟。然后加入55μL底物混合物（终浓度，0.5 mM PEP，4.0 mM ADP，0.12 mM NADH，0.25 mM FBP和1单位LDH），将板放置在FlexStation 3中，然后以30秒的暴露间隔测定NADH荧光3-6分钟。
细胞实验	细胞活力实验[1] 根据制造商的说明，用MTS assa检测细胞活力。简而言之，将每孔5000个细胞镀在96孔板上。孵育12小时后，用不同浓度的受试化合物或DMSO（作为阴性对照）处理细胞48小时。然后每孔加入20μL MTS，在37°C下孵育3小时。用酶标仪（Flexstation 3）在490 nm波长下测定每孔的吸光度。使用三次实验的Prism Graphpad软件计算IC50值。
参考文献	[1]. Discovery of novel naphthoquinone derivatives as inhibitors of the tumor cell specific M2 isoform of pyruvate kinase. Eur J Med Chem. 2017 Sep 29;138:343-352.
其他信息	丙酮酸激酶M2 (PKM2) 是糖酵解途径的限速酶，在癌细胞中高表达。癌细胞高度依赖PKM2来满足其合成代谢和能量需求，因此，特异性靶向PKM2具有成为癌症治疗策略的潜力。本文报道了新型萘醌衍生物作为PKM2选择性小分子抑制剂的合成和生物学评价。一些靶化合物，例如化合物3k，表现出比已报道的最佳PKM2抑制剂紫草素更强的PKM2抑制活性。性能优异的化合物3k对一系列高表达PKM2的癌细胞系（包括HCT116、Hela和H1299）也表现出纳摩尔级的抗增殖活性，IC50值范围为0.18至1.56 μM。此外，化合物3k对癌细胞的细胞毒性高于正常细胞。新型高效PKM2小分子抑制剂的发现不仅为癌症治疗提供了候选化合物，也为深入评估PKM2的功能提供了一种工具。[1] 本研究描述了一种此前未被报道的PKM2抑制剂的鉴定和表征。这些新型萘醌衍生物作为PKM2抑制剂，表现出比紫草素更强的抑制活性，且选择性与紫草素相似。这些化合物将PKM2锁定在低活性构象，从而迫使癌细胞代谢发生改变，使其代谢灵活性低于正常状态。此外，部分靶化合物的抗增殖活性高于紫草素。然而，酶活性和细胞毒性实验中出现了一些意想不到的结果。PKM2抑制活性与靶化合物的体外细胞毒性之间缺乏相关性，表明除PKM2抑制活性外，细胞可能通过其他机制激活这些化合物。然而，毫无疑问，PKM2是这些合成的萘醌衍生物的作用靶点，因为某些抑制PKM2活性的化合物的IC50值接近纳摩尔浓度范围。PKM2已被证实不仅是丙酮酸激酶代谢重编程的主要参与者，而且作为癌细胞中的蛋白激酶，还直接调控基因表达。EGFR激活后，PKM2从癌细胞的细胞质转位到细胞核，激活β-catenin，诱导CCDN1和c-Myc表达，并上调GLUT1和乳酸脱氢酶A（LDHA）。这些糖酵解基因的上调会增加葡萄糖消耗和乳酸生成，进而促进肿瘤发生。因此，抑制PKM2共激活的肿瘤基因转录和糖酵解基因表达也是潜在的肿瘤治疗策略。我们将尝试确定该机制是否适用于合成的萘醌衍生物。如果适用，该机制还可以解释靶化合物的酶活性和细胞毒性之间的构效关系差异。进一步的研究还将侧重于PKM2蛋白与小分子抑制剂复合物的结构研究，这可能有助于发现更有效的化合物。无论如何，本文的研究结果为开发PKM2靶向抗癌疗法奠定了基础。[1]

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C18H19NO2S2
分子量	345.478962182999
精确质量	345.085
元素分析	C, 62.58; H, 5.54; N, 4.05; O, 9.26; S, 18.56
CAS号	94164-88-2
PubChem CID	131698387
外观&性状	Light yellow to yellow solid powder
LogP	3.5
tPSA	94.8
氢键供体(HBD)数目	0
氢键受体(HBA)数目	4
可旋转键数目(RBC)	3
重原子数目	23
分子复杂度/Complexity	549
定义原子立体中心数目	0
SMILES	O=C1C(C)=C(CSC(N2CCCCC2)=S)C(=O)C2C1=CC=CC=2
InChi Key	STAFOGVMELKGRI-UHFFFAOYSA-N
InChi Code	InChI=1S/C18H19NO2S2/c1-12-15(11-23-18(22)19-9-5-2-6-10-19)17(21)14-8-4-3-7-13(14)16(12)20/h3-4,7-8H,2,5-6,9-11H2,1H3
化学名	(3-methyl-1,4-dioxo-1,4-dihydronaphthalen-2-yl)methyl piperidine-1-carbodithioate
别名	PKM2-IN-1; PKM2 IN-1; 94164-88-2; PKM2-IN-1; PKM2 inhibitor(compound 3k); PKM2 inhibitor; (3-methyl-1,4-dioxo-1,4-dihydronaphthalen-2-yl)methyl piperidine-1-carbodithioate; CHEMBL4128703; (3-methyl-1,4-dioxonaphthalen-2-yl)methyl piperidine-1-carbodithioate; PKM2-IN 1
HS Tariff Code	2934.99.9001
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO : ~10 mg/mL (~28.95 mM)
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: 8 mg/mL (23.16 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 80.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中并混合均匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。配方 2 中的溶解度:* ≥ 8 mg/mL (23.16 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 80.0mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20％SBE-β-CD生理盐水中，混匀。 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More* 配方 3 中的溶解度: ≥ 8 mg/mL (23.16 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 80.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中，混合均匀。请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO : ~10 mg/mL (~28.95 mM)

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: 8 mg/mL (23.16 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 80.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中并混合均匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 8 mg/mL (23.16 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 80.0mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20％SBE-β-CD生理盐水中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 8 mg/mL (23.16 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 80.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中，混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	2.8945 mL	14.4726 mL	28.9452 mL
	5 mM	0.5789 mL	2.8945 mL	5.7890 mL
	10 mM	0.2895 mL	1.4473 mL	2.8945 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。