Stafib-2

别名: Stafib-2; 2097938-74-2; Benzamide, 4-[2-[[[3,4-bis(phosphonooxy)phenyl]methyl]amino]-2-oxoethoxy]-N-(4-phenoxyphenyl)-; 4-((2-(4-((4-Phenoxyphenyl)carbamoyl)phenoxy)acetamido)methyl)-1,2-phenylene bis(dihydrogen phosphate); [4-[[[2-[4-[(4-phenoxyphenyl)carbamoyl]phenoxy]acetyl]amino]methyl]-2-phosphonooxyphenyl] dihydrogen phosphate; Stafib-2?; DTXSID601118678
目录号: V69141 纯度: ≥98%
Stafib-2 是一种有效且特异性的转录因子 STAT5b 抑制剂,抑制 STAT5b 和 STAT5a 的 IC50 值分别为 82 nM 和 1.7 μM。
Stafib-2 CAS号: 2097938-74-2
产品类别: STAT
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产品描述
Stafib-2 是一种有效且特异性的转录因子 STAT5b 抑制剂,抑制 STAT5b 和 STAT5a 的 IC50 值分别为 82 nM 和 1.7 μM。 Stafib-2的细胞通透性较差。
生物活性&实验参考方法
靶点
STAT5b(IC50 = 82 nM)
体外研究 (In Vitro)
Stafib-2 对 STAT5b 的亲和力非常高 (Ki=8.8 nM)[1]。在 K562 和 MDA-MB-231 细胞中,stafib-2(3–10 μM;4-48 小时)不表现出任何可辨别的活性[1]。
利用等温滴定量热法(ITC)和蛋白质点突变体分析联合验证了Stafib-2的结合位点,这是首次利用ITC对野生型和突变型蛋白的功能比较,用氨基酸分辨率来表征STAT蛋白的小分子配体的结合位点。前药Pomstafib-2选择性抑制人白血病细胞中STAT5b酪氨酸磷酸化,并以stat5依赖的方式诱导细胞凋亡。我们提出Pomstafib-2作为一种化学工具来解决STAT5蛋白在不同细胞过程中所起作用的基本问题,Pomstafib-2是目前可用的最活跃的STAT5b活化选择性抑制剂
酶活实验
荧光偏振(FP)测定[1]
测试化合物取代荧光团标记肽(最终浓度:10 nM)从各自结合蛋白的能力如前所述进行了分析。肽序列为:STAT1: 5-羧基荧光素- gy (PO3H2)DKPHVL;STAT3: 5-carboxyfluorescein-GY (PO3H2) LPQTV-NH2;STAT4: 5-carboxyfluorescein-GY (PO3H2) LPQNID-OH;STAT5a和STAT5b: 5-羧基荧光素- gy (PO3H2)LVLDKW;STAT6: 5-carboxyfluorescein-GY (PO3H2) VPWQDLI-OH;Lck SH2: 5-羧基荧光素gy (PO3H2)EEIP。由于蛋白质不稳定,未对STAT2进行分析。最终蛋白浓度:STAT1: 420 nM;STAT3: 270 nM;STAT4: 130 nM;STAT5a: 130 nM;STAT5b: 100 nM;STAT6: 310 nM;lk SH2: 30 nM。这些浓度对应于各自蛋白-肽相互作用的kd值。移液部分使用Biomek FX机器人进行。在加入荧光标记的肽之前,将蛋白质和化合物孵育1小时。另外一个小时后,荧光偏振测量使用无限F500平板阅读器。最终缓冲液浓度:10 mM Tris (pH 8.0), 50 mM NaCl, 1 mM EDTA, 1 mM DTT, 0.1% Nonidet P-40替代品,2% DMSO。根据肽-蛋白结合曲线拟合,将FP的变化转化为抑制百分比。根据IC50数据,使用已发表的公式计算ki值。
等温滴定热法(ITC) [1]
ITC实验在MicroCal VP-ITC量热计上进行。典型的滴定设置为:25°C细胞温度,150 s初始延迟,约20µM STAT蛋白在10 mM Tris中,50 mM NaCl, pH 8.0, 200µM化合物4作为四钠盐,搅拌速度300 rpm,参考功率为20µcal/s。所有的溶液在实验前都脱了气。结果数据通过NITPIC和SEDPHAT34进行分析,并拟合单位点结合模型,同时将4的浓度定义为固定。采用了低噪声热图积分方法。插图使用GUSSI制作。
细胞实验
Western Blots [1]
如前所述,转染培养的K562细胞并进行Western blotting。使用Fugene HD转染试剂(每孔1 × 106个细胞,1 ml培养基,DNA比例为4:1)。24 h后,分别用化合物或DMSO处理细胞4 h (DMSO终浓度0.2%)。收获后,细胞裂解(裂解缓冲液组成:50 mM Tris-HCl pH 7.5, 150 mM NaCl, 10 mM Na4P2O7, 10%甘油,1% Triton X-100, 1 mM EDTA, 100 ng/mL抑蛋白蛋白,1 mM Na3VO4, 10 mM NaF, 1 mM PMSF)。通过SDS-PAGE(10%)分离细胞裂解液组分,然后转移到硝化纤维素膜上。一抗(phospho-STAT5;STAT5;α-兔hrp二抗和ECL检测β-Actin),并用ImageQuant成像仪进行可视化。采用ImageJ软件(NIH)进行信号定量。
凋亡试验[1]
细胞凋亡检测如前所述16。简而言之,将K562细胞(每孔2.5 × 105个细胞)或MDA-MB-231细胞(每孔1 × 105个细胞)接种于24孔组织培养板中,用化合物8按指定浓度(终DMSO浓度:0.2%)处理48小时。48h后收获细胞。用温磷酸盐缓冲盐水(PBS)清洗MDA-MB-231细胞两次,然后用Accutase在37°C下孵育10分钟。用每孔的细胞培养上清进行精准酶中和和细胞重悬。收获后,细胞在4°C下3000 rpm离心5分钟,用冷PBS洗涤2次,再次离心。使用PE Annexin V凋亡检测试剂盒对细胞进行染色。将细胞重悬于结合缓冲液中,并与PE Annexin V和7-AAD在4℃下孵育30 min。用LSRⅱ型流式细胞仪检测细胞凋亡。
参考文献

[1]. Rational development of Stafib-2: a selective, nanomolar inhibitor of the transcription factor STAT5b. Sci Rep. 2017 Apr 11;7(1):819.

其他信息
转录因子STAT5b是肿瘤治疗的靶点。我们近期报道了儿茶酚二磷酸及其衍生物(如Stafib-1)是首批STAT5b SH2结构域的选择性抑制剂。本文中,我们利用固态核磁共振证实了儿茶酚二磷酸与STAT5b的结合,并报道了Stafib-1(Ki = 44 nM)到Stafib-2(Ki = 9 nM)的合理优化。我们结合等温滴定量热法(ITC)和蛋白质点突变分析验证了Stafib-2的结合位点,这是首次利用ITC对野生型和突变型蛋白质进行功能比较,从而以氨基酸分辨率表征STAT蛋白小分子配体的结合位点。前药Pomstafib-2选择性抑制人白血病细胞中STAT5b的酪氨酸磷酸化,并以STAT5依赖的方式诱导细胞凋亡。我们提出Pomstafib-2,它是目前活性最高、选择性最强的STAT5b激活抑制剂,可作为一种化学工具,用于解决不同STAT5蛋白在各种细胞过程中所发挥的基本作用这一根本问题。[1]
我们报道了STAT5b SH2结构域抑制剂Stafib-1 (2) 到Stafib-2 (4) 的合理优化,Stafib-2在保持对密切相关的STAT5a SH2结构域的高选择性的同时,活性显著提高。我们首次将固态核磁共振应用于配体与SH2结构域结合的分析。Stafib-2对STAT5b的高亲和力使我们能够通过等温滴定量热法(ITC)首次比较小分子STAT SH2结构域配体与野生型和突变型STAT蛋白的结合情况,从而实验验证了STAT5b上Stafib-2的亲水性和疏水性结合口袋。戊酰氧基甲酯Pomstafib-2 (8) 能以仅1.5 µM的IC50值抑制培养的人类白血病细胞中STAT5b的磷酸化,且对STAT5a的磷酸化无显著影响,并以STAT5依赖的方式增加人类白血病细胞的凋亡率。由于Pomstafib-2 (8) 是目前活性最高、选择性最强的STAT5b激活抑制剂,我们建议将其用作化学工具,以解析活细胞中两种STAT5蛋白重叠且非冗余的功能。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C28H26N2O12P2
分子量
644.4597697258
精确质量
644.096
元素分析
C, 52.18; H, 4.07; N, 4.35; O, 29.79; P, 9.61
CAS号
2097938-74-2
PubChem CID
129896883
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
1.8
tPSA
210
氢键供体(HBD)数目
6
氢键受体(HBA)数目
12
可旋转键数目(RBC)
13
重原子数目
44
分子复杂度/Complexity
1020
定义原子立体中心数目
0
SMILES
P(=O)(O)(O)OC1=C(C=CC(=C1)CNC(COC1C=CC(C(NC2C=CC(=CC=2)OC2C=CC=CC=2)=O)=CC=1)=O)OP(=O)(O)O
InChi Key
LJGIDZSIOSYQMR-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C28H26N2O12P2/c31-27(29-17-19-6-15-25(41-43(33,34)35)26(16-19)42-44(36,37)38)18-39-22-11-7-20(8-12-22)28(32)30-21-9-13-24(14-10-21)40-23-4-2-1-3-5-23/h1-16H,17-18H2,(H,29,31)(H,30,32)(H2,33,34,35)(H2,36,37,38)
化学名
[4-[[[2-[4-[(4-phenoxyphenyl)carbamoyl]phenoxy]acetyl]amino]methyl]-2-phosphonooxyphenyl] dihydrogen phosphate
别名
Stafib-2; 2097938-74-2; Benzamide, 4-[2-[[[3,4-bis(phosphonooxy)phenyl]methyl]amino]-2-oxoethoxy]-N-(4-phenoxyphenyl)-; 4-((2-(4-((4-Phenoxyphenyl)carbamoyl)phenoxy)acetamido)methyl)-1,2-phenylene bis(dihydrogen phosphate); [4-[[[2-[4-[(4-phenoxyphenyl)carbamoyl]phenoxy]acetyl]amino]methyl]-2-phosphonooxyphenyl] dihydrogen phosphate; Stafib-2?; DTXSID601118678
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 50 mg/mL (77.58 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.88 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.88 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (3.88 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.5517 mL 7.7584 mL 15.5169 mL
5 mM 0.3103 mL 1.5517 mL 3.1034 mL
10 mM 0.1552 mL 0.7758 mL 1.5517 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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