Thalidomide-5-OH

别名: 5-hydroxythalidomide; 64567-60-8; 2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-5-hydroxyisoindoline-1,3-dione; Thalidomide-5-OH; 2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-5-hydroxyisoindole-1,3-dione; (+/-)-Hydroxythalidomide; CHEMBL182442; 29V976C3CJ; 4-羟基沙利度胺
目录号: V83050 纯度: =99.93%
Thalidomide-5-OH 是一种基于 Thalidomide 的 cereblon(E3 连接酶)配体,可招募 CRBN 蛋白。
Thalidomide-5-OH CAS号: 64567-60-8
产品类别: PROTAC | 蛋白降解靶向嵌合体
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
100mg
250mg
500mg
1g
5g
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Other Forms of Thalidomide-5-OH:

  • Thalidomide-4-OH-(S)-CH3
  • 2-(2,6-二氧代 - 哌啶-3-基)-4-羟基 - 异吲哚-1,3-二酮
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纯度: =99.93%

产品描述
Thalidomide-5-OH 是一种基于 Thalidomide 的 cereblon(E3 连接酶)配体,可招募 CRBN 蛋白。沙利度胺-5-OH可以通过接头与靶蛋白的配体缀合,形成PROTAC分子。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cereblon
体外研究 (In Vitro)
血管生成,特别是抗血管生成,是癌症治疗中特别感兴趣的一个领域。几种抗血管生成药物正处于临床试验的最后阶段。其中一种药物沙利度胺以其致畸潜力而闻名,对几种肿瘤类型显示出希望。沙利度胺之前已被证明需要生物激活才能在分离的血管和内皮细胞中发挥其抗血管生成作用。在这项工作中,我们使用子宫内鸡胚绒毛尿囊膜(CAM)系统证实了这些发现。特别是,沙利度胺的抗血管生成作用被人类激活而不是大鼠肝微粒体激活后显著增强。我们还在CAM试验中表明,沙利度胺在1'-或5--位的羟基化保留了抗血管生成活性,而在4--位的羟化导致了一种无活性的化合物。我们进一步证明,沙利度胺在培养中对MDA-MB-231人癌症细胞显示出弱的抗增殖活性。然而,沙利度胺对SH-SY5Y人神经母细胞瘤和人脐静脉内皮细胞(HUVEC)类型显示出略强的抗增殖活性。此外,与单独使用沙利度胺相比,沙利度酰胺与人肝微粒体的孵育对这些细胞类型没有额外的抗增殖作用。最后,我们报告说,所测试的沙利度胺代谢物对乳腺癌或神经母细胞瘤细胞都没有任何抗增殖作用,但对内皮细胞确实具有明显的抗增殖活性。总之,这项工作表明,基于药物推定代谢产物的羟基化沙利度胺类似物具有显著的抗血管生成活性,探索这些衍生物作为潜在的抗血管新生药物值得进一步研究[1]。
体内研究 (In Vivo)
化疗药物沙利度胺的致畸性是物种特异性的,影响人类、非人灵长类动物和兔子。在先前研究的啮齿动物中,沙利度胺的一次氧化主要导致失活5'-羟基沙利度酰胺的形成。在目前的研究中,口服沙利度胺(2.0mg/kg)后,通过分析沙利度酰胺敏感物种雄性家兔的血浆,证实了与5-羟基沙利度米和5'-羟基沙利度米类似的体内生物转化。在雄性家兔口服剂量后4小时和7小时,使用液相色谱-串联质谱法检测到精浆和血浆中沙利度胺的相似水平。雄性家兔的5-羟基沙利度胺和5'-羟基沙利度胺的精浆浓度也与口服沙利度酰胺(2.0mg/kg)后的血浆浓度大致相似。此外,简化的基于生理学的药代动力学兔模型生成的值与沙利度胺对非偶联5-羟基沙利度酰胺和5'-羟基沙利度胺的肝脏固有清除率在0.01代谢比下的体内血浆测量数据一致。这些结果表明,沙利度胺的代谢激活可能依赖于兔肝酶,就像人源化肝小鼠的细胞色素P450酶一样;相比之下,啮齿动物的肝脏主要介导沙利度胺向5'-羟基沙利度酰胺的生物转化。未来应考虑使用实验动物的发育毒性测试系统,该系统涉及通过精液阴道内暴露于化疗药物沙利度胺[2]。
酶活实验
沙利度胺通过含有泛素连接酶的cereblon(CRBN)诱导蛋白质降解并改变其底物特异性,从而引起致畸作用。人类P450细胞色素通过尚不清楚的机制将沙利度胺转化为两种单羟基代谢物,这两种代谢物被认为有助于沙利度酰胺的作用。在这里,我们报告说,早幼粒细胞白血病锌指(PLZF)/ZBTB16是一种CRBN靶蛋白,其降解与沙利度胺和5-羟基沙利度酰胺诱导的致畸性有关。使用小麦无细胞蛋白质合成系统中产生的人类转录因子蛋白阵列,PLZF被鉴定为沙利度胺依赖性CRBN底物。PLZF被泛素连接酶CRL4CRBN与沙利度胺、其衍生物或5-羟基沙利度酰胺复合物降解,降解方式依赖于PLZF保守的第一和第三锌指结构域。令人惊讶的是,沙利度胺和5-羟基沙利度酰胺对小鼠和鸡CRBN具有明显不同的底物特异性,这两种化合物都会在鸡胚胎中引起致畸表型。一致地,敲除Plzf会诱导鸡四肢形成短骨。最重要的是,沙利度胺或5-羟基沙利度酰胺处理在鸡胚中诱导了PLZF蛋白的降解,但没有诱导已知的沙利度脲依赖性CRBN底物SALL4的降解。此外,PLZF过表达部分挽救了沙利度胺诱导的表型。我们的研究结果表明,PLZF是沙利度胺诱导的CRBN新底物,与沙利度酰胺致畸性有关[3]。
细胞实验
为了检测过表达的PLZF、SALL4或IKZF1的5‐hydroxythalidomide/5-羟基沙利度胺依赖性降解,将HEK293T-CRBN-/-细胞在48孔板中培养,并用200 ng pcDNA3.1(+)-FLAG-CRBN-WT和20 ng pcDNA3.1-AGIA-SALL4、pcDNA3.1-(+)-AGIA-PLZF或pcDNA3.1-IKIZF1转染。转染细胞8小时后,在培养基中以指定的时间和浓度用沙利度胺、5-羟基沙利度酰胺或DMSO(0.1%)处理细胞(图4C)。对于内源性SALL4、PLZF、IKZF1、HuH7或THP-1细胞,在48孔平板中培养,并在培养基中以指定的时间和浓度用沙利度胺、5-羟基沙利度酰胺或DMSO(0.1%)处理(图4D和E)。[3]

为了检测IMiD依赖性蛋白质降解的物种特异性,将HEK293T-CRBN-/-细胞在48孔板中培养,并用200 ng pcDNA3.1(+)-FLAG(小鼠或鸡)CRBN-WT或CRBN-IV和20 ng pcDNA3.1-AGIA-PLZF或pcDNA3.1-(+)-AGIA-SALL4转染。转染细胞8小时后,在培养基中用沙利度胺或DMSO(0.1%)处理细胞,处理时间和浓度如图5A-D所示。[3]

为了检查5-羟基沙利度胺是否诱导小鼠或鸡SALL4或PLZF的降解,将HEK293T-CRBN−/-细胞在48孔板中培养,并用200 ng pcDNA3.1(+)-FLAG‐(小鼠或鸡)CRBN̴WT和20 ng pcDNA310(+)-AGIA \8208》(小鼠或鸡肉)SALL4或pcDNA3.1。转染细胞8小时后,在培养基中用沙利度胺、5-羟基沙利度酰胺或DMSO(0.1%)处理细胞,处理时间和浓度如图5E-h所示。[3]

在所有实验中,细胞在含有5%2-巯基乙醇的1倍样品缓冲液中煮沸裂解,裂解物通过免疫印迹进行分析。
定量实时PCR(qRT-PCR)[3]
为了证明PLZF蛋白翻译后水平降低,通过qRT-PCR评估了用DMSO或来那度胺处理24小时的HEK293T、HuH7或THP-1细胞中PLZF mRNA的表达。为了分析SALL4或PLZF mRNA的表达,通过qRT-PCR评估了用DMSO、沙利度胺或5‐hydroxythalidomide处理24小时的HuH7细胞。使用SuperPrep细胞裂解试剂盒从用DMSO或来那度胺处理24小时的HEK293T、HuH7或THP-1细胞中分离总RNA。根据制造商的方案,使用SuperPrep RT试剂盒合成cDNA。使用KOD SYBR qPCR Mix进行RT-PCR,并根据甘油醛3-磷酸脱氢酶(GAPDH)mRNA水平对数据进行标准化。PCR引物如下:PLZF FW 5′-GCACAGTTCGAGAGAGGA‐3′,PLZF RV 5′-GGCCATCGTGTCAGTCGCAGT \8208t 3′,SALL4 FW 5′-KGTCCTCGAGAGACAGAGAGAGATGT 3〃,SALL4 RV 5′GGCATCCAGAGAGACAGAGAGACCTT \8208》3′,GAPDH FW 5′-AGCACAGGGTGGTGGAGC \8208y 3′,GAPDH RV 5′/GTGGGGGGGGGAGAGAGACTGAG \8208'。
动物实验
沙利度胺处理鸡胚[3]
将沙利度胺固体晶体溶于45% 2-羟丙基-β-环糊精溶液中,于60℃下溶解1-2小时,制备沙利度胺(2 μg/μl,7.8 mM)或5-羟基沙利度胺(2 μg/μl,7.3 mM)储备液。将该储备液与等体积的2×Hanks缓冲液混合,制成工作液(1 μg/μl,沙利度胺浓度为3.9 mM,5-羟基沙利度胺浓度为3.6 mM)。在胚胎发育第18阶段(E3),于右前肢芽上方的羊膜上开一个小孔,将工作液注入羊膜与右前肢芽之间的空隙中,以进行沙利度胺处理。对于原位杂交样本,为了在短时间内诱导沙利度胺或5-羟基沙利度胺对靶蛋白产生强烈的作用,并进行免疫荧光和免疫印迹分析,将胚胎用30 μl工作液处理,并孵育至HH 22/23期(E4)。对于骨骼模式分析样本,为了降低致死率并提高在HH 36期(E10)肢芽中表现出致畸表型的鸡胚的收集率,将胚胎每隔12小时用10 μl工作液处理一次,共处理三次,并孵育至HH 36期(E10)。
参考文献

[1]. Effects of Putative Hydroxylated Thalidomide Metabolites on Blood Vessel Density in the Chorioallantoic Membrane (CAM) Assay and on Tumor and Endothelial Cell Proliferation. Biol Pharm Bull. 2002 May;25(5):597-604.

其他信息
5-羟基沙利度胺是邻苯二甲酰亚胺类化合物的一种。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C13H10N2O5
分子量
274.2289
精确质量
274.059
元素分析
C, 56.94; H, 3.68; N, 10.22; O, 29.17
CAS号
64567-60-8
相关CAS号
Thalidomide-4-OH;5054-59-1
PubChem CID
5743568
外观&性状
Gray to brown solid powder
密度
1.611g/cm3
沸点
600ºC at 760mmHg
闪点
316.7ºC
折射率
1.679
LogP
0.007
tPSA
107.27
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
1
重原子数目
20
分子复杂度/Complexity
503
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C1CCC(N2C(=O)C3C=CC(=CC=3C2=O)O)C(=O)N1
InChi Key
LJBQRRQTZUJWRC-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C13H10N2O5/c16-6-1-2-7-8(5-6)13(20)15(12(7)19)9-3-4-10(17)14-11(9)18/h1-2,5,9,16H,3-4H2,(H,14,17,18)
化学名
2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-5-hydroxyisoindole-1,3-dione
别名
5-hydroxythalidomide; 64567-60-8; 2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-5-hydroxyisoindoline-1,3-dione; Thalidomide-5-OH; 2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-5-hydroxyisoindole-1,3-dione; (+/-)-Hydroxythalidomide; CHEMBL182442; 29V976C3CJ;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~62.5 mg/mL (~227.91 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (7.58 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (7.58 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.6466 mL 18.2329 mL 36.4657 mL
5 mM 0.7293 mL 3.6466 mL 7.2931 mL
10 mM 0.3647 mL 1.8233 mL 3.6466 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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