PTC299

别名: PTC299; PTC 299; PTC-299
目录号: V4687 纯度: ≥98%
PTC-299 (PTC299; PTC 299) 是一种新型、有效、口服生物可利用的 VEGF 抑制剂,具有潜在的抗血管生成和抗肿瘤活性。
PTC299 CAS号: 1256565-36-2
产品类别: New7
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纯度: ≥98%

产品描述
PTC-299(PTC299;PTC 299)是一种新型、有效、口服生物可利用的 VEGF 抑制剂,具有潜在的抗血管生成和抗肿瘤活性。它在细胞应激条件下通过 VEGF mRNA 的转录后调节发挥作用。 PTC299 对血液癌细胞具有广泛而有效的活性。 PTC299 通过选择性结合 VEGF 信使 RNA (mRNA) 的 5'- 和 3'- 非翻译区 (UTR) 进行转录后靶向,从而阻止 VEGF 翻译。这会抑制 VEGF 蛋白的产生并降低其在肿瘤和血液中的水平。反过来,这可能导致抑制内皮细胞的迁移、增殖和存活、微血管形成、抑制肿瘤细胞增殖,并最终诱导肿瘤细胞死亡。
生物活性&实验参考方法
靶点
Dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) (Inhibitor. IC50 ≈ 1 nM for inhibition of proliferation in MOLM-13 AML cells; binds to the same site as brequinar based on pull-down and docking studies) [1]
体外研究 (In Vitro)
PTC299 抑制缺氧诱导的 HeLa 细胞中 VEGFA 蛋白的合成,EC50 为 1.64 ± 0.83 nM[1]。在白血病细胞中,PTC299 的疗效比 Brequinar、Vidofludimus 或 A 77-1726 强十到千倍以上,IC50 约为 1 nM [1]。
PTC299 抑制 HeLa 细胞中缺氧诱导的 VEGFA 蛋白产生,EC50 为 1.64 ± 0.83 nM。其无活性的 R-对映体 PTC-371 无效。 [1]
PTC299 剂量依赖性地抑制转染了含有 VEGFA 5'-UTR 载体的 HT1080 细胞中 V5 标记的 VEGFA165 蛋白的产生,证实了该 UTR 对其活性的必要性。 [1]
使用 35S 标记的蛋氨酸/半胱氨酸进行的脉冲追踪实验表明,PTC299 (100 nM) 降低了新合成的 VEGFA 蛋白水平,但不影响总蛋白合成、VEGFA 分泌或降解,表明其抑制 VEGFA mRNA 翻译。 [1]
PTC299 处理 HT1080 细胞 8 小时后,选择性降低了细胞内嘧啶核苷酸 (dCTP, dTTP) 水平,但不影响嘌呤核苷酸 (dATP, dGTP) 水平。 [1]
使用 15N-谷氨酰胺进行的代谢标记实验表明,PTC299 (100 nM) 抑制嘧啶核苷酸的从头合成,降低了 15N 标记的 CTP、UTP 和 UMP 的水平。这种抑制是快速且剂量依赖性的。 [1]
PTC299 诱导的 VEGFA 蛋白合成抑制和 S 期细胞周期停滞可被外源性尿苷完全挽救,但不能被腺苷、胞苷或鸟苷挽救,这将其效应与嘧啶核苷酸耗竭联系起来。 [1]
使用 PTC299 偶联的 Sepharose 珠子进行的化学下拉实验,特异性地从细胞裂解液中富集了 DHODH 和 prohibitin-1/2。游离的 PTC299 或 brequinar 能竞争性阻断 DHODH(而非 prohibitin)与珠子的结合。游离的 PTC299 或 brequinar 也能将 DHODH 从珠子上洗脱下来。PTC299 珠子结合人源 DHODH,但不结合大鼠 DHODH。 [1]
PTC299 抑制从 K562 细胞分离的线粒体中的 DHODH 活性,其效力与 brequinar 相似,且强于 teriflunomide。 [1]
在包含 240 种肿瘤细胞系的筛选中,PTC299 显示出广泛的抗增殖活性。敏感性 (IC50 < 1 µM) 在造血系统细胞系中 (57%) 比在实体瘤细胞系中 (18%) 更常见。基因表达分析表明,敏感细胞通常具有较低的嘧啶补救合成酶 (CDA, UPP1) 表达,更依赖于从头合成。 [1]
PTC299 能强效抑制白血病细胞系(例如 MOLM-13 AML,IC50 ≈ 1 nM)的增殖,其效力显著高于 brequinar、vidofludimus 或 teriflunomide。它还能抑制五个患者来源的急性髓系白血病 (AML) 细胞样本的增殖,IC50 值在 2 nM 到 60 nM 之间。 [1]
PTC299 能诱导 AML MOLM-13 细胞分化。 [1]
体内研究 (In Vivo)
在小鼠 HT1080 纤维肉瘤异种移植模型中,口服给予 PTC299 (0.3, 1, 3 mg/kg,每日两次) 能剂量依赖性地抑制肿瘤生长。3 mg/kg BID 的剂量达到最大效果。 [1]
在同一模型中,PTC299 治疗导致瘤内和循环血浆中人源 VEGFA 水平的剂量依赖性降低,这与肿瘤生长控制相关。CD31 染色显示,肿瘤血管直径减小且分布更均匀。 [1]
在全身性白血病模型中,静脉接种了 MOLT-4 人急性淋巴细胞白血病 (ALL) 细胞的 NOD-SCID 小鼠,在接种后第 7 天开始接受 PTC299 (10 mg/kg,每日一次) 治疗。PTC299 显著延长了中位生存时间(136 天 vs 溶媒组 46 天),并减少了循环白血病细胞。多柔比星未能延长生存期。 [1]
在实体瘤异种移植模型中,皮下植入 MOLM-13 AML 细胞的裸鼠接受 PTC299 (10 mg/kg, QD)、阿糖胞苷 (AraC, 60 mg/kg, QD) 或两者联合治疗。与溶媒或单独 AraC 相比,单独使用 PTC299 显著延缓了肿瘤生长。PTC299 与 AraC 联合进一步延缓了肿瘤生长。 [1]
在一项针对 2 型神经纤维瘤病 (NF2) 患者的临床研究中,为期 8 周的 PTC299 治疗显著降低了患者升高的血清 VEGFA 水平。对部分患者存档血清样本的分析显示,PTC299 治疗增加了二氢乳清酸 (DHO,DHODH 的底物) 的水平,表明在人体内实现了靶点结合。 [1]
酶活实验
对于体外 DHODH 活性测定,使用了显色底物还原法。通过监测 2,6-二氯吲哚酚 (DCIP) 的还原,分光光度法测量了二氢乳清酸 (DHO) 氧化与泛醌还原的偶联反应。在测试化合物或溶媒对照存在下测定反应速率。 [1]
为了在更生理化的背景下进行 DHODH 抑制研究,使用玻璃匀浆器从对数生长期的 K562 细胞中分离线粒体。将分离的线粒体沉淀并重悬于匀浆缓冲液中。然后使用相同的显色原理,在抑制剂存在下评估这些线粒体制备物中的 DHODH 活性,反应 30 分钟后通过 LC-MS/MS 定量乳清酸的产生。 [1]
细胞实验
对于 VEGFA 抑制 ELISA,用一系列剂量的 PTC299 处理细胞(例如 HeLa、HT1080)指定时间(例如,HeLa 细胞在缺氧条件下)。然后收集培养上清液,使用商业酶联免疫吸附测定 (ELISA) 试剂盒按照说明书定量 VEGFA 蛋白水平。绘制剂量反应曲线并计算 EC50 值。 [1]
对于细胞增殖/毒性测定(CC50 或 IC50 测定),将细胞接种于板中,并用一系列浓度的 PTC299 处理 72 小时。然后使用 CellTiter-Glo 发光细胞活力测定法评估细胞活力,该法通过测量细胞 ATP 水平作为活细胞数的指标。绘制剂量反应曲线并计算 IC50 值。 [1]
对于嘧啶核苷酸从头合成的代谢标记,将对数生长期的细胞培养在含有 1 mM 15N-谷氨酰胺的无谷氨酰胺培养基中。用化合物或溶媒处理指定时间(例如 8 小时)后,洗涤、收集细胞,并在冷的甲醇/水混合物中裂解。离心后收集上清液,通过 LC-MS/MS 分析以定量 15N 标记的嘧啶核苷酸代谢物(例如 UMP、CTP、UTP)。 [1]
对于细胞周期分析,在存在或不存在外源性核苷 (100 µM) 的情况下,用 PTC299 (100 nM) 处理 HT1080 细胞 24 小时。然后收集细胞,固定,用碘化丙啶染色,并通过流式细胞术分析 DNA 含量和细胞周期分布。 [1]
动物实验
对于皮下异种移植模型(例如,HT1080 纤维肉瘤、MOLM-13 AML),将肿瘤细胞植入免疫缺陷小鼠(例如,裸鼠)的侧腹部。当肿瘤达到预定大小后,将小鼠随机分组进行治疗。PTC299 配制成载体(具体成分未在正文中详细说明),并通过灌胃法给药。在 HT1080 研究中,每日两次(BID)分别给予 0.3、1 和 3 mg/kg 的剂量。在 MOLM-13 AML 研究中,每日一次(QD)给予 10 mg/kg 的剂量。定期测量肿瘤体积。[1]
对于系统性白血病模型,将 1 × 107 个 MOLT-4 人 ALL 细胞静脉注射到 NOD-SCID 小鼠体内。接种后7天,将小鼠随机分组并开始治疗。PTC299以10 mg/kg的剂量每日一次口服给药。对照组接受赋形剂或阿霉素(0.5或1 mg/kg,腹腔注射,每周一次)。监测小鼠的存活情况。在第2周和第4周,通过流式细胞术对人CD45进行染色,定量分析循环白血病细胞。[1]
药代性质 (ADME/PK)
对NF2临床试验中一名患者的存档血清样本进行分析表明,PTC299的血浆浓度随治疗而升高,并与血清二氢乳清酸(DHO)水平升高相关,证实了药物的全身暴露和靶点结合。[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
临床前安全性研究(详见补充材料)表明,PTC299 在动物模型中安全且耐受性良好。即使浓度比其在肿瘤细胞中的 IC50 高 1000 倍,PTC299 也不会抑制正常原代细胞(包括造血干细胞)的增殖。[1]
在筛选试验中,PTC299 对 205 种激酶和 62 个其他药理靶点均未显示出脱靶抑制作用。[1]
在之前的实体瘤临床试验中,PTC299 未引起髓系抑制,而髓系抑制是某些其他 DHODH 抑制剂的常见副作用。[1]
然而,文献指出,在之前的临床研究中,279 名接受治疗的患者中有 2 名出现严重肝毒性,因此 PTC299 的临床试验被暂停。[1]
参考文献

[1]. Targeting of Hematologic Malignancies with PTC299, A Novel Potent Inhibitor of DihydroorotateDehydrogenase with Favorable Pharmaceutical Properties. Mol Cancer Ther. 2019 Jan;18(1):3-16.

[2]. Brief Report: A Phase 1b/Pharmacokinetic Trial of PTC299, a Novel PostTranscriptional VEGF Inhibitor, for AIDS-Related Kaposi's Sarcoma: AIDS Malignancy Consortium Trial 059. J Acquir Immune Defic Syndr. 2016 May 1;72(1):52-7.

[3]. Phase I and pharmacokinetic trial of PTC299 in pediatric patients with refractory or recurrent central nervous system tumors: a PBTC study. J Neurooncol. 2015;121(1):217-224.

[4]. Zeng Z, et al, Targeting dihydroorotate dehydrogenase in acute myeloid leukemia. Haematologica. 2018 Sep;103(9):1415-1417.

其他信息
PTC299 是一种新型口服小分子药物,旨在抑制肿瘤中血管内皮生长因子 (VEGF) 的产生。VEGF 的过度表达在多种疾病中起着关键作用,包括癌症和黄斑变性。PTC299 是通过 PTC 公司的 GEMS 技术发现的,其靶向调控 VEGF 生成的转录后过程,目前正在开发用于癌症治疗。
Emvododstat 是一种口服生物利用度高的血管内皮生长因子 (VEGF) 合成小分子抑制剂,具有潜在的抗血管生成和抗肿瘤活性。Emvododstat 通过选择性结合 VEGF 信使 RNA (mRNA) 的 5' 和 3' 非翻译区 (UTR) 来靶向转录后过程,从而阻止 VEGF 的翻译。这抑制了 VEGF 蛋白的产生,并降低了其在肿瘤和血液中的水平。反过来,这可能导致内皮细胞迁移、增殖和存活受到抑制,微血管形成受到抑制,肿瘤细胞增殖受到抑制,并最终诱导肿瘤细胞死亡。VEGF在多种肿瘤细胞类型中表达上调,并在血管生成过程中发挥关键作用。此外,emvododstat可能增强其他化疗药物的抗肿瘤活性。
药物适应症
已在癌症/肿瘤(未具体说明)和实体瘤的治疗中进行研究。
作用机制
PTC299旨在通过靶向调控VEGF生成的转录后控制过程来抑制肿瘤中VEGF的产生。由于PTC299抑制VEGF的产生,因此其作用发生在VEGF通路中的不同位置,与Avastin®或Sutent®等疗法不同。 PTC299 可作为单一药物使用,也可与其他抗血管生成药物或化疗药物联合使用,用于治疗癌症。
药效学
PTC299 在多种肿瘤类型中均表现出广泛的活性,可阻断 VEGF 合成,包括乳腺癌、宫颈癌、结直肠癌、纤维肉瘤、胃癌、肺癌、黑色素瘤、神经母细胞瘤、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌和肾细胞癌。PTC299 作为单药疗法,可显著降低肿瘤和血浆中的 VEGF 浓度,降低肿瘤血管密度,并显著抑制肿瘤进展。
PTC299 最初是通过 PTC Therapeutics 的 GEMS 技术,在表型筛选中被鉴定为 VEGFA mRNA 翻译抑制剂。后续的机制研究表明,其主要靶点是二氢乳清酸脱氢酶 (DHODH),它是嘧啶从头合成途径中的限速酶。VEGFA 生成的抑制是嘧啶核苷酸耗竭的下游结果。[1]
它代表了一类新型的 DHODH 抑制剂。与一些使用纯化酶测定法鉴定的抑制剂不同,PTC299 在 DHODH 嵌入线粒体膜时表现出更强的效力,这表明其活性可能受到膜脂相互作用的促进。[1]
分子对接研究表明,PTC299 与 brequinar 类似物 C44 结合于 DHODH 中相同的疏水性口袋,主要通过非极性亲脂性(“手套式”)相互作用。[1]
其活性具有物种选择性,能有效抑制人 DHODH,但对大鼠 DHODH 没有抑制作用。 [1]
由于PTC299在体外和体内均对血液肿瘤细胞具有强大的活性,并且观察到这类癌症通常嘧啶补救途径活性降低,因此PTC299正在被重新评估用于治疗血液恶性肿瘤(例如白血病、淋巴瘤)。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H20CL2N2O3
分子量
467.343904495239
精确质量
466.09
元素分析
C, 64.25; H, 4.31; Cl, 15.17; N, 5.99; O, 10.27
CAS号
1256565-36-2
PubChem CID
49787172
外观&性状
White to light yellow solid powder
LogP
6.3
tPSA
54.6
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
651
定义原子立体中心数目
1
SMILES
COC1=CC=C(C=C1)[C@H]2C3=C(CCN2C(=O)OC4=CC=C(C=C4)Cl)C5=C(N3)C=CC(=C5)Cl
InChi Key
SRSHBZRURUNOSM-DEOSSOPVSA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H20Cl2N2O3/c1-31-18-7-2-15(3-8-18)24-23-20(21-14-17(27)6-11-22(21)28-23)12-13-29(24)25(30)32-19-9-4-16(26)5-10-19/h2-11,14,24,28H,12-13H2,1H3/t24-/m0/s1
化学名
(4-chlorophenyl) (1S)-6-chloro-1-(4-methoxyphenyl)-1,3,4,9-tetrahydropyrido[3,4-b]indole-2-carboxylate
别名
PTC299; PTC 299; PTC-299
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~106.99 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 0.83 mg/mL (1.78 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 8.3 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 0.83 mg/mL (1.78 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 8.3 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1398 mL 10.6988 mL 21.3977 mL
5 mM 0.4280 mL 2.1398 mL 4.2795 mL
10 mM 0.2140 mL 1.0699 mL 2.1398 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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