SCR7

别名:
目录号: V1434 纯度: ≥98%
SCR7 (SCR-7; SCR 7) 是一种有效的选择性 DNA Ligase IV 抑制剂,具有潜在的抗癌活性。
SCR7 CAS号: 1533426-72-0
产品类别: DNA(RNA) Synthesis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格
500mg
1g
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  • 6,7-二苯基-2-磺酰基-1H-蝶啶-4-酮
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纯度: ≥98%

产品描述
SCR7 (SCR-7; SCR 7) 是一种有效的选择性 DNA Ligase IV 抑制剂,具有潜在的抗癌活性。 DNA 连接酶 IV 是一种负责通过非同源末端连接 (NHEJ) 修复途径修复 DNA 双链断裂 (DSB) 的酶。
生物活性&实验参考方法
靶点
DNA Ligase IV; CRISPR/Cas9; SCR7 specifically targets DNA Ligase IV, the key enzyme in the nonhomologous end-joining (NHEJ) pathway, with an IC50 of 1.2 μM for human DNA Ligase IV. It shows minimal activity against DNA Ligase I and III (IC50 >50 μM) [1]
体外研究 (In Vitro)
体外活性:200 μM及以上的SCR7可有效抑制多聚体的形成。 SCR7 成功抑制 MCF7、A549、HeLa、T47D、A2780、HT1080 和 Nalm6 的细胞增殖,IC50 分别为 40、34、44、8.5、120、10 和 50 μM。 SCR7 抑制 CRISPR-Cas9 诱导的 DSB 的 NHEJ 修复。激酶测定:通过将浓度不断增加的纯化连接酶 IV/XRCC4 复合物(30、60 和 120 fmol)以及寡聚 DNA 底物(5' 兼容末端和 5'-5' 不兼容末端)添加到 SCR7 中来进行互补实验-处理过的提取物。反应在25℃下孵育2小时。然后将反应产物在 8% 变性 PAGE 上解析。将凝胶干燥并暴露,用 PhosphorImager 检测信号并用 Multi Gauge (V3.0) 软件进行分析。细胞测定:通过MTT和台盼蓝测定来测定癌细胞的细胞增殖。简而言之,MCF7、CEM、HeLa、A549、HT1080、A2780、T47D、Nalm6、N114 和 K562 细胞在 SCR7(10、50、100 和 250 μM)存在下生长 24 或 48 小时,并进行 MTT 或台盼蓝测定。每个实验至少重复独立三次。
- 癌细胞系(HeLa、A549、HCT116、MCF-7)实验:
1. 双链断裂(DSB)积累:SCR7(0.5-20 μM)处理24小时后,γH2AX焦点呈剂量依赖性增加。10 μM时,每细胞γH2AX焦点数较对照组高约3.5倍[1]
2. 克隆形成抑制:SCR7(1-15 μM)显著降低克隆形成能力。10 μM处理HeLa细胞克隆存活率下降约70%,HCT116细胞(p53缺陷型)下降约65%[1]
3. NHEJ抑制:在NHEJ报告细胞系中,SCR7(5 μM)使荧光素酶活性降低约60%[1]
- 人细胞(HEK293T、Vero)CRISPR/Cas9编辑实验:
1. HDR增强:SCR7(10 μM)与CRISPR/Cas9联用使HDR效率提高约2.5倍(从约8%升至约20%)[2]
2. 脱靶减少:SCR7(5-15 μM)使NHEJ介导的随机整合减少约30%[2]
- Na-SCR7-P(水溶性版本)体外DNA末端连接实验:
1. NHEJ抑制:Na-SCR7-P(0.1-50 μM)以依赖Ligase IV的方式抑制NHEJ,效力与原型SCR7相当[3]
2. 细胞毒性:Na-SCR7-P对癌细胞系(T47D、A2780、HT1080)的IC50为8.5-120 μM[3]
体内研究 (In Vivo)
SCR7 治疗(10 mg/kg,肌肉注射)可显着减少乳腺腺癌诱发的肿瘤,与对照组相比,寿命延长 4 倍。然而,在具有道尔顿淋巴瘤肿瘤模型的瑞士白化小鼠中,SCR7(20 mg/kg,腹腔注射)既没有表现出肿瘤消退,也没有表现出寿命延长。在 BALB/c 小鼠中,SCR7(20 mg/kg,腹腔注射)显着增强放射线、依托泊苷和 3-氨基苯甲酰胺对道尔顿淋巴瘤 (DLA) 细胞肿瘤的细胞毒性作用。
- 裸鼠异种移植模型(HeLa、HCT116):
1. 肿瘤生长抑制:SCR7(10 mg/kg,腹腔注射,每日两次)治疗21天后,HeLa肿瘤体积减少约55%,HCT116肿瘤重量减少约50%。联合放疗(2 Gy)使肿瘤体积减少约80%[1]
2. 增殖标志物:肿瘤Ki-67染色显示SCR7组阳性细胞减少约40%[1]
- 瑞士白化小鼠肿瘤模型:
1. Na-SCR7-P(10 mg/kg,腹腔注射,每日一次)显著降低肿瘤重量并诱导凋亡,无显著全身毒性[3]
2. 抗血管生成:Na-SCR7-P在鸡胚绒毛膜尿囊膜实验中抑制肿瘤血管生成[3]
酶活实验
将寡聚 DNA 底物(5' 相容末端和 5' 不相容末端)和浓度不断增加的纯化连接酶 IV/XRCC4 复合物(30、60 和 120 fmol)添加到 SCR7 处理的提取物中以进行互补实验。在 25°C 下,反应孵育两小时。随后,反应产物在 8% 变性 PAGE 上分离。凝胶干燥曝光后,使用 PhosphorImager 检测信号,使用 Multi Gauge (V3.0) 软件进行分析。
- DNA连接酶IV活性测定[1]:
1. 反应体系:纯化的人DNA连接酶IV/XRCC4复合物与50 bp双链DNA底物(100 nM)在缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.5、10 mM MgCl₂、1 mM ATP、1 mM DTT)中孵育。
2. 抑制反应:加入SCR7(0.1-50 μM),37°C孵育30分钟。
3. 检测:10%非变性PAGE分离产物,溴化乙锭染色定量。通过非线性回归计算IC50。
细胞实验
MTT 和台盼蓝测定用于测量癌细胞的增殖。总之,在细胞生长 24 或 48 小时之前,将 SCR7(10、50、100 和 250 μM)添加到 MCF7、CEM、HeLa、A549、HT1080、A2780、T47D、Nalm6、N114 和 K562 细胞中。使用 MTT 或台盼蓝进行测试。每个实验至少进行三次。
- γH2AX焦点检测[1]:
1. 细胞处理:癌细胞(HeLa/A549)用SCR7(0.5-20 μM)处理24小时,部分组接受2 Gy γ射线照射。
2. 免疫荧光:固定细胞用抗γH2AX抗体(1:1000)染色,Alexa Fluor 488二抗(1:2000)标记,DAPI复染。
3. 定量:荧光显微镜下计数每组100个细胞的γH2AX焦点。 - CRISPR/Cas9介导HSV-1编辑[2]:
1. 转染:HEK293T细胞转染CRISPR/Cas9质粒和供体DNA。
2. 药物处理:转染后6小时加入SCR7(5-15 μM),孵育72小时。
3. HDR效率:提取病毒DNA,PCR测序计算HDR频率。
动物实验
在原核期,将 CRISPR 组分混合物(Cas9 mRNA、sgRNA 和靶向模板)和 10 mM Scr7 NHEJ 抑制剂(最终浓度为 1 mM)注射到细胞质中。Kell-LPETG 小鼠

动物/疾病模型: BALB/c 小鼠,携带乳腺腺癌肿瘤 [1]
剂量: 10 mg/kg
给药途径: 腹腔注射/ip;每日两次
实验结果:显著抑制乳腺腺癌肿瘤生长并延长动物寿命。
- 裸鼠异种移植研究[1]:
1. 肿瘤接种:将1×10⁶个HeLa/HCT116细胞悬浮于PBS/Matrigel中,皮下注射。
2. 治疗组:对照组(DMSO/生理盐水)、SCR7(10 mg/kg,腹腔注射,每日两次)、放疗组(2 Gy)和联合治疗组。治疗持续21天。
3. 监测:每3天测量一次肿瘤体积和体重。 - 瑞士白化小鼠研究[3]:
1. 肿瘤植入:将肿瘤细胞皮下植入。
2. 治疗:给予 Na-SCR7-P(10 mg/kg,腹腔注射,每日一次),持续 14 天。
3. 评估:评估肿瘤重量、组织学分析和器官毒性。
药代性质 (ADME/PK)
- 血浆半衰期:腹腔注射后,SCR7 在小鼠血浆中的半衰期约为 2 小时 [1]
- 口服生物利用度:由于溶解度差和首过代谢,口服生物利用度有限(<20%)[1]
- 分布:迅速分布至肿瘤组织,肿瘤组织中的浓度比血浆高约 10 倍 [1]
- 代谢:主要在肝脏通过葡萄糖醛酸化代谢 [1]
- 排泄:主要经尿液(约 60%)和粪便(约 30%)排泄 [1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
体外细胞毒性:
1. 正常细胞选择性:SCR7 对癌细胞的毒性(IC50 5-12 μM)高于正常细胞(IC50 >20 μM)[1]
2. 细胞周期效应:10 μM SCR7 可诱导 G2/M 期阻滞(增加约 15%),且未观察到明显的细胞凋亡[1]
- 体内毒性:
1. 全身毒性:SCR7(10 mg/kg)处理的小鼠未出现明显的体重减轻或器官损伤[1]
2. 器官组织学:肝脏/肾脏切片未见病理变化[1]
3. Na-SCR7-P 毒性:治疗剂量下未观察到明显的全身毒性[3]
参考文献

[1]. Cell . 2012 Dec 21;151(7):1474-87.

[2]. Nat Biotechnol . 2015 May;33(5):543-8.

[3]. Scientific Reports. 2017, 7, Article number: 8943.

其他信息
SCR7 是首个小分子 NHEJ 抑制剂,其开发目的是为了增强癌症治疗效果,提高细胞对 DNA 损伤剂的敏感性 [1]
- 在 CRISPR/Cas9 基因编辑中,SCR7 将 DSB 修复从易出错的 NHEJ 重定向到精确的 HDR,从而提高编辑效率 [2]
- 水溶性 Na-SCR7-P 保留了 NHEJ 抑制活性,同时提高了体内疗效并降低了毒性 [3]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H14N4OS
分子量
334.394961833954
精确质量
334.088
元素分析
C, 64.65; H, 4.22; N, 16.75; O, 4.78; S, 9.59
CAS号
1533426-72-0
相关CAS号
14892-97-8
PubChem CID
91885409
外观&性状
Yellow solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
644.9±65.0 °C at 760 mmHg
闪点
343.8±34.3 °C
蒸汽压
0.0±2.0 mmHg at 25°C
折射率
1.675
LogP
-0.22
tPSA
105.46
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
570
定义原子立体中心数目
0
SMILES
S=C1NC(C(=C(N=CC2C=CC=CC=2)N1)N=CC1C=CC=CC=1)=O |t:6,17|
InChi Key
NEEVCWPRIZJJRJ-LWRDCAMISA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H14N4OS/c23-17-15(19-11-13-7-3-1-4-8-13)16(21-18(24)22-17)20-12-14-9-5-2-6-10-14/h1-12H,(H2,21,22,23,24)/b19-11?,20-12+
化学名
5-(benzylideneamino)-6-[(E)-benzylideneamino]-2-sulfanylidene-1H-pyrimidin-4-one
别名

SCR-7; SCR 7; SCR7; 1533426-72-0; 5,6-bis((E)-benzylideneamino)-2-thioxo-2,3-dihydropyrimidin-4(1H)-one; 5-(benzylideneamino)-6-[(E)-benzylideneamino]-2-sulfanylidene-1H-pyrimidin-4-one; 4(1H)-Pyrimidinone, 2,3-dihydro-5,6-bis[(phenylmethylene)amino]-2-thioxo-; 5,6-bis[(E)-(phenylmethylidene)amino]-2-sulfanylidene-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-4-one; SCR7

HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~66 mg/mL (~198.6 mM)
Water: <1 mg/mL
Ethanol: ~3 mg/mL (~9.0 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.48 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.48 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + + 45% Saline
例如,若需制备1 mL的工作液,可取25mg/mL的DMSO储备液100μL,加入tO+400μL PEG300,混匀(澄清溶液);再向上述溶液中加入50μL Tween 80,混匀(澄清溶液);最后向上述溶液中加入450μL生理盐水,混匀(澄清溶液)。
生理盐水的配制:将0.9g氯化钠溶于ddH₂O中,定容至100mL,即得澄清澄清的生理盐水。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.9904 mL 14.9522 mL 29.9043 mL
5 mM 0.5981 mL 2.9904 mL 5.9809 mL
10 mM 0.2990 mL 1.4952 mL 2.9904 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Effects of small molecules on cell viability and cell cycle. Effects of small molecules (Scr7, L755507, and resveratrol) on (A) cell viability and (B) cell cycle. Scientific Reports. 2017, 7, Article number: 8943.
  • Structural and Functional Characterization of SCR7. Cell . 2012 Dec 21;151(7):1474-87.
  • Design, Synthesis, and Characterization of SCR7 and Its Effect on DNA End-Joining. Cell . 2012 Dec 21;151(7):1474-87.
  • verexpression and Purification of Ligases and Effect of SCR7 on DNA End-Joining Catalyzed by Liver and Kidney Extracts. Cell . 2012 Dec 21;151(7):1474-87.
  • Evaluation of SCR7 Binding to the DBD of Ligase IV and Its Effect on Binding to DSBs. Cell . 2012 Dec 21;151(7):1474-87.
  • Evaluation of the Effect and Specificity of SCR7 on NHEJ and Cytotoxicity within Cells. Cell . 2012 Dec 21;151(7):1474-87.
  • Effect of SCR7 on Tumor Progression in Mice Models Bearing Various Tumors. Cell . 2012 Dec 21;151(7):1474-87.
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