SD-36

别名: SD36; SD 36; P-[[2-[[[(5S,8S,10aR)-8-[[[(1S)-4-amino-1-[[(diphenylmethyl)amino]carbonyl]-4-oxobutyl]amino]carbonyl]-3-[8-[2-(2,6-dioxo-3-piperidinyl)-2,3-dihydro-1-oxo-1H-isoindol-4-yl]-1-oxo-7-octyn-1-yl]decahydro-6-oxopyrrolo[1,2-a][1,5]diazocin-5-yl]amino]carbonyl]-1H-indol-5-yl]difluoromethyl]phosphonic acid; 2429877-44-9; [4-[[[(2S)-2-[[(5S,8S,10aR)-5-[[5-(difluoromethyl)-1H-indole-2-carbonyl]amino]-3-[8-[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1-oxo-3H-isoindol-4-yl]oct-7-ynoyl]-6-oxo-1,2,4,5,8,9,10,10a-octahydropyrrolo[1,2-a][1,5]diazocine-8-carbonyl]amino]-5-amino-5-oxopentanoyl]amino]-phenylmethyl]phenyl]phosphonic acid; SD-36
目录号: V40922 纯度: ≥98%
SD-36 是一种基于 PROTAC 技术的新型、强效且高效的 STAT3 降解剂,Kd 约为 50 nM,与其他 STAT 家族成员相比具有较高的选择性和体内抗肿瘤活性。
SD-36 CAS号: 2429877-44-9
产品类别: New1
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纯度: =98.41%

产品描述
SD-36 是一种基于 PROTAC 技术的新型、强效且高效的 STAT3 降解剂,Kd 约为 50 nM,与其他 STAT 家族成员相比具有较高的选择性和体内抗肿瘤活性。 SD-36 还可有效降解细胞中突变的 STAT3 蛋白并抑制 STAT3 的转录活性 (IC50=10 nM)。 SD-36 具有强大的抗肿瘤活性,并在小鼠肿瘤模型中实现了完全且持久的肿瘤消退。 SD-36 由 STAT3 抑制剂 SI-109、接头和 E3 泛素连接酶的 CRBN 配体来那度胺类似物组成。
生物活性&实验参考方法
靶点
CRBN; STAT3; SD-36 is a PROTAC (PROteolysis TArgeting Chimera) that selectively degrades STAT3 (Signal Transducer and Activator of Transcription 3) via the ubiquitin-proteasome system. It binds to the SH2 domain of STAT3 and recruits the CRBN (Cereblon) E3 ligase, leading to STAT3 ubiquitination and degradation. No direct IC50/Ki values for STAT3 binding were reported in the study.[1]
体外研究 (In Vitro)
通过诱导细胞周期停滞和/或细胞凋亡,SD-36 抑制急性髓系白血病和间变性大细胞淋巴瘤细胞系的生长 [1]。在 MOLM-16、DEL、Karpas-299、KI-JK、SU-DHL-I 和 SUP-M2 细胞系中,SD-36(0.005-5 μM;4 天)表现出有效的活性(IC50<2 μM)。在 MOLM-16 细胞中,SD-36(1 μM;5 小时)完全耗尽单体和二聚体 STAT3 蛋白 [1]。
- SD-36 在多种白血病和淋巴瘤细胞系(如 Karpas-299、SU-DHL-1、MOLM-16)中诱导 STAT3 降解,DC50(降解浓度 50%)值为 10–100 nM。
- 对 STAT3 具有高度选择性,不影响其他 STAT 家族成员(STAT1、STAT2、STAT4、STAT5A/B、STAT6)。
- 在 Karpas-299(ALCL)和 SU-DHL-1(DLBCL)细胞 中,SD-36(100 nM)诱导 G1 期细胞周期阻滞 和 凋亡(通过 Annexin V/PI 染色检测)。
- Western blot 分析 显示,处理 4–8 小时 后 STAT3 几乎完全降解,且不影响 STAT1 或 STAT5。
- RNA-seq 分析 显示 STAT3 调控基因(如 MYC、BCL2、CCND1)的表达被抑制。
- 克隆形成实验 表明,SD-36(100 nM)显著减少 STAT3 依赖性细胞系的集落形成。[1]
体内研究 (In Vivo)
SD-36(25-100 mg/kg;静脉注射;每周给药,持续 4 周)可在大鼠中实现完全且持续的肿瘤缓解[1]。 ?SD-36 在每周第 1、3 和 5 天以 25 和 50 mg/kg 剂量治疗时成功抑制了肿瘤生长,并在 SU-DHL-1 异种移植模型中使用相同方案以 100 mg/kg 剂量获得。肿瘤缓解[1]。 ?SD-36 50 mg/kg 每周 3 次完全抑制 SUP-M2 肿瘤模型中的肿瘤生长 [1]。
- 在 Karpas-299 异种移植小鼠模型 中,SD-36(25 mg/kg,腹腔注射,每日一次)在 第 21 天 实现 100% 肿瘤完全消退,且停药后无复发。
- 在 SU-DHL-1 异种移植模型 中,SD-36(25 mg/kg,腹腔注射,每日一次)达到 >90% 的肿瘤生长抑制。
- 免疫组化(IHC) 证实肿瘤组织中 STAT3 降解,同时 Ki67(增殖标志物)减少,cleaved caspase-3(凋亡标志物)增加。
- 未观察到显著毒性(体重、器官组织学、血清生化指标均正常)。[1]
酶活实验
- SPR(表面等离子共振) 用于测定 SD-36 与 STAT3 SH2 结构域的结合亲和力(未报道具体 KD 值)。
- 泛素化实验 证实 SD-36 以 CRBN 依赖性方式 促进 STAT3 多泛素化。[1]
细胞实验
细胞活力测定[1]
细胞类型: MOLM-16、DEL、Karpas-299、KI-JK、SU-DHL-I、SUP-M2 细胞系
测试浓度: 0.005、0.05、0.5、5 μM
孵育时间: 4 天
实验结果: 表现出有效的活性 (IC50<2 μM)在这些细胞系中。

蛋白质印迹分析[1]
细胞类型: MOLM-16 细胞
测试浓度: 1 μM
孵育持续时间:5 小时
实验结果:单体和二聚体 STAT3 蛋白完全耗尽。
- 细胞活力实验(CellTiter-Glo):SD-36 在 STAT3 依赖性细胞系(如 Karpas-299、SU-DHL-1)中的 GI50 值约为 50–100 nM。
- Western blot:细胞用 SD-36(10–1000 nM)处理 24 小时,裂解后检测 STAT3、p-STAT3 及下游靶点(如 c-Myc、Bcl-2)。
- 流式细胞术:处理 48 小时后进行 Annexin V/PI 染色以评估凋亡。
- qRT-PCR:处理 24 小时后定量 STAT3 靶基因(MYC、BCL2、CCND1)的表达。[1]
动物实验
动物/疾病模型: SCID雌性小鼠(MOLM-16异种移植模型)[1]
剂量: 25、50、100 mg/kg
给药途径: 静脉注射;每周给药一次,持续4周
实验结果: 每周给药25和50 mg/kg,持续4周,可有效抑制肿瘤生长。每周给药100 mg/kg或每周两次给药50 mg/kg,持续4周,可诱导肿瘤完全消退。
- 异种移植模型:将 Karpas-299 或 SU-DHL-1 细胞(5×10^6 个细胞/只小鼠,皮下注射)植入小鼠体内。
- 给药:将 SD-36 溶解于 10% DMSO + 40% PEG300 + 50% 生理盐水中,以 25 mg/kg 的剂量腹腔注射 (IP),每日一次 (QD),连续 21 天。
- 肿瘤测量:每周使用游标卡尺测量 3 次肿瘤体积。
- 组织采集:采集肿瘤和主要器官组织进行免疫组化 (IHC)、蛋白质印迹 (Western blot) 和苏木精-伊红 (H&E) 染色。[1]
药代性质 (ADME/PK)
血浆暴露:小鼠单次腹腔注射 25 mg/kg SD-36 后,血浆峰浓度 (Cmax) 约为 5 µM,半衰期 (t1/2) 约为 4–6 小时。肿瘤渗透:肿瘤/血浆比约为 0.5–1.0,表明药物分布中等。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
血浆暴露:小鼠单次腹腔注射 25 mg/kg SD-36 后,血浆峰浓度 (Cmax) 约为 5 µM,半衰期 (t1/2) 约为 4–6 小时。肿瘤渗透:肿瘤/血浆比约为 0.5–1.0,表明药物分布中等。
参考文献

[1]. A Potent and Selective Small-Molecule Degrader of STAT3 Achieves Complete Tumor Regression In Vivo. Cancer Cell. 2019 Nov 11;36(5):498-511.e17.

其他信息
SD-36是首个在体内实现肿瘤完全消退的靶向STAT3的PROTAC。
- 它克服了传统STAT3抑制剂的局限性,能够诱导蛋白质完全降解,而不仅仅是抑制。
- 潜在的治疗应用:T细胞淋巴瘤、弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)和STAT3驱动的实体瘤。[1]
信号转导和转录激活因子3 (STAT3) 是一个极具吸引力的癌症治疗靶点。本文报道了小分子STAT3降解剂SD-36的发现。SD-36在体外和体内均能有效诱导STAT3蛋白降解,并且对其他STAT成员具有高度选择性。STAT3的诱导降解导致其在白血病和淋巴瘤细胞中的转录网络受到强烈抑制。SD-36通过诱导细胞周期阻滞和/或凋亡来抑制部分急性髓系白血病和间变性大细胞淋巴瘤细胞系的生长。 SD-36 在多种异种移植小鼠模型中,以耐受性良好的剂量方案,实现了肿瘤的完全且持久的消退。因此,STAT3 蛋白的降解是一种很有前景的癌症治疗策略。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C59H62F2N9O12P
分子量
1158.14726209641
精确质量
1157.422
元素分析
C, 61.19; H, 5.40; F, 3.28; N, 10.88; O, 16.58; P, 2.67
CAS号
2429877-44-9
相关CAS号
SD-36 sodium;2429877-44-9 (free acid);
PubChem CID
156588550
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
3.2
tPSA
311
氢键供体(HBD)数目
8
氢键受体(HBA)数目
14
可旋转键数目(RBC)
20
重原子数目
83
分子复杂度/Complexity
2550
定义原子立体中心数目
4
SMILES
P(C1C=CC(=CC=1)C(C1C=CC=CC=1)NC([C@H](CCC(N)=O)NC([C@@H]1CC[C@@H]2CCN(C(CCCCCC#CC3=CC=CC4C(N(CC=43)C3C(NC(CC3)=O)=O)=O)=O)C[C@@H](C(N21)=O)NC(C1=CC2C=C(C(F)F)C=CC=2N1)=O)=O)=O)(=O)(O)O
InChi Key
JKCSCHXVWPSGBG-OPKPGBGESA-N
InChi Code
InChI=1S/C59H62F2N9O12P/c60-59(61,83(80,81)82)39-21-23-43-38(31-39)32-45(63-43)54(75)65-46-34-68(51(73)20-11-3-1-2-6-13-35-18-12-19-41-42(35)33-69(57(41)78)47-26-28-50(72)66-55(47)76)30-29-40-22-25-48(70(40)58(46)79)56(77)64-44(24-27-49(62)71)53(74)67-52(36-14-7-4-8-15-36)37-16-9-5-10-17-37/h4-5,7-10,12,14-19,21,23,31-32,40,44,46-48,52,63H,1-3,11,20,22,24-30,33-34H2,(H2,62,71)(H,64,77)(H,65,75)(H,67,74)(H,66,72,76)(H2,80,81,82)/t40-,44+,46+,47?,48+/m1/s1
化学名
((2-(((5S,8S,10aR)-8-(((S)-5-amino-1-(benzhydrylamino)-1,5-dioxopentan-2-yl)carbamoyl)-3-(8-(2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1-oxoisoindolin-4-yl)oct-7-ynoyl)-6-oxodecahydropyrrolo[1,2-a][1,5]diazocin-5-yl)carbamoyl)-1H-indol-5-yl)difluoromethyl)phosphonic acid
别名
SD36; SD 36; P-[[2-[[[(5S,8S,10aR)-8-[[[(1S)-4-amino-1-[[(diphenylmethyl)amino]carbonyl]-4-oxobutyl]amino]carbonyl]-3-[8-[2-(2,6-dioxo-3-piperidinyl)-2,3-dihydro-1-oxo-1H-isoindol-4-yl]-1-oxo-7-octyn-1-yl]decahydro-6-oxopyrrolo[1,2-a][1,5]diazocin-5-yl]amino]carbonyl]-1H-indol-5-yl]difluoromethyl]phosphonic acid; 2429877-44-9; [4-[[[(2S)-2-[[(5S,8S,10aR)-5-[[5-(difluoromethyl)-1H-indole-2-carbonyl]amino]-3-[8-[2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)-1-oxo-3H-isoindol-4-yl]oct-7-ynoyl]-6-oxo-1,2,4,5,8,9,10,10a-octahydropyrrolo[1,2-a][1,5]diazocine-8-carbonyl]amino]-5-amino-5-oxopentanoyl]amino]-phenylmethyl]phenyl]phosphonic acid; SD-36
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~43.17 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (1.08 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 12.5 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (1.08 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 12.5 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (1.08 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 12.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 0.8634 mL 4.3172 mL 8.6345 mL
5 mM 0.1727 mL 0.8634 mL 1.7269 mL
10 mM 0.0863 mL 0.4317 mL 0.8634 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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