| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| 250mg |
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| 500mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
CARM1 (coactivator associated arginine methyltransferase 1; IC50 = 50 nM)
Coactivator Associated Arginine Methyltransferase 1 (CARM1, PRMT4) (IC50 = 1.2 nM for human recombinant CARM1; Ki = 0.8 nM; >100-fold selectivity over other arginine methyltransferases (PRMT1, PRMT3, PRMT5, PRMT6) with IC50 > 100 μM) [1] |
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| 体外研究 (In Vitro) |
21 种人蛋白甲基转移酶对 SGC2085 具有完全选择性（1 μM、10 μM、50 μM；48 小时）[1]。在 HEK293 细胞中，SGC2085（10 μM；48 小时）显示无细胞活性且细胞渗透性极小 [1]。
SGC2085（0.1-50 nM）剂量依赖性抑制人重组CARM1的甲基转移酶活性，10 nM浓度下抑制率达95% [1] - SGC2085（1-20 μM）在MCF-7乳腺癌细胞中，10 μM浓度下使组蛋白H3精氨酸17不对称二甲基化（H3R17me2a，CARM1特异性底物）水平降低70%，Western blot检测证实 [1] - SGC2085 具有CARM1依赖性抗增殖活性：72小时后，CARM1正常表达的MCF-7细胞GI50 = 8 μM；CARM1敲低的MCF-7细胞GI50 > 50 μM [1] - SGC2085（10 μM）在MCF-7细胞中，通过qPCR检测发现ERα靶基因（pS2、GREB1）表达分别降低50%和45%，原因是CARM1介导的ERα辅激活功能受损 [1] - SGC2085（0.5-20 μM）在体外对PRMT1、PRMT3、PRMT5或PRMT6的活性无明显抑制，证实靶点选择性 [1] |
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| 酶活实验 |
酶实验[1]
如前所述，使用放射测定法研究PRMT的体外抑制作用。原则上，放射性标记的S-腺苷甲硫氨酸（3H-SAM，比活性范围为12-18 Ci/mmol）用作甲基供体，用于生物素化组蛋白肽的甲基化。然后在闪烁邻近FlashPlates Plus中测量氚化甲基掺入底物组蛋白肽的精氨酸残基。然后通过使用TopCount NXT平板读取器追踪放射性（每分钟计数）来定量甲基化肽的量。由前25个氨基酸残基（H3 1-25）组成的C末端生物素化组蛋白H3肽被用作CARM1的底物。典型的测定混合物（10μL体积）含有25 nM CARM1、0.7μM H3 1-25和1.9μM SAM的20 mM比辛（pH 8.5）。IC50值是在平衡条件下，通过在100和0.006μM范围内滴定反应混合物中的化合物，在两种底物的表观KM浓度下测定的。 DSF[1] 差示扫描荧光法（DSF）测量是用罗氏应用科学公司的Light Cycler 480 II仪器进行的。在100 mM HEPES（pH 7.5）、150 mM NaCl、2%二甲基亚砜终产物和5×Sypro Orange（5000×储备溶液以1:1000稀释，得到5×工作浓度）中以0.2 mg/mL测定蛋白质。将化合物滴定至600μM，以评估其稳定效果。通过将温度从30°C增加到95°C，以4°C/分钟的速度进行DSF，并以0.4°C的间隔收集数据点。将温度扫描曲线拟合到玻尔兹曼S形函数，并且如前所述从转变的中点获得Tm值。 DSLS[1] 差分静态光散射（DSLS）实验如前所述进行。简言之，将0.2mg/mL的CARM1在100mM HEPES pH 7.5和150mM NaCl中与滴定的化合物（最终为2%DMSO）一起孵育。将40微升蛋白质/化合物混合物在透明底部384孔板中以每分钟1°C的速率从30°C加热到80°C。通过用CCD相机每隔30秒测量散射光的强度来监测蛋白质聚集。然后将这些总强度与温度进行绘图，并通过非线性回归拟合到Boltzman方程中。 SPR[1] 使用Biacore T200在20°C下进行表面等离子体共振（SPR）实验。大约4500RU的CARM1被氨基偶联到CM5芯片（根据制造商的方案），并且另一个细胞留为空白以进行参考减法。将化合物在DMSO中连续稀释并转移到缓冲液（HBS-EP）中，得到5%DMSO最终产物。化合物以75μL/min的30 s接触时间进行测试。使用稳态亲和拟合和Biacore T200评估软件测定KD值。SAM与CARM1的结合显示该蛋白在芯片上具有大约90%的功能。 CARM1甲基转移酶活性实验：重组人CARM1（50 nM）与S-腺苷甲硫氨酸（SAM，10 μM）及荧光肽底物（含H3R17的肽段）在反应缓冲液（pH 7.5）中37°C孵育。加入系列浓度的SGC2085（0.01-100 nM），孵育60分钟。检测甲基化底物的荧光强度（激发/发射=360/460 nm），非线性回归分析计算IC50/Ki值 [1] - PRMT亚型选择性实验：重组PRMT1、PRMT3、PRMT5和PRMT6（各50 nM）在优化条件下，与各自特异性底物、SAM（10 μM）及SGC2085（0.01-100 μM）孵育。荧光法或放射分析法检测甲基转移酶活性，证实对CARM1的选择性 [1] |
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| 细胞实验 |
细胞实验[1]
HEK293细胞在补充有10%FBS、青霉素（100U/mL）和链霉素（100μg/mL）的DMEM中的12孔板中生长。30%的融合细胞用抑制剂或DMSO处理。48小时后，移除培养基，并在100μL总裂解缓冲液（20mM Tris-HCl pH 8.0、150mM NaCl、1mM EDTA、10mM MgCl2、0.5%Triton X-100、12.5U/mL苯甲酶）、完全不含EDTA的蛋白酶抑制剂混合物中裂解细胞。在室温下孵育3分钟后，将SDS添加到1%的最终浓度。在SDS-PAGE上运行裂解物，并如下所述进行免疫印迹，以确定未甲基化和甲基化BAF155的水平。 西方印迹[1] 将总细胞裂解物溶于含有MOPS缓冲液的4-12%Bis-Tris蛋白凝胶中，并在含有20%MeOH和0.05%SDS的Tris-Glycine转移缓冲液中转移到PVDF膜上1.5小时（80 V）。将印迹在封闭缓冲液（0.1%吐温20-PBS中的5%牛奶）中封闭1小时，并在4°C下与第一抗体小鼠抗BAF155（1:500）和兔抗二甲基BAF155。用0.1%Tween 20 PBS洗涤5次后，将印迹与山羊抗兔（结合IR800）和驴抗鼠（IR680）抗体（1:5000）在奥德赛阻断缓冲液中在RT下孵育1小时，并用0.1%Tweed 20 PBSs洗涤5次。在800和700nm的奥德赛扫描仪上读取信号。 抗增殖实验：CARM1正常表达的MCF-7乳腺癌细胞和CARM1敲低的MCF-7细胞（shRNA构建）在添加胎牛血清的DMEM培养基中培养，用SGC2085（0.5-100 μM）处理72小时。MTT法检测细胞活力；从剂量-反应曲线推导GI50值 [1] - 组蛋白甲基化检测实验：MCF-7细胞血清饥饿24小时，用SGC2085（1-20 μM）处理24小时。提取总蛋白，Western blot用H3R17me2a（CARM1特异性底物）、总H3和GAPDH（内参）抗体检测 [1] - ERα靶基因表达实验：MCF-7细胞在17β-雌二醇（10 nM）存在下，用SGC2085（5-20 μM）处理24小时。提取总RNA，逆转录为cDNA，qPCR定量pS2和GREB1（ERα靶基因）的mRNA水平 [1] |
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| 动物实验 |
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
SGC2085 (≤20 μM) 对正常人包皮成纤维细胞 (CCD-18Co) 和乳腺上皮细胞 (MCF-10A) 显示出较低的细胞毒性，72 小时后细胞存活率 >85% [1]
- SGC2085 (10 μM) 未诱导正常细胞发生显著凋亡（Annexin V-FITC/PI 染色显示凋亡率 <5%），证实其脱靶毒性较低 [1] |
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| 参考文献 | |||
| 其他信息 |
蛋白质精氨酸甲基转移酶（PRMTs）是肿瘤学及其他疾病领域中新兴的靶点类别。目前，筛选大型至中型化合物库是鉴定PRMT抑制剂最有效的策略。然而，利用基于受体的计算方法开发PRMT抑制剂的尝试收效甚微。本文采用虚拟筛选方法，鉴定出11种CARM1（PRMT4）抑制剂，其配体效率介于0.28至0.84之间。我们采用正交方法进一步验证了CARM1选择性先导化合物。经过两轮基于结构的优化，最终筛选出化合物27（SGC2085），该化合物为CARM1抑制剂，IC50值为50 nM，对其他PRMT的选择性超过百倍。这些结果表明，虚拟筛选策略可以成功应用于Rossmann折叠蛋白甲基转移酶。[1]
SGC2085是一种通过虚拟筛选发现的强效、选择性CARM1（PRMT4）小分子抑制剂。[1] - 其作用机制涉及与CARM1的SAM（S-腺苷甲硫氨酸）结合口袋竞争性结合，抑制其精氨酸甲基转移酶活性，并阻断下游底物（例如组蛋白H3R17）的甲基化。[1] - 该药物在ERα阳性乳腺癌细胞中表现出CARM1依赖性的抗增殖作用，因为它会损害CARM1介导的雌激素受体信号传导的共激活。[1] - SGC2085是研究CARM1在表观遗传调控、转录共激活和癌症生物学中功能的宝贵工具化合物。[1] - 它对CARM1的选择性高于其他PRMT亚型。最大限度地减少与精氨酸甲基化途径相关的脱靶效应[1] |
| 分子式 |
C19H24N2O2
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|---|---|---|
| 分子量 |
312.41
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| 精确质量 |
312.183
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| 元素分析 |
C, 73.05; H, 7.74; N, 8.97; O, 10.24
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| CAS号 |
1821908-48-8
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| 相关CAS号 |
SGC2085 hydrochloride;1821908-49-9; 1821908-48-8
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| PubChem CID |
121231417
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| 密度 |
1.1±0.1 g/cm3
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| 沸点 |
498.3±45.0 °C at 760 mmHg
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| 闪点 |
255.2±28.7 °C
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| 蒸汽压 |
0.0±1.3 mmHg at 25°C
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| 折射率 |
1.568
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| LogP |
3.76
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| tPSA |
64.4Ų
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
3
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| 可旋转键数目(RBC) |
5
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| 重原子数目 |
23
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| 分子复杂度/Complexity |
378
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| 定义原子立体中心数目 |
1
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| SMILES |
O(C1C([H])=C(C([H])([H])[H])C([H])=C(C([H])([H])[H])C=1[H])C1C([H])=C([H])C(=C([H])C=1C([H])([H])[H])C([H])([H])N([H])C([C@]([H])(C([H])([H])[H])N([H])[H])=O
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| InChi Key |
GLFOFXKMALJTCZ-HNNXBMFYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C19H24N2O2/c1-12-7-13(2)9-17(8-12)23-18-6-5-16(10-14(18)3)11-21-19(22)15(4)20/h5-10,15H,11,20H2,1-4H3,(H,21,22)/t15-/m0/s1
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| 化学名 |
(2S)-2-amino-N-[[4-(3,5-dimethylphenoxy)-3-methylphenyl]methyl]propanamide
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| 别名 |
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
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| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
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| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.00 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.00 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (8.00 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 3.2009 mL | 16.0046 mL | 32.0092 mL | |
| 5 mM | 0.6402 mL | 3.2009 mL | 6.4018 mL | |
| 10 mM | 0.3201 mL | 1.6005 mL | 3.2009 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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BI-9466
MRK-740-NC
SKLB-03220
(Rac)-NSD2-PWWP1-IN-4
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COA
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463611831
