SGC2085 HCl

别名: SGC2085 HCl; SGC-2085 hydrochloride; SGC 2085
目录号: V2107 纯度: ≥98%
通过虚拟筛选方法鉴定的 SGC2085 HCl 是一种有效的选择性共激活剂相关精氨酸甲基转移酶 1 (CARM1) 抑制剂,IC50 为 50 nM。
SGC2085 HCl CAS号: 1821908-49-9
产品类别: Histone Methyltransferase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
Other Sizes

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  • SGC2085
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
通过虚拟筛选方法鉴定的 SGC2085 HCl 是一种有效的选择性共激活剂相关精氨酸甲基转移酶 1 (CARM1) 抑制剂,IC50 为 50 nM。蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMT)代表了肿瘤学和其他疾病领域的新兴靶标类别。迄今为止,识别 PRMT 抑制剂最成功的策略是筛选大中型化学库。使用基于受体的计算方法开发 PRMT 抑制剂的尝试取得了有限的成功。 SGC2085 在 R1 位上有一个甲基,在 R2 位上有一个 3,5-二甲基苯氧基,对 CARM1 的 IC50 为 50 nM,并且对 CARM1 的选择性是 PRMT6 的 100 多倍。这些结果表明,R1 上取代基的存在对于 CARM1 的有效和选择性抑制至关重要。除 PRMT6 (IC50=5.2 μM) 外,SGC2085 不抑制其他 PRMT。
生物活性&实验参考方法
靶点
CARM1 (coactivator associated arginine methyltransferase 1; IC50 = 50 nM)
体外研究 (In Vitro)
对于 21 种人类蛋白甲基转移酶,SGC2085 盐酸盐(1 μM、10 μM、50 μM;48 小时)表现出完全的选择性 [1]。在 HEK293 细胞中,SGC2085 盐酸盐(10 μM;48 小时)显示没有细胞活性且细胞渗透性极小 [1]。
酶活实验
酶实验[1]
如前所述,使用放射测定法研究PRMT的体外抑制作用。原则上,放射性标记的S-腺苷甲硫氨酸(3H-SAM,比活性范围为12-18 Ci/mmol)用作甲基供体,用于生物素化组蛋白肽的甲基化。然后在闪烁邻近FlashPlates Plus中测量氚化甲基掺入底物组蛋白肽的精氨酸残基。然后通过使用TopCount NXT平板读取器追踪放射性(每分钟计数)来定量甲基化肽的量。由前25个氨基酸残基(H3 1-25)组成的C末端生物素化组蛋白H3肽被用作CARM1的底物。典型的测定混合物(10μL体积)含有25 nM CARM1、0.7μM H3 1-25和1.9μM SAM的20 mM比辛(pH 8.5)。IC50值是在平衡条件下,通过在100和0.006μM范围内滴定反应混合物中的化合物,在两种底物的表观KM浓度下测定的。
DSF[1]
差示扫描荧光法(DSF)测量是用罗氏应用科学公司的Light Cycler 480 II仪器进行的。在100 mM HEPES(pH 7.5)、150 mM NaCl、2%二甲基亚砜终产物和5×Sypro Orange(5000×储备溶液以1:1000稀释,得到5×工作浓度)中以0.2 mg/mL测定蛋白质。将化合物滴定至600μM,以评估其稳定效果。通过将温度从30°C增加到95°C,以4°C/分钟的速度进行DSF,并以0.4°C的间隔收集数据点。将温度扫描曲线拟合到玻尔兹曼S形函数,并且如前所述从转变的中点获得Tm值。
DSLS[1]
差分静态光散射(DSLS)实验如前所述进行。简言之,将0.2mg/mL的CARM1在100mM HEPES pH 7.5和150mM NaCl中与滴定的化合物(最终为2%DMSO)一起孵育。将40微升蛋白质/化合物混合物在透明底部384孔板中以每分钟1°C的速率从30°C加热到80°C。通过用CCD相机每隔30秒测量散射光的强度来监测蛋白质聚集。然后将这些总强度与温度进行绘图,并通过非线性回归拟合到Boltzman方程中。
SPR[1]
使用Biacore T200在20°C下进行表面等离子体共振(SPR)实验。大约4500RU的CARM1被氨基偶联到CM5芯片(根据制造商的方案),并且另一个细胞留为空白以进行参考减法。将化合物在DMSO中连续稀释并转移到缓冲液(HBS-EP)中,得到5%DMSO最终产物。化合物以75μL/min的30 s接触时间进行测试。使用稳态亲和拟合和Biacore T200评估软件测定KD值。SAM与CARM1的结合显示该蛋白在芯片上具有大约90%的功能。
细胞实验
细胞实验[1]
HEK293细胞在补充有10%FBS、青霉素(100U/mL)和链霉素(100μg/mL)的DMEM中的12孔板中生长。30%的融合细胞用抑制剂或DMSO处理。48小时后,移除培养基,并在100μL总裂解缓冲液(20mM Tris-HCl pH 8.0、150mM NaCl、1mM EDTA、10mM MgCl2、0.5%Triton X-100、12.5U/mL苯甲酶)、完全不含EDTA的蛋白酶抑制剂混合物中裂解细胞。在室温下孵育3分钟后,将SDS添加到1%的最终浓度。在SDS-PAGE上运行裂解物,并如下所述进行免疫印迹,以确定未甲基化和甲基化BAF155的水平。
西方印迹[1]
将总细胞裂解物溶于含有MOPS缓冲液的4-12%Bis-Tris蛋白凝胶中,并在含有20%MeOH和0.05%SDS的Tris-Glycine转移缓冲液中转移到PVDF膜上1.5小时(80 V)。将印迹在封闭缓冲液(0.1%吐温20-PBS中的5%牛奶)中封闭1小时,并在4°C下与第一抗体小鼠抗BAF155(1:500)和兔抗二甲基BAF155。用0.1%Tween 20 PBS洗涤5次后,将印迹与山羊抗兔(结合IR800)和驴抗鼠(IR680)抗体(1:5000)在奥德赛阻断缓冲液中在RT下孵育1小时,并用0.1%Tweed 20 PBSs洗涤5次。在800和700nm的奥德赛扫描仪上读取信号。
动物实验


参考文献
2016 Jul 28;59(14):6838-47.
其他信息
蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMTs)是肿瘤学和其他疾病领域中新兴的靶点类别。目前,筛选大型至中型化合物库是鉴定PRMT抑制剂最成功的策略。利用基于受体的计算方法开发PRMT抑制剂的尝试收效甚微。本文采用虚拟筛选方法,鉴定出11个CARM1(PRMT4)抑制剂,其配体效率范围为0.28至0.84。通过正交方法进一步验证了CARM1选择性先导化合物。经过两轮基于结构的优化,最终筛选出化合物27(SGC2085),该化合物为CARM1抑制剂,IC50值为50 nM,对其他PRMT的选择性超过100倍。这些结果表明,虚拟筛选策略可以成功应用于Rossmann折叠蛋白质甲基转移酶的研究。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H25CLN2O2
分子量
348.867004156113
精确质量
348.16
元素分析
C, 65.41; H, 7.22; Cl, 10.16; N, 8.03; O, 9.17
CAS号
1821908-49-9
相关CAS号
SGC2085;1821908-48-8
PubChem CID
124081151
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
tPSA
64.4Ų
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
378
定义原子立体中心数目
1
SMILES
CC1=CC(=CC(=C1)OC2=C(C=C(C=C2)CNC(=O)[C@H](C)N)C)C.Cl
InChi Key
OQGSBQJSJRLNQH-RSAXXLAASA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H24N2O2.ClH/c1-12-7-13(2)9-17(8-12)23-18-6-5-16(10-14(18)3)11-21-19(22)15(4)20;/h5-10,15H,11,20H2,1-4H3,(H,21,22);1H/t15-;/m0./s1
化学名
(S)-2-amino-N-(4-(3,5-dimethylphenoxy)-3-methylbenzyl)propanamide hydrochloride
别名
SGC2085 HCl; SGC-2085 hydrochloride; SGC 2085
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: >62 mg/mL (198.45 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:62 mg/mL (198.45 mM)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.8664 mL 14.3320 mL 28.6640 mL
5 mM 0.5733 mL 2.8664 mL 5.7328 mL
10 mM 0.2866 mL 1.4332 mL 2.8664 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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