| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
CARM1 (coactivator associated arginine methyltransferase 1; IC50 = 50 nM)
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| 体外研究 (In Vitro) |
对于 21 种人类蛋白甲基转移酶,SGC2085 盐酸盐(1 μM、10 μM、50 μM;48 小时)表现出完全的选择性 [1]。在 HEK293 细胞中,SGC2085 盐酸盐(10 μM;48 小时)显示没有细胞活性且细胞渗透性极小 [1]。
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| 酶活实验 |
酶实验[1]
如前所述,使用放射测定法研究PRMT的体外抑制作用。原则上,放射性标记的S-腺苷甲硫氨酸(3H-SAM,比活性范围为12-18 Ci/mmol)用作甲基供体,用于生物素化组蛋白肽的甲基化。然后在闪烁邻近FlashPlates Plus中测量氚化甲基掺入底物组蛋白肽的精氨酸残基。然后通过使用TopCount NXT平板读取器追踪放射性(每分钟计数)来定量甲基化肽的量。由前25个氨基酸残基(H3 1-25)组成的C末端生物素化组蛋白H3肽被用作CARM1的底物。典型的测定混合物(10μL体积)含有25 nM CARM1、0.7μM H3 1-25和1.9μM SAM的20 mM比辛(pH 8.5)。IC50值是在平衡条件下,通过在100和0.006μM范围内滴定反应混合物中的化合物,在两种底物的表观KM浓度下测定的。 DSF[1] 差示扫描荧光法(DSF)测量是用罗氏应用科学公司的Light Cycler 480 II仪器进行的。在100 mM HEPES(pH 7.5)、150 mM NaCl、2%二甲基亚砜终产物和5×Sypro Orange(5000×储备溶液以1:1000稀释,得到5×工作浓度)中以0.2 mg/mL测定蛋白质。将化合物滴定至600μM,以评估其稳定效果。通过将温度从30°C增加到95°C,以4°C/分钟的速度进行DSF,并以0.4°C的间隔收集数据点。将温度扫描曲线拟合到玻尔兹曼S形函数,并且如前所述从转变的中点获得Tm值。 DSLS[1] 差分静态光散射(DSLS)实验如前所述进行。简言之,将0.2mg/mL的CARM1在100mM HEPES pH 7.5和150mM NaCl中与滴定的化合物(最终为2%DMSO)一起孵育。将40微升蛋白质/化合物混合物在透明底部384孔板中以每分钟1°C的速率从30°C加热到80°C。通过用CCD相机每隔30秒测量散射光的强度来监测蛋白质聚集。然后将这些总强度与温度进行绘图,并通过非线性回归拟合到Boltzman方程中。 SPR[1] 使用Biacore T200在20°C下进行表面等离子体共振(SPR)实验。大约4500RU的CARM1被氨基偶联到CM5芯片(根据制造商的方案),并且另一个细胞留为空白以进行参考减法。将化合物在DMSO中连续稀释并转移到缓冲液(HBS-EP)中,得到5%DMSO最终产物。化合物以75μL/min的30 s接触时间进行测试。使用稳态亲和拟合和Biacore T200评估软件测定KD值。SAM与CARM1的结合显示该蛋白在芯片上具有大约90%的功能。 |
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| 细胞实验 |
细胞实验[1]
HEK293细胞在补充有10%FBS、青霉素(100U/mL)和链霉素(100μg/mL)的DMEM中的12孔板中生长。30%的融合细胞用抑制剂或DMSO处理。48小时后,移除培养基,并在100μL总裂解缓冲液(20mM Tris-HCl pH 8.0、150mM NaCl、1mM EDTA、10mM MgCl2、0.5%Triton X-100、12.5U/mL苯甲酶)、完全不含EDTA的蛋白酶抑制剂混合物中裂解细胞。在室温下孵育3分钟后,将SDS添加到1%的最终浓度。在SDS-PAGE上运行裂解物,并如下所述进行免疫印迹,以确定未甲基化和甲基化BAF155的水平。 西方印迹[1] 将总细胞裂解物溶于含有MOPS缓冲液的4-12%Bis-Tris蛋白凝胶中,并在含有20%MeOH和0.05%SDS的Tris-Glycine转移缓冲液中转移到PVDF膜上1.5小时(80 V)。将印迹在封闭缓冲液(0.1%吐温20-PBS中的5%牛奶)中封闭1小时,并在4°C下与第一抗体小鼠抗BAF155(1:500)和兔抗二甲基BAF155。用0.1%Tween 20 PBS洗涤5次后,将印迹与山羊抗兔(结合IR800)和驴抗鼠(IR680)抗体(1:5000)在奥德赛阻断缓冲液中在RT下孵育1小时,并用0.1%Tweed 20 PBSs洗涤5次。在800和700nm的奥德赛扫描仪上读取信号。 |
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| 动物实验 |
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| 参考文献 |
J Med Chem.2016 Jul 28;59(14):6838-47.
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| 其他信息 |
蛋白质精氨酸甲基转移酶(PRMTs)是肿瘤学和其他疾病领域中新兴的靶点类别。目前,筛选大型至中型化合物库是鉴定PRMT抑制剂最成功的策略。利用基于受体的计算方法开发PRMT抑制剂的尝试收效甚微。本文采用虚拟筛选方法,鉴定出11个CARM1(PRMT4)抑制剂,其配体效率范围为0.28至0.84。通过正交方法进一步验证了CARM1选择性先导化合物。经过两轮基于结构的优化,最终筛选出化合物27(SGC2085),该化合物为CARM1抑制剂,IC50值为50 nM,对其他PRMT的选择性超过100倍。这些结果表明,虚拟筛选策略可以成功应用于Rossmann折叠蛋白质甲基转移酶的研究。[1]
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| 分子式 |
C19H25CLN2O2
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|---|---|---|
| 分子量 |
348.867004156113
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| 精确质量 |
348.16
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| 元素分析 |
C, 65.41; H, 7.22; Cl, 10.16; N, 8.03; O, 9.17
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| CAS号 |
1821908-49-9
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| 相关CAS号 |
SGC2085;1821908-48-8
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| PubChem CID |
124081151
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| 外观&性状 |
Typically exists as solid at room temperature
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| tPSA |
64.4Ų
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| 氢键供体(HBD)数目 |
3
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| 氢键受体(HBA)数目 |
3
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| 可旋转键数目(RBC) |
5
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| 重原子数目 |
24
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| 分子复杂度/Complexity |
378
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| 定义原子立体中心数目 |
1
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| SMILES |
CC1=CC(=CC(=C1)OC2=C(C=C(C=C2)CNC(=O)[C@H](C)N)C)C.Cl
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| InChi Key |
OQGSBQJSJRLNQH-RSAXXLAASA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C19H24N2O2.ClH/c1-12-7-13(2)9-17(8-12)23-18-6-5-16(10-14(18)3)11-21-19(22)15(4)20;/h5-10,15H,11,20H2,1-4H3,(H,21,22);1H/t15-;/m0./s1
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| 化学名 |
(S)-2-amino-N-(4-(3,5-dimethylphenoxy)-3-methylbenzyl)propanamide hydrochloride
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| 别名 |
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
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| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
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| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.8664 mL | 14.3320 mL | 28.6640 mL | |
| 5 mM | 0.5733 mL | 2.8664 mL | 5.7328 mL | |
| 10 mM | 0.2866 mL | 1.4332 mL | 2.8664 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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