SR-2211

别名: SR2211; SR 2211; SR2211; 1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-[3-fluoro-4-[4-[[4-(pyridin-4-ylmethyl)piperazin-1-yl]methyl]phenyl]phenyl]propan-2-ol; 1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-(3-fluoro-4-(4-((4-(pyridin-4-ylmethyl)piperazin-1-yl)methyl)phenyl)phenyl)propan-2-ol; RefChem:185198; 1359164-11-6; SR-2211 2-氟-4-[[4-(4-吡啶甲基)-1-哌嗪]甲基]-α,α-双(三氟甲基)-[1,1-联苯]-4-甲醇
目录号: V7906 纯度: ≥98%
SR2211 是一种有效的选择性 RORγ 合成调节剂,可作为反向激动剂,Ki 为 105 nM,IC50 约为 320 nM。
SR-2211 CAS号: 1359164-11-6
产品类别: New1
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产品描述
SR2211 是一种有效的选择性 RORγ 合成调节剂,可作为反向激动剂,Ki 为 105 nM,IC50 约为 320 nM。
生物活性&实验参考方法
靶点
Retinoic acid receptor-related orphan receptor γ (RORγ) [1, 2].
Ki: 105 nM (for RORγ) [1].
体外研究 (In Vitro)
SR2211 处理 EL4 后 IL-17 基因表达降低。同样,SR2211 显着降低了 IL-23 受体 (Il23r) 的表达。当用 SR2211 处理 EL-4 细胞时,与用媒介物处理的细胞相比,IL-17 细胞内染色显着减少 [1]。
在放射性配体结合实验中,SR2211 可以置换与 GST-RORγ-LBD 结合的 [³H]-T0901317,计算得到的 Kᵢ 值为 105 nM [1]。
在基于细胞的 Gal4 共转染实验中,SR2211 抑制 Gal4-RORγ LBD 的转录活性,IC₅₀ 约为 320 nM。在 10 μM 浓度下,对 Gal4-RORα、Gal4-LXRα、Gal4-FXR 或 Gal4-VP16 对照的转录活性无显著影响 [1]。
在使用 5X-RORE 荧光素酶报告基因的全长 RORγ 报告实验中,SR2211 以 RORγ 依赖性方式显著抑制荧光素酶活性 [1]。
在使用 IL-17 荧光素酶报告基因的天然启动子实验中,SR2211 以 RORγ 依赖性方式抑制了由 IL-17 启动子驱动的转录活性,抑制率超过 50% [1]。
在 EL-4 小鼠 T 淋巴细胞中,用 5 μM SR2211 预处理后,再使用 PMA/离子霉素刺激,通过定量实时 PCR 检测发现,内源性 IL-17A 和 IL-23R 的 mRNA 表达显著降低。SR2211 对 IL-17A 基因表达的抑制作用强于地高辛 [1]。
在 EL-4 细胞中,通过流式细胞术进行细胞内细胞因子染色,结果显示,在 PMA/离子霉素刺激后,用 5 μM SR2211 处理可显著抑制 IL-17 蛋白的产生 [1]。
在荧光素酶报告基因实验(使用转染了 RORγ 的 HEK293 细胞)中,SR2211 显示出抑制活性,IC₅₀ 为 0.11 ± 0.03 μM [2]。
在热位移实验中,SR2211 稳定了 RORγ-LBD 蛋白,导致 ΔTm 为 6.50 °C [2]。
在测量 RORγ-LBD 与 SRC1 共激活因子肽相互作用的 AlphaScreen 实验中,SR2211 的 IC₅₀ 为 0.91 ± 0.07 μM [2]。
酶活实验
放射性配体结合实验 (SPA):该实验以闪烁亲近分析技术形式进行。反应混合物包含 0.25 mg 谷胱甘肽 YSI 微珠、1 μg GST-RORγ-LBD、5 nM [³H]-T0901317 作为放射性配体,以及不同浓度的 SR2211,反应缓冲液为 (50 mM HEPES, pH 7.4, 0.01% 牛血清白蛋白, 150 mM NaCl, 5 mM MgCl₂, 10% 甘油, 1 mM DTT 和蛋白酶抑制剂混合物)。所有成分轻柔混合后孵育 20 小时,然后在 TopCount 仪器上读取信号。通过分析结合数据计算 Kᵢ 值 [1]。
氢/氘交换质谱分析:使用自动化系统进行溶液相酰胺氢/氘交换实验。将 4 μL 10 μM 的 RORγ-LBD 蛋白溶液用含 D₂O 的 HDX 缓冲液稀释,并在 25°C 下孵育不同时间点(10秒、30秒、60秒、900秒、3600秒)。氘交换后,用 0.1% TFA(含 3 M 尿素,1°C)稀释使蛋白变性。样品流经固定的胃蛋白酶柱,产生的肽段被 C8 捕集柱捕获。肽段随后通过 C18 HPLC 柱梯度洗脱,并直接电喷雾进入 Orbitrap 质谱仪。使用内部软件处理数据,计算未结合和结合(SR2211)的 RORγ-LBD 之间氘摄取量的差异 [1]。
热位移实验:热位移实验用于检测配体结合。所有反应在含有 10 mM HEPES (pH 7.5)、150 mM NaCl 和 5% (v/v) 甘油的缓冲液中进行,最终蛋白浓度为 10 μM RORγ-LBD,化合物浓度为 200 μM。将 10 μL 反应混合物加入 96 孔 PCR 板中。加入荧光探针(稀释度为 1:1000),混合物在冰上与化合物孵育 30 分钟。使用实时 PCR 系统将温度以每分钟 0.5°C 的速率从 30°C 升至 80°C,并以 0.5°C 的间隔记录荧光读数 [2]。
AlphaScreen 实验:该实验用于评估化合物破坏 RORγ-LBD 与 SRC1 共激活因子肽之间相互作用的能力。所有反应在存在不同浓度待测化合物的情况下,包含结合在镍受体微珠上的 200 nM RORγ-LBD (5 μg/mL) 和结合在链霉亲和素供体微珠上的 50 nM 生物素化 SRC1-4 肽 (5 μg/mL)。化合物浓度范围从 150 nM 到 200 μM。AlphaScreen 实验缓冲液含有 50 mM MOPS、50 mM NaF、0.05 mM CHAPS 和 0.1 mg/mL 牛血清白蛋白,pH 7.4。N 端生物素化的 SRC1-4 肽序列为 QKPTSPGQTPQAQQKSLIQQLLTE [2]。
细胞实验
Gal4 共转染实验:HEK293 细胞在含有 10% 胎牛血清的 DMEM 中培养。使用 1 × 10⁶ 个细胞在 6 厘米培养皿中进行批量反向转染,总 DNA 量为 3 μg(受体与报告基因比例为 1:1),转染试剂与 DNA 的比例为 3:1。次日,将细胞以 10,000 个/孔的密度重新铺板于 384 孔板中。4 小时后,用 SR2211 或 DMSO 处理细胞。孵育 20 小时后,通过一步加入检测试剂测定荧光素酶水平,并使用读板仪读取。数据以相对于 DMSO 处理细胞的倍数变化进行标准化 [1]。
全长 RORγ 报告基因实验 (5X-RORE):使用由五个 ROR 响应元件重复序列驱动的荧光素酶报告基因,以及空载体或全长 RORγ 进行类似的共转染实验 [1]。
天然启动子实验 (IL-17-Luc):使用 IL-17 荧光素酶报告基因以及全长 RORα 或 RORγ 进行共转染实验,以评估 SR2211 对天然 ROR 靶标启动子的影响 [1]。
EL-4 细胞中的实时 PCR 分析:将一百万 EL-4 细胞接种于 6 孔板中,与 5 μM SR2211、地高辛或 DMSO 孵育 20 小时。然后用 PMA (50 ng/mL) 和离子霉素 (1 μg/mL) 刺激细胞 5 小时。提取 RNA 并合成 cDNA。通过实时 PCR 定量 IL-17A 和 IL-23R 的基因表达,并以 GAPDH 的表达进行标准化 [1]。
流式细胞术细胞内细胞因子染色:用 PMA (50 ng/mL) 和离子霉素 (1 μg/mL) 刺激 EL-4 细胞 5 小时。刺激 3 小时后,加入蛋白转运抑制剂再孵育 2 小时。随后固定、透化细胞,并用 IL-17A 抗体进行染色。使用流式细胞仪进行细胞分选和分析 [1]。
荧光素酶报告基因实验(用于 RORγ 抑制):该实验用于测试化合物对 RORγ 转录活性的影响。HEK293T 细胞与 RORγ 和荧光素酶报告基因共转染。然后用待测化合物处理细胞 20 小时,并测定荧光素酶活性。据报道,SR2211 的 IC₅₀ 为 0.11 ± 0.03 μM [2]。
参考文献

[1]. Identification of SR2211: a potent synthetic RORγ-selective modulator. ACS Chem Biol. 2012 Apr 20;7(4):672-7.

[2]. Identification of N-phenyl-2-(N-phenylphenylsulfonamido)acetamides as new RORγ inverse agonists: Virtual screening, structure-based optimization, and biological evaluation. Eur J Med Chem. 2016 Jun 30;116:13-26.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C26H24F7N3O
分子量
527.49
精确质量
527.18
元素分析
C, 59.20; H, 4.59; F, 25.21; N, 7.97; O, 3.03
CAS号
1359164-11-6
PubChem CID
51035449
外观&性状
Off-white to light brown solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
552.4±50.0 °C at 760 mmHg
闪点
287.9±30.1 °C
蒸汽压
0.0±1.6 mmHg at 25°C
折射率
1.545
LogP
4.79
tPSA
39.6
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
37
分子复杂度/Complexity
698
定义原子立体中心数目
0
SMILES
FC1=C(C2=CC=C(CN3CCN(CC4=CC=NC=C4)CC3)C=C2)C=CC(C(C(F)(F)F)(O)C(F)(F)F)=C1
InChi Key
KVHKWAZUPPBMLL-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C26H24F7N3O/c27-23-15-21(24(37,25(28,29)30)26(31,32)33)5-6-22(23)20-3-1-18(2-4-20)16-35-11-13-36(14-12-35)17-19-7-9-34-10-8-19/h1-10,15,37H,11-14,16-17H2
化学名
1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-[3-fluoro-4-[4-[[4-(pyridin-4-ylmethyl)piperazin-1-yl]methyl]phenyl]phenyl]propan-2-ol
别名
SR2211; SR 2211; SR2211; 1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-[3-fluoro-4-[4-[[4-(pyridin-4-ylmethyl)piperazin-1-yl]methyl]phenyl]phenyl]propan-2-ol; 1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-(3-fluoro-4-(4-((4-(pyridin-4-ylmethyl)piperazin-1-yl)methyl)phenyl)phenyl)propan-2-ol; RefChem:185198; 1359164-11-6; SR-2211
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~189.58 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.74 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.8958 mL 9.4789 mL 18.9577 mL
5 mM 0.3792 mL 1.8958 mL 3.7915 mL
10 mM 0.1896 mL 0.9479 mL 1.8958 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Demonstration of direct binding of SR2211 to RORγ Competition assay was performed to determine IC50 value of SR2211 in a SPA assay (A). Increasing concentrations of SR2211 were incubated with 5nM of [3H]-T1317 and 1ug of GSTRORγ along with Glutathione-YSi beads as detailed in Methods. The percent radioligand bound was calculated at various concentration of SR2211 after 20 hr of incubation. Ki value for SR2211 was calculated to be 105nM using graphpad prism software. Data shown are representative results from two independent experiments performed in triplicates. HDX perturbation results from SR2211 (right) and T1317 (middle) and digoxin (left) with RORγ (B). Negative perturbation values means that the exchange rate is slower for these regions within the protein in the ligand-bound protein.[1]. Kumar N, et al. Identification of SR2211: a potent synthetic RORγ-selective modulator. ACS Chem Biol. 2012 Apr 20;7(4):672-7.
  • Suppression of constitutive activity of RORγ by SR2211 293T cells were cotransfected with Gal4-RORa (A), Gal4-RORg (B), Gal4-LXRa (C), Gal4-FXR (D) or Gal4-VP16 (E) along with a UAS-luciferase plasmid. The cells were treated for 20 hr with indicated conc of SR2211 or postice controls SR3335 (A), T1317 (C) and GW4064 (D). Relative change was determined by normalizing to cells treated with vehicle. Each data point was performed in 6 replicates and represented as mean ±SEM, n = 6.[1]. Kumar N, et al. Identification of SR2211: a potent synthetic RORγ-selective modulator. ACS Chem Biol. 2012 Apr 20;7(4):672-7.
  • SR2211 modulates full length RORγ in reporter assays 293T cells were cotransfected with 5X RORE-luc and either empty vector (A) or RORγ (B); IL-17-Luc reporter and either RORα (C) or RORγ (D); ABCA1 luciferase and LXRα (E) followed by treatment with indicated concentration of SR2211 for 20 hr. The luciferase activity was measured. Relative change was determined by normalizing to vehicle treated cells. Each data point was measured in 4-6 replicates and presented as mean ±SEM.[1]. Kumar N, et al. Identification of SR2211: a potent synthetic RORγ-selective modulator. ACS Chem Biol. 2012 Apr 20;7(4):672-7.
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