SU4984

别名: SU 4984; SU4984; RefChem:932326; 186610-89-9; SU4984
目录号: V15398 纯度: ≥98%
SU4984是一种PTK(蛋白酪氨酸激酶)抑制剂,可以抑制成纤维细胞生长因子受体1(FGFR1),IC50为10-20 μM。
SU4984 CAS号: 186610-89-9
产品类别: New1
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产品描述
SU4984是一种PTK(蛋白酪氨酸激酶)抑制剂,可以抑制成纤维细胞生长因子受体1(FGFR1),IC50为10-20 μM。 SU4984 还抑制血小板衍生生长因子受体和胰岛素受体的活性。 SU4984可用于癌症相关研究。
SU4984(3-[4-(1-甲酰基哌嗪-4-基)亚苄基]-2-吲哚酮)是一种基于羟吲哚结构的小分子蛋白酪氨酸激酶抑制剂,靶向受体酪氨酸激酶的ATP结合口袋。它可抑制FGFR1(IC50 = 10–20 μM)、野生型KIT、PDGFR和胰岛素受体,但不抑制EGFR(浓度高达200 μM)。在NIH 3T3细胞中,SU4984可阻断aFGF诱导的FGFR1自磷酸化(IC50 = 20–40 μM)及其下游MAP激酶的活化。SU4984还能抑制野生型KIT和近膜区突变的KIT,并可杀死表达活化KIT突变体的肿瘤性肥大细胞。FGFR1激酶结构域与SU4984复合物的晶体结构分析(分辨率2.4 Å)显示,羟吲哚核心占据了腺嘌呤结合位点,并与铰链区残基Glu562和Ala564形成两个关键的氢键,为其抑制活性提供了结构基础。
生物活性&实验参考方法
靶点
FGFR1 (fibroblast growth factor receptor 1) – IC50 = 10-20 μM (in vitro autophosphorylation assay in the presence of 1 mM ATP); IC50 = 20-40 μM (in vivo autophosphorylation in NIH 3T3 cells) [1]
KIT (wild-type and juxtamembrane mutants) – inhibits wild-type KIT and KIT with juxtamembrane activating mutations [2]
PDGFR – inhibits platelet-derived growth factor receptor [2]
Insulin receptor – inhibits insulin receptor [2]
EGFR (epidermal growth factor receptor) – no inhibition up to 200 μM [1]
体外研究 (In Vitro)
体外活性: SU4984在体外激酶实验中,使用[γ-32P]ATP测定,抑制纯化的FGFR1激酶结构域的自磷酸化活性,在1 mM ATP存在下IC50为10-20 μM。[1]
SU4984在NIH 3T3细胞中抑制aFGF诱导的FGFR1自磷酸化,IC50为20-40 μM。它还以相似的IC50值抑制aFGF诱导的pp90和MAP激酶(ERK1和ERK2)的酪氨酸磷酸化。[1]
SU4984在50 μM浓度下抑制NIH 3T3细胞中aFGF诱导的[3H]胸苷掺入。[1]
SU4984抑制PDGF受体和胰岛素受体的酪氨酸磷酸化,但即使在高达200 μM的浓度下也不抑制EGF受体的磷酸化。[1]
SU4984抑制野生型KIT和具有近膜区激活突变的KIT,但对具有激酶结构域突变(如D816V)的KIT效果较差。[2]
SU4984可杀死表达近膜区突变KIT的肿瘤性肥大细胞,也可杀死表达激酶结构域突变KIT的肿瘤性肥大细胞(如具有D814Y突变的P815细胞)。[2]
在 1 mM 三磷酸腺苷 (ATP) 存在下,SU4984(5-100 μM;5 分钟)抑制 FGFR1K 的激酶活性,IC50 为 10-20 μM [1]。 SU4984(10-90 μM;5 分钟)的 IC50 为 20–40 μM,可防止 NIH 3T3 细胞中 aFGF 诱导的 FGFR1 自身磷酸化 [1]。使用 SU4984 (5 μM) 时,观察到 C2 KIT 组成型磷酸化减少 50%,野生型受体酪氨酸磷酸化显着减少 [2]。 C2 和 P815 细胞被 SU4984(1–10 μM;6 天)杀死[2]。
酶活实验
酶/受体实验: FGFR1K体外激酶实验:将FGFR1K(2.2 mg/ml,溶于10 mM Tris pH 8、10 mM NaCl)与不同浓度的SU4984(从100 mM DMSO储备液稀释)或DMSO对照混合。通过将酶-化合物混合物加入2×激酶缓冲液(2 mM ATP/[γ-32P]ATP(10 μCi/μl)、4 mM MgCl2,溶于10 mM Tris pH 8、10 mM NaCl)中在室温下启动反应。在不同时间点,取出等分试样加入20 mM EDTA终止反应。反应产物通过SDS-PAGE(12%凝胶)和放射自显影分析。切下放射性条带,通过切伦科夫计数定量32P掺入量。[1]
晶体学研究:将天然FGFR1K晶体在含5 mM SU4984的稳定溶液中于4°C浸泡24-48小时。在旋转阳极X射线发生器上收集数据。使用未结合配体的FGFR1K结构的相角计算差异傅里叶电子密度图。使用模拟退火和共轭梯度最小化精修结构。[1]
细胞实验
细胞实验: 使用表达内源性FGF受体的NIH 3T3细胞。将细胞与不同浓度的SU4984在37°C预孵育5分钟,然后用aFGF(100 ng/ml)和肝素(10 μg/ml)在37°C刺激5分钟。细胞裂解液用抗FGFR1抗体免疫沉淀,通过SDS-PAGE分离,并用抗磷酸酪氨酸抗体或抗FGFR1抗体进行免疫印迹。[1]
对于[3H]胸苷掺入实验,NIH 3T3细胞用SU4984(50 μM)处理或不处理,用aFGF刺激,然后用[3H]胸苷标记。24小时后测量胸苷掺入量。[1]
对于PDGFR、胰岛素受体和EGFR实验:使用NIH 3T3细胞(PDGFR)、NIHIR细胞(胰岛素受体)或HER14细胞(EGFR)。将细胞与不同浓度的SU4984在37°C预孵育5分钟,然后用PDGF(40 ng/ml)、胰岛素(1 μg/ml)或EGF(100 ng/ml)在37°C刺激5分钟。细胞裂解液用受体特异性抗体免疫沉淀,并用抗磷酸酪氨酸抗体进行免疫印迹。[1]
KIT活性测定:通过体内磷酸化实验测定KIT磷酸化。使用肿瘤性肥大细胞系C2(表达近膜区突变KIT)和P815(表达D814Y激酶结构域突变)。用SU4984处理细胞并评估细胞活力。[2]
参考文献

[1]. Structures of the tyrosine kinase domain of fibroblast growth factor receptor in complex with inhibitors. Science. 1997 May 9;276(5314):955-60.

[2]. Indolinone derivatives inhibit constitutively activated KIT mutants and kill neoplastic mast cells. J Invest Dermatol. 2000 Feb;114(2):392-4.

其他信息
SU4984(3-[4-(1-甲酰基哌嗪-4-基)亚苄基]-2-吲哚酮)是一种基于羟吲哚的蛋白酪氨酸激酶抑制剂。它由羟吲哚与4-(1-甲酰基哌嗪-4-基)苯甲醛在乙醇中与哌啶于90°C反应5小时制备,得率65%,为黄色固体。NMR光谱显示SU4984主要以反式构型存在,但在晶体结构中观察到的是顺式构型。[1]
在FGFR1K与SU4984复合物的晶体结构(分辨率2.4 Å)中,羟吲哚占据ATP腺嘌呤结合位点,并与蛋白骨架形成两个氢键:羟吲哚的N-1与Glu562的羰基氧之间,以及羟吲哚的O-2与Ala564的酰胺氮之间。苯环与Ala564的羰基氧形成氧-芳香环接触。哌嗪环与Gly567存在范德华接触。[1]
SU4984具有相对较宽的抑制谱,对FGFR、PDGFR、胰岛素受体和KIT均有效。它不抑制EGFR。[1][2]
SU4984 是一种能够抑制成纤维细胞生长因子受体 1 的酪氨酸激酶活性、PDGF 受体的酪氨酸磷酸化以及胰岛素受体的物质。(美国国家癌症研究所)
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H19N3O2
分子量
333.38376
精确质量
333.148
元素分析
C, 72.05; H, 5.74; N, 12.60; O, 9.60
CAS号
186610-89-9
PubChem CID
5941540
外观&性状
Yellow solid powder
密度
1.34g/cm3
沸点
649.1ºC at 760 mmHg
闪点
346.4ºC
蒸汽压
9.81E-17mmHg at 25°C
折射率
1.72
LogP
3.234
tPSA
52.65
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
25
分子复杂度/Complexity
531
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=C1/C(=C/C2C=CC(N3CCN(C=O)CC3)=CC=2)/C2C(=CC=CC=2)N1
InChi Key
ZNFJBJDODKHWED-AQTBWJFISA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H19N3O2/c24-14-22-9-11-23(12-10-22)16-7-5-15(6-8-16)13-18-17-3-1-2-4-19(17)21-20(18)25/h1-8,13-14H,9-12H2,(H,21,25)/b18-13-
化学名
4-[4-[(Z)-(2-oxo-1H-indol-3-ylidene)methyl]phenyl]piperazine-1-carbaldehyde
别名
SU 4984; SU4984; RefChem:932326; 186610-89-9; SU4984
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~149.98 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 5 mg/mL (15.00 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 50.0mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.9996 mL 14.9979 mL 29.9958 mL
5 mM 0.5999 mL 2.9996 mL 5.9992 mL
10 mM 0.3000 mL 1.4998 mL 2.9996 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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