SW-100

别名: SW-100; SW 100; SW100
目录号: V4636 纯度: ≥98%
SW-100 (SW100) 是一种基于四氢喹啉的化合物,是一种新型、有效、脑渗透性和选择性组蛋白脱乙酰酶 6 (HDAC6) 抑制剂 (IC50 = 2.3 nM),具有神经保护作用。
SW-100 CAS号: 2126744-35-0
产品类别: HDAC
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
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纯度: ≥98%

产品描述
SW-100 (SW100) 是一种基于四氢喹啉的化合物,是一种新型、有效、脑渗透性和选择性组蛋白脱乙酰酶 6 (HDAC6) 抑制剂 (IC50 = 2.3 nM),具有神经保护作用。相对于所有其他 HDAC 同工酶,它对 HDAC6 的选择性至少高 1000 倍。 SW-100 显示出显着提高的穿过血脑屏障的能力。脆性 X 综合征 (FXS) 需要疾病缓解疗法,因为目前尚无有效的治疗或治愈方法。 SW-100 能够提高 FXS、Fmr1-/- 小鼠模型的记忆性能。这种小分子表现出良好的脑渗透性、低纳摩尔抑制 HDAC6 的效力 (IC50 = 2.3 nM),其选择性比所有其他 I、II 和 IV 类 HDAC 亚型至少高出一千倍。此外,通过抑制 HDAC6 (CD2) 的 α-微管蛋白脱乙酰酶结构域,SW-100 在细胞中上调 α-微管蛋白乙酰化,而不影响组蛋白乙酰化,并选择性恢复 Fmr1- 海马中受损的乙酰化 α-微管蛋白水平。 /- 老鼠。最后,SW-100 改善了 Fmr1-/- 小鼠的多种记忆和学习障碍,从而模拟了与 FXS 相关的智力缺陷,从而为寻求基于 HDAC6 的疗法来治疗这种罕见疾病提供了强有力的理由。
生物活性&实验参考方法
靶点
HDAC1 (IC50 = 5.23 μM); HDAC2 (IC50 = 32.8 μM); HDAC3 (IC50 = 29.5 μM); HDAC4 (IC50 = 10.9 μM); HDAC5 (IC50 = 4.07 μM); HDAC6 (IC50 = 2.3 nM); HDAC7 (IC50 = 4.55 μM); HDAC8 (IC50 = 3.72 μM); HDAC9 (IC50 = 3.46 μM); HDAC10 (IC50 = 26.2 μM); HDAC11 (IC50 = 5.72 μM)
SW-100 is a highly selective histone deacetylase 6 (HDAC6) inhibitor. The reported IC₅₀ value for HDAC6 is 2.3 nM. It demonstrates at least 1000-fold to 10000-fold selectivity over all other class I, II, and IV HDAC isoforms, including HDAC1 (IC₅₀ = 5.3 µM), HDAC8 (IC₅₀ = 3.7 µM), and others. [1]
体外研究 (In Vitro)
SW-100(0.01-10 µM;48 小时)显示乙酰化 α-微管蛋白水平以剂量依赖性方式明显增加[1]。 Western Blot分析[1] 细胞系:HEK293细胞 浓度:0.01, 0.1, 1, 10 µM 孵育时间:48小时 结果:乙酰化α-微管蛋白水平明显增加,且呈剂量依赖性。
在细胞NanoBRET靶点结合实验中,SW-100 对全长HDAC6的IC₅₀为279 nM,对HDAC6的CD2结构域为97 nM。[1]
SW-100处理HEK293细胞可剂量依赖性地增加乙酰化α-微管蛋白水平,效果与阳性对照NexA相似。其增加乙酰化α-微管蛋白水平的起始浓度低至10 nM。[1]
在N2a神经元细胞中,用1 µM SW-100处理可使乙酰化α-微管蛋白与总α-微管蛋白的比率增加(与溶媒对照组相比>8倍),而对乙酰化组蛋白H3与组蛋白H4的水平仅产生适度变化(<1.5倍),表明其对微管蛋白去乙酰化的功能选择性高于组蛋白。[1]
体内研究 (In Vivo)
SW-100(20 mg/kg;腹腔注射;每天两次,持续两天)可改善脆性 X 综合征小鼠模型的多种记忆和学习障碍,包括新物体识别、时间顺序以及坐标和分类空间处理[1]。动物模型:8-10周龄C57BL/6小鼠(Fmr1-/-小鼠)[1] 剂量:20 mg/kg 给药方式:腹腔注射;每天两次,持续两天 结果:改善了 Fmr1-/- 小鼠的多种记忆和学习障碍,包括新物体识别、时间排序以及坐标和分类空间处理。
对Fmr1⁻/⁻ 小鼠(脆性X综合征模型)腹腔注射SW-100(20 毫克/公斤,每日两次),连续2天,并在测试日额外注射,可改善多种认知缺陷。它逆转了小鼠在坐标空间处理、类别空间处理、新物体识别和时间顺序记忆任务中的缺陷。经治疗的Fmr1⁻/⁻ 小鼠在这些任务中的表现与溶媒治疗的野生型小鼠无显著差异。该治疗未改变野生型小鼠的表现。[1]
SW-100治疗(相同给药方案)显著增加了Fmr1⁻/⁻ 小鼠海马体中受损的乙酰化α-微管蛋白水平,使其恢复至接近野生型水平。在野生型小鼠的海马体中未观察到对乙酰化α-微管蛋白水平的显著影响。[1]
酶活实验
使用人全长重组HDAC1-11亚型进行HDAC抑制实验。使用荧光底物肽:源自p53的肽 (RHKK(Ac)AMC) 用于HDAC1、2、3、6、10和11;含有三氟乙酰化赖氨酸的肽 (Ac-LGK(TFA)-AMC) 用于HDAC4、5、7和9;源自p53的肽 (RHK(Ac)K(Ac)AMC) 用于HDAC8。反应在含有Tris-HCl、NaCl、KCl、MgCl₂和BSA的pH 8.0缓冲液中进行。测试化合物与酶预孵育5-10分钟后加入底物。反应在30°C下孵育2小时,然后加入显色剂淬灭。动力学测量荧光,并使用终点读数通过拟合S形剂量-反应曲线来确定IC₅₀。[1]
细胞实验
细胞系:HEK293细胞
浓度:0.01, 0.1, 1, 10 µM
孵育时间:48小时
结果:乙酰化α-微管蛋白水平明显升高,且呈剂量依赖性。
在HEK293细胞中进行α-微管蛋白乙酰化研究时,将细胞铺板并用SW-100以10 nM、100 nM、1 µM和10 µM的浓度处理24小时。然后裂解细胞,测定蛋白浓度。样品进行SDS-PAGE,转印至PVDF膜,并用抗乙酰化α-微管蛋白和总α-微管蛋白的抗体进行检测。通过化学发光法检测信号并通过光密度法定量。[1]
在N2a细胞中进行α-微管蛋白/组蛋白乙酰化研究时,用1 µM或10 nM SW-100处理细胞。收集细胞并提取总组蛋白。使用针对乙酰化α-微管蛋白、总α-微管蛋白、乙酰化组蛋白H3 (Lys9/Lys14) 和总组蛋白H4的抗体,通过蛋白质印迹法分析蛋白样品。[1]
进行NanoBRET靶点结合实验时,使用稳定表达NanoLuc-HDAC6(全长或CD2结构域)或HDAC1-NanoLuc的HEK293细胞。将细胞与指定浓度(全长HDAC6为100 nM,HDAC6-CD2为250 nM,HDAC1为1000 nM)的细胞渗透性SAHA基示踪剂一起孵育。加入系列稀释的SW-100并平衡2小时。加入NanoGlo底物和细胞外NanoLuc抑制剂后,测量450 nm(供体)和>610 nm(受体)的发光。将竞争性置换数据拟合到三参数曲线以确定IC₅₀值。[1]
动物实验
8-10周龄C57BL/6小鼠(Fmr1-/-小鼠)[1]
20 mg/kg
腹腔注射;每日两次,连续两天
为了研究Fmr1⁻/⁻小鼠的疗效,使用了成年雄性野生型和Fmr1⁻/⁻小鼠(8-10周龄)。SW-100溶解于10% DMSO、40% PEG-400和50%生理盐水的混合溶液中,浓度为4 mg/mL。该化合物以20 mg/kg体重的剂量进行腹腔注射,每日两次,连续两天。在第三天和第四天认知测试前1小时额外注射一次。[1]
认知任务(坐标空间加工、类别空间加工、新物体识别和时间顺序记忆)在两天内进行。小鼠被驯化至适应测试室。每次实验之间,用70%乙醇清洁物体和仪器。由一位对基因型和处理方式不知情的实验人员通过视频记录记录小鼠的探索时间并进行评分。[1]
为了分析脑组织中的乙酰化α-微管蛋白,小鼠接受相同的给药方案(20 mg/kg,每日两次,连续2天,并在测试当天额外注射)。解剖海马,在裂解缓冲液中匀浆,然后离心。测定蛋白质浓度,并使用针对乙酰化α-微管蛋白和总α-微管蛋白的抗体进行Western blot分析。[1]
药代性质 (ADME/PK)
在一项针对野生型C57BL/6雄性小鼠的初步药代动力学研究中,单次腹腔注射SW-100(20 mg/kg)后,给药后1小时脑血浆浓度比为2.44,给药后4小时脑血浆浓度比为4.54。[1]
SW-100在人和小鼠肝微粒体中的代谢稳定性均较低(半衰期<10分钟)。在人和小鼠肝细胞中,其半衰期也较短(<30分钟)。[1]
在HEK293细胞的hERG抑制试验中,该化合物的IC₅₀ > 10 µM。在 10 µM 的浓度下,该化合物对主要的人类细胞色素 P450 同工酶(1A2、2C9、2C19、2D6、3A4)的抑制率较低(<25%)。[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
SW-100在Ames诱变性试验中,使用四种鼠伤寒沙门氏菌菌株(TA98、TA100、TA1535、TA1537)和一种大肠杆菌菌株(WP2 uvrA),在有无代谢活化(S9混合物)的情况下,结果均为阴性。[1]
参考文献

[1]. Brain Penetrable Histone Deacetylase 6 Inhibitor SW-100 Ameliorates Memory and LearningImpairments in a Mouse Model of Fragile X Syndrome. ACS Chem Neurosci. 2019 Mar 20;10(3):1679-1695.

其他信息
SW-100 是一种基于四氢喹啉的苯羟肟酸类化合物,旨在提高其脑渗透性,优于早期的 HDAC6 抑制剂,例如 tubastatin A (TubA)。其脑摄取率的提高归因于其碱性帽基团较低的计算 pKₐ 值 (2.91),从而在 MDCK-MDR1 细胞中实现了 0.51 的有利 P-糖蛋白外排比率。[1] 在脆性 X 综合征小鼠模型中,其疗效机制被认为是选择性抑制 HDAC6,导致脑内 α-微管蛋白乙酰化水平升高。据推测,这可以改善该疾病中受损的微管依赖性运输,从而减轻认知缺陷。 [1]
该研究将SW-100定位为一种新型的、可穿透血脑屏障的、高选择性的HDAC6抑制剂,具有治疗脆性X综合征相关认知障碍以及其他神经退行性疾病的潜力。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H17CLN2O2
分子量
316.782083272934
精确质量
316.1
元素分析
C, 64.46; H, 5.41; Cl, 11.19; N, 8.84; O, 10.10
CAS号
2126744-35-0
相关CAS号
2126744-35-0
PubChem CID
130345472
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
3.3
tPSA
52.6
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
22
分子复杂度/Complexity
385
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
MNAYBFFSFQRSIT-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H17ClN2O2/c18-15-7-8-16-14(10-15)2-1-9-20(16)11-12-3-5-13(6-4-12)17(21)19-22/h3-8,10,22H,1-2,9,11H2,(H,19,21)
化学名
4-[(6-chloro-3,4-dihydro-2H-quinolin-1-yl)methyl]-N-hydroxybenzamide
别名
SW-100; SW 100; SW100
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ≥ 125 mg/mL (~394.6 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (6.57 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (6.57 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (6.57 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 3.1568 mL 15.7838 mL 31.5676 mL
5 mM 0.6314 mL 3.1568 mL 6.3135 mL
10 mM 0.3157 mL 1.5784 mL 3.1568 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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