YKL-5-124

别名: YKL5-124; YKL-5124; YKL-5 124; YKL-5-124; YKL 5-124
目录号: V41716 纯度: ≥98%
YKL-5-124 (YKL-5124) 是一种新型、选择性、共价 CDK7 抑制剂 (IC50=53.5 nM),具有抗癌活性。
YKL-5-124 CAS号: 1957203-01-8
产品类别: CDK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10mg
25mg
50mg
100mg
Other Sizes

Other Forms of YKL-5-124:

  • YKL-5-124 TFA
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产品描述
YKL-5-124 (YKL-5124) 是一种新型、选择性、共价 CDK7 抑制剂 (IC50=53.5 nM),具有抗癌活性。它抑制 CDK7/CycH/MAT1 酶活性,IC50 为 9.7 nM,并且对 CDK7 的生化和细胞选择性优于结构相关激酶 CDK12/13
生物活性&实验参考方法
靶点
CDK7 (IC50 = 53.5 nM); CDK7/Mat1/CycH (IC50 = 9.7 nM); CDK2 (IC50 = 1300 nM); CDK9 (IC50 = 3020 nM)
体外研究 (In Vitro)
YKL-5-124 导致 G1/S 转变停滞并抑制 E2F 驱动的基因表达;这些效应被无法共价结合 YKL-5-124 的 CDK7 突变体所挽救,证明了靶向特异性。与 THZ1 不同,YKL-5-124 处理不会导致 RNA 聚合酶 II C 末端结构域磷酸化发生变化;然而,通过组合 YKL-5-124 和 THZ531(一种选择性 CDK12/13 抑制剂)可以重建抑制作用,揭示 CDK 控制基因转录的潜在冗余。这些发现强调了 CDK7/12/13 多药理学对 THZ1 抗癌活性的重要性,并认为选择性抑制 CDK7 可能有助于治疗以 E2F 失调为标志的癌症。参考:选择性 CDK7 共价抑制剂的开发揭示了优势细胞-循环表型。细胞化学生物学。 2019 年 6 月 20 日;26(6):792-803.e10。
体内研究 (In Vivo)
细胞周期蛋白依赖性激酶 7 (CDK7) 是细胞周期和基因转录的中央调节因子。然而,人们对其对基因组不稳定性和癌症免疫力的影响知之甚少。使用选择性 CDK7 抑制剂 YKL-5-124,研究表明 CDK7 抑制主要破坏细胞周期进程,并在小细胞肺癌 (SCLC) 中诱导 DNA 复制应激和基因组不稳定,同时触发免疫反应信号传导。这些肿瘤固有事件激发了 T 细胞引发的强大的免疫监视程序,通过添加免疫检查点封锁进一步增强了该程序。 YKL-5-124 与抗 PD-1 组合可在多种高度侵袭性 SCLC 小鼠模型中提供显着的生存益处,为由 CDK7 抑制剂和免疫疗法组成的新组合方案提供理论依据。参考:选择性 CDK7 共价抑制剂的开发揭示了主导作用细胞周期表型。细胞化学生物学。 2019 年 6 月 20 日;26(6):792-803.e10。
细胞实验
细胞系:HAP1 细胞
浓度:0 nM、0.2 nM、0.7 nM、2 nM、6.3 nM、20 nM、60 nM、200 nM、633.3 nM、2000 nM
孵育时间:72 小时
结果:引起 G1 和 G2/M 期细胞的剂量依赖性增加以及相应的 S 期细胞损失。
动物实验
NSG雌性小鼠
2.5 mg/kg
腹腔注射
参考文献

[1]. Development of a Selective CDK7 Covalent Inhibitor Reveals Predominant Cell-Cycle Phenotype. Cell Chem Biol. 2019 Jun 20;26(6):792-803.e10.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C28H33N7O3
分子量
515.6067
精确质量
515.264
元素分析
C, 65.22; H, 6.45; N, 19.02; O, 9.31
CAS号
1957203-01-8
相关CAS号
YKL-5-124 TFA;2748220-93-9
PubChem CID
121443990
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
2
tPSA
123
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
38
分子复杂度/Complexity
865
定义原子立体中心数目
1
SMILES
CC1(C2=C(CN1C(=O)N[C@H](CN(C)C)C3=CC=CC=C3)C(=NN2)NC(=O)C4=CC=C(C=C4)NC(=O)C=C)C
InChi Key
KPABJHHKKJIDGX-JOCHJYFZSA-N
InChi Code
InChI=1S/C28H33N7O3/c1-6-23(36)29-20-14-12-19(13-15-20)26(37)31-25-21-16-35(28(2,3)24(21)32-33-25)27(38)30-22(17-34(4)5)18-10-8-7-9-11-18/h6-15,22H,1,16-17H2,2-5H3,(H,29,36)(H,30,38)(H2,31,32,33,37)/t22-/m1/s1
化学名
N-[(1S)-2-(dimethylamino)-1-phenylethyl]-6,6-dimethyl-3-[[4-(prop-2-enoylamino)benzoyl]amino]-1,4-dihydropyrrolo[3,4-c]pyrazole-5-carboxamide
别名
YKL5-124; YKL-5124; YKL-5 124; YKL-5-124; YKL 5-124
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~100 mg/mL (~194 mM)
Ethanol: ~100 mg/mL (~194 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.03 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.08 mg/mL (4.03 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.03 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9395 mL 9.6973 mL 19.3945 mL
5 mM 0.3879 mL 1.9395 mL 3.8789 mL
10 mM 0.1939 mL 0.9697 mL 1.9395 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Biochemical characterization of YKL-5-124. Cell Chem Biol . 2019 Jun 20;26(6):792-803.e10.
  • Cellular engagement of CDK7 by YKL-5-124. Cell Chem Biol . 2019 Jun 20;26(6):792-803.e10.
  • Cell cycle effects from YKL-5-124 treatment. Cell Chem Biol . 2019 Jun 20;26(6):792-803.e10.
  • Transcriptional effects from YKL-5-124 treatment. Cell Chem Biol . 2019 Jun 20;26(6):792-803.e10.
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