PHGDH-IN-3

别名: PHGDH inhibitor D8; PHGDH-IN-D8; GLXC-26715; PHGDH-IN-3
目录号: V56613 纯度: ≥98%
PHGDH-IN-3 是一种口服生物活性磷酸甘油酸脱氢酶 (PHGDH) 抑制剂。
PHGDH-IN-3 CAS号: 2893778-31-7
产品类别: Others 11
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100mg
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产品描述
PHGDH-IN-3 是一种口服生物活性磷酸甘油酸脱氢酶 (PHGDH) 抑制剂。PHGDH-IN-3 对 PHGDH 的抑制 IC50 为 2.8 μM。PHGDH-IN-3 可用于癌症相关研究。
PHGDH-IN-3(化合物 D8)是一种口服生物活性磷酸甘油酸脱氢酶 (PHGDH) 抑制剂。PHGDH 是丝氨酸合成途径中的第一个酶,催化 3-磷酸甘油酸转化为 3-磷酸羟基丙酮酸。该化合物通过抑制 PHGDH,阻断肿瘤细胞中丝氨酸的从头合成,从而抑制核苷酸合成和细胞增殖。
生物活性&实验参考方法
靶点
PHGDH-IN-3 specifically targets phosphoglycerate dehydrogenase (PHGDH), the rate-limiting enzyme of the serine biosynthesis pathway. It exhibits an IC50 of 2.8 μM against PHGDH and demonstrates high binding affinity for the PHGDH protein with a Kd value of 2.33 μM.
体外研究 (In Vitro)
PHGDH-IN-3(化合物D8)具有很强的酶抑制活性,其IC50值为2.8 μM[1]。PHGDH-IN-3对PHGDH蛋白具有很强的亲和力,其Kd值为2.33 μM[1]。PHGDH-IN-3可以抑制MDA-MB-468细胞中抗生素诱导的丝氨酸从头合成[1]。体外实验表明,PHGDH-IN-3具有很强的酶抑制活性,IC50值为2.8 μM。它对PHGDH蛋白具有很高的结合亲和力,Kd值为2.33 μM。该化合物通过抑制PHGDH,阻断3-磷酸甘油酸向丝氨酸的转化,从而减少肿瘤细胞中丝氨酸的从头合成,并抑制核苷酸合成和细胞增殖。
体内研究 (In Vivo)
PHGDH-IN-3(化合物D8)(口服、静脉注射;1、3 mg/kg)具有优异的国内药代动力学特性[1]。PHGDH-IN-3(腹腔注射;12.5、25、50 mg/kg;每日一次,连续31天)在PC9异种移植小鼠模型中表现出显著的抗肿瘤作用[1]。体内研究表明,PHGDH-IN-3是一种口服活性化合物,可用于癌症研究。它已在依赖于丝氨酸生物合成的癌症临床前模型中进行了研究,例如某些乳腺癌和PHGDH扩增的黑色素瘤。该化合物的口服生物利用度使其给药方便,可用于疗效研究。
酶活实验
使用重组人 PHGDH 酶评估 PHGDH-IN-3 的酶活性。将该酶与底物 3-磷酸甘油酸和 NAD⁺ 在不同浓度的待测化合物存在下孵育。通过分光光度法在 340 nm 处监测 NADH 的生成。IC50 值由剂量反应曲线计算得出。
细胞实验
PHGDH-IN-3 的体外细胞活性检测采用 PHGDH 扩增或丝氨酸合成依赖性的癌细胞系(例如,MDA-MB-468 乳腺癌细胞)。细胞用化合物处理 48-72 小时。采用 MTT 或 CellTiter-Glo 法检测细胞活力。通过 LC-MS 定量分析处理后细胞中的丝氨酸和核苷酸水平,以确认靶点结合和通路抑制。
动物实验
动物/疾病模型: ICR小鼠[1]
剂量: 1、3 mg/kg
给药途径: 口服 (po) 和静脉注射 (iv) 给药
实验结果: 药代动力学参数 静脉注射 (1 mg/kg) 口服 (3 mg/kg) AUC (h·ng/mL) 38,358 ± 14,768 94,386 ± 23,416 T1/2 (h) 4.94 ± 0.38 4.74 ± 0.30 Tmax (h) 3.33 ± 1.15 CL_obs (mL/min/kg) 0.48 ± 0.23 Cmax (ng/mL) 8842 ± 1755 F (%) 82.0 动物/疾病模型: Balb/c 裸鼠 [1]
剂量: 12.5、25、50 mg/kg
给药途径: 腹腔注射;每日一次,持续 31 天
实验结果: 已证实其在体内具有抗肿瘤作用,并能显著延缓肿瘤生长。25 mg/kg 剂量可显著降低小鼠肿瘤重量。
在 PHGDH 扩增型癌症的异种移植小鼠模型中进行了 PHGDH-IN-3 的体内研究。该化合物以不同剂量口服给药。定期测量肿瘤体积。评估药效学标志物,例如肿瘤丝氨酸水平和核苷酸合成率。监测体重和整体健康状况以评估耐受性。
药代性质 (ADME/PK)
本研究评估了PHGDH-IN-3在啮齿动物体内经口服和静脉注射给药后的药代动力学特性。采用液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS)测定血浆浓度,以确定关键参数,包括口服生物利用度、半衰期(t₁/₂)、最大浓度(Cmax)和曲线下面积(AUC)。该化合物的口服生物利用度支持其用于体内疗效研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
PHGDH-IN-3 仅供研究用途,未获准用于临床。标准毒理学评估包括啮齿动物急性毒性和重复给药毒性研究,以及安全性药理学评价。目前尚无该化合物的公开毒性数据。
参考文献

[1]. Discovery of Novel Drug-like PHGDH Inhibitors to Disrupt Serine Biosynthesis for Cancer Therapy. J Med Chem. 2023 Jan 12;66(1):285-305.

其他信息
PHGDH-IN-3 是一种用于研究癌症代谢以及丝氨酸生物合成在肿瘤细胞增殖中作用的研究工具。许多癌症,特别是那些存在 PHGDH 扩增的癌症,依赖于从头合成丝氨酸来产生核苷酸和促进细胞生长。PHGDH 抑制剂正被研究作为潜在的治疗药物,用于靶向癌症的代谢脆弱性。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H18FN3O4S2
分子量
495.545826435089
精确质量
495.07
元素分析
C, 58.17; H, 3.66; F, 3.83; N, 8.48; O, 12.91; S, 12.94
CAS号
2893778-31-7
PubChem CID
166638116
外观&性状
Off-white to light brown solid powder
LogP
4.1
tPSA
142
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
7
重原子数目
34
分子复杂度/Complexity
829
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C(NC1=NC(C2=CC=CC(F)=C2)=CS1)(=O)C1=CC=C(S(NC2=CC=CC(C(C)=O)=C2)(=O)=O)C=C1
InChi Key
VUAMLKVINZWIJR-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H18FN3O4S2/c1-15(29)17-4-3-7-20(13-17)28-34(31,32)21-10-8-16(9-11-21)23(30)27-24-26-22(14-33-24)18-5-2-6-19(25)12-18/h2-14,28H,1H3,(H,26,27,30)
化学名
4-(N-(3-acetylphenyl)sulfamoyl)-N-(4-(3-fluorophenyl)thiazol-2-yl)benzamide
别名
PHGDH inhibitor D8; PHGDH-IN-D8; GLXC-26715; PHGDH-IN-3
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~201.80 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (10.09 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0180 mL 10.0898 mL 20.1796 mL
5 mM 0.4036 mL 2.0180 mL 4.0359 mL
10 mM 0.2018 mL 1.0090 mL 2.0180 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们