BODIPY FL L-Cystine

目录号: V43195 纯度: ≥98%
BODIPY FL L-胱氨酸是一种硫醇反应性绿色荧光染料。
BODIPY FL L-Cystine CAS号: 1180490-57-6
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
BODIPY FL L-胱氨酸是一种硫醇反应性绿色荧光染料。BODIPY FL L-胱氨酸可以标记膜蛋白、具有疏水结合位点的蛋白质或疏水配体。(λex=504 nm,λem=511 nm)
BODIPY FL L-胱氨酸是一种硫醇反应性绿色荧光染料。它由BODIPY FL荧光团与氨基酸L-胱氨酸偶联而成。其分子式为C34H38B2F4N6O6S2,分子量为788.45。该染料能特异性地与硫醇(-SH)基团反应,因此可用于标记含有游离硫醇基团(半胱氨酸)的蛋白质、肽和其他生物分子。它可用于标记膜蛋白、具有疏水结合位点的蛋白质或疏水配体。BODIPY FL荧光团发出明亮且光稳定的绿色荧光,最大激发波长为504 nm,最大发射波长为511 nm。该探针尤其适用于研究生物化学和细胞生物学中的蛋白质-配体相互作用、细胞氧化还原状态以及半胱氨酸相关过程。
生物活性&实验参考方法
靶点
Free thiol groups (cysteine residues) on proteins, peptides, and other biomolecules. BODIPY FL L-Cystine contains a disulfide bond (the L-cystine moiety) that can undergo disulfide exchange with free thiols on target molecules. The dye reacts with thiol groups through a disulfide exchange reaction, forming a mixed disulfide between the probe and the target thiol, thereby covalently labeling the target molecule. The reaction is specific for reduced thiols (free -SH) and does not react with oxidized disulfides or other functional groups under mild conditions. This mechanism allows the probe to label proteins that have exposed cysteine residues, such as those in the active sites of enzymes (e.g., phosphatases, proteases) or proteins that undergo redox regulation. The BODIPY FL fluorophore provides a fluorescent signal for detection and quantification. The probe does not have a specific protein target but rather reacts with any accessible thiol, making it a general thiol-labeling reagent. It can also be used to label thiols on membrane proteins or in hydrophobic environments, as the BODIPY FL moiety is relatively lipophilic. The probe can also be used to detect changes in the cellular redox state, such as the ratio of reduced to oxidized glutathione (GSH/GSSG), as the label can be reduced back to free thiols under reducing conditions.
体外研究 (In Vitro)
在体外,BODIPY FL L-胱氨酸用于标记含有游离巯基的蛋白质或肽。标记反应通常在pH 6.5-8.0的缓冲液(例如PBS、Tris-HCl或HEPES)中进行,室温反应1-2小时或在4℃下过夜。染料溶于DMSO或DMF中配制成1-10 mM的储备液,然后在标记反应中稀释至1-100 uM。标记效率取决于巯基的可及性以及染料和靶标的浓度。标记后的蛋白质可通过SDS-PAGE电泳结合凝胶内荧光扫描(激发波长488 nm,发射波长530 nm)、Western印迹(如有抗BODIPY抗体,则使用抗体,但通常使用直接荧光检测)或质谱分析进行分析,以鉴定标记的肽段。该染料还可用于标记细胞裂解液中的硫醇基团,以评估硫醇蛋白质组或氧化还原状态。在活细胞中,该染料可用于标记膜蛋白表面暴露的硫醇(非渗透条件下)或细胞总硫醇(透化后)。然而,由于带电荷的胱氨酸部分的存在,该染料穿过细胞膜的能力有限;未经透化处理,活细胞可能无法有效吸收该染料。该染料还可用于竞争性分析,以筛选硫醇反应性化合物或测量纯化蛋白或生物样品中的硫醇含量(例如,通过测量标记后荧光强度的增加)。由于BODIPY FL基团的亲脂性,该染料可用于标记膜蛋白、具有疏水结合位点的蛋白质或疏水配体。
体内研究 (In Vivo)
由于BODIPY FL L-胱氨酸与血液中的硫醇反应,可能导致非特异性标记,因此其体内应用受到限制。然而,该探针可用于标记动物模型中富含硫醇的组织或肿瘤,尤其适用于氧化还原状态的研究或追踪含硫醇药物或纳米颗粒的递送。例如,可通过其硫醇反应基团将该染料与靶向部分(例如抗体或肽)偶联,然后将其注射到动物体内进行成像。或者,也可将该染料局部注射(例如瘤内注射)以标记肿瘤微环境中的含硫醇蛋白。由于该探针主要用于体外或离体实验,因此详细的体内活性数据尚未广泛发表。建议研究人员自行开展初步研究以确定其体内应用价值。该染料尚未获准用于人体。
酶活实验
对于无细胞蛋白标记反应,将BODIPY FL L-胱氨酸溶解于DMSO中,浓度为1-10 mM。将含有游离巯基的纯化蛋白(例如,BSA,其Cys34位点含有一个游离半胱氨酸残基)溶解于标记缓冲液(例如,50 mM Tris-HCl pH 7.5,150 mM NaCl,1 mM EDTA)中。如需还原二硫键,则将蛋白在37℃下用1-10 mM DTT或TCEP处理30分钟,然后通过缓冲液交换(例如,使用脱盐柱)或透析去除还原剂。将蛋白溶液(0.1-1 mg/mL)与BODIPY FL L-胱氨酸(相对于蛋白巯基过量1-20倍)在室温下避光孵育1-2小时。加入过量的半胱氨酸或β-巯基乙醇(10-20 mM)10分钟即可终止反应。未反应的染料可通过缓冲液交换(脱盐柱、透析或沉淀)去除。使用分光光度计测量504 nm(BODIPY)和280 nm(蛋白质)处的吸光度,或将标记蛋白的荧光强度与游离染料的标准曲线进行比较,即可评估标记效率。通过SDS-PAGE和凝胶内荧光扫描(激发波长488 nm,发射波长530 nm)分析标记蛋白,以确认标记并评估纯度。对于测定样品(例如细胞裂解液、生物体液)中的硫醇含量,可以使用BODIPY FL L-胱氨酸进行基于荧光的分析。将含有还原型硫醇的样品与染料(10-50 uM)在缓冲液中孵育30-60分钟,并测量荧光强度(激发波长504 nm,发射波长511-530 nm)的增加。硫醇的浓度通过与使用还原型谷胱甘肽(GSH)或半胱氨酸标准品生成的标准曲线进行比较来确定。该染料也可用于标记纳米颗粒或其他材料表面的硫醇基团,以进行生物偶联研究。
细胞实验
为了标记活细胞表面(非渗透性)的巯基,将细胞(例如 HeLa、CHO 细胞)培养至 70-80% 汇合度,培养于培养皿或盖玻片上。移除培养基,并用 PBS(pH 7.4)洗涤细胞两次,以去除血清蛋白(血清蛋白含有巯基,会消耗染料)。用 DMSO 储备液新鲜配制 BODIPY FL L-胱氨酸(1-10 uM)的 PBS 溶液(不含还原剂)(最终 DMSO 浓度 <0.5%)。将染料溶液加入细胞中,并在室温或 4℃ 下孵育 15-60 分钟(以尽量减少内吞作用)。孵育后,用 PBS 洗涤细胞 3 次,以去除未结合的染料。对于荧光成像,细胞可用 4% 多聚甲醛固定 10-15 分钟,洗涤后用抗褪色封片剂封片。使用荧光显微镜采集图像,激发波长为 488 nm,发射波长为 505-550 nm(FITC 通道)。为了标记细胞内硫醇,必须先对细胞进行透化处理。细胞用 4% 多聚甲醛固定(10-15 分钟,室温),然后用 0.1-0.5% Triton X-100 的 PBS 溶液透化 5-10 分钟。洗涤后,按照上述方法将细胞与染料孵育。或者,也可以用还原剂(例如 TCEP)处理活细胞,以还原二硫键并暴露更多的硫醇,然后在洗去还原剂后进行标记。对于流式细胞术分析,细胞按上述方法在悬浮液中染色,洗涤后,在配备 488 nm 激光器和 530/30 nm 发射滤光片(FITC 通道)的流式细胞仪上进行分析。该染料也可用于标记细胞裂解液或组织匀浆中的硫醇。对于组织切片的离体标记,将冷冻或石蜡包埋的切片脱蜡、复水,用PBS缓冲液洗涤,然后在室温下与染料(1-10 uM,溶于PBS缓冲液)孵育30-60分钟。洗涤后,将切片封片并成像。所有步骤均应避光,以防止染料发生光漂白。
动物实验
BODIPY FL L-胱氨酸的体内标记方案尚未完全建立。若要进行全身给药,需将该染料溶解于无菌PBS缓冲液(DMSO含量<5%)中,浓度为0.5-2 mg/mL,经0.22 μm滤膜过滤后,以0.1-1 mg/kg的剂量经尾静脉注射给小鼠。循环30-120分钟后,处死小鼠,并收集组织进行离体荧光成像(激发波长488 nm,发射波长510-530 nm)和组织学分析。然而,该染料与血清白蛋白和其他含硫醇蛋白的非特异性结合可能会限制全身给药的应用。其他给药途径包括瘤内或皮内注射,用于局部标记。该染料还可以通过硫醇-马来酰亚胺偶联或二硫键交换与靶向配体(例如抗体、肽或适配体)偶联,然后将偶联物用于靶向成像。例如,首先用TCEP或DTT还原抗体以生成游离硫醇,然后与BODIPY FL L-胱氨酸(或BODIPY FL的马来酰亚胺衍生物)反应生成标记抗体。纯化标记抗体后,将其注射到小鼠体内(例如,0.5-5 mg/kg,静脉注射)进行体内肿瘤成像。注射后4-24小时,使用配备合适滤光片(激发波长470-490 nm,发射波长510-540 nm)的全身成像系统进行荧光成像。由于绿色荧光,信号穿透深度仅限于浅表组织,与近红外染料相比,背景信号可能较高。研究人员应根据具体应用优化实验方案。该化合物仅供研究使用,不可用于人体。
药代性质 (ADME/PK)
BODIPY FL L-胱氨酸的药代动力学数据有限。作为一种硫醇反应性染料,预计全身给药后会迅速与血浆蛋白(尤其是白蛋白)和细胞硫醇结合。游离探针(未结合)的分子量为788.45,具有中等亲脂性(估计logP值约为2-3)。静脉注射后,该化合物会迅速从循环中清除,半衰期仅为数分钟,这是由于其与硫醇反应或被肝脏和脾脏摄取所致。当与靶向配体(例如抗体)偶联时,其药代动力学特征将主要由配体决定,半衰期延长(数小时至数天),且生物分布也不同。体外实验表明,该染料在黑暗且无还原剂存在的情况下相对稳定,但可被DTT或TCEP还原,这可能与细胞内氧化还原研究相关。对于定量分析,可使用有机溶剂(例如甲醇/氯仿)从生物样品(例如血浆、组织)中提取染料,并使用内标物通过高效液相色谱-荧光检测法进行分析。由于没有详细的公开数据,建议研究人员根据具体应用需求进行定制的药代动力学研究。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
BODIPY FL L-胱氨酸的毒理学数据有限。体外实验表明,在用于标记的浓度(1-10 μM)和短时间暴露(1-2 小时)内,该染料通常无毒,这已通过细胞活力检测(MTT、LDH)得到证实。在较高浓度(例如 >50 μM)或长时间暴露(>24 小时)下,由于硫醇修饰对细胞氧化还原平衡或蛋白质功能的影响,可能会观察到一定的细胞毒性。该染料仅供研究使用,不得用于人体。处理有机染料和化学品时应遵循标准安全预防措施:佩戴手套、实验服和护目镜;避免吸入粉尘;在通风良好的区域操作;避光。该化合物应储存在 -20°C,避光防潮,并在打开前使其升温至室温。该化合物及其任何废弃物的妥善处置应符合当地法规。目前尚无遗传毒性、致癌性或生殖毒性数据。
参考文献

[1]. An effective thiol-reactive probe for differential scanning fluorimetry with a standard real-time polymerase chain reaction device. Anal Biochem. 2016 Apr 15;499:63-65.

[2]. Glutathione-mediated release of Bodipy® from PEG cofunctionalized gold nanoparticles. Int J Nanomedicine. 2012;7:4007-22.

其他信息
BODIPY FL L-胱氨酸是一种研究级硫醇反应性荧光染料,目前尚无获批的临床应用。它以固体粉末形式供应,纯度≥95%(通常>95%)。分子量为788.45,分子式为C34H38B2F4N6O6S2。该染料可溶于DMSO(10-20 mg/mL)和其他有机溶剂(DMF、乙醇),但水溶性有限。DMSO储备液(1-10 mM)应在-20℃避光保存,最长可达6个月。它可用于标记膜蛋白、具有疏水结合位点的蛋白质或疏水配体。BODIPY FL荧光团的激发/发射波长最大值分别为504/511 nm,产生明亮的绿色荧光。L-胱氨酸部分赋予其对硫醇基团的特异性。该探针特别适用于研究蛋白质-配体相互作用、细胞氧化还原状态以及半胱氨酸相关过程。它还可用于标记细胞表面的巯基或标记纯化蛋白质以进行生化分析。其同义词包括 BODIPY FL L-胱氨酸。详细实验方案请参阅产品数据表和相关文献。该化合物仅供研究使用,不得用于诊断或治疗用途。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C34H36B2N6O6F4S2-2.H+
分子量
787.44
精确质量
788.241
CAS号
1180490-57-6
PubChem CID
168008656
外观&性状
Orange to red solid powder
tPSA
199
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
14
可旋转键数目(RBC)
15
重原子数目
54
分子复杂度/Complexity
1670
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C(C1=CC=C2C=C3C(C)=CC(C)=N3[B+3]([F-])([F-])[N-]12)CC(=O)NC(C(=O)[O-])CSSCC(C(=O)[O-])NC(=O)CCC1=CC=C2C=C3C(C)=CC(C)=N3[B+3]([F-])([F-])[N-]12.[H+]
InChi Key
IUOBNSXKYBKQEY-NSOVKSMOSA-N
InChi Code
InChI=1S/C34H38B2F4N6O6S2/c1-19-13-21(3)43-29(19)15-25-7-5-23(45(25)35(43,37)38)9-11-31(47)41-27(33(49)50)17-53-54-18-28(34(51)52)42-32(48)12-10-24-6-8-26-16-30-20(2)14-22(4)44(30)36(39,40)46(24)26/h5-8,13-16,27-28H,9-12,17-18H2,1-4H3,(H,41,47)(H,42,48)(H,49,50)(H,51,52)/t27-,28-/m0/s1
化学名
(2R)-3-[[(2R)-2-carboxy-2-[3-(2,2-difluoro-10,12-dimethyl-1-aza-3-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-3,5,7,9,11-pentaen-4-yl)propanoylamino]ethyl]disulfanyl]-2-[3-(2,2-difluoro-10,12-dimethyl-1-aza-3-azonia-2-boranuidatricyclo[7.3.0.03,7]dodeca-3,5,7,9,11-pentaen-4-yl)propanoylamino]propanoic acid
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~63.42 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.67 mg/mL (2.12 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 16.7 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80 +,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.2699 mL 6.3497 mL 12.6994 mL
5 mM 0.2540 mL 1.2699 mL 2.5399 mL
10 mM 0.1270 mL 0.6350 mL 1.2699 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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