Coenzyme F420-1 (Factor F420-1)

别名: 8-Hydroxy-5-deazaflavin; Factor Fo; 10-(2,3,4,5-tetrahydroxypentyl)-1H-pyrimido[4,5-b]quinoline-2,4,8-trione; factor 420; 37333-48-5; 8-HDF cpd; F(420); DTXSID50958446;
目录号: V40878 纯度: ≥98%
辅酶 FO 是一种脱偶黄素发色团,在产甲烷途径中发挥重要的氢化物受体/供体作用。
Coenzyme F420-1 (Factor F420-1) CAS号: 37333-48-5
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
Other Sizes
点击了解更多
  • 与全球5000+客户建立关系
  • 覆盖全球主要大学、医院、科研院所、生物/制药公司等
  • 产品被大量CNS顶刊文章引用
InvivoChem产品被CNS等顶刊论文引用
产品描述
辅酶 FO 是一种脱偶黄素发色团,在产甲烷途径中发挥重要的氢化物受体/供体作用。
生物活性&实验参考方法
体外研究 (In Vitro)
辅酶 FO 合成过程由两个独立的自由基 SAM 活性位点促进,每个酶对应 CofG、CofH 或 FbiC 中的每一种。 Fo合酶的功能域由这两个SAM域组成。詹氏甲烷球菌使用八种不同的酶来生物合成 F420;需要弄清楚的最后一步是脱偶黄素发色团 (Fo) 是如何形成的 [1]。产甲烷代谢中关键的低氧化还原电位电子载体是辅酶 F420。 F420 依赖性氢化酶在氢气存在下还原辅酶 F420 [3]。辅酶 F420 的功能是将氢化物转移至分枝杆菌中发现的 F420 特异性葡萄糖-6-磷酸脱氢酶 (Fgd)。辅酶 F420 参与能量代谢、NADP 还原、氧解毒和亚硫酸盐还原。它存在于所有产甲烷古菌和某些非产甲烷古菌中。当使用 F420H2 将 NO2 转化回 NO 时,巨噬细胞对结核分枝杆菌的抗菌活性可能会降低[4]。
酶活实验
产甲烷古菌利用[NiFe]-氢化酶(Frh)氧化/还原F420, F420是H2和CO2产甲烷途径中重要的氢化物载体。Frh约占细胞质蛋白的1%,形成一个巨大的复合物,由FrhABG异源三聚体组成,每个异源三聚体具有a [NiFe]中心,四个Fe-S簇和一个FAD。在这里,我们报告了用近原子分辨率冷冻电镜测定的Frh的结构,有和没有结合底物F420。FrhB的多肽链没有同源物,从EM图谱中重新追踪。1.2-MDa复合体包含12个异源三聚体拷贝,出乎意料地形成了一个空心核的球形蛋白壳。低温电镜图显示,与蛋白壳平行的金属簇链具有很强的电子密度,f420结合位点位于链的末端,靠近球形结构的外部。DOI: http://dx.doi.org/10.7554/eLife.00218.001。[1]
辅酶F420是一种氧化还原辅助因子,存在于产甲烷菌和各种放线菌中。尽管该辅助因子具有重要的生物学意义,但其去氮黄素核心(8-羟基-5-去氮黄素,F(o))的生物合成仍然知之甚少。F(o)合成酶是一种不同寻常的多结构域自由基SAM酶,它使用两个独立的5'-脱氧腺苷基自由基来催化F(o)的形成。在这篇文章中,我们报告一个详细的机械研究这个复杂的酶,使我们识别(1)衬底的氢原子抽象的两个激进萨姆域,(2)第二个tyrosine-derived产品,(3)CofH-catalyzed的反应产物反应,(4)演示这种产品是CofG衬底,和(5)立体化学的研究是一致的形成在CofH p-hydroxybenzyl激进活跃的站点。这些结果使我们提出了F(o)合成酶的机制,并在自由基SAM酶学中发现了一个新的催化基序,涉及使用两个5'-脱氧腺苷基介导复杂杂环的形成。[2]
细胞实验
辅酶F420是产甲烷代谢的中心低氧化还原电位电子载体。辅酶在氢作用下通过f420依赖性氢化酶的作用被还原。在ph7下,F420还原的标准自由能变化确定为-15 kJ mol(-1),与温度(25-65℃)无关。用热自养甲烷菌的甲烷生成细胞悬浮液在各种条件下孵育的实验表明,还原和氧化F420的比例与气相氢分压处于热力学平衡状态。在分批进料发酵过程中,随着溶解氢的减少,比例发生了变化。在大多数情况下,电池内F420氧化态和细胞外氢之间的热力学平衡的变化是预期的。此外,barkeri甲烷藻的细胞代谢甲醇,但不转化乙酸盐,在与外部氢的热力学平衡中保持了还原酶和氧化辅酶F420的比例。研究结果表明,F420是一个有用的探针,可用于评估氢代谢甲烷菌的原位氢浓度。[3]
在分枝杆菌中,去氮黄素衍生物F(420)作为F(420)特异性葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(Fgd)的氢化物转移辅酶。分枝杆菌中使用fgd产生的还原F(420) (F(420)H(2))的生理相关反应尚不清楚。在这项工作中,发现F(420)H(2)仅在氧气存在的情况下被NO氧化。进一步分析表明,由NO和O(2)生成的NO(2)是氧化剂。紫外可见光谱和基于NO传感器的分析证明,F(420)H(2)将NO(2)还原为NO。这种反应可以作为结核分枝杆菌的防御系统,结核分枝杆菌在有氧条件下对NO(2)比NO更敏感。活化的巨噬细胞产生NO,在酸化的吞噬体中转化为NO(2)。因此,结核分枝杆菌通过F(420)H(2)将NO(2)转化为NO,可以降低巨噬细胞的抗菌作用;这种防御与细菌需氧生长的活动性肺结核相对应。这一假设与以下观察结果相一致:耻毛分枝杆菌突变株(结核分枝杆菌的非致病性亲戚)不产生或不能减少F(420),对NO(2)的敏感性约为野生型菌株的4倍。这种现象让人联想到γ -生育酚的抗癌活性,它可以将NO(2)还原为NO,并保护人体细胞免受NO(2)诱导的癌变。[2]
参考文献

[1]. De novo modeling of the F(420)-reducing [NiFe]-hydrogenase from a methanogenic archaeon by cryo-electron microscopy. Elife. 2013;2:e00218. Published 2013 Mar 5.

[2]. Biosynthetic versatility and coordinated action of 5'-deoxyadenosyl radicals in deazaflavin biosynthesis. J Am Chem Soc. 2015;137(16):5406-5413.

[3]. Hydrogen concentrations in methane-forming cells probed by the ratios of reduced and oxidized coenzyme F420. Microbiology. 2005;151(Pt 5):1697‐1705.

[4]. Conversion of NO2 to NO by reduced coenzyme F420 protects mycobacteria from nitrosative damage. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106(15):6333‐6338.

其他信息
Factor Fo is a member of quinolines.
8-Hydroxy-5-deazaflavin has been reported in Methanothermobacter thermautotrophicus with data available.
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H17N3O7
分子量
363.322084188461
精确质量
363.107
CAS号
37333-48-5
PubChem CID
122079
外观&性状
Yellow to brown solid powder
LogP
-3
tPSA
169.16
氢键供体(HBD)数目
6
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
26
分子复杂度/Complexity
796
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
HJMIIBXYFPJZBP-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H17N3O7/c20-6-12(23)13(24)11(22)5-19-10-4-8(21)2-1-7(10)3-9-14(19)17-16(26)18-15(9)25/h1-4,11-13,20,22-24H,5-6H2,(H2,17,18,25,26)
化学名
10-(2,3,4,5-tetrahydroxypentyl)-1H-pyrimido[4,5-b]quinoline-2,4,8-trione
别名
8-Hydroxy-5-deazaflavin; Factor Fo; 10-(2,3,4,5-tetrahydroxypentyl)-1H-pyrimido[4,5-b]quinoline-2,4,8-trione; factor 420; 37333-48-5; 8-HDF cpd; F(420); DTXSID50958446;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~5 mg/mL (~13.76 mM)
Ethanol :< 1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 1 mg/mL (2.75 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 10.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 0.53 mg/mL (1.46 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 5.3mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7524 mL 13.7620 mL 27.5239 mL
5 mM 0.5505 mL 2.7524 mL 5.5048 mL
10 mM 0.2752 mL 1.3762 mL 2.7524 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们