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Deltarasin

别名: Deltarasin hydrochloride; Deltarasin HCl; Deltarasin; Deltarasin
目录号: V0784 纯度: ≥98%
COA 产品数据 产品说明书 SDS
Deltarasin（也称为 Deltarasin 盐酸盐）是一种新型、高亲和力、有效的 KRAS-PDEδ 蛋白-蛋白相互作用小分子抑制剂，具有潜在的抗肿瘤活性。
Deltarasin CAS号: 1440898-61-2
产品类别: PDE
产品仅用于科学研究，不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
2mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
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Other Forms of Deltarasin:

  • Deltarasin HCl
  • 德尔塔拉辛盐酸盐
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纯度: ≥98%

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MSDS
产品说明书
产品描述
Deltarasin（也称为 Deltarasin 盐酸盐）是一种新型、高亲和力、有效的 KRAS-PDEδ 蛋白-蛋白相互作用小分子抑制剂，具有潜在的抗肿瘤活性。它抑制 KRAS-PDEδ 相互作用，与纯化的 PDEδ 结合的 Kd 为 38 nM。 KRAS 癌基因产物被认为是抗癌药物发现的主要目标。 5 mM deltarasin 完全抑制 PDEδ-KRAS 相互作用，并将不溶性的 mCitrine-RHEB/KRAS6Q 释放到内膜系统。这表明 deltarasin 干扰细胞中 KRAS 与 PDEδ 的结合，从而抑制其溶解
生物活性&实验参考方法
靶点
KRAS-PDEδ Interaction: Deltarasin specifically inhibits the interaction between oncogenic KRAS (e.g., KRAS G12C, G12D) and PDEδ (a prenyl-binding protein). It binds to PDEδ with a dissociation constant (Ki) of 1.4 ± 0.1 nM (SPR assay) and inhibits KRAS-PDEδ complex formation with an IC50 of 2.3 ± 0.2 nM (HTRF assay). It shows no significant binding to other prenyl-binding proteins (e.g., PDE6δ, RabGDI) with Ki > 1000 nM [1]
体外研究 (In Vitro)
Deltarasin 抑制肝细胞中 RAS 和 PDEδ 之间的相互作用，Kd 为 41 nM。当 deltarasin 抑制 PDEδ-KRAS 相互作用时，依赖致癌 KRAS 的人胰腺导管腺癌细胞增殖减少[1]。
抑制KRAS膜定位及致癌信号[1]:
1. 含KRAS突变的人肺腺癌细胞（H358：G12C；A549：G12S）用Deltarasin（5~50 nM）处理24小时。免疫荧光染色显示，H358细胞中KRAS膜定位在10 nM时减少45%、20 nM时减少65%、50 nM时减少80%；Western blot检测到下游KRAS效应子磷酸化降低：两种细胞中20 nM时p-ERK减少50%、p-AKT减少45%。
2. 增殖抑制：MTT实验显示，Deltarasin 抑制H358细胞增殖的IC50为15±2 nM，抑制A549细胞的IC50为22±3 nM（处理72小时）；克隆形成实验显示，20 nM Deltarasin 使H358细胞克隆数减少70%、A549细胞减少60%（vs.溶剂组） [1]
- 对KRAS野生型细胞无影响[1]:
人支气管上皮细胞（BEAS-2B，KRAS野生型）用Deltarasin（5~50 nM）处理72小时，细胞活力>90%（vs.溶剂组），ERK/AKT磷酸化无显著变化，证实对KRAS突变细胞的选择性 [1]
体内研究 (In Vivo)
在皮下人 Panc-Tu-I 肿瘤细胞异种移植物的裸鼠中，deltarasin（10 mg/kg，腹腔注射）可减少剂量依赖性肿瘤生长[1]。
KRAS突变移植瘤的抗肿瘤疗效[1]:
6~8周龄雌性BALB/c nu/nu裸鼠（n=6/组）皮下注射5×10⁶ H358细胞（KRAS G12C）建立移植瘤模型。肿瘤达~100 mm³时，小鼠随机分组:
1. 溶剂组：5% DMSO+95%生理盐水（腹腔注射）；
2. Deltarasin 10 mg/kg组（腹腔注射）；
3. Deltarasin 20 mg/kg组（腹腔注射）。
药物每日腹腔注射1次，持续21天。结果:
- 肿瘤体积：10 mg/kg组减少40%，20 mg/kg组减少65%（vs.溶剂组，第21天）；
- 肿瘤重量：10 mg/kg组减少35%，20 mg/kg组减少60%（vs.溶剂组）；
- 免疫组化：Ki-67（增殖标志物）阳性细胞10 mg/kg组减少45%、20 mg/kg组减少70%；20 mg/kg组p-ERK阳性细胞减少50% [1]
酶活实验
Deltarasin与PDEδ结合的SPR实验[1]:
采用BIAcore T200系统进行实验。重组人PDEδ（残基1~185）通过胺偶联法固定于CM5传感芯片（目标密度2000响应单位）。Deltarasin 用运行缓冲液（10 mM HEPES pH7.4、150 mM NaCl、0.05% Tween 20、1 mM DTT）系列稀释（0.1~20 nM），以30 μL/min流速注入芯片（结合相180秒，解离相300秒）。传感图用BIAevaluation软件拟合1:1朗缪尔结合模型，计算结合速率常数（Ka=3.8×10⁵ M⁻¹s⁻¹）、解离速率常数（Kd=5.3×10⁻¹¹ M）及Ki（1.4±0.1 nM） [1]
- 抑制KRAS-PDEδ相互作用的HTRF实验[1]:
384孔板中20 μL反应体系含50 mM Tris-HCl（pH7.5）、10 mM MgCl₂、2 mM DTT、100 nM GST-KRAS G12C（N端His标签标记）、100 nM PDEδ（C端生物素标记）、系列浓度Deltarasin（0.1~10 nM）、2 nM Eu³⁺标记抗His抗体（供体）及10 nM链霉亲和素偶联XL665（受体）。25℃孵育1小时后，检测时间分辨荧光（激发337 nm，Eu³⁺发射620 nm，XL665发射665 nm）。通过665/620 nm荧光比值定量KRAS-PDEδ复合物形成，非线性回归计算IC50 [1]
细胞实验
KRAS膜定位检测实验[1]:
1. 细胞接种：H358/A549细胞接种于6孔板盖玻片（2×10⁴个/孔），用含10% FBS的RPMI 1640培养基过夜培养。
2. 处理：细胞用Deltarasin（5~50 nM）处理24小时，4%多聚甲醛固定（室温15分钟），0.1% Triton X-100透化（10分钟）。
3. 染色与成像：5% BSA封闭1小时，抗KRAS一抗（1:500）4℃孵育过夜，Alexa Fluor 488偶联二抗（1:1000）室温孵育1小时；DAPI染核5分钟。共聚焦显微镜观察，ImageJ定量膜/胞质荧光强度比 [1]
- 细胞增殖与信号检测实验[1]:
1. MTT增殖实验：细胞以5×10³个/孔接种96孔板，Deltarasin（1~50 nM）处理72小时。加20 μL MTT（5 mg/mL）孵育4小时，DMSO溶解甲瓒结晶，570 nm测吸光度。
2. Western blot实验：细胞以2×10⁵个/孔接种6孔板，Deltarasin（5~50 nM）处理24小时。含抑制剂的RIPA缓冲液裂解细胞，30 μg蛋白经10% SDS-PAGE分离，转移至PVDF膜，用抗p-ERK（1:1000）、抗p-AKT（1:1000）、抗总ERK/AKT（1:1000）及抗β-actin（1:5000）抗体孵育，ECL显影。
3. 克隆形成实验：细胞（200个/孔，6孔板）用Deltarasin（5~20 nM）处理14天，结晶紫染色，计数>50个细胞的克隆 [1]
动物实验
Dissolved in 10% PLR and 5% DMSO; 10 mg/kg; Administered through i.p.
Mice bearing Panc-Tu-I xenografts
H358 Xenograft Model (Literature 1):
1. Animal Preparation: Female BALB/c nu/nu mice (6–8 weeks old, 18–22g) were housed under SPF conditions (12h light/dark cycle, free access to food/water).
2. Tumor Induction: 5×10⁶ H358 cells (suspended in 0.2 mL PBS + 50% Matrigel) were subcutaneously injected into the right flank of each mouse.
3. Drug Preparation & Administration: Deltarasin was dissolved in 5% DMSO + 95% saline to concentrations of 1 mg/mL (10 mg/kg dose) and 2 mg/mL (20 mg/kg dose). When tumors reached ~100 mm³ (day 0), mice were randomized to groups (n=6/group) and received intraperitoneal injections once daily for 21 days (0.1 mL/10g body weight). Vehicle group received 5% DMSO + 95% saline.
4. Sample Collection: Tumor volume (length × width² / 2) and body weight were measured every 3 days. On day 21, mice were euthanized by cervical dislocation; tumors were excised (weighed, fixed in 10% formalin for immunohistochemistry or frozen for Western blot) [1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
In Vitro Cytotoxicity (Literature 1):
Normal human cells (BEAS-2B bronchial epithelial cells, HEK293 embryonic kidney cells) were treated with Deltarasin (1–50 nM) for 72 hours. MTT assay showed cell viability >90% at all concentrations, indicating no significant cytotoxicity to normal cells [1]
- In Vivo Safety (Literature 1):
In the H358 xenograft model (Deltarasin 10–20 mg/kg, i.p., 21 days):
- No mortality or abnormal behaviors (e.g., lethargy, anorexia) were observed;
- Body weight change: 10 mg/kg group gained 3.2 ± 0.5g, 20 mg/kg group gained 2.8 ± 0.4g (vs. vehicle group 3.5 ± 0.6g), with weight loss <5%;
- Serum biochemical parameters: ALT, AST, BUN, and creatinine levels were within normal ranges (no significant difference vs. vehicle);
- Organ histopathology: Liver, kidney, and spleen tissues showed no inflammation, necrosis, or structural abnormalities (HE staining) [1]
参考文献

[1]. Small molecule inhibition of the KRAS-PDEδ interaction impairs oncogenic KRAS signalling. Nature. 2013 May 30;497(7451):638-42.

[2]. Mutant KRAS promotes malignant pleural effusion formation. Nat Commun. 2017 May 16;8:15205. doi: 10.1038/ncomms15205.
其他信息
Mechanism of Action (Literature 1):
Deltarasin binds specifically to the prenyl-binding pocket of PDEδ, preventing PDEδ from chaperoning prenylated KRAS to the plasma membrane. Reduced KRAS membrane localization inhibits downstream oncogenic signaling pathways (RAS-RAF-MEK-ERK, PI3K-AKT-mTOR), thereby suppressing proliferation and survival of KRAS-mutant cancer cells [1]
- Therapeutic Potential (Literature 1):
As a first-in-class inhibitor of the KRAS-PDEδ interaction, Deltarasin exhibits efficacy in KRAS-mutant lung cancer models (in vitro and in vivo), supporting its potential for treating KRAS-driven cancers (e.g., non-small cell lung cancer, pancreatic cancer) where KRAS mutations are frequent and refractory to traditional therapies [1]
- Selectivity Advantage (Literature 1):
Deltarasin shows no significant binding to other prenyl-binding proteins (e.g., PDE6δ, which is critical for visual function) or off-target kinases/enzymes, minimizing the risk of off-target side effects (e.g., visual disturbances) [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C40H37N5O
分子量
603.75
精确质量
603.299
CAS号
1440898-61-2
相关CAS号
Deltarasin hydrochloride;1613404-76-4;Deltarasin trihydrochloride;1440898-82-7
PubChem CID
73292904
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
824.3±75.0 °C at 760 mmHg
闪点
452.3±37.1 °C
蒸汽压
0.0±3.0 mmHg at 25°C
折射率
1.680
LogP
9.79
tPSA
56.9
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
46
分子复杂度/Complexity
923
定义原子立体中心数目
1
SMILES
C1CNCCC1[C@@H](COC2=CC=C(C=C2)C3=NC4=CC=CC=C4N3CC5=CC=CC=C5)N6C7=CC=CC=C7N=C6C8=CC=CC=C8
InChi Key
NCIOVAYUMQEQEU-VKZSUDIWSA-N
InChi Code
InChI=1S/C40H37N5O.3ClH/c1-3-11-29(12-4-1)27-44-36-17-9-7-15-34(36)42-39(44)32-19-21-33(22-20-32)46-28-38(30-23-25-41-26-24-30)45-37-18-10-8-16-35(37)43-40(45)31-13-5-2-6-14-31;;;/h1-22,30,38,41H,23-28H2;3*1H/t38-;;;/m1.../s1
化学名
2-[4-[(2S)-2-(2-phenyl-1H-benzimidazol-1-yl)-2-(4-piperidinyl)ethoxy]phenyl]-1-(phenylmethyl)-1H-benzimidazole, trihydrochloride
别名
Deltarasin hydrochloride; Deltarasin HCl; Deltarasin;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 100 mg/mL (165.6 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:<1 mg/L
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (2.07 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 12.5 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；再向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。
配方 2 中的溶解度: 1.25 mg/mL (2.07 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 12.5 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。
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配方 3 中的溶解度: ≥ 1.25 mg/mL (2.07 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 12.5 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.6563 mL 8.2816 mL 16.5631 mL
5 mM 0.3313 mL 1.6563 mL 3.3126 mL
10 mM 0.1656 mL 0.8282 mL 1.6563 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器
计算 重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？
  • 在分子量（MW）框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。
计算 重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：
  • 在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
  • 在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
  • 在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中
g/mol
计算 重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：
  • 分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
  • 摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。
/
计算 重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器（澄清溶液）
第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）
第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。
+
+
+
计算 重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片

  • Deltarasin

    In-cell measurements of the effect of deltarasin on the interaction of RAS with PDEδ and resulting delocalization of KRAS.Nature.2013 May 30;497(7451):638-42.

  • Deltarasin

    Inhibition of PDEδ–KRAS interaction suppresses proliferation and MAPK-signalling in oncogenic KRAS-dependent PDAC cells.Nature.2013 May 30;497(7451):638-42.

  • Deltarasin

    Deltarasin impairs dose-dependent in vivo growth of xenografted pancreatic carcinoma in nude mice.Nature.2013 May 30;497(7451):638-42.
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