FAPy-adenine

别名: 4,6-二氨基-5-甲酰胺基嘧啶;4,6-二氨基-5-甲酰基氨基嘧啶
目录号: V37802 纯度: ≥98%
FAPy-腺嘌呤是一种氧化的 DNA 碱基。
FAPy-adenine CAS号: 5122-36-1
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格
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产品描述
FAPy-腺嘌呤是一种氧化的DNA碱基。阿尔茨海默病(AD)患者脑组织中FAPy-腺嘌呤含量升高。氧化核苷是肿瘤、衰老和神经退行性疾病的生化标志物。
FAPy-腺嘌呤 (V37802):4,6-二氨基-5-甲酰胺基嘧啶;腺嘌呤与羟基自由基或电离辐射反应形成的氧化性DNA损伤。它并非药物,而是氧化应激和基因毒性的关键生物标志物。通常通过定量检测尿液、血液和组织中的FAPy-腺嘌呤来评估衰老、神经退行性疾病和癌症中的DNA损伤。
生物活性&实验参考方法
靶点
DNA (as a base lesion); recognized by base excision repair (BER) enzymes such as Fpg (formamidopyrimidine DNA glycosylase) and Nth (endonuclease III).
体外研究 (In Vitro)
FAPy-腺嘌呤能够与四种标准核酸碱基中的每一种形成配对[1]。
在纯化酶活性测定中,含FAPy-腺嘌呤的寡核苷酸可作为大肠杆菌Fpg(kcat/Km ≈ 2.5×10⁶ M-¹min-¹)和人NTH1(亲和力较低)的底物。在DNA聚合酶旁路实验中,可引起G→T颠换。
体内研究 (In Vivo)
阿尔茨海默病相关的脑氧化应激被认为会因氧自由基的产生而加剧,从而对核DNA造成损害[1]。
不适用于治疗;内源性地,啮齿动物肝脏中的 FAPy-腺嘌呤水平在全身照射(0.1-10 Gy)后以剂量依赖的方式增加,在 2 小时达到峰值,并在 24 小时内因修复而下降。
酶活实验
BER 糖基化酶切割分析:将含有单个 FAPy-腺嘌呤的 5'-FAM 标记的 30 聚体寡核苷酸 (1 pmol) 与 0.5 nM Fpg 在 20 uL 缓冲液 (70 mM MOPS-KOH pH 7.5, 10 mM EDTA) 中于 37°C 孵育 15 分钟;用甲酰胺终止反应;产物通过 20% PAGE 分离;对切割条带与未切割条带进行荧光成像。
细胞实验
虽然不是药物,但可用于细胞损伤测量:用 200 uM H2O2 处理人类淋巴细胞 30 分钟,提取 DNA,水解(88% 甲酸,140℃,20 分钟),然后通过 LC-MS/MS 定量 FAPy-腺嘌呤;水平从基线 ~0.5 个损伤/10⁶ 个碱基增加到 ~8 个损伤/10⁶ 个碱基。
动物实验
大鼠暴露于 5 Gy γ 射线照射;在 0、6、24、48 小时收集组织(肝脏、肾脏、大脑);分离、纯化和水解 DNA;通过 HPLC-ECD 测量 FAPy-腺嘌呤;在 6 小时达到峰值,然后下降;与彗星试验尾矩相关。
药代性质 (ADME/PK)
并非药代动力学指标;作为生物标志物,人体尿液中 FAPy-腺嘌呤的排泄量约为 0.5-2 nmol/24 h,随年龄增长而增加(20 至 80 岁之间增加 2 倍),阿尔茨海默病患者的排泄量增加(增加 4 倍)。不经代谢;修复后直接经尿液排出。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
本身无毒;FAPy-腺嘌呤水平升高与诱变和致癌作用相关。可用作氧化性DNA损伤的生物标志物;在炎症性肠病患者的结肠隐窝中,FAPy-腺嘌呤水平>10个损伤/10⁶个碱基与突变频率增加相关。
参考文献

[1]. Increased nuclear DNA oxidation in the brain in Alzheimer's disease.

[2]. Theoretical description of the coding potential of diamino-5-formamidopyrimidines. Z Naturforsch C J Biosci. 1999 Mar-Apr;54(3-4):239-45.

[3]. A rapid and sensitive method for quantitation of nucleosides in human urine using liquid chromatography/mass spectrometry with direct urine injection. Rapid Commun Mass Spectrom. 2004;18(9):973-7.

其他信息
4,6-二氨基-5-氨基甲酸酯是一种氨基嘧啶化合物,其结构是在4,6-二氨基嘧啶的5位上连接了一个额外的甲酰胺基团。当DNA暴露于电离辐射时,它会造成DNA损伤。它既是一种氨基嘧啶,也是一种甲脒。
广泛用作DNA损伤研究的分析标准品。可通过液相色谱-串联质谱法(LC-MS/MS,152→135离子对)或高效液相色谱-电化学检测法进行定量分析。常与8-氧代-dG共同分析。可作为碱基切除修复和氧化应激机制研究的参考化合物。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C5H7N5O
分子量
153.14200
精确质量
281.08
CAS号
5122-36-1
相关CAS号
FAPy-adenine; 5122-36-1
PubChem CID
114926
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
464.7±47.0 °C at 760 mmHg
熔点
224 - 226 °C
闪点
234.8±29.3 °C
蒸汽压
0.0±1.1 mmHg at 25°C
折射率
1.674
来源
Endogenously produced metabolite
LogP
1.92
tPSA
106.92
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
1
重原子数目
11
分子复杂度/Complexity
131
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=CNC1=C(N)N=CN=C1N
InChi Key
MVYUVUOSXNYQLL-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C5H7N5O/c6-4-3(10-2-11)5(7)9-1-8-4/h1-2H,(H,10,11)(H4,6,7,8,9)
化学名
N-(4,6-diaminopyrimidin-5-yl)formamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~17.86 mg/mL (~116.63 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (13.58 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

配方 2 中的溶解度: ≥ 1.79 mg/mL (11.69 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 17.9 mg/mL的澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中并混合均匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 1.79 mg/mL (11.69 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 17.9mg/mL澄清的DMSO储备液加入到900μL 20%SBE-β-CD生理盐水中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 6.5300 mL 32.6499 mL 65.2997 mL
5 mM 1.3060 mL 6.5300 mL 13.0599 mL
10 mM 0.6530 mL 3.2650 mL 6.5300 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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