Fumarate hydratase-IN-1

目录号: V32399 纯度: ≥98%
Fumarate Hydratase-IN-1 (compound 2) 是一种细胞穿透/可渗透的富马酸水合酶抑制剂。
Fumarate hydratase-IN-1 CAS号: 1644060-37-6
产品类别: New2
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产品描述
Fumarate Hydratase-IN-1 (compound 2) 是一种细胞穿透/可渗透的富马酸水合酶抑制剂。 Fumarate Hydratase-IN-1 对多种细胞系具有抗增殖活性,平均 IC50 为 2.2 μM。
生物活性&实验参考方法
靶点
At an average IC50 value of 2.2 μM, fumarate hydrolase-IN-1 inhibits the following cell lines: SK-MEL-28, PC3, HCT-116, ACHN, and SW620 [1].
体外研究 (In Vitro)
富马酸水解酶-IN-1 的平均 IC50 值为 2.2 μM,可抑制以下细胞系:SK-MEL-28、PC3、HCT-116、ACHN 和 SW620 [1]。
Fumarate hydratase-IN-1(化合物3)在多种人类癌细胞系中表现出营养依赖性的抗增殖活性。在无葡萄糖的L-15培养基中培养的SW620、ACHN、HCT-116、PC3和SK-MEL-28细胞系中,其抑制细胞生长的平均IC50约为2.2 μM。然而,当相同细胞系在含葡萄糖的标准DME培养基中培养时,其生长抑制活性降低了10倍以上。[1]
用半乳糖或丙酮酸代替葡萄糖作为碳源,也会导致用化合物3处理的SW620细胞存活率显著降低,表明在糖酵解被抑制的条件下,其细胞毒性增强。[1]
在糖酵解抑制剂2-脱氧葡萄糖(10 mM)存在下,用Fumarate hydratase-IN-1(10 mM)处理SW620细胞,可在30分钟内导致细胞ATP水平快速下降。相反,在葡萄糖转运抑制剂细胞松弛素B(10 μM)存在下用化合物3处理细胞,未观察到ATP耗竭。此特征与典型的OXPHOS抑制剂不同。[1]
化合物3不会引起细胞NADH水平的快速升高,这一点与OXPHOS抑制剂不同。[1]
Fumarate hydratase-IN-1能剂量依赖性地抑制SW620细胞的氧消耗速率。使用Clark型氧电极进行的实时测量显示,用化合物3处理后,细胞呼吸抑制作用立即发生。这种效应不能被质子解偶联剂FCCP所挽救。琥珀酸可以重新启动经化合物3处理的细胞的呼吸作用,表明电子传递链的复合体II-IV功能保持正常。[1]
在使用亚线粒体颗粒的实验中,该化合物不抑制线粒体电子传递链任何单个复合体(I-IV)的活性。[1]
酶活实验
使用偶联酶法测定了Fumarate hydratase-IN-1对延胡索酸水合酶的抑制活性。通过将延胡索酸转化为L-苹果酸的反应与随后由苹果酸脱氢酶(MDH)催化L-苹果酸氧化为草酰乙酸的反应相偶联来监测延胡索酸水合酶活性。通过分光光度法在340 nm处监测NAD+还原为NADH来跟踪氧化反应。初步对照实验证实化合物3不抑制MDH活性。[1]
在此实验中,Fumarate hydratase-IN-1以剂量依赖的方式抑制延胡索酸水合酶。使用Lineweaver-Burk图进行的动力学分析表明,它作为一种竞争性抑制剂,Ki值为4.5 μM。底物延胡索酸的Km测定为1.3 mM,Vmax为1.1 μM/min。[1]
细胞实验
使用细胞活力测定法评估抗增殖活性。将细胞(例如SW620、ACHN、HCT-116、PC3、SK-MEL-28)接种在96孔板中,并在不同的培养基中培养:含葡萄糖的标准DME培养基或无葡萄糖的L-15培养基。用Fumarate hydratase-IN-1的系列稀释液处理细胞48小时。然后使用标准测定法(例如MTS、Alamar Blue)测量细胞活力/增殖,并计算IC50值。[1]
对于ATP测量实验,用Fumarate hydratase-IN-1(10 mM)分别与2-脱氧葡萄糖(10 mM)或细胞松弛素B(10 μM)组合处理SW620细胞30分钟。然后使用基于发光法的ATP检测试剂盒定量细胞ATP水平。[1]
使用XFe96细胞外通量分析仪实时测量细胞氧消耗速率。将SW620细胞接种在XF96板中,测量基线OCR。随后,用不同浓度的Fumarate hydratase-IN-1(0.5-5 μM)处理细胞,并随时间监测OCR。对照化合物包括寡霉素(1 μM,ATP合酶抑制剂)、FCCP(0.5 μM,解偶联剂)以及鱼藤酮(1 μM)和抗霉素A(1 μM,复合体I和III抑制剂)的混合物。[1]
还使用Clark型氧电极评估了OCR抑制的详细实时动力学。将SW620细胞悬浮在呼吸缓冲液中,连续监测氧浓度。建立基线后,加入Fumarate hydratase-IN-1,并记录氧消耗速率的变化。通过在化合物处理后加入琥珀酸来测试其恢复呼吸的能力。[1]
参考文献

[1]. Identification of Fumarate Hydratase Inhibitors with Nutrient-Dependent Cytotoxicity. J Am Chem Soc, 2015 Jan 21, 137(2): 564-567.

其他信息
富马酸水合酶-IN-1是一种可透过细胞膜的小分子抑制剂,能够抑制三羧酸循环(TCA循环)中的富马酸水合酶。[1]
它的发现源于对一个包含多种化合物的化合物库进行的高通量筛选,该筛选旨在寻找具有营养依赖性细胞毒性的化合物,尤其是在低葡萄糖条件下具有更高效力的化合物。[1]
共聚焦荧光显微镜证实,该化合物(作为其乙酯前药的活性代谢物)定位于线粒体。[1]
这类化合物对富马酸水合酶的抑制作用会损害线粒体呼吸,从而使细胞高度依赖葡萄糖代谢才能存活。在需要破坏细胞氧化还原平衡并增强糖酵解依赖性的疾病中,这种机制可能具有治疗潜力。 [1]
目标蛋白(富马酸水合酶)的鉴定采用光亲和标记策略,使用设计的探针(化合物 4),随后进行蛋白质分离和液相色谱-质谱分析。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C27H30N2O4
分子量
446.538107395172
精确质量
446.22
CAS号
1644060-37-6
PubChem CID
121230973
外观&性状
Off-white to yellow solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
693.0±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
372.9±31.5 °C
蒸汽压
0.0±2.2 mmHg at 25°C
折射率
1.616
LogP
4.77
tPSA
75.7
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
33
分子复杂度/Complexity
764
定义原子立体中心数目
2
SMILES
CCOC(=O)[C@@]12CCCC=C1N(C(=O)[C@H]2CC(=O)NC)CC3=CC=C(C=C3)C4=CC=CC=C4
InChi Key
VFGLXHHVYNTCPD-AJTFRIOCSA-N
InChi Code
InChI=1S/C27H30N2O4/c1-3-33-26(32)27-16-8-7-11-23(27)29(25(31)22(27)17-24(30)28-2)18-19-12-14-21(15-13-19)20-9-5-4-6-10-20/h4-6,9-15,22H,3,7-8,16-18H2,1-2H3,(H,28,30)/t22-,27-/m1/s1
化学名
ethyl (3S,3aR)-3-[2-(methylamino)-2-oxoethyl]-2-oxo-1-[(4-phenylphenyl)methyl]-3,4,5,6-tetrahydroindole-3a-carboxylate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~111.97 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.60 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.60 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.60 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2394 mL 11.1972 mL 22.3944 mL
5 mM 0.4479 mL 2.2394 mL 4.4789 mL
10 mM 0.2239 mL 1.1197 mL 2.2394 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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