GNE-6776

别名: GNE-6776;GNE6776;GNE 6776 6'-氨基-4'-乙基-5'-(4-羟基苯基)-N-甲基-[3,3'-联吡啶]-6-甲酰胺
目录号: V3028 纯度: ≥98%
GNE-6776 (GNE6776) 是一种新型、高效、特异性、非共价、口服生物可利用的 USP7(泛素特异性蛋白酶7)抑制剂,具有抗癌活性。
GNE-6776 CAS号: 2009273-71-4
产品类别: DUB
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
GNE-6776 (GNE6776) 是一种新型、高效、特异性、非共价、口服生物可利用的 USP7(泛素特异性蛋白酶7)抑制剂,具有抗癌活性。它对 USP7(IC50 约为 1.34 uM)比 USP47 和 USP5(IC50>200 uM)更具选择性。 GNE-6776还可以促进内源性MDM2泛素化,稳定p53并上调p21,诱导肿瘤细胞死亡并增强化疗药物和PIM激酶抑制剂等靶向化合物的细胞毒性; GNE-6776 促进人类异种移植物中的靶向途径调节。结构研究表明,GNE-6776 非共价地靶向距离催化半胱氨酸 12 Å 的 USP7。 GNE-6776 减弱泛素结合,从而抑制 USP7 去泛素酶活性。它与酸性残基相互作用,介导与泛素 Lys48 侧链的氢键相互作用,表明 USP7 优先与具有游离 Lys48 侧链的泛素部分相互作用并裂解。
生物活性&实验参考方法
靶点
USP7
体外研究 (In Vitro)
体外活性:高通量筛选和反筛选测定。 USP7 UbA10 时间分辨荧光能量转移 (TR-FRET) 活性测定。 USP7 的潜在抑制剂在以 UbA10 作为底物的基于 TR-FRET 的酶活性测定中被鉴定。 UbA10 是天然存在的泛素前体 Ub52 的片段;它保留了 Ub52 的 10 个氨基酸片段,该片段延伸到泛素 C 末端之外。初步筛选测定是一种新型的基于 TR-FRET 的活性测定,可测量双标记肽底物的全长 USP7 的裂解。该肽的 N 末端带有谷胱甘肽 S-转移酶 (GST),C 末端带有 8 个组氨酸残基 (GST-UbA10-His)。这些标签分别由抗 GSH-d2(TR-FRET 受体)和抗 His-铕(TR-FRET 供体)检测。 USP7 在泛素 C 末端对该底物进行切割,导致这两个标签分离并丢失 TR-FRET 信号。将化合物分配到 1,536 孔黑色板(MaKO,Aurora Microplates)中,然后加入 2 μl 全长重组 USP7 的测定缓冲液(50 mM HEPES pH 7.5、0.1% Prionex (Pentapharm)、0.01% Triton X-100 和10 mM 二硫苏糖醇 (DTT))。孵育 10 分钟后,在测定缓冲液中添加 2 μl GST-UbA10-His 底物开始反应。反应75分钟后,添加2μl检测抗体试剂,其在测定缓冲液中含有抗His-铕(Life Technologies)和抗-GST-d2(CISbio)。 60 分钟后,在 ViewLux 读数器 (PerkinElmer) 上读取 618 nm 和 671 nm 处的荧光,并在 340 nm 处激发。双标记底物的裂解导致 TR-FRET 信号丢失,而化合物对 USP7 的抑制恢复了信号。 TR-FRET 比率计算为 671 nm 处的荧光除以 618 nm 处的荧光。 TR-FRET 比率标准化为对照以确定单一浓度筛选的抑制百分比。为了确认浓度-反应模式(10 个点,n = 2),根据化合物浓度绘制抑制百分比,并使用筛选分析分析仪 (Genedata) 将数据拟合到四参数曲线以确定 IC50 值。测定缓冲液经过优化,以保持酶稳定性并最大化背景测定信号:包含 Triton X-100,以防止酶和/或底物非特异性吸附到测定板和/或化合物聚集体、Priionex 载体蛋白上包含在内是为了帮助稳定酶并防止对容器和管道表面的非特异性吸附,以及最大限度地减少库化合物的非特异性抑制,DTT 有助于保持良好的 USP7 活性并最大限度地减少通过氧化还原作用的抑制剂的影响骑自行车。试剂浓度经过优化,可在信号降低测定中实现约 50% 的底物转化,从而获得良好的测定性能,其主要目标是最大限度地减少所需的 USP7 浓度。调整 GST-UbA10-Hi 浓度以使检测信号最大化,抗-GST-d2 浓度与底物的浓度大致平行调整,抗-His-铕的使用浓度代表与底物兼容的最低浓度。 ViewLux 读板机上的稳健检测。进行时程评估以确认酶浓度 (10 nM) 和反应时间 (75 分钟) 处于酶活性的线性范围内。此外,使用延长的检测反应时间过程来证明 60 分钟的孵育足以达到平衡。在最终测定条件下,试剂稳定性研究表明超过 20 小时的可接受性能。在整个屏幕过程中,Z' 值的平均值为 0.76。激酶测定:USP7 二泛素 FRET 活性测定。潜在的 USP7 抑制剂在使用内部猝灭的 K63 连接的双泛素底物(U-310,Boston Biochem)的正交活性测定中得到证实。条件与用于 UbA10 TR-FRET 活性测定的条件相似。将分配到 1,536 孔板中的化合物与全长重组 USP7 在测定缓冲液中预孵育 10 分钟,并通过添加 2 μl 双泛素底物开始反应。在60分钟温育期间,USP7对底物的裂解导致QX1标签对TAMRA标签的猝灭的释放,从而荧光增加。通过 540 nm 激发和 585 nm 发射读取荧光强度。浓度响应测定方法和数据分析按照 UbA10 TR-FRET 测定进行。 USP7 泛素/Rho110 活性测定。以泛素/罗丹明-110 作为底物的正交活性测定也证实了潜在的 USP7 抑制剂。将化合物与 2 μl 全长重组 USP7 在测定缓冲液中预孵育 10 分钟,并通过添加 2 μl 泛素/罗丹明-110(U-555,Boston Biochem)开始反应。经过 60 分钟的反应后,USP7 将罗丹明-110 从泛素上裂解下来,从而增强了荧光,在 485 nm 激发和 535 nm 发射下读取荧光强度。一般测定条件和数据分析如上所述。细胞测定:在添加化合物前 24 小时将 EOL-1 细胞接种到 384 孔板中。然后将细胞与化合物(例如,GNE-6776;0.003、0.009、0.027、0.082、0.25、0.74、2.22、6.67和20μM)孵育72小时或120小时,然后测定活力。生物学测定一式三份进行。在整个测定过程中,细胞在 RPMI-1640、2.5% FBS(72 小时测定)或 5% FBS(120 小时测定)和 2 mM 谷氨酰胺中孵育(37°C,5% CO2)。报告的 IC50 和平均活力指标如下: IC50 是相对于未处理的孔估计抑制为 50% 时的剂量(即绝对 IC50)。计算平均生存力
体内研究 (In Vivo)
GNE-6776 促进人类异种移植物中的靶向途径调节。尽管仅短暂地达到有效暴露,但 GNE-6776 会导致适度但显着的 EOL-1 异种移植物生长延迟
动物实验
Immunodeficient C.B-17 SCID mice with an EOL1 AML xenograft, aged 12–16 weeks[1]
100 or 200 mg/kg
参考文献

[1]. Nature. 2017 Oct 26;550(7677):534-538.

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H20N4O2
分子量
348.406
CAS号
2009273-71-4
相关CAS号
2009273-71-4 ;2009273-60-1
SMILES
O=C(C1=CC=C(C2=C(CC)C(C3=CC=C(O)C=C3)=C(N)N=C2)C=N1)NC
InChi Key
UCYSSYGGXOFJKK-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H20N4O2/c1-3-15-16(13-6-9-17(23-10-13)20(26)22-2)11-24-19(21)18(15)12-4-7-14(25)8-5-12/h4-11,25H,3H2,1-2H3,(H2,21,24)(H,22,26)
化学名
5-[6-amino-4-ethyl-5-(4-hydroxyphenyl)pyridin-3-yl]-N-methylpyridine-2-carboxamide
别名
GNE-6776;GNE6776;GNE 6776
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外)
DMSO : 70~100 mg/mL ( 200.91~287.03 mM )
Ethanol : ~2 mg/mL
溶解度 (体内)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.18 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.18 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (7.18 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.8702 mL 14.3509 mL 28.7018 mL
5 mM 0.5740 mL 2.8702 mL 5.7404 mL
10 mM 0.2870 mL 1.4351 mL 2.8702 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • GNE-6776

    Figure 1: Identification and characterization of USP7 inhibitors.2017 Oct 26;550(7677):534-538.

  • GNE-6776

    Figure 2: Selectivity of USP7 inhibitors and synergy with PIM kinase inhibition.

    GNE-6776

    Figure 3: USP7 inhibitors compete with ubiquitin binding to USP7.2017 Oct 26;550(7677):534-538.

  • GNE-6776

    Figure 4: USP7 preferentially binds and cleaves ubiquitin moieties with free K48 side chains.2017 Oct 26;550(7677):534-538.

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