Guadecitabine sodium (SGI110; S110)

别名: SGI-110 sodium; S-110 sodium; SGI110 sodium; Guadecitabine sodium [USAN]; S110 sodium salt; sodium;[(2R,3S,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxo-1,3,5-triazin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] phosphate; S-110; SGI-110 sodium salt; 0RB89YH367; S110 sodium; SGI 110 sodium; S 110 sodium
目录号: V28733 纯度: ≥98%
瓜德西他滨钠(SGI-110 钠;S-110 钠)是一种由 5-Aza-CdR 和脱氧鸟苷组成的二核苷酸,是一种新型有效的 DNA 甲基转移酶 (DNMT) 抑制剂,有可能用于治疗急性髓系白血病。 AML)和骨髓增生异常综合征(MDS)。
Guadecitabine sodium (SGI110; S110) CAS号: 929904-85-8
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
2mg
5mg
10mg
25mg
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产品描述
瓜德西他滨钠(SGI-110 钠;S-110 钠)是一种由 5-Aza-CdR 和脱氧鸟苷组成的二核苷酸,是一种新型有效的 DNA 甲基转移酶 (DNMT) 抑制剂,可用于治疗急性骨髓性白血病(AML)和骨髓增生异常综合征(MDS)。
生物活性&实验参考方法
靶点
DNMT/DNA methyltransferases
体外研究 (In Vitro)
处理 HCT116 结直肠癌细胞六天后,瓜地他滨钠(SGI-110 钠)被证明会导致 p16 表达呈剂量依赖性增加。此外,用瓜地他滨钠或 5-aza-CdR 处理三天的 T24 和 HCT116 细胞中 p16 蛋白水平以剂量依赖性方式增加,表明瓜地他滨钠抑制 DNA 甲基化并引起 mRNA 和 mRNA 的修饰。触发 p16 的能力。蛋白质和 5-aza-CdR 的量。因此,在抑制T24和HCT116细胞中5'区DNA甲基化和诱导p16基因表达方面,瓜地他滨钠对p16表达的作用与5-aza-CdR相似,且前者作用更强。在这两种细胞系中,诱导都与基因 5' 区域的去甲基化有关。在高达 1 μM 的测试水平下,瓜地西他滨钠的危险性略低于 5-aza-CdR,但在 10 μM 的测试水平下,它表现出相同的毒性 [1]。
体内研究 (In Vivo)
瓜地西他滨钠(SGI-110钠)的毒性与5-Aza-CdR相当,但在10 mg/kg的剂量下也能有效降低DNA甲基化并减缓肿瘤生长。瓜地他滨钠可有效恢复体内 p16 基因表达。 p16 基因在亲本 EJ6 细胞中显着甲基化。在体内,瓜地他滨钠能够显着降低 p16 启动子区域的 DNA 甲基化水平。由于瓜地西他滨钠在体内比 5-Aza-CdR 具有更好的耐受性,因此对于未来的临床应用来说,它可能是一个更有吸引力的选择 [2]。
酶活实验
通过甲基化特异性单核苷酸延伸(Ms SNuPE)进行定量DNA甲基化分析[2]
如前所述,用亚硫酸氢钠转化每个基因组DNA样品2µg,并通过PCR扩增每个感兴趣的区域。p16的PCR条件如下:95°C 3分钟,然后在95°C下变性1分钟40个循环,在62°C下退火1分钟,在72°C下延伸1分钟,最后在72°℃下延伸10分钟。亚硫酸氢盐特异性PCR引物序列如下:p16正义、5'-GTA-GGT-GGGG-GAG-GAG-TTT-AGT-3'、p16反义、5'-TCT-AAT AAC-CAA CCA ACC CCT-CCT-3'。p16的Ms-SNuPE条件如下:95°C 2分钟,50°C 2 min,72°C 1分钟。p16 SNuPE引物如下:5'-TTTT-TAG-GGGG-TGT-TAT ATT-3',5'-TTT-TTTT-TGT-TTG-GAA-AGA-TAT-3'和5'-TTT GAG-GGA-TAG-GGT-3'。用Qiagen凝胶提取试剂盒提取PCR扩增子,并进行Ms SNuPE分析,以检查甲基化水平的变化,如前所述。
细胞实验
瓜地西他滨对肿瘤细胞的体外治疗(S110), J Biomol Screen. 2012 Jan;17(1):2-17.
将细胞(3-4×105)接种在T75组织培养瓶中,24小时后用瓜地西他滨(S110)、5-AZA-CdR或3′-3′-DpG处理,每12小时用含有1μM或10μM<强>胍西他滨、1μM 5-AZA-CdR或3′-3'-DpG的新鲜培养基替换培养基,持续2天(4次脉冲),然后用不含药物的新鲜培养基再处理2天。对照培养物在没有药物的情况下在类似的实验条件下进行处理。
细胞毒性试验,J Biomol Screen. 2012 Jan;17(1):2-17.
使用定量测量LDH释放的比色细胞毒性测定试剂盒对未经处理或用1μM瓜地西他滨(S110)处理的Mel 275黑色素瘤细胞测试HLA-A2限制的gp100特异性CTL的细胞溶解活性。细胞以25/1、12/1、6/1和3/1的效应/靶(E/T)比使用。根据制造商的说明确定特定裂解的百分比。
在37°C下,用20μg/ml的抗HLA I类单克隆抗体W6/32或抗ICAM-1单克隆抗体84H10预孵育30分钟,研究了HLA I类抗原和ICAM-1对瓜地西他滨(S110)处理的Mel 275黑色素瘤细胞的阻断作用。然后,洗涤细胞,并在E/T比为25/1的LDH释放试验中将其用作HLA-A2限制性gp100特异性CTL的靶标。
动物实验
体内药物耐受性研究[2]
将无肿瘤的裸鼠(nu/nu)分为六个治疗组,每组六只动物。S110 和 5-氮杂胞苷(5-Aza-CdR)均用 PBS 配制,并通过尾静脉注射给药。剂量和给药方案的设计使得每组在七天后均接受等摩尔量的 S110 或 5-Aza-CdR。动物按以下方案治疗三周:第 1 组每周一接受 36.6 mg/kg S110 给药;第 2 组每周一次接受 15 mg/kg 5-Aza-CdR 给药;第 3 组每周二和周四接受 18.3 mg/kg S110 给药;第 4 组每周两次接受 7.5 mg/kg 5-Aza-CdR 给药。最后,第5组和第6组分别接受了12.2 mg/kg和5.0 mg/kg的S110和5-Aza-CdR,每周三次(周一、周三和周五)给药。通过体重测量和发病率对耐受性进行粗略评估。每周记录两次体重测量。[2]
腹腔注射给药的体内异种移植药物疗效研究[2]
本研究使用EJ6人膀胱癌细胞,实验方法与之前描述的类似。将悬浮于PBS中的EJ6细胞(5 × 10⁵/注射)皮下注射(SQ)到4至6周龄雌性BALB/c无胸腺裸鼠(Foxn1nu)的左右背部(沿腋中线)。小鼠随机分为3组。 2-3周后,当肉眼可见的肿瘤(50-200 mm³)形成后,开始治疗。使用游标卡尺测量肿瘤大小,并使用以下公式计算肿瘤体积(TV):TV = LD²/2(其中L为最长直径,D为最短直径)。使用相对肿瘤体积(RTV)计算各组小鼠肿瘤生长倍数差异,RTV的计算公式如下:RTV = TVₙ/TV₀,其中TVₙ为第n天的肿瘤体积(mm³),TV₀为第0天(初始治疗)的肿瘤体积(mm³)。在治疗开始和结束时称量小鼠体重,以确定毒性。每只小鼠的体重变化百分比采用以下公式计算:[(W6−W0)/W0] × 100%(其中 Wn 为第 n 天小鼠的体重)。

5-氮杂胞苷 (5-Aza-CdR) 用作阳性对照,0.45% PBS 用作阴性对照。PBS、5-Aza-CdR(PBS 中剂量为 5 mg/kg)和 S110(PBS 中剂量为 10 mg/kg)均通过腹腔注射 (IP) 给药,连续 6 天。

所有小鼠在最后一次给药后 24 小时处死。此时,取出肿瘤,并将每个肿瘤分成两份。一份立即用 TRIzol 试剂匀浆用于 RNA 提取,另一份立即置于液氮中冷冻,用于后续 DNA 提取。基因组DNA和RNA将分别用于通过Ms-SNuPE分析p16启动子的甲基化状态和通过实时RT-PCR分析基因表达。[2]
体内异种移植药物疗效研究(皮下给药)[2]
将107 EJ6膀胱癌细胞皮下接种于无胸腺nu/nu小鼠右后侧。待肿瘤直径达到0.5 cm后,将动物随机分为三组,每组8只,开始治疗。剂量和给药方案的设计使得每组均接受等摩尔量的S110或5-Aza-CdR。药物每周皮下注射一次,S110剂量为12.2 mg/kg,5-Aza-CdR剂量为5.0 mg/kg,持续三周。该研究包含一个适当的PBS对照组。每周两次通过卡尺测量肿瘤大小和体重来监测肿瘤生长抑制和耐受性。
参考文献

[1]. Delivery of 5-aza-2'-deoxycytidine to cells using oligodeoxynucleotides. Cancer Res. 2007 Jul 1;67(13):6400-8.

[2]. S-110, a 5-Aza-2'-deoxycytidine-containing dinucleotide, is an effective DNA methylation inhibitor in vivo and can reduce tumor growth. Mol Cancer Ther. 2010 May;9(5):1443-50.

其他信息
愈创西他滨钠是愈创西他滨的钠盐形式,愈创西他滨是一种二核苷酸抗代谢物,由地西他滨通过磷酸二酯键与脱氧鸟苷连接而成,具有潜在的抗肿瘤活性。愈创西他滨经磷酸二酯键断裂代谢活化后,地西他滨部分掺入DNA,抑制DNA甲基转移酶,从而导致非特异性的全基因组低甲基化,并诱导细胞周期停滞于S期。该药物对胞苷脱氨酶具有抵抗性,这可能导致地西他滨在细胞内外逐渐释放,从而延长地西他滨的暴露时间。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C₁₈H₂₃N₉NAO₁₀P
分子量
579.39
精确质量
579.12
元素分析
C, 37.31; H, 4.00; N, 21.76; Na, 3.97; O, 27.61; P, 5.35
CAS号
929904-85-8
相关CAS号
Guadecitabine;929901-49-5
PubChem CID
135564654
外观&性状
White to off-white solid powder
tPSA
292.69
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
12
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
39
分子复杂度/Complexity
1110
定义原子立体中心数目
6
SMILES
C1[C@@H]([C@H](O[C@H]1N2C=NC3=C2N=C(NC3=O)N)COP(=O)([O-])O[C@H]4C[C@@H](O[C@@H]4CO)N5C=NC(=NC5=O)N)O.[Na+]
InChi Key
XLHBNJPXFOZFNJ-BYKQGDNKSA-M
InChi Code
InChI=1S/C18H24N9O10P.Na/c19-16-22-6-27(18(31)25-16)12-2-8(9(3-28)35-12)37-38(32,33)34-4-10-7(29)1-11(36-10)26-5-21-13-14(26)23-17(20)24-15(13)30;/h5-12,28-29H,1-4H2,(H,32,33)(H2,19,25,31)(H3,20,23,24,30);/q;+1/p-1/t7-,8-,9+,10+,11+,12+;/m0./s1
化学名
sodium;[(2R,3S,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxo-1,3,5-triazin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] phosphate
别名
SGI-110 sodium; S-110 sodium; SGI110 sodium; Guadecitabine sodium [USAN]; S110 sodium salt; sodium;[(2R,3S,5R)-5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methyl [(2R,3S,5R)-5-(4-amino-2-oxo-1,3,5-triazin-1-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] phosphate; S-110; SGI-110 sodium salt; 0RB89YH367; S110 sodium; SGI 110 sodium; S 110 sodium
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~86.30 mM)
H2O : ~50 mg/mL (~86.30 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.31 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.31 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.31 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 33.33 mg/mL (57.53 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶.

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7260 mL 8.6298 mL 17.2595 mL
5 mM 0.3452 mL 1.7260 mL 3.4519 mL
10 mM 0.1726 mL 0.8630 mL 1.7260 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
Phase 3 Randomized, Open-Label Study of Guadecitabine vs Treatment Choice in Previously Treated Acute Myeloid Leukemia
CTID: NCT02920008
Phase: Phase 3
Status: Completed
Date: 2024-08-28
Guadecitabine With or Without Idarubicin or Cladribine in Treating Older Patients With Previously Untreated Acute Myeloid Leukemia
CTID: NCT02096055
Phase: Phase 2
Status: Completed
Date: 2024-08-27
SGI-110 in Adults With Untreated Acute Myeloid Leukemia (AML), Not Considered Candidates for Intensive Remission Induction
CTID: NCT02348489
Phase: Phase 3
Status: Completed
Date: 2024-08-27
SGI-110 in Combination With Carboplatin in Ovarian Cancer
CTID: NCT01696032
Phase: Phase 2
Status: Completed
Date: 2024-08-27
SGI-110 in the Treatment of Advanced Hepatocellular Carcinoma (HCC)
CTID: NCT01752933
Phase: Phase 2
Status: Completed
Date: 2024-08-27
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