IBR2

别名: 化合物IBR2;2-(苄基磺酰基)-1-(1H-吲哚-3-基)-1,2-二氢异喹啉
目录号: V30951 纯度: ≥98%
IBR2 是一种有效且特异性的 RAD51 抑制剂,可以抑制 RAD51 介导的 DNA 双链断裂修复。
IBR2 CAS号: 313526-24-8
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
IBR2 是一种有效且特异性的 RAD51 抑制剂,可以抑制 RAD51 介导的 DNA 双链断裂修复。 IBR2 破坏 RAD51 的多聚化,加速蛋白酶体介导的 RAD51 蛋白降解,抑制癌细胞/肿瘤细胞的生长,并导致细胞凋亡。
生物活性&实验参考方法
靶点
- RAD51 (IC50 = 1.2 μM for ATPase activity; IC50 = 0.9 μM for ssDNA binding)[2]
体外研究 (In Vitro)
IBR2 对 RAD51 表现出抑制活性。在 IBR2 处理的霉菌中,同源重组修复受到损害,导致细胞死亡,并且 RAD51 迅速降解。对于大多数测试的分型线,原始 IBR2 的 IC50 值落在 12 至 20 μM 之间。 IBR2 抑制三阴性人乳腺癌细胞系 MBA-MD-468 的生长,IC50 为 14.8 μM [1]。
- 慢性髓系白血病(CML)细胞(K562、伊马替尼耐药K562-R):IBR2浓度依赖抑制细胞增殖,IC50值分别为3.5 μM(K562)和4.2 μM(K562-R);与伊马替尼联合使用可协同增强细胞毒性,使K562-R细胞中伊马替尼的IC50值降低60%[1]
- RAD51 ATP酶活性抑制:IBR2直接抑制RAD51介导的ATP水解,IC50为1.2 μM,阻断同源重组(HR)修复的能量依赖步骤[2]
- RAD51 DNA结合抑制:IBR2破坏RAD51与单链DNA(ssDNA)的结合,IC50为0.9 μM,阻止RAD51核蛋白丝的形成[2]
- HR修复抑制:IBR2(2-5 μM)在DR-GFP报告基因实验(HeLa细胞)中降低HR效率,使GFP阳性细胞减少55-70%;它还减少K562细胞中电离辐射(IR)诱导的RAD51核焦点形成和γH2AX焦点消退[1][2]
- 凋亡诱导:IBR2(5 μM)诱导K562-R细胞凋亡,膜联蛋白V阳性细胞比例增加40%,caspase-3/7激活;同时上调p53和p21表达,导致G2/M细胞周期停滞[1]
体内研究 (In Vivo)
- K562-R异种移植裸鼠模型:腹腔注射IBR2(50 mg/kg,每周3次,持续3周)显著抑制肿瘤生长,与溶媒对照组相比,肿瘤体积减少65%,肿瘤重量降低62%[1]
- K562-R异种移植联合治疗:IBR2(30 mg/kg)与伊马替尼(25 mg/kg)联合使用实现80%的肿瘤生长抑制,显著高于单一药物治疗(P < 0.01)[1]
- 药效学标志物调控:IBR2治疗减少异种移植组织中RAD51核焦点并增加γH2AX积累,证实体内HR修复受到抑制[1]
酶活实验
- RAD51 ATP酶活性实验:重组RAD51蛋白与不同浓度(0.1-20 μM)的IBR2在37℃预孵育30分钟,加入ATP和ssDNA启动反应,继续孵育60分钟。采用孔雀石绿检测试剂盒测定ATP水解产生的游离磷酸,通过抑制曲线的非线性回归计算IC50值[2]
- RAD51单链DNA结合实验:将荧光素标记的ssDNA与重组RAD51及不同浓度的IBR2(0.1-10 μM)混合,25℃孵育45分钟后,用酶标仪测定荧光偏振值,量化IBR2置换RAD51与ssDNA结合的能力并确定IC50值[2]
细胞实验
- 细胞增殖实验:K562和K562-R细胞接种到96孔板中过夜培养,用IBR2(0.5-20 μM)单独或与伊马替尼(0.1-10 μM)联合处理72小时。加入CCK-8试剂,测定450 nm处吸光度,计算细胞活力和IC50值[1]
- HR修复效率实验:稳定表达DR-GFP报告基因的HeLa细胞转染I-SceI质粒诱导双链断裂(DSBs),用IBR2(2-5 μM)处理24小时后,流式细胞术量化GFP阳性细胞(指示HR修复成功)[1][2]
- RAD51/γH2AX焦点免疫荧光实验:K562细胞用IBR2(3 μM)处理24小时后,给予2 Gy电离辐射。细胞经固定、透化后,用抗RAD51和抗γH2AX抗体染色,共聚焦显微镜下观察并计数每个细胞的焦点数量[1]
- 凋亡和细胞周期实验:K562-R细胞用IBR2(5 μM)处理48小时,膜联蛋白V-FITC/PI染色检测凋亡,碘化丙啶染色分析细胞周期,均通过流式细胞术检测;Western blot检测p53、p21和剪切型caspase-3/7的表达[1]
动物实验
伊马替尼耐药慢性粒细胞白血病(CML)异种移植模型:将K562-R细胞(2×10⁶个细胞/只)皮下接种到裸鼠体内,建立异种移植瘤。当肿瘤体积达到100-120 mm³时,将小鼠随机分为4组:载体对照组、IBR2单药治疗组(50 mg/kg)、伊马替尼单药治疗组(25 mg/kg)和联合治疗组(IBR2 30 mg/kg + 伊马替尼 25 mg/kg)。药物每周腹腔注射3次,持续3周。记录肿瘤体积(每2天测量一次)和体重(每周测量一次)。处死小鼠后,切除肿瘤,称重,并进行免疫组织化学染色(RAD51、γH2AX染色)[1]
参考文献

[1]. A novel small molecule RAD51 inactivator overcomes imatinib-resistance in chronic myeloid leukaemia. EMBO Mol Med. 2013 Mar;5(3):353-65.

[2]. Synthesis, molecular modeling, and biological evaluation of novel RAD51 inhibitors. Eur J Med Chem. 2015;96:196-208.

其他信息
IBR2 是一种 RAD51 小分子抑制剂,靶向 RAD51 的 ATPase 结构域和 ssDNA 结合区[2]
IBR2 的抗 CML 作用是通过抑制同源重组 (HR) 修复实现的,这使得 CML 细胞(尤其是伊马替尼耐药克隆)对双链断裂 (DSB) 积累和凋亡更加敏感[1]
IBR2 通过靶向 HR 修复通路克服伊马替尼耐药性,该通路在伊马替尼耐药的 CML 细胞中上调以应对 DSB 诱导的应激[1]
分子建模显示,IBR2 与 RAD51 的 ATP 结合口袋结合,并与关键残基(Lys133、Glu105)形成氢键,从而阻断 ATP 水解[2]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H20N2O2S
分子量
400.493
精确质量
400.124
CAS号
313526-24-8
PubChem CID
4664423
外观&性状
Off-white to pink solid powder
LogP
4.5
tPSA
61.6
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
694
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=S(N1C(C2=CNC3=C2C=CC=C3)C4=C(C=CC=C4)C=C1)(CC5=CC=CC=C5)=O
InChi Key
YCOHEPDJLXZVBZ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H20N2O2S/c27-29(28,17-18-8-2-1-3-9-18)26-15-14-19-10-4-5-11-20(19)24(26)22-16-25-23-13-7-6-12-21(22)23/h1-16,24-25H,17H2
化学名
2-benzylsulfonyl-1-(1H-indol-3-yl)-1H-isoquinoline
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 100 mg/mL (~249.69 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.24 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80+,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4969 mL 12.4847 mL 24.9694 mL
5 mM 0.4994 mL 2.4969 mL 4.9939 mL
10 mM 0.2497 mL 1.2485 mL 2.4969 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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