MS402

别名: 3-氯-N-(4-甲氧基苯基)-4-((2-甲基-3-氧代环戊-1-烯-1-基)氨基)苯甲酰胺
目录号: V32375 纯度: ≥98%
MS402 是一种 BD1 选择性 BET BrD 抑制剂(拮抗剂),对 BRD4(BD1)、BRD4(BD2)、BRD3(BD1)、BRD3(BD2)、BRD2(BD1) 和 BRD2(BD2) 的 Ki 分别为 77 nM。
MS402 CAS号: 1672684-68-2
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
MS402 是一种 BD1 选择性 BET BrD 抑制剂(拮抗剂),对 BRD4(BD1)、BRD4(BD2)、BRD3(BD1)、BRD3(BD2)、BRD2(BD1) 和 BRD2(BD2) 的 Ki 分别为 77 nM。 718 nM、110 nM、200 nM、83 nM 和 240 nM。 MS402 阻断 Th17 细胞分化并改善小鼠结肠炎。
生物活性&实验参考方法
体外研究 (In Vitro)
MS402 能剂量依赖性地选择性抑制小鼠初始CD4+ T细胞分化为辅助性T细胞17 (Th17)(例如,在测试浓度范围内,IL-17+细胞百分比从18.6%降至8.0%)。它对Th1细胞分化有适度影响(IFN-γ+细胞从49.7%降至38.6%),对Th2(IL-4表达)或调节性T细胞(Treg,Foxp3表达)的分化几乎没有影响。
MS402 能剂量依赖性地抑制Th17特征基因(如 rorc, il17a)的mRNA表达,适度影响Th1基因(tbx21/T-bet, ifng),对Th2(gata3, il4)或Treg(foxp3, il10)基因影响甚微。
MS402 处理降低了 il17a/f 和 rorc 基因座上的Brd4和Cdk9占据以及RNA聚合酶II Ser2磷酸化水平,这些是转录延伸的关键。
MS402 不影响T细胞增殖。
基因组分析(ChIP-seq, RNA-seq)显示,与泛BET抑制剂JQ1相比,MS402 能有效降低Brd4在Th17特征基因位点和超级增强子上的占据并下调其转录,但对看家基因影响较小。[1]
体内研究 (In Vivo)
用从 C57BL/6 小鼠淋巴结和脾脏获得的初始 CD4+CD45RBhi 细胞重建 4 周后,Rag1-/- 动物开始体重减轻。 MS402(10 mg/kg;腹腔注射,每周两次,持续 3 周)引起的体重减轻显着减少[1]。
在Rag1−/−小鼠的T细胞转移诱导性结肠炎预防模型中,腹腔注射 MS402(10 mg/kg,每周两次,持续7周,从第0周开始)显著减轻了体重下降,改善了结肠缩短和炎症,并导致更低的疾病组织病理学评分(0-1分,对照组为3分)。
在治疗模型中(在细胞移植后第5周结肠炎已形成时开始治疗),MS402(10 mg/kg,每周两次,持续3周)逆转了体重下降,改善了结肠病理,并降低了炎症评分。
结肠组织的流式细胞术分析显示,MS402 治疗显著降低了产生IL-17和IFN-γ的CD4+ T细胞比例,且在治疗模型中对Th17细胞的影响更为显著。
与疾病对照组相比,MS402 治疗组小鼠结肠中关键细胞因子(il17, il21, il22, il6, ifng)和转录因子(rorc, T-bet)的mRNA水平显著降低。[1]
酶活实验
使用结合实验测定抑制常数 (Ki)。可能采用荧光偏振或类似的结合实验,测量了MS402与各种溴结构域(BRD4 BD1、BD2以及其他蛋白如BRD2、BRD3、CBP、PCAF等的溴结构域)的亲和力。报告的BRD4 BD1的Ki值为77 nM。基于这些测量结果计算了其对BD2和其他溴结构域的选择性。[1]
可能采用了热位移实验来评估化合物结合和蛋白稳定性,辅助表征结合选择性。[1]
细胞实验
使用抗体包被的磁珠从小鼠脾脏和淋巴结中纯化初始CD4+ T细胞。
对于Th17分化,细胞在板结抗CD3和抗CD28抗体以及细胞因子IL-6和TGF-β存在下被激活。每天向培养基中添加指定浓度(例如,100 nM, 500 nM)的MS402或其他抑制剂。细胞培养3-3.5天。
对于细胞内细胞因子染色,分化后的细胞在布雷菲德菌素A存在下,用佛波酯 (PMA) 和离子霉素刺激5小时。细胞固定、透化,并用针对IL-17、IFN-γ和CD4的荧光标记抗体染色,随后进行流式细胞术分析。
对于mRNA表达分析,从分化的细胞中提取总RNA,进行逆转录,并使用基因特异性引物通过定量实时PCR (qPCR) 进行分析。表达水平以内参基因 (Actin/Gapdh) 进行标准化。
进行了染色质免疫沉淀 (ChIP) 实验。细胞用甲醛交联、裂解并超声处理以剪切染色质。用抗Brd4或其他蛋白的抗体对染色质提取物进行免疫沉淀。沉淀的DNA通过qPCR (ChIP-qPCR) 分析或用于测序文库制备 (ChIP-seq)。[1]
动物实验
动物/疾病模型: C57BL/6 小鼠、Rag1-/- 小鼠、T 细胞转移诱导的结肠炎模型 [1]
剂量: 10 mg/kg
给药途径: 腹腔注射 (ip),每周两次,持续 3 周
实验结果: 体重减轻显著减少。
T 细胞转移诱导的结肠炎模型:从供体小鼠 (C57BL/6) 的脾脏和淋巴结中分离出幼稚 CD4+CD45RBhi T 细胞。将约 5 × 10⁵ 个细胞溶于无菌 PBS 中,腹腔注射到每只 Rag1−/− 受体小鼠体内。
预防性研究:从 T 细胞转移当天(第 0 周)开始,每周两次腹腔注射 MS402(10 mg/kg,溶于 PBS),持续 7 周。对照组注射 PBS 溶剂。
治疗性研究:在 T 细胞转移后第 5 周,当小鼠出现结肠炎症状(例如体重减轻)时,开始腹腔注射 MS402(10 mg/kg,每周两次),持续 3 周。
每周监测小鼠的体重变化。在研究终点(第 7 或 8 周),处死小鼠。切取结肠组织,测量其大小,并固定用于组织病理学分析(H&E 染色)。由一位对治疗方案不知情的病理学家对切片进行炎症严重程度评分。
分离结肠固有层淋巴细胞进行流式细胞术分析,以确定IL-17+和IFN-γ+ CD4+ T细胞的频率。
结肠组织还用于RNA提取和qPCR分析,以检测细胞因子和转录因子mRNA的水平。[1]
参考文献

[1]. BET N-terminal bromodomain inhibition selectively blocks Th17 cell differentiation and ameliorates colitis in mice. Proc Natl Acad Sci U S A. 2017 Mar 14;114(11):2952-2957.

其他信息
MS402 是一种基于环戊酮的小分子抑制剂,旨在选择性靶向 BET 蛋白的第一个溴结构域 (BD1)。
MS402 与 BRD4 BD1 复合物的晶体结构(PDB:5ULA)显示,该化合物结合于 ZA 通道,形成特异性的氢键和范德华力。与 BD1 中 Gln85 和 Ile146 的关键相互作用使其对 BD2 具有选择性。
该研究提出,选择性抑制 BET 蛋白 BD1(主要通过破坏 Brd4 功能)是阻断致病性 Th17 细胞分化的有效策略,且不会广泛损害其他 T 辅助细胞谱系,为 Th17 介导的炎症性肠病(如结肠炎)提供了一种潜在的治疗方法。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C20H19CLN2O3
分子量
370.8295
精确质量
370.108
CAS号
1672684-68-2
PubChem CID
90718189
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
3.6
tPSA
67.4
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
26
分子复杂度/Complexity
569
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC1C([H])=C(C(N([H])C2C([H])=C([H])C(=C([H])C=2[H])OC([H])([H])[H])=O)C([H])=C([H])C=1N([H])C1=C(C([H])([H])[H])C(C([H])([H])C1([H])[H])=O
InChi Key
VZTVTSICPINUNG-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C20H19ClN2O3/c1-12-17(9-10-19(12)24)23-18-8-3-13(11-16(18)21)20(25)22-14-4-6-15(26-2)7-5-14/h3-8,11,23H,9-10H2,1-2H3,(H,22,25)
化学名
3-chloro-N-(4-methoxyphenyl)-4-[(2-methyl-3-oxocyclopenten-1-yl)amino]benzamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~269.67 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (6.74 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.74 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.6967 mL 13.4833 mL 26.9665 mL
5 mM 0.5393 mL 2.6967 mL 5.3933 mL
10 mM 0.2697 mL 1.3483 mL 2.6967 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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