NMDI14

目录号: V30975 纯度: ≥98%
NMDI14 是无义介导的 RNA 衰变 (NMD) 的抑制剂(阻断剂/拮抗剂)。
NMDI14 CAS号: 307519-88-6
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
NMDI14 是无义介导的 RNA 衰变 (NMD) 的抑制剂(阻断剂/拮抗剂)。 NMDI14 干扰 SMG7-UPF1 相互作用并抑制无义介导的 RNA 衰变。
生物活性&实验参考方法
靶点
NMDI14 targets nonsense-mediated RNA decay (NMD) pathway (IC₅₀ = 1.8 μM for NMD inhibition)[1]
体外研究 (In Vitro)
NMDI14 是一种无义介导的 RNA 衰变 (NMD) 抑制剂。如果产生生物活性血红蛋白,用NMDI14处理细胞6小时,可使PTC 39 β-珠蛋白升高至12%,相对提高四倍,足以改善地中海贫血的临床症状。 NMDI14 治疗三天并没有导致细胞计数减少,表明 NMD 可以被药理学抑制,而不会对增殖产生微小的改变。 NMDI14 使 941 个基因升高超过 1.5 倍。 NMDI14 处理 6 小时导致 N417 细胞中 p53 表达达到稳态,与 U2OS 细胞中的表达相当。在不影响 NMDI 处理的 U2OS 细胞中野生型 p53 稳定性的情况下,NMDI14 显着提高了 N417 细胞中 PTC 突变体 p53 mRNA 的稳定性 [1]。
NMDI14 可特异性抑制人类癌细胞中的NMD通路,稳定含无义突变的mRNA(包括p53无义突变体如R175X、R248X、R273X);使含无义突变的p53 mRNA水平升高2-3倍,并恢复功能性p53蛋白表达[1]
NMDI14 以浓度依赖性方式(EC₅₀≈2.5 μM)抑制携带p53无义突变的癌细胞(转染p53-R175X、R248X、R273X的H1299细胞)增殖;通过恢复p53介导的下游靶基因(p21、Bax)转录激活,诱导细胞G1期周期阻滞和凋亡[1]
NMDI14 对正常人类成纤维细胞的NMD通路无显著抑制作用,表明其对NMD通路失调的癌细胞具有选择性活性[1]
细胞实验
NMD抑制活性检测实验:在RPMI 1640培养基中培养人类癌细胞(H1299、HCT116)和正常成纤维细胞;用NMDI14(0.1-10 μM)处理细胞24小时;转染含无义突变的报告质粒以监测NMD活性;通过荧光素酶活性检测量化NMD抑制效率[1]
p53无义突变恢复实验:向H1299细胞转染p53无义突变质粒(R175X、R248X、R273X);用NMDI14(1-5 μM)处理转染后的细胞48小时;通过实时荧光定量PCR(qPCR)检测p53 mRNA水平,Western blot检测p53蛋白水平;通过qPCR和Western blot分析p53下游靶基因(p21、Bax)的表达[1]
癌细胞增殖与凋亡检测实验:在RPMI 1640培养基中培养携带p53无义突变的癌细胞;用NMDI14(0.5-10 μM)处理细胞24-72小时;通过CCK-8法评估细胞增殖,PI染色流式细胞术分析细胞周期分布,Annexin V-FITC/PI双染色流式细胞术检测凋亡[1]
参考文献

[1]. Identification and characterization of small molecules that inhibit nonsense-mediated RNA decay and suppress nonsense p53 mutations. Cancer Res. 2014 Jun 1;74(11):3104-1.

[2]. Decreased mRNA and protein stability of W1282X limits response to modulator therapy. J Cyst Fibros. 2019;18(5):606-613.

其他信息
NMDI14是一种NMD通路的小分子抑制剂,专为靶向肿瘤抑制基因(例如p53)中存在无义突变的癌细胞而开发[1]
其作用机制涉及与NMD复合物的关键组分(UPF1)结合,阻止含有无义突变的mRNA降解,从而促进功能性蛋白质的翻译[1]
NMDI14有望成为一种靶向治疗药物,用于治疗对传统疗法无反应的无义突变癌症,其作用机制是通过恢复失活的肿瘤抑制蛋白的功能[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C21H25N3O4S
分子量
415.505903959274
精确质量
415.156
CAS号
307519-88-6
PubChem CID
2886617
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
658.8±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
352.2±31.5 °C
蒸汽压
0.0±2.0 mmHg at 25°C
折射率
1.597
LogP
4.3
tPSA
125
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
645
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
QRLPSNLBUMVXBL-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C21H25N3O4S/c1-6-28-21(27)18-12(4)13(5)29-20(18)24-17(25)9-16-19(26)23-15-8-11(3)10(2)7-14(15)22-16/h7-8,16,22H,6,9H2,1-5H3,(H,23,26)(H,24,25)
化学名
ethyl 2-[[2-(6,7-dimethyl-3-oxo-2,4-dihydro-1H-quinoxalin-2-yl)acetyl]amino]-4,5-dimethylthiophene-3-carboxylate
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 25 mg/mL (~60.17 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 0.83 mg/mL (2.00 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 8.3 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 0.83 mg/mL (2.00 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 8.3 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4067 mL 12.0334 mL 24.0668 mL
5 mM 0.4813 mL 2.4067 mL 4.8134 mL
10 mM 0.2407 mL 1.2033 mL 2.4067 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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