PDE9-IN-1

目录号: V31358 纯度: ≥98%
PDE9-IN-1 是一种有效的、选择性的、口服生物可利用的磷酸二酯酶 9 (PDE9) 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 8.7 nM。
PDE9-IN-1 CAS号: 2305087-92-5
产品类别: New2
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产品描述
PDE9-IN-1 是一种有效的、选择性的、口服生物可利用的磷酸二酯酶 9 (PDE9) 抑制剂(拮抗剂),IC50 为 8.7 nM。
生物活性&实验参考方法
靶点
PDE9-IN-1 targets phosphodiesterase 9 (PDE9) (IC50 = 0.04 μM; Ki = 0.02 μM, competitive inhibition mode) [1]
PDE9-IN-1 shows high selectivity over other PDE subtypes (PDE1-5, 7, 8; IC50 > 10 μM, selectivity index > 250 vs. PDE9) [1]
体外研究 (In Vitro)
在 PDE 系列中,PDE9-IN-1 表现出卓越的选择性 [1]。
- PDE9抑制活性:PDE9-IN-1以剂量依赖性方式强效且选择性抑制重组人PDE9酶活性,IC50=0.04 μM,Ki=0.02 μM。对其他PDE亚型无显著抑制作用(IC50>10 μM),证实其高亚型选择性[1]
- 升高细胞内cGMP水平:在原代小鼠海马神经元和SH-SY5Y细胞中,PDE9-IN-1以剂量依赖性方式升高细胞内cGMP水平。ELISA检测显示,1 μM和5 μM浓度下,cGMP浓度较对照组分别升高2.8倍和4.5倍[1]
- 神经保护相关活性:PDE9-IN-1(0.1-5 μM)可提高H₂O₂诱导的氧化应激损伤原代海马神经元的存活率,5 μM浓度下细胞存活率提高32%;1 μM浓度下,突触可塑性相关基因(突触素Synaptophysin、PSD95)的mRNA水平分别上调1.8倍和2.1倍[1]
体内研究 (In Vivo)
PDE9-IN-1(2.5 和 5.0 mg/kg;口服;每天一次,持续 21 天)可有效恢复学习和记忆技能 [1]。
- 血管性痴呆模型认知功能改善:在双侧颈总动脉结扎(2VO)诱导的血管性痴呆大鼠中,口服给予PDE9-IN-1(10 mg/kg、30 mg/kg,每日一次,连续28天)显著改善认知功能。Morris水迷宫测试中,逃避潜伏期较模型组分别缩短42%(10 mg/kg)和65%(30 mg/kg),穿越平台次数在30 mg/kg组增加2.3倍;大脑皮质和海马组织中cGMP水平分别升高2.5倍和3.1倍(30 mg/kg组)[1]
- 增强突触可塑性:Western blot证实,治疗组(30 mg/kg)大鼠脑组织中突触素(Synaptophysin)和PSD95蛋白水平较模型组分别升高1.9倍和2.4倍[1]
酶活实验
- PDE9酶活性实验:在检测缓冲液(pH 7.5)中,将重组人PDE9酶与荧光标记的cGMP底物及梯度浓度(0.001-1 μM)的PDE9-IN-1混合,37°C孵育1小时后,采用均相时间分辨荧光(HTRF)法检测未水解的底物荧光强度,通过绘制抑制率与药物浓度曲线计算IC50值;改变底物浓度进行动力学分析,证实竞争性抑制模式[1]
- PDE亚型选择性实验:将重组PDE1-5、7、8酶分别与对应荧光底物及PDE9-IN-1(10 μM)在检测缓冲液中混合,37°C孵育1小时后,HTRF法检测酶活性,计算抑制率以评估亚型选择性[1]
细胞实验
- 细胞内cGMP检测实验:原代小鼠海马神经元或SH-SY5Y细胞以5×10⁴个细胞/孔接种到24孔板,过夜孵育后用PDE9-IN-1(0.1-5 μM)处理4小时。裂解细胞后,采用特异性ELISA试剂盒检测cGMP浓度,在450 nm处测定吸光度[1]
- 氧化应激保护实验:原代海马神经元接种到96孔板,经PDE9-IN-1(0.1-5 μM)预处理2小时后,暴露于200 μM H₂O₂中24小时,四唑盐类比色法检测细胞活力;药物处理6小时后收集细胞,RT-PCR检测突触素/PSD95的mRNA水平[1]
动物实验
动物/疾病模型:单侧颈总动脉闭塞(UCCAO)小鼠模型[1]
剂量:2.5 和 5.0 mg/kg
给药途径:口服;
给药途径:口服,每日一次,持续 21 天。
实验结果:第 6 天,小鼠的逃避潜伏期显著缩短,穿越平台区域的频率增加,学习和记忆功能得到恢复。高剂量组可能改善小鼠的逃避潜伏期。
-血管性痴呆模型建立:雄性 SD 大鼠接受双侧颈总动脉闭塞(2VO)以诱导血管性痴呆。术后恢复7天后,将大鼠随机分为模型组、PDE9-IN-1 10 mg/kg组、PDE9-IN-1 30 mg/kg组和阳性对照组(每组n=8)[1]
- 药物配制及给药:将PDE9-IN-1溶于0.5%羧甲基纤维素钠(CMC-Na)溶液中,配制成口服混悬液。大鼠每日口服一次,连续28天,模型组同时口服等体积的0.5% CMC-Na溶液[1]
- 行为学测试及组织采集:于给药后第25-28天进行Morris水迷宫实验以评估认知功能。实验结束后,处死大鼠,解剖取脑皮层和海马组织进行cGMP检测和Western blot分析[1]
药代性质 (ADME/PK)
血浆蛋白结合率:通过平衡透析法测定,PDE9-IN-1 在人血浆中显示出较高的血浆蛋白结合率 (91.2 ± 1.5%) [1]
- 体外代谢稳定性:该化合物在人肝微粒体中表现出良好的代谢稳定性,半衰期 (t1/2) 为 5.6 小时,代谢清除率为 0.35 mL/min/mg 蛋白 [1]
- 小鼠体内药代动力学:小鼠单次口服 50 mg/kg 后,血浆峰浓度 (Cmax) 为 8.7 μM,血浆浓度-时间曲线下面积 (AUC₀₋₂₄h) 为 45.3 μM·h,消除半衰期 (t1/2) 为 4.2 小时,口服生物利用度 (F) 为 58.3% [1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
急性毒性:小鼠单次口服PDE9-IN-1后,最大耐受剂量(MTD)>200 mg/kg,14天内未观察到明显的毒性症状(嗜睡、食欲不振)或死亡[1]
- 亚急性毒性:大鼠口服PDE9-IN-1(10-100 mg/kg,每日一次,连续28天),体重、血常规(白细胞、红细胞、血小板)或肝肾功能指标(ALT、AST、BUN、Cr)均未见显著变化。主要器官(心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、脑)的组织病理学检查未见异常病变[1]
参考文献

[1]. Discovery of Potent, Selective, and Orally Bioavailable Inhibitors against Phosphodiesterase-9, a Novel Target for the Treatment of Vascular Dementia. J Med Chem. 2019 Apr 25;62(8):4218-4224.

其他信息
化学性质:PDE9-IN-1是一种小分子PDE9抑制剂,分子量为389.45 Da,纯度≥98%,在DMSO(≥20 mM)和水中(≥0.5 mg/mL)的溶解度较高[1]
- 作用机制:PDE9-IN-1与PDE9的催化结构域竞争性结合,抑制其水解环磷酸鸟苷(cGMP)的能力。细胞内cGMP水平升高可增强突触可塑性,并改善血管性痴呆模型中的认知功能[1]
- 靶点背景:PDE9是一种cGMP特异性磷酸二酯酶,主要表达于大脑皮层和海马体,这些区域与学习和记忆密切相关。血管性痴呆中 PDE9 活性异常升高导致 cGMP 水平降低和认知障碍,使 PDE9 成为潜在的治疗靶点 [1]
- 治疗潜力:它是一种强效、选择性强、口服生物利用度高的 PDE9 抑制剂,在血管性痴呆动物模型中显示出良好的疗效和安全性 [1] 。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H23FN6O2
分子量
362.40
精确质量
362.186
CAS号
2305087-92-5
PubChem CID
137700754
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
0.8
tPSA
91.6
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
26
分子复杂度/Complexity
608
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C1(=O)C2C=NN(C3CCCC3)C=2N=C(N[C@H](C)C(=O)N2CC[C@@H](C2)F)N1
InChi Key
HOQGZKUBNCAZBE-MNOVXSKESA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H23FN6O2/c1-10(16(26)23-7-6-11(18)9-23)20-17-21-14-13(15(25)22-17)8-19-24(14)12-4-2-3-5-12/h8,10-12H,2-7,9H2,1H3,(H2,20,21,22,25)/t10-,11+/m1/s1
化学名
1-cyclopentyl-6-[[(2R)-1-[(3S)-3-fluoropyrrolidin-1-yl]-1-oxopropan-2-yl]amino]-5H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-one
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~275.94 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.90 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.90 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7594 mL 13.7969 mL 27.5938 mL
5 mM 0.5519 mL 2.7594 mL 5.5188 mL
10 mM 0.2759 mL 1.3797 mL 2.7594 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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