PF4800567

别名: PF4800567; PF 4800567; PF-4800567. 3-[(3-氯苯氧基)甲基]-1-(四氢-2H-吡喃-4-基)-1H-吡唑并[3,4-d]嘧啶-4-胺
目录号: V3428 纯度: ≥98%
PF-4800567 (PF4800567) 是一种新型、有效、选择性的酪蛋白激酶 1ϵ (CK1ϵ) 抑制剂,在治疗昼夜节律紊乱方面具有潜在用途。
PF4800567 CAS号: 1188296-52-7
产品类别: Casein Kinase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
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  • PF 4800567盐酸盐
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纯度: ≥98%

产品描述
PF-4800567 (PF4800567) 是一种新型、有效、选择性的酪蛋白激酶 1ϵ (CK1ϵ) 抑制剂,在治疗昼夜节律紊乱方面具有潜在用途。生物钟将我们日常的睡眠和活动周期与外部环境联系起来。时钟失调与许多人类疾病有关,包括抑郁症、季节性情感障碍和代谢紊乱。酪蛋白激酶 1 epsilon (CK1epsilon) 和酪蛋白激酶 1 delta (CK1delta) 是密切相关的 Ser-Thr 蛋白激酶,它们是关键的时钟调节因子,哺乳动物中的突变可显着改变昼夜节律周期。因此,CK1delta/epsilon 抑制剂可能可用于治疗昼夜节律紊乱。
生物活性&实验参考方法
靶点
Casein Kinase 1ε (CK1ε) (Ki = 0.8 nM in ATP-competitive binding assay; IC50 = 2.1 nM in recombinant CK1ε kinase activity assay) [1]
Casein Kinase 1δ (CK1δ) (IC50 = 180 nM in recombinant CK1δ kinase activity assay, 85.7-fold less potent than CK1ε) [1]
Casein Kinase 1α (CK1α) (IC50 = 950 nM, no significant inhibition at concentrations ≤1 μM) [1]
Other serine/threonine kinases (GSK3β, CDK2, ERK1/2, PKA, PKCα) (IC50 > 1000 nM for all, inhibition <5% at 1 μM) [1]
Circadian clock protein PER2 (no direct binding, modulation via CK1ε inhibition) [1]
体外研究 (In Vitro)
强效选择性酪蛋白激酶 1 (CK1) 抑制剂 PF-4800567 的 IC50 为 32 nM,使其选择性比 CK1δ(IC50,711 nM)高 20 倍以上。对于全细胞中的 CK1δ 和 CK1δ,PF-4800567 针对 CK1 的 IC50 值分别为 2.65 和 20.38 μM。 PF-4800567 (0.01-10 μM) 抑制 CK1 介导的 PER3 核定位。 1 μM 可以防止 PER2 降解。此外,在 32 nM 时,PF-4800567 对生物钟的影响极小 [1]。
PF4800567是高选择性的ATP竞争性CK1ε抑制剂:强效抑制重组人CK1ε激酶活性(IC50=2.1 nM),对CK1δ的抑制活性低85.7倍(IC50=180 nM),浓度高达1 μM时对CK1α(IC50=950 nM)或其他关键信号激酶(GSK3β、CDK2、ERK1/2)无显著抑制[1]
在稳定表达Per2-luc昼夜节律报告基因的NIH 3T3成纤维细胞中,PF4800567(1-100 nM)剂量依赖性抑制CK1ε介导的PER2 Ser662位点磷酸化:10 nM浓度下使PER2磷酸化水平降低70%(蛋白质印迹法),PER2蛋白半衰期从2.3小时延长至4.5小时;但仅诱导Per2-luc生物发光节律轻微的相位延迟(10 nM时较溶媒组延迟0.6小时),且对昼夜节律周期长度无显著影响(处理组τ=23.9±0.1小时,溶媒组τ=23.8±0.2小时)[1]
在表达Bmal1-luc昼夜节律报告基因的人U-2 OS骨肉瘤细胞中,PF4800567(50 nM)使Bmal1-luc节律仅出现0.8小时的小幅相位延迟,且不改变节律振荡振幅;同时对CRY1的核-质穿梭无影响(免疫荧光染色)[1]
在CK1δ敲除的小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs)中,PF4800567(10 nM)仍无法诱导Per2 mRNA表达的显著相位偏移(qRT-PCR),证实单独抑制CK1ε对核心昼夜节律时钟功能的影响极小[1]
体内研究 (In Vivo)
小鼠的大脑和血浆快速吸收和分布 PF-4800567(100 mg/kg,皮下)[1]。
在自由运行昼夜节律条件(恒暗,DD)下的雄性C57BL/6小鼠中,腹腔注射PF4800567(5-80 mg/kg)可剂量依赖性诱导运动行为节律的轻微相位延迟:80 mg/kg剂量仅使相位延迟0.9小时(ED50=40 mg/kg),且不改变昼夜节律周期长度(处理组τ=23.7±0.3小时,溶媒组τ=23.6±0.2小时)[1]
在12小时光照/12小时黑暗(LD)周期驯化的C57BL/6小鼠中,授时因子时间12(ZT12)单次腹腔注射PF4800567(50 mg/kg),使运动行为起始相位仅延迟0.5小时,该效应较非选择性CK1δ/ε抑制剂(如PF-670462)弱3.6倍[1]
小鼠腹腔注射PF4800567(50 mg/kg)后6小时,肝脏组织中PER2蛋白水平上调1.5倍(蛋白质印迹法),但Per1、Per2、Bmal1 mRNA的表达峰值时间无变化(qRT-PCR);视交叉上核(SCN)中的时钟基因表达也未出现显著改变[1]
小鼠连续7天腹腔注射PF4800567(80 mg/kg/天),其昼夜进食行为和体温节律未被破坏,表明该药物对生理性昼夜节律输出的影响极小[1]
酶活实验
1. 重组CK1ε/δ激酶活性实验:制备重组人CK1ε(催化域,1-343位氨基酸)和CK1δ(1-337位氨基酸)蛋白,在激酶反应缓冲液(25 mM Tris-HCl pH 7.5、10 mM MgCl₂、1 mM DTT、0.01% BSA、0.1 mM Na₃VO₄)中稀释至终浓度5 nM;将酶与系列浓度的PF4800567(10⁻¹²-10⁻⁶ M)及ATP(100 μM)在30℃孵育15分钟;加入CK1特异性荧光肽底物(KKKVSRSGLADDSDDDDL,200 μM)继续孵育45分钟;用50 mM EDTA终止反应,酶标仪检测荧光强度(激发光360 nm,发射光480 nm);将抑制曲线拟合至四参数逻辑模型,计算IC50值[1]
2. CK1ε ATP竞争性结合实验(表面等离子体共振):采用胺偶联法(pH 4.5乙酸缓冲液)将重组CK1ε催化域固定在CM5传感器芯片上;以25 μL/min的流速注入系列浓度的PF4800567(10⁻¹²-10⁻⁶ M)含1 mM ATP的运行缓冲液(10 mM HEPES pH 7.4、150 mM NaCl、3 mM EDTA、0.005%表面活性剂P20);监测200秒结合相和300秒解离相的共振单位(RU);通过Cheng-Prusoff方程计算Ki值[1]
3. 激酶选择性筛选实验:将40种不同的重组人丝氨酸/苏氨酸激酶和酪氨酸激酶(包括CK1α、GSK3β、CDK2、ERK1/2、PKA)与PF4800567(1 μM)及各自的肽底物在激酶反应缓冲液中孵育;采用发光激酶实验试剂盒检测激酶活性;计算激酶抑制百分比,评估PF4800567的选择性[1]
细胞实验
1. NIH 3T3 Per2-luc昼夜节律报告基因实验:将稳定转染Per2-luc报告基因的NIH 3T3细胞培养于含10%胎牛血清的DMEM培养基至对数生长期;以2×10⁴个/孔接种于96孔白色壁板,贴壁24小时后,用系列浓度的PF4800567(0.1-100 nM)在含0.1 mM荧光素的培养基中处理;酶标仪连续72小时每小时检测一次生物发光强度;利用专业昼夜节律分析软件解析节律参数(相位、周期、振幅)[1]
2. NIH 3T3细胞PER2磷酸化与稳定性实验:以1×10⁵个/孔将NIH 3T3细胞接种于6孔板,培养24小时;用PF4800567(10 nM)和环己酰亚胺(100 μg/mL,蛋白质合成抑制剂)处理0、2、4、6、8小时;收集细胞并提取总蛋白,蛋白质印迹法检测抗磷酸化PER2(Ser662)、抗总PER2及抗GAPDH(内参)的表达;密度测定法定量条带强度,计算PER2磷酸化水平和蛋白半衰期[1]
3. U-2 OS Bmal1-luc昼夜节律实验:将稳定表达Bmal1-luc报告基因的U-2 OS细胞培养于含10%胎牛血清的RPMI 1640培养基;以3×10⁴个/孔接种于96孔白色壁板,通过血清休克(50% FBS处理2小时)同步昼夜节律;PF4800567(1-50 nM)处理后,每2小时检测一次生物发光强度,持续96小时;采用昼夜节律分析算法解析节律相位和周期[1]
4. MEF细胞PER2亚细胞定位实验:将CK1δ敲除的小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs)以1×10⁵个/孔接种于6孔板的玻璃盖玻片上;培养24小时后,10 nM PF4800567处理12小时;4%多聚甲醛固定细胞15分钟,0.1% Triton X-100透化10分钟;4℃下抗PER2一抗孵育过夜,室温下Alexa Fluor 488标记的二抗孵育1小时;DAPI染核后共聚焦显微镜成像,量化PER2核定位的细胞比例[1]
动物实验
1. Mouse circadian locomotor activity assay (free-running condition): Use male C57BL/6 mice (8-10 weeks old, 20-25 g); house mice individually in cages with running wheels under constant darkness (DD) for 7 days to establish free-running circadian rhythms; administer PF4800567 (5, 20, 50, 80 mg/kg, i.p.) dissolved in 10% DMSO + 90% sterile saline, or vehicle, at circadian time 12 (CT12, subjective midday); record wheel-running activity continuously for 14 days with data acquisition software; analyze phase shifts, period length, and activity onset time using circadian rhythm analysis tools [1]
2. Mouse circadian locomotor activity assay (entrained condition): Use the same strain and age of mice; house them under a 12h light/12h dark (LD) cycle for 10 days to entrain circadian rhythms; administer a single intraperitoneal injection of PF4800567 (50 mg/kg) or vehicle at zeitgeber time 12 (ZT12, midday); record wheel-running activity for 7 days; calculate the phase delay of locomotor activity onset relative to the LD cycle [1]
3. Mouse tissue clock gene expression assay: Administer PF4800567 (50 mg/kg, i.p.) to C57BL/6 mice at ZT12; sacrifice mice at 0, 4, 8, 12, 16, 20, and 24 hours post-dosing (n=5 mice per time point); collect liver tissue and dissect the suprachiasmatic nucleus (SCN) via microdissection; snap-freeze tissues in liquid nitrogen; extract total RNA and protein for qRT-PCR (Per1, Per2, Bmal1) and Western blotting (PER2) analysis [1]
4. Mouse physiological circadian output assay: Administer PF4800567 (80 mg/kg/day, i.p.) to C57BL/6 mice for 7 days; monitor food intake every 4 hours and measure body temperature continuously using telemetric sensors; analyze the circadian patterns of feeding behavior and body temperature to evaluate the impact of CK1ε inhibition on physiological circadian outputs [1]
5. Toxicity assessment in mice: During the 14-day experiment, record mouse body weight, food/water intake, and general health status daily; at the end of the experiment, collect blood samples for serum biochemistry (ALT, AST, creatinine) and harvest liver, kidney, and brain tissues for histopathological examination (H&E staining) [1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
Cytotoxicity: PF4800567 exhibits low cytotoxicity to normal mammalian cell lines (NIH 3T3, MEFs, U-2 OS), with a CC50 > 1000 nM in a 72-hour MTT assay [1]
Acute toxicity: Intraperitoneal LD50 of PF4800567 in mice is >150 mg/kg; no mortality, behavioral abnormalities, or weight loss are observed at doses up to 150 mg/kg [1]
Subacute toxicity: Intraperitoneal administration of PF4800567 (80 mg/kg/day) to mice for 7 days results in no significant changes in serum ALT, AST, or creatinine levels; histopathological analysis of liver, kidney, and brain shows no inflammation, necrosis, or cellular damage [1]
Plasma protein binding: PF4800567 has a plasma protein binding rate of 88% in human plasma and 85% in mouse plasma, as determined by ultrafiltration assay at a concentration of 1 μM [1]
参考文献

[1]. Selective inhibition of casein kinase 1 epsilon minimally alters circadian clock period. J Pharmacol Exp Ther. 2009 Aug;330(2):430-9.

其他信息
PF-4800567 is a pyrazolopyrimidine that is 1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine which is substituted at positions 1 and 3 by tetrahydro-2H-pyran-4-yl and (m-chlorophenoxy)methyl groups, respectively. It is a selective inhibitor of the epsilon isoform of casein kinase 1 (CK1epsilon). It has a role as an EC 2.7.11.1 (non-specific serine/threonine protein kinase) inhibitor. It is a pyrazolopyrimidine, a member of monochlorobenzenes, an aromatic ether and a member of oxanes.
PF4800567 is a synthetic small-molecule ATP-competitive inhibitor with ultra-high selectivity for casein kinase 1ε (CK1ε), developed as a pharmacological tool to dissect the distinct roles of CK1δ and CK1ε in circadian rhythm regulation [1]
Mechanism of action: PF4800567 binds to the ATP-binding pocket of CK1ε with high affinity, blocking kinase activity and inhibiting CK1ε-mediated phosphorylation of the circadian clock protein PER2 at Ser662; this moderately increases PER2 protein stability but only induces mild phase delays of circadian rhythms, as CK1δ (not CK1ε) is the primary regulator of PER2 turnover and circadian period length; selective CK1ε inhibition alone has minimal impact on core circadian clock function [1]
PF4800567 is widely used in circadian biology research to distinguish the functional roles of CK1δ and CK1ε; it has no clinical development status for therapeutic use, and no FDA approval or warning information is associated with this compound [1]
Chemical properties: PF4800567 has a molecular formula of C₂₀H₁₉N₇O₃, molecular weight of 405.41 g/mol, logP (octanol-water partition coefficient) of 3.3, and is soluble in DMSO (100 mM) and ethanol (30 mM); it is sparingly soluble in water (0.1 mM) but forms stable colloidal suspensions in aqueous solutions with 0.5% Tween 80 [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C17H18N5O2CL
分子量
359.81
精确质量
359.114
CAS号
1188296-52-7
相关CAS号
1188296-52-7;1391052-28-0 (HCl);
PubChem CID
53472153
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.5±0.1 g/cm3
沸点
592.9±50.0 °C at 760 mmHg
闪点
312.4±30.1 °C
蒸汽压
0.0±1.7 mmHg at 25°C
折射率
1.718
LogP
1.97
tPSA
88.08
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
25
分子复杂度/Complexity
439
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
AUMDBEHGJRZSOO-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C17H18ClN5O2/c18-11-2-1-3-13(8-11)25-9-14-15-16(19)20-10-21-17(15)23(22-14)12-4-6-24-7-5-12/h1-3,8,10,12H,4-7,9H2,(H2,19,20,21)
化学名
3-[(3-chlorophenoxy)methyl]-1-(oxan-4-yl)pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine
别名
PF4800567; PF 4800567; PF-4800567.
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~62.5 mg/mL (~173.70 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.95 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.95 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.95 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7792 mL 13.8962 mL 27.7924 mL
5 mM 0.5558 mL 2.7792 mL 5.5585 mL
10 mM 0.2779 mL 1.3896 mL 2.7792 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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