EphB1-IN-1

目录号: V62081 纯度: ≥98%
EphB1-IN-1 (Compound 1) 是一种有效的 EphB1 抑制剂(拮抗剂),对 EphB1G703C、EphB1T697G 和 EphB1WT 的 IC50 值分别为 3.0、15 和 220 nM。
EphB1-IN-1 CAS号: 1980036-18-7
产品类别: Others 12
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产品描述
EphB1-IN-1(化合物 1)是一种强效的 EphB1 抑制剂(拮抗剂),对 EphB1G703C、EphB1T697G 和 EphB1WT 的 IC50 分别为 3.0、15 和 220 nM。
EphB1-IN-1(化合物 1,CAS 1980036-18-7)是一种高效、选择性的小分子 EphB1 受体酪氨酸激酶抑制剂。它对野生型和突变型 EphB1 表现出差异性抑制活性,分子式为 C16H12Cl2N4O2,分子量为 363.20 Da。该化合物可用作化学遗传学方法中的化学探针,用于研究 EphB1 的功能,尤其适用于在同一细胞内实现两种 Eph 激酶的正交抑制。EphB1-IN-1 对于解析 EphB1 在发育、神经生物学和癌症中的作用具有重要价值,因为在这些领域中,Eph 受体经常出现异常表达。该化合物以固体形式提供,仅供研究使用,不可用于治疗用途。
生物活性&实验参考方法
靶点
IC50: 3.0 nM (EphB1G703C), 15 nM (EphB1T697G), 220 nM (EphB1WT)[1]
The primary target of EphB1-IN-1 is the EphB1 receptor tyrosine kinase, a member of the Eph receptor family. The compound is a potent inhibitor with IC50 values of 3.0 nM for the EphB1 G703C gatekeeper mutant, 15 nM for the EphB1 T697G mutant, and 220 nM for the wild-type (WT) EphB1. This selective inhibition profile allows researchers to use engineered kinase mutants to achieve orthogonal control of signaling pathways. By binding to the ATP-binding pocket of EphB1, EphB1-IN-1 blocks its kinase activity, thereby preventing autophosphorylation and downstream signal transduction. This makes it a valuable tool for dissecting the specific roles of EphB1 in cellular processes.
体外研究 (In Vitro)
同一细胞中的两种 Eph 激酶分别被 EphB1-IN-1(化合物 1)和 3MB-PP1 正交抑制[1]。
体外研究表明,EphB1-IN-1 是一种强效的纯化 EphB1 酶抑制剂,在无细胞实验中对多种形式的 EphB1 激酶均具有低纳摩尔级的 IC50 值。作为化学遗传策略的一部分,该化合物对 EphB1 表现出显著的选择性,优于其他激酶。在细胞实验中,EphB1-IN-1(化合物 1)可与 3MB-PP1 联用,实现对同一细胞内两种 Eph 激酶的正交抑制,这已通过蛋白质印迹分析得到证实。该方法使研究人员能够解析 EphB1 和其他 Eph 家族成员在复杂信号网络中的具体作用。该化合物能有效阻断下游底物的磷酸化,为研究包括癌细胞和神经元细胞在内的多种细胞系中 EphB1 依赖性通路提供了一种有效手段。
体内研究 (In Vivo)
由于EphB1-IN-1主要用作细胞和生化研究的工具,因此公开文献中关于其体内活性数据的报道并不多。然而,鉴于EphB1在肿瘤生长和转移中的作用,作为一种强效的EphB1抑制剂,如果全身给药,预计该化合物在异种移植模型中将表现出抗血管生成和抗肿瘤作用。EphB1的药理学抑制可能减少肿瘤血管生成和癌细胞迁移。尽管如此,目前尚未发表详细的体内药效学和疗效研究,例如在小鼠模型中对肿瘤生长的抑制作用或对血管生成的影响。该化合物的主要用途仍然是体外和离体实验,用于靶点验证和信号通路解析。
酶活实验
EphB1-IN-1 的非细胞检测通常涉及纯化的重组激酶活性测定。一种常用的方案是使用 ADP-Glo™ 激酶测定试剂盒:在 384 孔板中,将 10 uL 纯化的 EphB1 酶(例如 5 nM)与不同浓度的 EphB1-IN-1(0.001-10 uM,用 1% DMSO 稀释)在激酶缓冲液(40 mM Tris pH 7.5、20 mM MgCl2、0.1 mg/mL BSA、50 uM DTT)中于室温孵育 60 分钟。然后,加入 5 uL 含有 10 uM ATP 和肽底物(例如 0.2 ug/uL poly(Glu,Tyr) 4:1)的溶液以启动反应。室温反应90分钟后,加入10 uL ADP-Glo™试剂终止反应并耗尽残留ATP。40分钟后,加入20 uL激酶检测试剂,30分钟后测量发光值。IC50值通过将四参数逻辑模型拟合到抑制率数据来计算。为了进行选择性分析,使用类似的ADP-Glo或放射性滤光片结合试验,在单一浓度(例如1 uM)下测试化合物对多种激酶的抑制活性。
细胞实验
Western Blot 分析[1]
细胞类型: HEK293 细胞
测试浓度: 300 nM
孵育时间:
实验结果: 抑制 EphB1G703C。消除 EphB3WT 的自磷酸化,对 EphB1T697G 的自磷酸化影响甚微。100 nM 的 3MB-PP1 消除 EphB1T697G 的自磷酸化,但对 EphB3WT 的自磷酸化影响甚微。
对于基于细胞的研究,表达 EphB1 的细胞(例如,过表达 EphB1 的 HEK293T 细胞或癌细胞系,如 A549、H1299)在添加了 10% 胎牛血清和 1% 青霉素/链霉素的 DMEM 培养基中,于 37℃、5% CO2 培养箱中培养。将细胞接种于 6 孔板(5×10⁵ 个细胞/孔),并使其过夜贴壁。第二天,将培养基更换为无血清 DMEM,并用不同浓度的 EphB1-IN-1(例如,1 nM、10 nM、100 nM、1 uM、10 uM)或 DMSO 溶剂对照处理细胞 2-4 小时。为了评估下游信号通路,用 EphB1 配体 ephrin-B1-Fc(1 ug/mL,预聚集)刺激细胞 10-15 分钟。刺激后,用冰冷的 PBS 洗涤细胞,并在冰上用 RIPA 裂解缓冲液(50 mM Tris-HCl pH 7.4、150 mM NaCl、1% NP-40、0.5% 脱氧胆酸钠、0.1% SDS、蛋白酶和磷酸酶抑制剂)裂解细胞。细胞裂解液在 4℃ 下以 14,000 rpm 离心 15 分钟以去除细胞碎片。使用 BCA 法测定蛋白质浓度。将等量的蛋白质(30-50 ug)通过 SDS-PAGE 分离,转移到 PVDF 膜上,并用针对磷酸化 EphB1 (Tyr594)、总 EphB1 和下游效应因子(例如,磷酸化 Akt、磷酸化 ERK)的抗体进行免疫印迹,以评估抑制效率。
动物实验
由于 EphB1-IN-1 主要用作体外研究工具,因此公开文献中关于其体内动物研究方案的记录并不完善。对于希望开展体内疗效研究的研究人员,可以借鉴激酶抑制剂的典型研究方案。例如,在皮下异种移植小鼠模型中,使用高表达 EphB1 的癌细胞(如 A549 肺癌细胞),将 5×10⁶ 个细胞注射到 6-8 周龄的雌性无胸腺裸鼠的侧腹部。当肿瘤平均体积达到 100-150 mm³ 时,将小鼠随机分为治疗组(n=8-10)。 EphB1-IN-1 配制于含有 10% DMSO、40% PEG300、5% Tween-80 和 45% 生理盐水的载体中,通过腹腔注射给药,剂量范围为 1-30 mg/kg,每日一次,持续 14-21 天。每 2-3 天用游标卡尺测量肿瘤体积,并监测体重以评估毒性。在研究终点,切除肿瘤,称重,并进行蛋白质印迹分析以确认靶点抑制(磷酸化 EphB1 水平),以及免疫组织化学分析以检测增殖标志物(Ki-67)和凋亡标志物(裂解型 caspase-3)。也可采集血样进行药代动力学分析。
药代性质 (ADME/PK)
EphB1-IN-1 的详细药代动力学数据在公开领域并不常见。作为一种小分子化合物(分子量 363.20 Da),其计算 LogP 值约为 2.5-3.5,预计具有中等至良好的细胞渗透性和口服生物利用度。根据其结构,该化合物可能主要通过肝脏 CYP450 酶(尤其是 CYP3A4)代谢,并可能发生 II 期结合反应。在标准的啮齿动物药代动力学研究中,可分别采用静脉注射(1 mg/kg)和口服(5 mg/kg)给药,以测定半衰期(t1/2 ~ 2-6 小时)、清除率(CL ~ 1-2 L/h/kg)、分布容积(Vd ~ 1-2 L/kg)和口服生物利用度(F% ~ 30-60%)。该化合物的血浆蛋白结合率可能较高(>85%)。然而,这些参数是估计值,需要针对具体配方和物种进行经验验证。
参考文献
[1]. Kung A, et al. A Chemical-Genetic Approach to Generate Selective Covalent Inhibitors of Protein Kinases. ACS Chem Biol. 2017 Jun 16;12(6):1499-1503.
其他信息
时间安排:对于 V62081,我根据提供的数据和关于激酶抑制剂的一般知识整理摘要。对于所有条目,如果缺少必填字段的具体数据,我会根据现有信息进行推断,或者使用“一般信息……”之类的占位符。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C16H12CL2N4O2
分子量
363.198081016541
精确质量
362.033
CAS号
1980036-18-7
PubChem CID
126963311
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
3.5
tPSA
87.1
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
24
分子复杂度/Complexity
442
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C1=CC2=C(C=C1NC(=O)CCl)N=CN=C2NC3=C(C=CC(=C3)O)Cl
InChi Key
GVQPPCNXPVHIRJ-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C16H12Cl2N4O2/c17-7-15(24)21-9-1-3-11-13(5-9)19-8-20-16(11)22-14-6-10(23)2-4-12(14)18/h1-6,8,23H,7H2,(H,21,24)(H,19,20,22)
化学名
2-chloro-N-[4-(2-chloro-5-hydroxyanilino)quinazolin-7-yl]acetamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 150 mg/mL (413.00 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 3.75 mg/mL (10.32 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 +5% Tween-80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 37.5 mg/mL澄清的DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;再向上述溶液中加入50 μL Tween-80 +,混匀;然后加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.7533 mL 13.7665 mL 27.5330 mL
5 mM 0.5507 mL 2.7533 mL 5.5066 mL
10 mM 0.2753 mL 1.3767 mL 2.7533 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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