Seco Rapamycin ethyl ester

别名: Seco Rapamycin ethyl ester; ethyl (2S)-1-[2-[(2R,3R,6S)-2-hydroxy-6-[(2S,3E,5E,7E,9S,11R,13R,14R,15E,17R,19E,21R)-14-hydroxy-22-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]-2,13-dimethoxy-3,9,11,15,17,21-hexamethyl-12,18-dioxodocosa-3,5,7,15,19-pentaenyl]-3-methyloxan-2-yl]-2-oxoacetyl]piperidine-2-carboxylate

目录号: V76525 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

Seco Rapamycin ethester 是 Rapamycin 的开环代谢物。

Seco Rapamycin ethyl ester 产品类别: Drug Metabolite

产品仅用于科学研究，不针对患者销售

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Nature 2025, 643(8070):192-200.

Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Science Adv 2025, 11(33):eadr5199.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

产品描述
生物活性&实验参考方法
化学信息
溶解度数据
计算器
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产品描述

Seco Rapamycin ethester 是 Rapamycin 的开环代谢物。 Seco-Rapamycin 几乎不影响 mTOR 功能。

生物活性&实验参考方法

靶点	Seco Rapamycin (Secorapamycin A) does not significantly affect mTOR function and no IC50, Ki, or EC50 values were reported in the literature [1].
体外研究 (In Vitro)	- 组织匀浆中的代谢转化：在人肝、空肠黏膜和Caco-2细胞匀浆中，Seco Rapamycin (Secorapamycin A) (20 μM) 通过NADPH依赖途径转化为二氢西罗莫司（M2）。酮康唑（100 μM）不抑制这些匀浆中的M2生成 [1]。 - Caco-2细胞单层分布：将Seco Rapamycin (Secorapamycin A) (20 μM) 加入Caco-2细胞单层的顶端隔室，4小时后基底外侧隔室中检测到的药物极少，且M2生成有限。然而，当从基底外侧给药时，顶端隔室中可检测到Seco Rapamycin (Secorapamycin A) 和M2。P-糖蛋白抑制剂LY335679减少了Seco Rapamycin (Secorapamycin A) 向顶端的转运，并增加了两个隔室中的M2水平 [1]。 Seco 雷帕霉素在 Caco-2 单层细胞和人体组织匀浆中的分布。将人肝脏、空肠粘膜和 Caco-2 匀浆用 20μM Seco Rapamycin 处理，看看是否可以转化为二氢西罗莫司 (M2)。这些匀浆均以依赖于 NADPH 的方式产生 M2。即使在 100μM 浓度下，酮康唑对任何测试的匀浆中的 M2 产生都没有影响。将 20μM Seco 雷帕霉素应用于 Caco-2 单层细胞，以测试 Seco 雷帕霉素是否可以在完整细胞中转化为 M2。四小时后，在施加到顶室后，在细胞级分和基底外侧室中发现很少的赛科雷帕霉素。此外，没有发现太多M2。顶端剂量后，LY335979 对 Seco Rapamycin 的分布影响很小，即使现在在顶端隔室中可检测到 M2。 LY335679 减少 Seco Rapamycin 流向心尖室的流量，并增加心尖室和基底外侧室中 M2 的量[1]。相反，当将 Seco 雷帕霉素应用于基底外侧室时，在顶端室中很容易检测到 Seco 雷帕霉素和 M2。
酶活实验	- 组织匀浆代谢活性：将人肝、空肠黏膜和Caco-2细胞匀浆与Seco Rapamycin (Secorapamycin A) (20 μM) 在NADPH存在下孵育，评估M2生成。反应30分钟后终止，通过液相色谱分析代谢产物。平行实验中加入酮康唑（100 μM）以评估细胞色素P450抑制作用 [1]。
细胞实验	Caco-2细胞单层通透性：将Caco-2细胞单层培养在transwell小室上，分别从顶端或基底外侧给予Seco Rapamycin (Secorapamycin A) (20 μM) 处理4小时。收集顶端和基底外侧隔室样品，用LC-MS/MS分析Seco Rapamycin (Secorapamycin A) 和M2水平。同时加入LY335979 (0.5 μM) 以研究P-糖蛋白介导的转运 [1]。
药代性质 (ADME/PK)	- Metabolic Pathway: Seco Rapamycin (Secorapamycin A) undergoes NADPH-dependent conversion to M2 in human intestinal and hepatic tissues, suggesting involvement of cytochrome P450 enzymes. However, specific pharmacokinetic parameters (e.g., half-life, bioavailability) were not reported [1]. - Tissue Distribution: In Caco-2 cell monolayers, Seco Rapamycin (Secorapamycin A) exhibited limited apical-to-basolateral transport but efficient basolateral-to-apical flux, indicating potential efflux mechanisms [1].
参考文献	[1]. Identification of a novel route of extraction of sirolimus in human small intestine: roles ofmetabolism and secretion. J Pharmacol Exp Ther. 2002 Apr;301(1):174-86.
其他信息	- Metabolite Background: Seco Rapamycin (Secorapamycin A) is the open-ring metabolite of sirolimus (rapamycin), formed during intestinal and hepatic metabolism [1]. - Study Purpose: The literature primarily investigates the intestinal extraction and metabolism of sirolimus, with Seco Rapamycin (Secorapamycin A) serving as a model compound to characterize metabolic pathways and transporter interactions [1]. - Transporter Interaction: P-glycoprotein modulation affected Seco Rapamycin (Secorapamycin A) distribution in Caco-2 cells, highlighting its potential as a P-glycoprotein substrate [1].

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

分子式	C53H83NO13
分子量	942.2
精确质量	941.58644
PubChem CID	154573775
外观&性状	Light yellow to yellow ointment
LogP	8.3
tPSA	195 Å²
氢键供体(HBD)数目	3
氢键受体(HBA)数目	13
可旋转键数目(RBC)	26
重原子数目	67
分子复杂度/Complexity	1790
定义原子立体中心数目	14
SMILES	CCOC(=O)[C@@H]1CCCCN1C(=O)C(=O)[C@]2([C@@H](CC[C@H](O2)C[C@@H](/C(=C/C=C/C=C/[C@@H](C)C[C@@H](C)C(=O)[C@@H]([C@@H](/C(=C/[C@@H](C)C(=O)/C=C/[C@H](C)C[C@@H]3CC[C@H]([C@@H](C3)OC)O)/C)O)OC)/C)OC)C)O
InChi Key	AFZMAZIUJNBBML-CCDOOBSISA-N
InChi Code	InChI=1S/C53H83NO13/c1-12-66-52(61)42-20-16-17-27-54(42)51(60)50(59)53(62)39(8)22-24-41(67-53)32-45(63-9)35(4)19-15-13-14-18-33(2)28-37(6)47(57)49(65-11)48(58)38(7)30-36(5)43(55)25-21-34(3)29-40-23-26-44(56)46(31-40)64-10/h13-15,18-19,21,25,30,33-34,36-37,39-42,44-46,48-49,56,58,62H,12,16-17,20,22-24,26-29,31-32H2,1-11H3/b15-13+,18-14+,25-21+,35-19+,38-30+/t33-,34+,36-,37-,39-,40+,41+,42+,44-,45+,46-,48-,49+,53-/m1/s1
化学名	ethyl (2S)-1-[2-[(2R,3R,6S)-2-hydroxy-6-[(2S,3E,5E,7E,9S,11R,13R,14R,15E,17R,19E,21R)-14-hydroxy-22-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]-2,13-dimethoxy-3,9,11,15,17,21-hexamethyl-12,18-dioxodocosa-3,5,7,15,19-pentaenyl]-3-methyloxan-2-yl]-2-oxoacetyl]piperidine-2-carboxylate
别名	Seco Rapamycin ethyl ester; ethyl (2S)-1-[2-[(2R,3R,6S)-2-hydroxy-6-[(2S,3E,5E,7E,9S,11R,13R,14R,15E,17R,19E,21R)-14-hydroxy-22-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]-2,13-dimethoxy-3,9,11,15,17,21-hexamethyl-12,18-dioxodocosa-3,5,7,15,19-pentaenyl]-3-methyloxan-2-yl]-2-oxoacetyl]piperidine-2-carboxylate
HS Tariff Code	2934.99.9001
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。 (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中（例如氮气保护），避免吸湿/受潮。
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO :~100 mg/mL (~106.13 mM)
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: 5 mg/mL (5.31 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。配方 2 中的溶解度:* 5 mg/mL (5.31 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More* 配方 3 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (5.31 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO :~100 mg/mL (~106.13 mM)

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: 5 mg/mL (5.31 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 5 mg/mL (5.31 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (5.31 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

制备储备液		1 mg	5 mg	10 mg
	1 mM	1.0613 mL	5.3067 mL	10.6135 mL
	5 mM	0.2123 mL	1.0613 mL	2.1227 mL
	10 mM	0.1061 mL	0.5307 mL	1.0613 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;

4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。