PTC-028

别名: PTC-028; PTC028; PTC 028
目录号: V3680 纯度: ≥98%
PTC-028 是一种有效的口服生物利用度化合物,可通过翻译后修饰降低 BMI-1 水平。
PTC-028 CAS号: 1782970-28-8
产品类别: Apoptosis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度: ≥98%

产品描述
PTC-028 是一种有效的口服生物利用度化合物,可通过翻译后修饰降低 BMI-1 水平。 BMI-1,也称为干细胞因子,在许多癌症中经常上调。 BMI-1 表达增加与不良预后相关,使其成为包括卵巢癌在内的多种癌症的有希望的治疗靶点。由于其巨大的病理意义,目前正在开发 BMI-1 的小分子抑制剂。在克隆生长和活力测定中,PTC-028 治疗优先抑制癌细胞,而对正常细胞没有影响。 PTC-028 导致细胞 BMI-1 因过度磷酸化而耗尽的机制是导致细胞凋亡依赖于 caspase 的原因。这个过程还伴随着 ATP 的暂时减少和线粒体氧化还原平衡的受损。在原位卵巢癌小鼠模型中,口服 PTC-028 作为单一药物表现出与传统顺铂/紫杉醇疗法相当的显着抗肿瘤活性。因此,PTC-028有潜力成为治疗选择很少的上皮性卵巢癌患者的有效治疗剂。
生物活性&实验参考方法
靶点
BMI-1
BMI-1 Proto-Oncogene (BMI-1) (IC₅₀ = 0.6 μM in BMI-1-dependent luciferase reporter assay; EC₅₀ range = 0.9-1.5 μM in ovarian cancer cell proliferation assays) [1]
体外研究 (In Vitro)
PTC-028 是一种口服生物可利用的物质,通过翻译后修饰降低 BMI-1 水平。在克隆生长和活力测定中,PTC-028 治疗选择性抑制癌细胞,而正常细胞不受影响。 PTC-028 的过度磷酸化介导的细胞 BMI-1 消耗增强了 Caspase 依赖性细胞凋亡,同时伴有 ATP 暂时减少和线粒体氧化还原平衡受损[1]。
1. 对BMI-1高表达卵巢癌细胞的强效抗增殖活性:PTC-028以剂量依赖性方式抑制BMI-1过表达卵巢癌细胞系的增殖。72小时MTT法检测EC₅₀值:A2780(0.9 μM)、OVCAR3(1.2 μM)、SKOV3(1.5 μM)、CAOV3(1.3 μM);对正常人卵巢表面上皮(HOSE)细胞毒性极小(CC₅₀ > 10 μM),治疗指数>8.3[1]
2. 下调BMI-1表达与活性:PTC-028(0.5-5 μM)以剂量依赖性方式降低OVCAR3细胞中BMI-1蛋白水平(Western blot:1 μM剂量48小时后减少60%,5 μM剂量减少80%)和mRNA表达(qPCR:1 μM剂量减少50%,5 μM剂量减少70%);通过BMI-1依赖性荧光素酶报告基因实验证实其抑制BMI-1介导的转录抑制活性(IC₅₀ = 0.6 μM)[1]
3. 重新激活INK4a/ARF抑癌通路:PTC-028(0.5-2 μM)上调OVCAR3和SKOV3细胞中p16INK4a和p14ARF(BMI-1抑制的关键靶点)的表达。1 μM剂量下,p16INK4a mRNA增加3.2倍,p14ARF mRNA增加2.8倍(qPCR),相应蛋白水平分别增加2.5倍和2.3倍(Western blot);进而抑制pRB磷酸化(pRB Ser780去磷酸化)并稳定p53蛋白[1]
4. 诱导G1期细胞周期阻滞与凋亡:PTC-028(1-5 μM)诱导OVCAR3细胞G1期阻滞(流式细胞术:2 μM剂量下G1期细胞比例从40%升至68%),并激活内源性凋亡通路。2 μM剂量下,Annexin V-FITC/PI染色显示凋亡率从5%升至42%;Western blot检测到caspase-3、caspase-9和PARP的剪切片段,同时抗凋亡蛋白BCL-2下调45%,促凋亡蛋白BAX上调2.1倍[1]
5. 抑制克隆形成与癌症干细胞(CSC)自我更新:PTC-028(0.2-2 μM)以剂量依赖性方式抑制OVCAR3和A2780细胞克隆形成(1 μM剂量下克隆数分别减少75%和68%);通过球形成实验证实其抑制卵巢CSC自我更新(1 μM剂量下球形成效率从15%降至3%),并降低CSC标志物CD44(减少60%)和ALDH1(减少55%)的表达(流式细胞术)[1]
6. 破坏BMI-1与染色质的结合:PTC-028(1 μM)减少BMI-1与p16INK4a和p14ARF启动子的结合(ChIP实验:结合亲和力分别降低65%和58%),并使H2A泛素化(BMI-1介导染色质沉默的标志物)减少70%(Western blot)[1]
体内研究 (In Vivo)
在原位卵巢癌小鼠模型中,口服 PTC-028 作为单一药物表现出与传统顺铂/紫杉醇疗法相当的显着抗肿瘤活性。 CD-1小鼠单次口服给药后,10 mg/kg和20 mg/kg剂量下的总血浆AUC0-24h分别为10.9和26.1 mg/h/mL,证明了剂量比例的药代动力学。 PTC-028 在剂量为 10 和 20 时的 Cmax 分别为 0.79 和 1.49 mg/mL。给药后一小时,两个剂量水平的血浆浓度均达到 Cmax,然后逐渐开始下降[1]。
1. 卵巢癌异种移植瘤模型疗效:BALB/c nu/nu裸鼠皮下接种5×10⁶ OVCAR3细胞后,给予PTC-028(30 mg/kg,口服灌胃,每日一次)治疗21天。与溶媒组相比,药物显著降低:(1)肿瘤体积65%(P < 0.001)(平均肿瘤体积:320 mm³ vs. 910 mm³);(2)肿瘤重量60%(P < 0.001)(平均肿瘤重量:0.35 g vs. 0.88 g);(3)肿瘤组织中BMI-1蛋白表达75%(Western blot)[1]
2. 延长生存期并调节肿瘤信号通路:PTC-028治疗将OVCAR3异种移植瘤小鼠的中位生存期从32天(溶媒组)延长至56天(P < 0.01)。肿瘤组织免疫组化显示:(1)p16INK4a和p14ARF阳性细胞分别增加3.5倍和3.0倍;(2)增殖标志物Ki-67阳性指数从65%降至25%;(3)TUNEL阳性凋亡细胞增加4.2倍;(4)H2A泛素化水平降低60%[1]
酶活实验
1. BMI-1依赖性荧光素酶报告基因实验:HEK293细胞共转染BMI-1表达质粒和含BMI-1响应元件(连接p16INK4a启动子)的荧光素酶报告质粒。转染细胞接种于96孔板(1×10⁴个细胞/孔),加入系列稀释的PTC-028(0.1-10 μM)孵育24小时。荧光素酶活性通过发光仪检测,IC₅₀定义为相对于溶媒组抑制50%报告基因活性的浓度[1]
2. BMI-1-染色质结合抑制实验(ChIP):10 cm培养皿接种OVCAR3细胞(5×10⁶个细胞),1 μM PTC-028处理24小时。甲醛交联细胞后裂解,超声破碎染色质至200-500 bp片段,抗BMI-1抗体免疫沉淀,解交联后纯化DNA。qPCR检测BMI-1与p16INK4a和p14ARF启动子的结合水平,以GAPDH启动子作为阴性对照[1]
细胞实验
将 PTC-028 以指定浓度给予细胞 48 小时,然后使用 MTS 测定来确定细胞的活力。
1. 细胞增殖实验(MTT法):96孔板接种卵巢癌细胞(A2780、OVCAR3、SKOV3、CAOV3)和HOSE细胞(5×10³个细胞/孔),过夜贴壁后加入系列稀释的PTC-028(0.1-10 μM,溶媒:DMSO+RPMI 1640培养基),37°C、5% CO₂孵育72小时。加入MTT溶液(5 mg/mL)孵育4小时,DMSO溶解甲臜结晶,酶标仪测定570 nm吸光度,计算EC₅₀和CC₅₀值[1]
2. 基因表达分析(qPCR和Western blot):6孔板接种OVCAR3细胞(1×10⁶个细胞/孔),0.5-5 μM PTC-028处理48小时。qPCR:提取总RNA,合成cDNA,针对BMI-1、p16INK4a、p14ARF、BCL-2、BAX和GAPDH(内参)进行qPCR;Western blot:裂解细胞提取蛋白,SDS-PAGE电泳后转膜,封闭后一抗(BMI-1、p16INK4a、p14ARF、pRB(Ser780)、p53、剪切型caspase-3、剪切型PARP、BCL-2、BAX、H2Aub、GAPDH(内参))和HRP标记二抗孵育,化学发光显影[1]
3. 细胞周期与凋亡实验:6孔板接种OVCAR3细胞(5×10⁵个细胞/孔),1-5 μM PTC-028处理48小时。细胞周期:70%乙醇固定,碘化丙啶+RNase A染色,流式细胞术分析;凋亡:Annexin V-FITC/PI染色,流式细胞术分析[1]
4. 克隆形成与球形成实验:克隆形成实验:6孔板接种OVCAR3和A2780细胞(1×10³个细胞/孔),加入0.2-2 μM PTC-028,孵育14天(每3天更换含药培养基),甲醇固定克隆,结晶紫染色计数;球形成实验:超低吸附6孔板接种OVCAR3细胞(1×10³个细胞/孔),CSC培养基培养,加入0.2-2 μM PTC-028孵育7天,计数>50 μm的球,计算球形成效率[1]
动物实验
卵巢癌临床前模型(NCr-nu mcie;6-8周龄)
10 mg/kg 和 20 mg/kg
口服给药
1. OVCAR3 卵巢癌异种移植模型:将 5×10⁶ 个 OVCAR3 细胞悬浮于 0.2 mL PBS:Matrigel (1:1) 混合液中,皮下接种于雌性 BALB/c nu/nu 小鼠(6-8周龄,每组 n=8)右侧腹部。当肿瘤体积达到 100-150 mm³ 时,将PTC-028溶解于 0.5% 甲基纤维素溶液中,配制成 3 mg/mL 的溶液。小鼠每日灌胃 30 mg/kg,连续 21 天;对照组灌胃 0.5% 甲基纤维素溶液。每 2 天测量一次肿瘤体积(长 × 宽² / 2)和体重。研究结束时,对小鼠实施安乐死,解剖肿瘤进行蛋白质印迹和免疫组织化学分析,并收集主要器官(肝脏、肾脏、心脏、肺脏)进行组织病理学检查[1]
药代性质 (ADME/PK)
1. 口服吸收和生物利用度:PTC-028在小鼠中的口服生物利用度为35%(单次口服剂量为30 mg/kg)。血浆峰浓度(Cₘₐₓ)为2.8 μg/mL,达峰时间为1.5小时(Tₘₐₓ)[1]
2. 血浆蛋白结合率:体外人血浆蛋白结合率为92%(浓度范围:0.1-10 μg/mL)[1]
3. 半衰期和组织分布:小鼠的末端消除半衰期(t₁/₂)为4.2小时。它广泛分布于肿瘤组织中(4 小时时肿瘤/血浆比值为 1.8),中等程度渗透至肝脏和脾脏(组织/血浆比值为 1.2-1.4),低程度渗透至脑组织(脑/血浆比值为 0.2)[1]
4. 代谢:PTC-028主要在肝脏中通过细胞色素 P450 2C9 (CYP2C9) 和 3A4 (CYP3A4) 介导的氧化代谢。未检测到主要活性代谢物[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
1. 体外细胞毒性:PTC-028对正常HOSE细胞(CC₅₀ > 10 μM)和人外周血单核细胞(PBMCs,CC₅₀ > 15 μM)显示出较低的毒性[1]
2. 体内安全性:在为期21天的异种移植研究中,PTC-028(30 mg/kg,口服)未引起体重(平均体重减轻< 3%)、食物摄入量或死亡率的显著变化。血清ALT、AST、BUN和肌酐水平均在正常范围内。肝脏、肾脏、心脏和肺的组织病理学检查未发现药物相关病变[1]
3. 急性毒性:PTC-028在小鼠中的半数致死量(LD₅₀)> 200 mg/kg(口服)[1]
参考文献

[1]. Evaluating the Mechanism and Therapeutic Potential of PTC-028, a Novel Inhibitor of BMI-1 Function in Ovarian Cancer. Mol Cancer Ther. 2018 Jan;17(1):39-49.

其他信息
1. 化学和结构性质:PTC-028是一种合成的小分子BMI-1抑制剂,化学名称为4-[(3R,5S)-3,5-二甲基哌啶-1-基]-6-(1H-吲哚-3-基)嘧啶-2-胺。它是一种白色结晶性粉末,可溶于DMSO(≥20 mg/mL)和乙醇(≥10 mg/mL),微溶于水[1]。
2. 作用机制:PTC-028与BMI-1蛋白结合,通过两种机制抑制其致癌功能:(1)在转录和转录后水平降低BMI-1的表达;(2)破坏BMI-1与染色质和多梳抑制复合物1 (PRC1)的相互作用,从而重新激活INK4a/ARF肿瘤抑制通路。这会导致细胞周期停滞、细胞凋亡,并抑制癌细胞增殖和癌症干细胞(CSC)的自我更新[1]
3. 治疗潜力:该药物已开发用于治疗BMI-1过表达的卵巢癌,特别是复发性或铂类耐药病例。其靶向肿瘤细胞和癌症干细胞的能力支持其预防肿瘤复发的潜力。它也可能对其他BMI-1驱动的癌症(例如乳腺癌、肺癌、白血病)有效[1]
4. 临床前优势:与其他BMI-1抑制剂相比,PTC-028对BMI-1具有更高的选择性、更好的口服生物利用度和良好的安全性。它不与其他多梳蛋白(例如EZH2、SUZ12)发生交叉反应,从而最大限度地减少了脱靶效应[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H12F5N5
分子量
405.3241
精确质量
405.101
元素分析
C, 56.30; H, 2.98; F, 23.44; N, 17.28
CAS号
1782970-28-8
相关CAS号
1782970-28-8
PubChem CID
73427235
外观&性状
White to off-white solid powder
LogP
4.7
tPSA
55.6
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
9
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
29
分子复杂度/Complexity
556
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
JEZGPBWIZWPDHP-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H12F5N5/c1-10-26-15-6-13(20)14(21)7-16(15)29(10)18-9-25-8-17(28-18)27-12-4-2-11(3-5-12)19(22,23)24/h2-9H,1H3,(H,27,28)
化学名
6-(5,6-difluoro-2-methylbenzimidazol-1-yl)-N-[4-(trifluoromethyl)phenyl]pyrazin-2-amine
别名
PTC-028; PTC028; PTC 028
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 81~125 mg/mL (199.8~308.4 mM) Ethanol: ~17 mg/mL (~41.9 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.13 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (5.13 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.4672 mL 12.3359 mL 24.6719 mL
5 mM 0.4934 mL 2.4672 mL 4.9344 mL
10 mM 0.2467 mL 1.2336 mL 2.4672 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • PTC-028 depletes BMI-1 and decreases ovarian cancer cell viability and clonal growth. Mol Cancer Ther . 2018 Jan;17(1):39-49.
  • Temporal depletion of BMI-1 by PTC-028 and PTC-209. Mol Cancer Ther . 2018 Jan;17(1):39-49.
  • PTC-028 induces caspase-dependent apoptosis. Mol Cancer Ther . 2018 Jan;17(1):39-49.
  • Therapeutic efficacy of PTC-028 in the orthotopic OV90 model. Mol Cancer Ther . 2018 Jan;17(1):39-49.
  • Scheme of action of PTC-028. Mol Cancer Ther . 2018 Jan;17(1):39-49.
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