DDO-2728

目录号: V86304 纯度: ≥98%
DDO-2728 CAS号: 3029515-97-4
产品类别: Apoptosis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
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产品描述
DDO-2728(化合物 19)是一种选择性 AlkB 同源物 5 (ALKBH5) 抑制剂,IC50 为 2.97 μM。DDO-2728 可增加 N6 甲基腺苷 (m6A) 修饰的丰度,诱导细胞凋亡和细胞周期阻滞。DDO-2728 在 MV4-11 异种移植瘤模型中抑制肿瘤生长,且安全性良好,表明靶向 ALKBH5 在癌症研究中具有潜在应用价值。
DDO-2728 是一种选择性吡唑并嘧啶类 ALKBH5 (AlkB 同源物 5) 抑制剂,IC50 为 2.97 μM。它可增加急性髓系白血病 (AML) 细胞中 N6 甲基腺苷 (m6A) 修饰的水平,并对这些细胞表现出抗增殖活性。 DDO-2728 在 MV4-11 异种移植模型中也表现出了抗肿瘤功效。
生物活性&实验参考方法
靶点
AlkB homologue 5 (ALKBH5) IC50: 2.97 μM[1]
DDO-2728 targets ALKBH5 (AlkB homolog 5), a demethylase that removes N6-methyladenosine (m6A) modifications from RNA. m6A is the most abundant internal modification in eukaryotic mRNA and plays a critical role in RNA metabolism, including splicing, translation, and stability. ALKBH5 is overexpressed in various cancers, including AML, and its inhibition can restore m6A levels, leading to altered gene expression and anti-cancer effects.
体外研究 (In Vitro)
DDO-2728(0-40 μM,48 h)可浓度梯度地增加 MOLM-13、HEK293 和 MV4-11 细胞中 m6A 甲基化的水平 [1]。DDO-2728(0.01-100 μM,72 h)可抑制 MOLM-13 和 MV4-11 细胞的增殖,IC50 值分别为 0.45 μM 和 1.2 μM,且对 HEK293 和 HUVEC 细胞的毒性相对较弱 [1]。DDO-2728(20 μM,48 h)可显著阻滞 MOLM-13 和 MV4-11 细胞的 G1/M 期细胞周期 [1]。DDO-2728(5、10 μM,48 h)可浓度依赖性地诱导 MV4-11 和 MOLM-13 细胞凋亡 [1]。 DDO-2728(20 μM,24 小时)可降低 MOLM-13 和 MV4-11 细胞中 TACC3 mRNA 的半衰期 [1]。DDO-2728(0-10 μM,48 小时)可显著降低 MOLM-13 和 MV4-11 细胞中 TACC3 和 c-Myc 的 mRNA 和蛋白水平 [1]。1.19 大鼠和人血浆及肝微粒体的代谢稳定性 [1]
体外实验表明,DDO-2728 可抑制 ALKBH5,IC50 值为 2.97 μM。它可增加 AML 细胞中 m6A 修饰水平,导致参与细胞增殖和存活的基因表达改变。该化合物可诱导 AML 细胞凋亡和细胞周期阻滞。其抗增殖活性已在多种 AML 细胞系中得到证实。该化合物对 ALKBH5 的选择性优于其他去甲基化酶,这体现了其特异性。
体内研究 (In Vivo)
DDO-2728(10-40 mg/kg,腹腔注射,每日一次,持续 14 天)可有效抑制裸鼠体内 MV4-11 异种移植瘤的生长[1]。 1.19 DDO-2728 在大鼠体内的药代动力学参数[1] 参数 大鼠(静脉注射,2mg/kg) 大鼠(腹腔注射,10mg/kg) T1/2 (min) 36.7 ± 3.2 148.3 ± 4.6 Cmax (ng/mL) 13388.3 ± 784.5 2337.5 ± 295.7 Tmax (min) 30 AUC0-∞ (min·μg/mL) 404.3 ± 58.6 349.1 ± 26.1 Vz_F_obs (mL/kg) 263.6 ± 17.5 6177.6 ± 650.2 Cl_F_obs (mL/min/kg) 5.0 ± 0.5 28.8 ± 2.2 MRT (min) 77.8 ± 15.5 168.2 ± 1.2 F (%) 17.3
在体内,DDO-2728 已在 MV4-11 异种移植模型中展现出抗肿瘤疗效。该化合物通过抑制 ALKBH5 并提高 m6A 水平,抑制 AML 模型中的肿瘤生长。该化合物在异种移植模型中的疗效凸显了其在癌症研究和靶向 ALKBH5 的治疗策略中的潜在应用价值。详细的体内疗效数据已在原始文献中描述。
酶活实验
DDO-2728 的非细胞结合试验包括测定其对纯化 ALKBH5 酶的抑制活性。使用含 m6A 的 RNA 底物评估 ALKBH5 的去甲基化酶活性,并定量去甲基化 RNA 的生成量。通过测定不同浓度 DDO-2728 存在下酶的活性来确定该化合物的 IC50 值。此外,还可以评估其对其他去甲基化酶的选择性。
细胞实验
细胞增殖实验[1]
细胞类型: MOLM-13、MV4-11、HEK293、HUVEC
测试浓度: 0.01-100 μM
孵育时间: 72 小时
实验结果: 对 MOLM-13 和 MV4-11 细胞的增殖具有抑制作用,IC50 值分别为 0.45 μM 和 1.2 μM;在 1 μM 浓度下,对 HEK293 和 HUVEC 细胞未观察到明显的细胞毒性。

细胞凋亡分析[1]
细胞类型: MOLM-13、MV4-11
测试浓度: 0、5、10 μM 孵育时间: 48 小时
实验结果: 以浓度依赖的方式诱导 MV4-11 和 MOLM-13 细胞凋亡,MV4-11 细胞凋亡率从 7.17% 增加到 55.4%,MOLM-13 细胞凋亡率从 6.49% 增加到 31.5%。

细胞周期分析[1]
细胞类型: MOLM-13、MV4-11
测试浓度: 20 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: 将 MOLM-13 和 MV4-11 细胞的细胞周期阻滞在 G1/M 期,因为不存在 G2/M 期细胞。
体外在 MV4-11 等 AML 细胞系中开展了 DDO-2728 的细胞实验。用不同浓度的化合物处理细胞,并使用 m6A 特异性抗体或 LC-MS/MS 对总 RNA 中的 m6A 水平进行定量。采用 CellTiter-Glo、MTT 和 Annexin V 染色等标准方法评估细胞活力、增殖和凋亡。细胞周期分析则通过流式细胞术进行。
动物实验
动物/疾病模型: MV4-11异种移植裸鼠[1]
剂量: 10、20和40 mg/kg
给药途径: 每日腹腔注射(ip),持续14天
实验结果: 即使在10 mg/kg的浓度下,也能显著抑制肿瘤生长。治疗期间小鼠体重和主要器官均无显著变化,试验组小鼠的器官重量与载体组相同,器官组织的HE染色图像未观察到明显的损伤。
使用MV4-11 AML细胞构建小鼠异种移植模型,对DDO-2728进行体内动物研究。通过适当的给药途径,用该化合物治疗荷瘤小鼠。肿瘤生长情况会随时间推移进行监测,终点指标包括肿瘤体积测量、生存分析以及肿瘤组织中m6A水平和ALKBH5靶基因表达的药效学评估。疗效与载体对照组进行比较。
药代性质 (ADME/PK)
DDO-2728 的药代动力学特性包括其分子式为 C28H17F3N4O7,CAS 编号为 3029515-97-4。该化合物为固体粉末。半衰期、生物利用度和组织分布等详细的药代动力学参数将在合适的动物模型中进行测定。储存条件应遵循供应商的建议。该化合物仅供研究使用。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
DDO-2728 的毒性数据是在临床前开发过程中获得的。作为一种 ALKBH5 抑制剂,其潜在毒性可能包括对正常组织中 RNA 代谢的影响。全面的毒理学研究将评估其安全范围并确定靶器官毒性。研究人员应查阅安全数据表,并采取适当的实验室安全预防措施,仅供研究使用。
参考文献

[1].Discovery of Pyrazolo[1,5-a]pyrimidine Derivative as a Novel and Selective ALKBH5 Inhibitor for the Treatment of AML. Journal of Medicinal Chemistry. 2023,Article ASAP.

其他信息
DDO-2728 是一种选择性 ALKBH5 抑制剂。它增加了 AML 细胞中的 m6A 修饰水平,并表现出抗增殖活性。它在 MV4-11 移植模型中显示了抗肿瘤功效。该化合物在癌症研究和针对 ALKBH5 的治疗策略中具有潜在应用。所有产品仅供研究使用,不得用于人类治疗应用。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
CAS号
3029515-97-4
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~125 mg/mL (~216.09 mM; with sonication)
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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