Pz-1

目录号: V32217 纯度: ≥98%
Pz-1 是 RET 和 VEGFR2 受体酪氨酸激酶的有效抑制剂。
Pz-1 CAS号: 1800505-64-9
产品类别: New2
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产品描述
Pz-1 是 RET 和 VEGFR2 受体酪氨酸激酶的有效抑制剂。 Pz-1 抑制这两种野生型激酶的 IC50 小于 1 nM。
生物活性&实验参考方法
靶点
Pz-1 is a type II tyrosine kinase inhibitor that attaches itself to the kinase's DFG-out conformation. Tyrosine phosphorylation of VEGFR2 and clinically relevant RET mutants, such as vandetanib- and cabozantinib-resistant mutants (RETV804M and RETV804L), was significantly inhibited by 1.0 nM Pz-1 in a cell-based assay [1].
体外研究 (In Vitro)
Pz-1 是一种 II 型酪氨酸激酶抑制剂,可将自身附着在激酶的 DFG-out 构象上。在基于细胞的测定中,1.0 nM Pz-1 显着抑制 VEGFR2 和临床相关 RET 突变体(例如凡德他尼和卡博替尼耐药突变体(RETV804M 和 RETV804L))的酪氨酸磷酸化 [1]。
在生化激酶实验中,Pz-1 对野生型 RET、VEGFR2 以及临床相关的 RET 突变体(RETC634R, RETM918T, RETV804M, RETV804L)表现出强效抑制活性,IC50 值均小于 1.0 nM。 [1]
在使用转染的 HEK293 细胞的实验中,1.0 nM 剂量的 Pz-1 能强烈抑制 RET 致癌蛋白(RETC634R, RETM918T, RETV804M, RETV804L)的酪氨酸磷酸化。 [1]
在 VEGFA 刺激的转染了 VEGFR2 的 HEK293 细胞中,1.0 nM 的 Pz-1 能有效抑制 VEGFR2 磷酸化。同样,在人脐静脉内皮细胞 (HUVECs) 中,Pz-1 抑制了内源性 VEGFA 诱导的 VEGFR2 磷酸化。 [1]
在用 RETC634Y 转化的 NIH3T3 成纤维细胞中,Pz-1 抑制细胞增殖的 IC50 为 0.5 nM。相比之下,抑制用 HRasG12V 转化的 NIH3T3 细胞增殖的 IC50 为 34.4 nM。在浓度高达 100.0 nM 时,Pz-1 对亲本 NIH3T3 细胞未产生可检测的生长抑制。 [1]
在 50.0 nM 浓度下对 91 种激酶组的全激酶组选择性筛选显示,除 RET 和 VEGFR2 外,Pz-1 仅对另外 7 种激酶有活性,表明其具有良好的全局选择性。 [1]
体内研究 (In Vivo)
Pz-1 主动结合 VEGFR2,阻止 RET 促进生长所需的血流。当每天口服 1.0 mg/kg 时,Pz-1 可以阻止肿瘤组织中 RET 和 VEGFR2 的磷酸化,并消除 RET 突变成纤维细胞引起的肿瘤发展。在高达 100.0 mg/kg 的浓度下,Pz-1 没有表现出明显的毒性,表明治疗窗口很宽[1]。
在注射了 NIH3T3 RETC634Y 细胞的免疫缺陷 (nu/nu) 小鼠中,在肿瘤出现前开始每日口服给予 1.0 mg/kg/天的 Pz-1,完全阻止了 RET 驱动肿瘤的形成。 [1]
在注射了 NIH3T3 HRasG12V 细胞的小鼠中,相同处理(1.0、3.0 或 10.0 mg/kg/天)减少但并未消除肿瘤形成,表明了对 RET 驱动肿瘤的优先疗效。 [1]
肿瘤组织分析表明,Pz-1 (1.0 mg/kg) 在 RET 驱动的肿瘤中抑制了 RET 和 VEGFR2 的磷酸化。它还特异性地在 RET 驱动的肿瘤中抑制了下游 MAPK 和 mTOR 信号级联,但在 Ras 驱动的肿瘤中则没有。然而,在 RET 和 Ras 驱动的肿瘤中,VEGFR2 磷酸化均被抑制。 [1]
酶活实验
使用基于微流控分离的生化激酶测定法测定 IC50 值。测定条件包括特定的 ATP 浓度(例如,某些化合物注明为 190 µM)。通过评估激酶对其底物活性的降低来测量抑制活性。所提供的数据来自至少三次独立实验的平均值。 [1]
为确定 RET 的 ATP Km,采用了标准的酶动力学方法,得出的 Km 值为 12.00 ± 0.26 µM。为表征抑制类型,在不同 ATP 浓度(6.2、12.5、50.0 和 100.0 µM)下测定了前体化合物 (3b) 的 IC50,显示其抑制与 ATP 部分竞争。 [1]
使用活性位点定向竞争结合测定法测定了 Pz-1 及其关键前体对 RET、VEGFR2 和 RETV804M 突变体的解离常数 (Kd) 值。 [1]
细胞实验
为评估对致癌性 RET 磷酸化的抑制,用 Pz-1 或对照溶剂处理表达特定 RET 突变体的细胞。处理后裂解细胞,通过 SDS-PAGE 分离蛋白质。使用磷酸化特异性抗体通过蛋白质印迹法分析 RET 在特定酪氨酸残基(如 Y1062)上的磷酸化水平,总 RET 蛋白水平作为上样对照。 [1]
为评估对 VEGFR2 磷酸化的抑制,将转染了 VEGFR2 的 HEK293 细胞或天然 HUVECs 血清饥饿,在存在或不存在 Pz-1 的情况下用 VEGFA 刺激,然后裂解。通过蛋白质印迹法检测 VEGFR2 在 Y1175 位点的磷酸化。 [1]
抗增殖活性通过细胞活力测定进行评估。用一系列浓度的 Pz-1 处理用 RETC634Y 或 HRasG12V 转化的 NIH3T3 细胞以及亲本 NIH3T3 细胞。经过适当的孵育时间后,定量细胞活力或增殖情况,并计算 IC50 值。 [1]
动物实验
在体内疗效研究中,将经RETC634Y或HRasG12V转化的NIH3T3成纤维细胞皮下注射到免疫缺陷(nu/nu)小鼠体内。在可触及肿瘤形成之前开始治疗。Pz-1每日通过灌胃(per os,PO)给药,剂量分别为1.0、3.0或10.0 mg/kg/天。对照组仅接受赋形剂。通过测量肿瘤体积来监测肿瘤的生长情况。[1]
在毒性评估中,小鼠接受Pz-1治疗,每日剂量最高达100.0 mg/kg,持续一周,并监测体重和血清丙氨酸氨基转移酶(ALT)水平。[1]
药代性质 (ADME/PK)
文献指出,Pz-1具有非常有利的药代动力学特性,但正文或可获取的补充信息中没有提供具体参数(例如,半衰期、生物利用度、AUC)。[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
在一项为期一周的小鼠研究中,每日口服剂量高达 100.0 mg/kg 的 Pz-1 耐受性良好,未检测到任何毒性迹象。血清丙氨酸转氨酶 (ALT) 水平随剂量呈线性增加,但始终在正常范围内,可作为监测指标。未报告其他特定毒性(例如血液学、肾脏毒性)或致死剂量。[1]
参考文献

[1]. Fragment-Based Discovery of a Dual pan-RET/VEGFR2 Kinase Inhibitor Optimized for Single-Agent Polypharmacology. Angew Chem Int Ed Engl. 2015 Jul 20;54(30):8717-21.

其他信息
Pz-1 是通过基于激酶导向片段 (KDF) 库的片段筛选发现的,随后通过计算建模和构效关系 (SAR) 研究进行了优化。[1]
它是一种 II 型酪氨酸激酶抑制剂,可与激酶的 DFG-out 构象结合。分子建模表明,其对 RET 和 VEGFR2 的等效效力得益于亚甲基连接基的自由旋转,从而允许其在两种激酶中呈现不同的结合几何构型。[1]
Pz-1 对 RET 门控突变体 (V804M/L) 仍具有强效活性,而这些突变体对已批准的药物凡德他尼和卡博替尼耐药。 [1]
该研究提出了一种单药多药理学策略,其中Pz-1同时靶向肿瘤实质(通过抑制RET)和肿瘤间质(通过抑制抗血管生成VEGFR2)。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C26H26N6O2
分子量
454.523644924164
精确质量
454.211
CAS号
1800505-64-9
PubChem CID
102004343
外观&性状
White to yellow solid powder
LogP
4.3
tPSA
90.8
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
34
分子复杂度/Complexity
706
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O1C(=CC(=N1)NC(CC1C=CC(=CC=1)N1C=NC2C=C(C3C=NN(C)C=3)C=CC1=2)=O)C(C)(C)C
InChi Key
NJLMIILZNLZZFW-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C26H26N6O2/c1-26(2,3)23-13-24(30-34-23)29-25(33)11-17-5-8-20(9-6-17)32-16-27-21-12-18(7-10-22(21)32)19-14-28-31(4)15-19/h5-10,12-16H,11H2,1-4H3,(H,29,30,33)
化学名
N-(5-tert-butyl-1,2-oxazol-3-yl)-2-[4-[5-(1-methylpyrazol-4-yl)benzimidazol-1-yl]phenyl]acetamide
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~50 mg/mL (~110.01 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.50 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.50 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.50 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2001 mL 11.0006 mL 22.0012 mL
5 mM 0.4400 mL 2.2001 mL 4.4002 mL
10 mM 0.2200 mL 1.1001 mL 2.2001 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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