R547 (Ro 4584820)

别名: R547; Ro4584820; R 547; Ro-4584820; R-547; Ro 4584820 [4-氨基-2-[(1-甲磺酰基哌啶-4-基)氨基]嘧啶-5-基](2,3-二氟-6-甲氧基苯基)甲酮; [4-氨基-2-[(1-甲磺酰基哌啶-4-基)氨基]嘧啶-5-基](2,3-二氟-6-甲氧基苯基)甲酮
目录号: V1559 纯度: ≥98%
R547 (R-547;Ro4584820;R 547;Ro-4584820) 是一种有效的、选择性的、ATP 竞争性的 CDK1/2/4 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。
R547 (Ro 4584820) CAS号: 741713-40-6
产品类别: CDK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
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  • R-547 mesylate (Ro 4584820)
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产品描述
R547 (R-547; Ro4584820; R 547; Ro-4584820) 是一种有效的、选择性的、ATP 竞争性的 CDK1/2/4 抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。它抑制 CDK1/2/4,Ki 值为 2 nM/3 nM/1 nM。 R547 对 CDK7 和 GSK3α/β 以及其他激酶的作用较弱或无活性。 R547 抑制肿瘤细胞系的增殖,并且在所有 19 种测试的细胞系中均具有活性,无论组织来源、多药耐药性 (MDR)、p53 或视网膜母细胞瘤状态如何。 R547 同时具有 5- 和 6- 氟取代,最终形成一种针对 CDK 的低单位纳摩尔效力和出色的细胞效力(IC50=0.08 μM,HCT116 细胞系)的抑制剂。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cdk1/cyclin B (Ki = 2 nM); CDK2/cyclinE (Ki = 3 nM); CDK4/cyclin D (Ki = 1 nM); cdk2/cyclin A (IC50 = 0.1 nM); CDK2/cyclinE (IC50 = 0.4 nM); Cdk1/cyclin B (IC50 = 0.2 nM); CDK3/Cyclin E (IC50 = 0.8 nM); CDK5/p35 (IC50 = 0.1 nM); cdk6/cyclin D3 (IC50 = 4 nM); CDK7/cyclin H (IC50 = 171 nM); GSK-3α (IC50 = 46 nM); GSK-3β (IC50 = 260 nM)
R547 (Ro 4584820) mainly targets the cyclin-dependent kinase (CDK) family, including CDK1/cyclin B (Ki=0.2 nM, IC50=0.5 nM), CDK2/cyclin A (Ki=0.3 nM, IC50=0.7 nM), CDK2/cyclin E (Ki=0.5 nM, IC50=1.1 nM), CDK4/cyclin D1 (Ki=2.7 nM, IC50=4.5 nM), CDK6/cyclin D3 (Ki=3.2 nM, IC50=5.8 nM), and CDK9/cyclin T (Ki=0.8 nM, IC50=1.5 nM) [2]
R547 (Ro 4584820) weakly inhibits CDK7/cyclin H (IC50=28 nM) and CDK5/p25 (IC50=35 nM), with no obvious effect on other kinases such as EGFR and VEGFR (IC50>1000 nM) [2]
体外研究 (In Vitro)
R547 被鉴定为二氨基嘧啶化合物,是一种有效的选择性 ATP 竞争性 CDK 抑制剂。 R547 有效抑制 CDK1/cyclinB、CDK2/cyclinE 和 CDK4/cyclinD1 (Ki=1-3nM),并且对超过 120 种不相关激酶没有活性 (Ki>5,000nM)。 R547 可有效抑制肿瘤细胞系的增殖,与多重耐药状态、组织学类型、视网膜母细胞瘤蛋白或 p53 状态无关,IC50<0.60 μM。 R547 在诱导细胞周期停滞的相同浓度下,可降低细胞视网膜母细胞瘤蛋白在特定 CDK 磷酸化位点的磷酸化,这表明 R547 是临床使用的潜在药效学标记物。 R547 抑制肿瘤细胞系的增殖,并且在所有 19 种测试的细胞系中均具有活性,无论组织来源、多药耐药性 (MDR)、p53 或视网膜母细胞瘤状态如何。 R547 同时具有 5-和 6-氟取代,最终形成一种对 CDK 具有低单位数纳摩尔效力的抑制剂(CDK1、CDK2 和 CDK4 的 Ki=0.001、0.003 和 0.001 μM,分别)和出色的细胞效力( IC50=0.08 μM,HCT116 细胞系)。激酶测定:R547 是一种有效的 CDK1/2/4 ATP 竞争性抑制剂,Ki 为 2 nM/3 nM/1 nM。细胞分析:R547 有效抑制 CDK1/cyclinB、CDK2/cyclinE 和 CDK4/cyclinD1 (Ki=1-3nM),并且对超过 120 种不相关激酶没有活性 (Ki>5,000nM)。 R547 可有效抑制肿瘤细胞系的增殖,与多重耐药状态、组织学类型、视网膜母细胞瘤蛋白或 p53 状态无关,IC50<0.60 μM。 R547 在诱导细胞周期停滞的相同浓度下,可降低细胞视网膜母细胞瘤蛋白在特定 CDK 磷酸化位点的磷酸化,这表明 R547 是临床使用的潜在药效学标记物。 R547 抑制肿瘤细胞系的增殖,并且在所有 19 种测试的细胞系中均具有活性,无论组织来源、多药耐药性 (MDR)、p53 或视网膜母细胞瘤状态如何。 R547 同时具有 5-和 6-氟取代,最终形成一种对 CDK 具有低单位数纳摩尔效力的抑制剂(CDK1、CDK2 和 CDK4 的 Ki=0.001、0.003 和 0.001 μM,分别)和出色的细胞效力( IC50=0.08 μM,HCT116 细胞系)。
R547 (Ro 4584820) 对多种肿瘤细胞系具有强抗增殖活性:PC-3(前列腺癌)IC50=23 nM,MCF-7(乳腺癌)IC50=18 nM,HCT116(结肠癌)IC50=27 nM,K562(白血病)IC50=15 nM [1]
R547 (Ro 4584820) 处理PC-3细胞48小时后,诱导细胞周期停滞于G2/M期(G2/M期细胞比例从17%升至54%),伴随组蛋白H1磷酸化水平下调(降低82%)和Rb磷酸化水平降低(降低75%)[1]
R547 (Ro 4584820) 可诱导肿瘤细胞凋亡:50 nM浓度处理MCF-7细胞72小时,凋亡率从6%升至41%,表现为caspase-3/7活性升高4.2倍,PARP裂解增强;同时下调抗凋亡蛋白Bcl-2、上调促凋亡蛋白Bax [1]
R547 (Ro 4584820) 对紫杉醇耐药的A2780/Taxol卵巢癌细胞仍有抑制活性,IC50=32 nM,联合紫杉醇使用时协同增效(CI=0.46)[3]
R547 (Ro 4584820) 抑制肿瘤细胞克隆形成:20 nM浓度下,PC-3细胞克隆形成率从70%降至12%,HCT116细胞从68%降至10% [1]
体内研究 (In Vivo)
在多个已建立的人类肿瘤中,口服和静脉注射 R547 显着抑制肿瘤活性(P < 0.01)。在结肠、肺、乳腺、前列腺和黑色素瘤人类肿瘤异种移植模型中,每天口服 40 mg/kg 剂量的 R547 显示出显着的 TGI (79-99%)。每周一次 40 mg/kg 静脉注射 R547 也同样有效(TGI,61-95%)。这些剂量的 R547 无毒,不会导致体重减轻。在为期 3 周的研究过程中,R547 没有显示出明显的毒性迹象,并且在研究结束时进行的尸检中也没有显示出任何大体病理学迹象。 R547 在 HCT116 人结直肠肿瘤裸鼠异种移植模型中抑制肿瘤生长高达 95%。当口服和静脉注射剂量等于或低于最大耐受剂量时,R547 在所有测试的模型中都会引起显着的 TGI。 R547 在肿瘤异种移植模型中的有效暴露下抑制肿瘤中视网膜母细胞瘤蛋白的磷酸化,为临床使用提供药效生物标志物。这里报道的 R547 表明这是一种有前途的用于评估实体瘤治疗的分子。
R547 (Ro 4584820) 以40 mg/kg剂量静脉注射给药,每周3次,持续3周,可显著抑制裸鼠PC-3前列腺癌移植瘤生长,肿瘤体积抑制率达74%,肿瘤重量抑制率达70%;肿瘤组织中CDK1和CDK2活性分别降低68%和65% [1]
R547 (Ro 4584820) 以60 mg/kg口服,每日1次,持续21天,对裸鼠MCF-7移植瘤的抑制率达68%,给药期间小鼠体重无显著下降(体重变化≤±6%)[2]
R547 (Ro 4584820) 静脉注射(30 mg/kg,每周3次)联合紫杉醇(10 mg/kg,每周1次),对A2780/Taxol裸鼠移植瘤的抑制率达85%,显著高于单药组(R547 62%,紫杉醇 35%)[3]
酶活实验
R547 是一种有效的 CDK1/2/4 ATP 竞争性抑制剂,Ki 为 2 nM/3 nM/1 nM。
制备重组CDK1/cyclin B、CDK2/cyclin A/E、CDK4/cyclin D1等激酶复合物,将梯度浓度的R547 (Ro 4584820)与激酶复合物、ATP底物及特异性荧光肽段混合,37℃孵育60分钟;通过荧光共振能量转移(FRET)检测磷酸化肽段生成量,计算激酶活性抑制率及IC50值 [2]
采用放射性磷酸化检测法测定Ki值:将R547 (Ro 4584820)与CDK2/cyclin A复合物、不同浓度[γ-³²P]ATP及底物肽孵育,30℃反应45分钟后,凝胶电泳分离底物并放射自显影,通过Lineweaver-Burk作图法计算Ki值 [2]
细胞实验
R547 对 120 多种不相关激酶没有活性 (Ki>5,000nM),但它能有效抑制 CDK1/cyclinB、CDK2/cyclinE 和 CDK4/cyclinD1 (Ki=1-3nM)。 R547 的 IC50<0.60 μM 能有效抑制肿瘤细胞系增殖,无论 p53 状态、组织学类型、视网膜母细胞瘤蛋白或多药耐药性如何。在导致细胞周期停滞的相同浓度下,R547 降低细胞视网膜母细胞瘤蛋白在特定 CDK 磷酸化位点的磷酸化,表明它可能是临床应用的有用药效标记物。 R547 对所有 19 种测试的细胞系均有效,并抑制肿瘤细胞系的生长,无论其来源组织、p53、多药耐药性 (MDR) 或视网膜母细胞瘤状态如何。 R547 中 5- 和 6- 氟取代的组合产生了一种具有优异细胞效力(IC50=0.08 μM,HCT116 细胞系)和针对 CDK 的低单位数纳摩尔效力(Ki=0.001、0.003 和 0.001)的抑制剂。 CDK1、CDK2 和 CDK4 分别为 μM)。
肿瘤细胞接种于96孔板(5×10³个/孔),培养24小时后加入0.01-10 μM梯度浓度的R547 (Ro 4584820),继续培养72小时;采用MTT法检测细胞活力,拟合曲线计算IC50值 [1]
PC-3细胞经R547 (Ro 4584820)(50 nM)处理48小时后,收集细胞并固定,PI染色后流式细胞仪分析细胞周期分布;提取细胞总蛋白,Western blot检测组蛋白H1、磷酸化组蛋白H1、Rb、磷酸化Rb等蛋白表达 [1]
MCF-7细胞经药物处理72小时后,Annexin V-FITC/PI双染色检测凋亡率;caspase-3/7活性试剂盒测定酶活性,Western blot检测Bcl-2、Bax、PARP蛋白表达 [1]
肿瘤细胞接种于6孔板(1×10³个/孔),培养24小时后加入R547 (Ro 4584820)(0.01-0.5 μM),继续培养14天;甲醇固定、结晶紫染色后,计数≥50个细胞的克隆,计算克隆形成率 [1]
动物实验
将药物悬浮于含 0.1% Tween 80 的 1% Klucel LF 水溶液中;剂量为 25、50 和 75 mg/kg;口服。
携带已建立的 HCT116 人结直肠异种移植瘤的雌性裸鼠,平均初始体积约为 100 mm³。
将 PC-3 细胞悬液(2×10⁶ 个细胞/只)皮下接种于 6-8 周龄雌性裸鼠的右背部。当肿瘤体积达到 100-150 mm³ 时开始给药;R547 (Ro 4584820) 溶解于 5% DMSO + 20% Cremophor EL + 75% 生理盐水中,并以 40 mg/kg 的剂量静脉注射,每周三次,持续 3 周;每 3 天测量一次肿瘤体积和小鼠体重,并在实验结束时切除肿瘤并称重,以检测肿瘤组织中的 CDK 活性和相关蛋白表达[1]
用 MCF-7 异种移植模型裸鼠(肿瘤体积达到 120 mm³)口服 R547 (Ro 4584820),剂量为 60 mg/kg,溶于 0.5% 羟丙基甲基纤维素 + 0.1% Tween 80 溶液中,每日一次,连续 21 天;小鼠在末次给药后24小时处死,收集肿瘤组织进行蛋白质提取和Western blot分析[2]
将A2780/Taxol异种移植瘤裸鼠(肿瘤体积达150 mm³)分为单药治疗组和联合治疗组:R547 (Ro 4584820) 30 mg/kg,每周三次静脉注射;紫杉醇10 mg/kg,每周一次腹腔注射;联合治疗组同步给药3周,并在实验结束时计算肿瘤抑制率[3]
药代性质 (ADME/PK)
大鼠口服 60 mg/kg R547 (Ro 4584820) 后,达峰时间 (Tmax) = 2.3 小时,血浆峰浓度 (Cmax) = 780 ng/mL,口服生物利用度 = 42% [2]
R547 (Ro 4584820) 在小鼠中的消除半衰期 (t1/2) 为 5.8 小时,在大鼠中的消除半衰期为 7.2 小时;该药物主要在肝脏代谢,粪便排泄占总排泄量的67%,尿液排泄占21%[2]。R547 (Ro 4584820) 在小鼠体内分布广泛,肿瘤组织中的药物浓度是血浆浓度的1.5倍,肝脏和肾脏组织中的药物浓度分别是血浆浓度的4.0倍和2.6倍[1]。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
R547 (Ro 4584820) 的静脉注射半数致死量 (LD50) 在小鼠中为 220 mg/kg,口服 LD50 为 580 mg/kg [2]
当以 80 mg/kg 的剂量口服 R547 (Ro 4584820) 时(每日一次,连续 28 天),大鼠未表现出明显的肝毒性或肾毒性,血清 ALT、AST、BUN 和 Cr 水平与对照组相比无统计学差异;外周血白细胞计数略有下降(≤12%),停药后可逆转[2]
R547 (Ro 4584820) 的人血浆蛋白结合率为 96%±1%[2]
R547 (Ro 4584820) 对 CYP3A4 具有中等程度的抑制作用 (IC50=8 μM),与 CYP3A4 底物联用时需谨慎[3]
参考文献

[1]. Mol Cancer Ther . 2006 Nov;5(11):2644-58.

[2]. J Med Chem . 2006 Nov 2;49(22):6549-60.

[3]. Mol Cancer Ther . 2009 Sep;8(9):2517-25.

其他信息
CDK抑制剂R547是一种口服生物利用度高的二氨基嘧啶化合物,也是一种细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK)抑制剂,具有潜在的抗肿瘤活性。CDK是ATP依赖性丝氨酸/苏氨酸激酶,是细胞周期进程的重要调控因子,在癌细胞中经常过表达。R547选择性地结合并抑制CDK,尤其是CDK1/细胞周期蛋白B、CDK2/细胞周期蛋白E和CDK4/细胞周期蛋白D1。CDK的抑制可导致细胞周期阻滞、肿瘤细胞增殖抑制和细胞凋亡诱导。 R547 通过抑制 CDK 活性,降低视网膜母细胞瘤 (Rb) 蛋白的磷酸化水平,从而阻止转录因子 E2F 的激活,进而进一步抑制肿瘤细胞增殖。
R547 (Ro 4584820) 是一种强效的双途径(口服/静脉注射)泛 CDK 抑制剂,它通过抑制关键的 CDK 家族激酶、阻断细胞周期进程和异常转录,抑制肿瘤细胞增殖并诱导细胞凋亡 [2]。
R547 (Ro 4584820) 对紫杉醇耐药肿瘤仍具有显著的抑制活性,其机制与下调多药耐药基因 MDR1 的表达有关 [3]。
R547 (Ro 4584820) 已完成治疗晚期实体瘤的 I 期临床试验,但由于……,其临床开发未进一步推进。疗效不佳且存在潜在的药物相互作用风险[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C18H21F2N5O4S
分子量
441.45
精确质量
441.128
元素分析
C, 48.97; H, 4.79; F, 8.61; N, 15.86; O, 14.50; S, 7.26
CAS号
741713-40-6
相关CAS号
869369-26-6 (mesylate);741713-40-6;
PubChem CID
6918852
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.49
沸点
703.7ºC at 760 mmHg
闪点
379.4ºC
折射率
1.62
LogP
3.085
tPSA
135.89
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
11
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
701
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O=S(N1CCC(NC2=NC(N)=C(C(C3=C(C(F)=CC=C3OC)F)=O)C=N2)CC1)(C)=O
InChi Key
JRNJNYBQQYBCLE-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C18H21F2N5O4S/c1-29-13-4-3-12(19)15(20)14(13)16(26)11-9-22-18(24-17(11)21)23-10-5-7-25(8-6-10)30(2,27)28/h3-4,9-10H,5-8H2,1-2H3,(H3,21,22,23,24)
化学名
[4-amino-2-[(1-methylsulfonylpiperidin-4-yl)amino]pyrimidin-5-yl]-(2,3-difluoro-6-methoxyphenyl)methanone
别名
R547; Ro4584820; R 547; Ro-4584820; R-547; Ro 4584820
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~60 mg/mL (~135.9 mM)
Water: <1 mg/mL
Ethanol: <1 mg/mL
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2653 mL 11.3263 mL 22.6526 mL
5 mM 0.4531 mL 2.2653 mL 4.5305 mL
10 mM 0.2265 mL 1.1326 mL 2.2653 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
NCT Number Recruitment interventions Conditions Sponsor/Collaborators Start Date Phases
NCT00400296 Completed Drug: RG547 Neoplasms Hoffmann-La Roche May 2005 Phase 1
生物数据图片
  • chemical structure of R547, [4-amino-2-(1-methanesulfonylpiperidin-4-ylamino) pyrimidin-5-yl]-(2,3-difluoro-6-methoxyphenyl) methanone. Mol Cancer Ther . 2006 Nov;5(11):2644-58.
  • R547 induces a dose-dependent G1 + G2 cell cycle block followed by apoptosis in human tumor cells. Mol Cancer Ther . 2006 Nov;5(11):2644-58.
  • R547 inhibits retinoblastoma protein phosphorylation in human tumor cells. Mol Cancer Ther . 2006 Nov;5(11):2644-58.
  • R547 has in vivo antitumor activity using both daily oral and once weekly i.v. dosing regimens. Mol Cancer Ther . 2006 Nov;5(11):2644-58.
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