S 2101

别名: S2101; S-2101; S 2101 (1R,2S)-rel-2-[3,5-Difluoro-2-(phenylmethoxy)phenyl]cycloprpanaminehydrochloride

目录号: V33464 纯度: ≥98%

COA 产品数据产品说明书 SDS

S-2101 是一种新型、有效的赖氨酸特异性去甲基酶 1 (LSD1) 抑制剂，具有抗癌活性。

S 2101 CAS号: 1239262-36-2
产品类别: New2

产品仅用于科学研究，不针对患者销售

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Nature 2025, 643(8070):192-200.

Nature 2024 Dec 18.

Nature 2021, 597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022: 8, eabm9427.

Nat Neurosci 2024, 27:1468-1474.

Science Adv 2025, 11(33):eadr5199.

Nat Metab 2024, 6: 1108-1127.

Cell Stem Cell 2024, 31:106-126.e13.

Nature 597, 119–125 (2021)

Cell Stem Cell 2020,26(6):845-861.e12.

Science Trans Med 2023,15(701):eadd7872.

STTT 2023,8(1):91.

Cell Reports 2023,42(4):112313

Science Trans Med 2023, 15: eadd7872.

Cancer Cell 2021,39(4):529-547.e7.

Cancer Discov 2022,12(4):1106-1127.

Immunity 2023,56(3):620-634.e11.

Immunity 2024,57:2651-2668.e12.

J Am Chem Soc 2022,144:21831-21836.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

Science Adv 2022:8,eabm9427.

Nature 2021,597(7874):119-125.

Cell 2020,183:1202-1218.e25.

PNAS Nexus 2022,1(3):pgac063.

ACS Nano 2023,17(10):9110-9125.

Biomaterial 2023 Sep16:302:122333.

产品描述
生物活性&实验参考方法
化学信息
溶解度数据
计算器
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产品描述

S-2101 是一种新型、有效的赖氨酸特异性去甲基酶 1 (LSD1) 抑制剂，具有抗癌活性。它抑制 LSD1，IC50 为 0.99 μM，Ki 为 0.61 μM，Kiact/Ki 为 4560 M/s。

生物活性&实验参考方法

靶点	KDM1/lysine-specific demethylase 1 (LSD1)
体外研究 (In Vitro)	S2101 是赖氨酸特异性脱甲基酶 1 (LSD1) 的抑制剂，IC50 为 0.99 μM，Ki 为 0.61 μM，Kinact/Ki 为 4560 M/s。此外，S2101 对 MAO-A (Ki=110 µM，Kinact/Ki=60 M/s) 和 MAO-B (Ki=17 µM，Kinact/Ki=18 M/s) 的抑制活性显着降低。在 HEK293T 细胞中用 S2101 处理 H3K4me2，这种处理会导致 H3K4me2 呈剂量依赖性升高，这肯定是由于 LSD1 失活而积累的。在 S2101 治疗期间，核提取物中 LSD1 和组蛋白 H3 的水平没有显着变化。由于用 1 μM S2101 处理时，50 μM 2-PCPA 会引发相似量的 H3K4me2，因此推测 S2101 在人体细胞中的 LSD1 抑制作用比 2-PCPA 大约高 50 倍[1]。
酶活实验	LSD1抑制实验[1] 采用过氧化物酶偶联反应法获得了LSD1去甲基酶抑制的动力学抑制参数。将LSD1蛋白（3.0 pmol）与40μM H3K4me2肽在含有10 mM HEPES Na（pH 7.5）、200μM 4-氨基安替比林、改良Trinder试剂TOOS[N-乙基-N-（2-羟基-3-磺基丙基）-3-甲基苯胺，钠盐，二水合物]和0.01 mg/mL辣根过氧化物酶的缓冲液中孵育10分钟。该系统产生7.61±0.56 min−1的kcat和16±5μM的Km。辣根过氧化物酶利用LSD1去甲基化产生的过氧化物酶副产物将TOOS和4-氨基安替比林转化为粉红色/紫色化合物，λmax为555 nm(http://www.dojindo.co.jp/protocol/protocol/trinder.pdf). 在黑暗中制备反应混合物以抑制Trinder试剂的反应性。用微孔板读取器（Ultrospec Visible Plate reader II 96，GE Healthcare）每10秒在562nm处测量反应混合物的吸收。尽管TOOS的λmax为555 nm，但在562 nm处测量波长足以提供准确的抑制结果，因为用于计算KI的方程取决于活性的差异，而不是绝对值。将结果转化为LSD1的去甲基化肽的量和MAOs的氧化酪胺的量，使用TOOS的ε值3.92×104。对结果进行分析，并与慢结合抑制剂方程（方程1）拟合以产生kobs，并根据Kitz−Wilson分析进一步转换以计算kinact和KIapp，或者当y截距明显为非零时，使用偏移值koffset（方程2）（26-31）。将KIapp转化为KI，以排除底物浓度的偏差（等式3）（26）。使用GraFit拟合数据(http://www.erithacus.com/grafit/)和KyPlot(http://www.kyenslab.com/jp/). MAO抑制试验[1] 使用过氧化物酶偶联反应法进行MAO抑制测定，基本上与LSD1相同，但分别以40或50μM酪胺为底物和9.0和4.5μg MAO-A和MAO-B。以与LSD1相同的方式分析和计算结果。每个结果都是从至少三个单独的实验中计算出来的。在时间过程测定上绘制的符号是实验的平均值，并且使用KyPlot通过慢结合抑制剂方程计算和拟合最佳拟合线。
细胞实验	化合物处理的细胞的蛋白质印迹分析[1] HEK293T细胞在Dulbecco改良的Eagle培养基中的100 mm培养皿中生长，该培养基含有10%FBS和100单位/mL青霉素、100μg/mL链霉素抗生素溶液，在37°C的5%CO2气氛下。用LSD1抑制剂处理约70%融合度的细胞24小时，分离，并用冰冷的PBS冲洗数次。根据制造商的说明，使用CelLytic Nuclear提取试剂盒制备核提取物。将每个核提取物在10%至20%的SDS−聚丙烯酰胺凝胶上进行电泳，然后转移到硝化纤维膜上。用第一抗体（抗H3，Abcam ab1791；抗H3K4me2，Upstate 07-030；和抗LSD1）探测膜上的蛋白质，然后用第二抗体（山羊抗兔IgG−辣根过氧化物酶偶联物）探测，并用化学发光系统Immobilion Western检测。
参考文献	[1]. Structurally designed trans-2-phenylcyclopropylamine derivatives potently inhibit histone demethylase LSD1/KDM1 . Biochemistry. 2010 Aug 3;49(30):6494-503.
其他信息	赖氨酸特异性去甲基化酶1 (LSD1/KDM1) 可使组蛋白H3去甲基化，此外，抑癌基因p53和DNA甲基转移酶1 (Dnmt1) 也参与此过程，从而通过改变染色质结构来调控真核生物基因表达。由于LSD1异常与多种癌症相关，且LSD1抑制可恢复癌细胞中异常沉默基因的表达，因此LSD1特异性抑制剂被认为是理想的抗癌药物。本研究基于LSD1和单胺氧化酶B (MAO-B) 与抗抑郁药反苯环丙胺 (2-PCPA) 衍生物的复合物结构，设计并合成了几种LSD1抑制剂候选化合物。在LSD1去甲基化实验中，化合物S2101表现出比反式环丙胺和已知的LSD1小分子抑制剂更强的LSD1抑制活性，其ak(inact)/K(I)值为4560 M⁻¹ s⁻¹。与反式环丙胺相比，该化合物对单胺氧化酶的抑制作用较弱。通过测定抑制剂与LSD1结合的结构，确定了两种2-PCPA衍生物2-PFPA和S1201的抑制模式，结果表明抑制剂-FAD加合物与周围LSD1残基的相互作用增强了其稳定性。这些分子有望成为治疗癌症或潜伏病毒感染的候选药物，也可作为LSD1相关生物学研究的工具[1]。

*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性

化学信息 & 存储运输条件

精确质量	311.09
元素分析	C, 61.64; H, 5.17; Cl, 11.37; F, 12.19; N, 4.49; O, 5.13
CAS号	1239262-36-2
PubChem CID	121513887
外观&性状	White to off-white solid powder
tPSA	35.2Å²
氢键供体(HBD)数目	2
氢键受体(HBA)数目	4
可旋转键数目(RBC)	4
重原子数目	21
分子复杂度/Complexity	322
定义原子立体中心数目	2
SMILES	C1[C@H]([C@@H]1N)C2=C(C(=CC(=C2)F)F)OCC3=CC=CC=C3.Cl
InChi Key	CTSUZAFTJVLOIX-SBKWZQTDSA-N
InChi Code	InChI=1S/C16H15F2NO.ClH/c17-11-6-13(12-8-15(12)19)16(14(18)7-11)20-9-10-4-2-1-3-5-10;/h1-7,12,15H,8-9,19H2;1H/t12-,15+;/m0./s1
化学名	(1R,2S)-2-(3,5-difluoro-2-phenylmethoxyphenyl)cyclopropan-1-amine;hydrochloride
别名	S2101; S-2101; S 2101
HS Tariff Code	2934.99.9001
存储方式	Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month
运输条件	Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)

溶解度数据

溶解度 (体外实验)	DMSO : ~100 mg/mL (~320.77 mM)
溶解度 (体内实验)	配方 1 中的溶解度: 5 mg/mL (16.04 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。配方 2 中的溶解度:* ≥ 5 mg/mL (16.04 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More* 配方 3 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (16.04 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

溶解度 (体外实验)

DMSO : ~100 mg/mL (~320.77 mM)

溶解度 (体内实验)

配方 1 中的溶解度: 5 mg/mL (16.04 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (16.04 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (16.04 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案：
1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL；
3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们;
7、以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。

计算器

质量

浓度

体积

分子量*

计算重置

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度，具体如下：

计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度

参见示例

使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示：
假如化合物的分子量为350.26 g/mol，在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少？

在分子量（MW）框中输入350.26
在“浓度”框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在“体积”框中输入5，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式，您可以计算体积和浓度。

浓度 (起始)

体积 (起始)

浓度 (终)

体积 (终)

计算重置

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如，可以输入C1、C2和V2来计算V1，具体如下：

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液？
使用方程式C1V1=C2V2，其中C1=10mM，C2=25μM，V2=25 ml，V1未知：

在C1框中输入10，然后选择正确的单位（mM）
在C2框中输入25，然后选择正确的单位（μM）
在V2框中输入25，然后选择正确的单位（mL）
单击“计算”按钮
答案62.5μL（0.1 ml）出现在V1框中

分子式

分子量

g/mol

计算重置

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成，具体如下：

注：化学分子式大小写敏感：C12H18N3O4 c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量（分子量）的说明：

要计算化合物的分子量 (摩尔质量)，请输入化学/分子式，然后单击“计算”按钮。

分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义：

分子质量（或分子量）是一种物质的一个分子的质量，用统一的原子质量单位（u）表示。（1u等于碳-12中一个原子质量的1/12）
摩尔质量（摩尔重量）是一摩尔物质的质量，以g/mol表示。

配液体积

质量

配液浓度

计算重置

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
单击“计算”按钮
答案显示在体积框中

动物体内实验配方计算器（澄清溶液）

第一步：请输入基本实验信息（考虑到实验过程中的损耗，建议多配一只动物的药量）

给药剂量 mg/kg

动物平均体重 g

每只动物给药体积 μL

动物数量

第二步：请输入动物体内配方组成（配方适用于不溶/难溶于水的化合物），不同的产品和批次配方组成不同，如对配方有疑问，可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外，请注意这只是一个配方计算器，而不是特定产品的确切配方。

% DMSO

% Tween 80

% ddH₂O

计算重置

计算结果:

工作液浓度： mg/mL；

DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。

体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH₂O，混匀澄清。

注意： (1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。