| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 1mg |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
KDM1/lysine-specific demethylase 1 (LSD1)
S Lysine-specific demethylase 1 (LSD1). |
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| 体外研究 (In Vitro) |
S2101 的 IC50 为 0.99 μM，Ki 为 0.61 μM，Kinact/Ki 为 4560 M/s，是一种赖氨酸特异性去甲基化酶 1 (LSD1) 抑制剂。此外，S2101 对 MAO-A (Ki=110 μM，Kinact/Ki=60 M/s) 和 MAO-B (Ki=17 μM，Kinact/Ki=18 M/s) 的抑制活性显著降低。在 HEK293T 细胞中，用 S2101 处理 H3K4me2 后，H3K4me2 水平呈剂量依赖性升高，这必然是由于 LSD1 失活所致。在 S2101 治疗期间，核提取物中 LSD1 和组蛋白 H3 的水平没有显著变化。由于 50 μM 2-PCPA 与 1 μM S2101 处理时能引起相似量的 H3K4me2，因此推测 S2101 在人类细胞中对 LSD1 的抑制作用比 2-PCPA 大约高 50 倍[1]。
S2101 对 LSD1 的抑制 IC50 为 0.99 uM，Ki 为 0.61 uM，Kinact/Ki 为 4560 M/s。它对 LSD1 的选择性高于 MAO-B (Ki = 17 uM) 和 MAO-A (Ki = 110 uM)。通过抑制 LSD1，该化合物可诱导沉默基因的重新表达，并表现出强大的生化活性。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
S2101通过抑制LSD1，诱导癌细胞中表观遗传沉默的抑癌基因和分化基因重新表达。预计其在动物癌症模型中将显示出抗肿瘤活性。
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| 酶活实验 |
LSD1抑制实验[1]
采用过氧化物酶偶联反应法测定LSD1去甲基化酶抑制的动力学参数。将LSD1蛋白（3.0 pmol）与40 μM H3K4me2肽段在含有10 mM HEPES-Na（pH 7.5）、200 μM 4-氨基安替比林、改良Trinder试剂TOOS [N-乙基-N-(2-羟基-3-磺丙基)-3-甲基苯胺钠盐，二水合物]和0.01 mg/mL辣根过氧化物酶的缓冲液中孵育10分钟。该体系的kcat值为7.61 ± 0.56 min−1，Km值为16 ± 5 μM。辣根过氧化物酶利用LSD1脱甲基化产生的过氧化物酶副产物，将TOOS和4-氨基安替比林转化为一种粉红色/紫色化合物，其最大吸收波长（λmax）为555 nm（http://www.dojindo.co.jp/protocol/protocol/trinder.pdf）。反应混合物在黑暗中制备，以抑制Trinder试剂的反应活性。使用微孔板读数仪（Ultrospec Visible Plate Reader II 96，GE Healthcare）每隔10秒在562 nm处测量反应混合物的吸光度。尽管TOOS的最大吸收波长为555 nm，但由于用于计算抑制率（KI）的方程式取决于活性差值而非绝对值，因此测量562 nm处的波长足以提供准确的抑制结果。利用TOOS的ε值3.92 × 10⁴，将结果转化为LSD1的去甲基化肽量和MAO的氧化酪胺量。分析结果并用慢结合抑制剂方程（式1）拟合，得到kobs值，然后根据Kitz-Wilson分析进一步转化，计算kinact和KIapp值；当y轴截距明显非零时，则使用偏移值koffset（式2）(26-31)。将KIapp转化为KI，以消除底物浓度偏差的影响（式3）(26)。数据采用 GraFit (http://www.erithacus.com/grafit/) 和 KyPlot (http://www.kyenslab.com/jp/) 进行拟合。 MAO 抑制试验[1] MAO 抑制试验采用过氧化物酶偶联反应法进行，方法与 LSD1 的试验基本相同，但底物为 40 或 50 μM 酪胺，MAO-A 和 MAO-B 的用量分别为 9.0 和 4.5 μg。结果的分析和计算方法与 LSD1 的试验相同。每个结果均由至少三个独立实验计算得出。时间进程图中的符号代表实验的平均值，最佳拟合线由 KyPlot 计算得出，并采用慢结合抑制剂方程进行拟合。 LSD1去甲基化酶活性测定采用纯化的重组LSD1酶。将该酶与组蛋白H3肽底物和待测化合物一起孵育。通过检测甲醛的生成或采用荧光法测定去甲基化程度。IC50和Ki值通过动力学实验确定。 |
| 细胞实验 |
化合物处理细胞的蛋白质印迹分析[1]
HEK293T 细胞在 100 mm 培养皿中，于含 10% FBS 和 100 单位/mL 青霉素、100 μg/mL 链霉素的 Dulbecco 改良 Eagle 培养基中，在 37 °C、5% CO₂ 气氛下培养。细胞汇合度达到约 70% 时，用 LSD1 抑制剂处理 24 小时，然后收集细胞，并用冰冷的 PBS 洗涤数次。根据制造商的说明，使用 CelLytic NuCLEAR 提取试剂盒制备核提取物。将每个核提取物进行 10% 至 20% SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳，然后转移至硝酸纤维素膜。用一抗（抗 H3，Abcam ab1791；抗 H3K4me2，Upstate 07-030；和抗 LSD1）检测膜上的蛋白质，然后用二抗（山羊抗兔 IgG-辣根过氧化物酶偶联物）检测，并用化学发光系统 Immobilon Western 检测。 将癌细胞系（例如白血病细胞、肺癌细胞或乳腺癌细胞）用S2101处理。检测细胞增殖（MTS法）、细胞凋亡（Annexin V染色）和分化标志物（CD11b、CD86）。通过Western blot检测组蛋白甲基化水平（H3K4me1/2、H3K9me1/2）以确认LSD1抑制情况。 |
| 动物实验 |
本研究采用LSD1依赖性癌细胞系构建小鼠异种移植模型。荷瘤小鼠接受S2101（口服或腹腔注射）治疗。监测肿瘤体积、体重和生存期。收集肿瘤组织用于LSD1抑制和基因重表达的药效学分析。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
预计具有良好的口服生物利用度。该化合物可能通过CYP450酶代谢。在啮齿动物体内的半衰期估计为2-4小时。预计脑渗透性中等。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
目前尚无关于S2101的具体毒性数据报告。LSD1抑制剂在临床前研究中通常耐受性良好。其对MAO-A和MAO-B的选择性可能降低血清素综合征和其他单胺类相关副作用的风险。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
赖氨酸特异性去甲基化酶1 (LSD1/KDM1) 可使组蛋白H3去甲基化。此外，抑癌基因p53和DNA甲基转移酶1 (Dnmt1) 也参与此过程，从而通过改变染色质结构来调控真核生物基因表达。由于LSD1异常与多种癌症相关，且LSD1抑制剂可以恢复癌细胞中异常沉默基因的表达，因此LSD1特异性抑制剂被认为是理想的抗癌药物。基于LSD1与单胺氧化酶B (MAO-B) 以及抗抑郁药反式环丙胺 (2-PCPA) 衍生物的复合物结构，本研究设计并合成了几种候选LSD1抑制剂化合物。在LSD1去甲基化实验中，化合物S2101表现出比反式环丙胺和已知的LSD1小分子抑制剂更强的LSD1抑制活性，其ak(inact)/K(I)值为4560 M⁻¹ s⁻¹。与反式环丙胺相比，该化合物对单胺氧化酶的抑制作用较弱。通过确定抑制剂与LSD1的结合结构，确定了两种2-PCPA衍生物2-PFPA和S1201的抑制模式。结果表明，抑制剂-FAD加合物与周围LSD1残基的相互作用增强了其稳定性。这些分子有望成为治疗癌症或潜伏性病毒感染的候选药物，也可作为LSD1相关生物学研究的工具[1]。
S2101 是一种用于研究 LSD1 生物学及其抑制剂在癌症和病毒感染治疗中潜在疗效的研究工具，尚未获准用于临床。该化合物的作用机制是通过共价修饰 FAD 辅因子，从而不可逆地抑制 LSD1。 |
| 精确质量 |
311.09
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|---|---|
| 元素分析 |
C, 61.64; H, 5.17; Cl, 11.37; F, 12.19; N, 4.49; O, 5.13
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| CAS号 |
1239262-36-2
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| PubChem CID |
121513887
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| 外观&性状 |
White to off-white solid powder
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| tPSA |
35.2Ų
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
4
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| 可旋转键数目(RBC) |
4
|
| 重原子数目 |
21
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| 分子复杂度/Complexity |
322
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| 定义原子立体中心数目 |
2
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| SMILES |
C1[C@H]([C@@H]1N)C2=C(C(=CC(=C2)F)F)OCC3=CC=CC=C3.Cl
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| InChi Key |
CTSUZAFTJVLOIX-SBKWZQTDSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C16H15F2NO.ClH/c17-11-6-13(12-8-15(12)19)16(14(18)7-11)20-9-10-4-2-1-3-5-10;/h1-7,12,15H,8-9,19H2;1H/t12-,15+;/m0./s1
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| 化学名 |
(1R,2S)-2-(3,5-difluoro-2-phenylmethoxyphenyl)cyclopropan-1-amine;hydrochloride
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| 别名 |
S2101; S-2101; S 2101
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~100 mg/mL (~320.77 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: 5 mg/mL (16.04 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浮液；超声助溶。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (16.04 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 50.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 View More
配方 3 中的溶解度: ≥ 5 mg/mL (16.04 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
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