SR9011

别名: SR9011; SR 9011; 3-[[(4-chlorophenyl)methyl-[(5-nitrothiophen-2-yl)methyl]amino]methyl]-N-pentylpyrrolidine-1-carboxamide; VYI79FLZ6W; CHEMBL1961797; 1-Pyrrolidinecarboxamide, 3-((((4-chlorophenyl)methyl)((5-nitro-2-thienyl)methyl)amino)methyl)-n-pentyl-; SR-9011
目录号: V4070 纯度: ≥98%
SR9011 是一种新型强效合成 REV-ERBα/β 激动剂,REV-ERBα 和 REV-ERBβ 的 IC50 值分别为 790 nM 和 560 nM。
SR9011 CAS号: 1379686-29-9
产品类别: REV-ERB
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
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Other Forms of SR9011:

  • SR9011 hydrochloride
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纯度: ≥98%

产品描述
SR9011 是一种新型、有效的合成 REV-ERBα/β 激动剂,REV-ERBα 和 REV-ERBβ 的 IC50 值分别为 790 nM 和 560 nM。同步行为节律和代谢过程对于心血管健康和预防代谢疾病非常重要。核受体 REV-ERB-α 和 REV-ERB-β 在调节驱动活动和代谢节律的核心时钟蛋白的表达方面发挥着不可或缺的作用。给予合成的 REV-ERB 配体会改变小鼠下丘脑的昼夜节律行为和核心时钟基因表达的昼夜节律模式。肝脏、骨骼肌和脂肪组织中一系列代谢基因的昼夜节律表达模式也发生了改变,导致能量消耗增加。用 REV-ERB 激动剂治疗饮食诱导的肥胖小鼠,通过减少脂肪量并显着改善血脂异常和高血糖来减少肥胖。这些结果表明,药理学上针对昼夜节律的合成 REV-ERB 配体可能有益于治疗睡眠障碍和代谢疾病。
生物活性&实验参考方法
靶点
REV-ERBα(IC50 = 790 nM); REV-ERBβ(IC50 = 560 nM)
体外研究 (In Vitro)
在表达嵌合 Gal4 DNA 结合结构域 (DBD)-REV-ERB 配体结合结构域 (LBD) α 或 β 和 Gal4 响应性荧光素酶报告基因 (REV-) 的 HEK293 细胞中,SR9011 剂量依赖性增强 REV-ERB 依赖性抑制活性。 REV-ERBβ IC50 = 560 nM,ERBα IC50 = 790 nM。在使用全长 REV-ERBα 和 Bmal1 启动子驱动的荧光素酶报告基因的共转染测试中,SR9011 有效抑制转录(SR9011 IC50 = 620 nM)。 SR9011 以依赖于 REV-ERBα/β 的方式抑制 HepG2 细胞中 BMAL1 mRNA 的表达 [1]。此外,SR9011 可以阻止乳腺癌细胞系的生长,无论其 ER 或 HER2 状态如何。 SR9011 似乎可以在乳腺癌细胞进入 M 期之前停止其细胞周期。由于细胞周期蛋白 A (CCNA2) 被发现是 REV-ERB 的直接靶基因,因此细胞周期停滞可能是通过 SR9011 抑制该细胞周期蛋白表达来介导的。 SR9011治疗后G0/G1期细胞增加,S和G2/M期细胞减少,表明REV-ERB激活可能减少从G1期到S期和/或从S期到G2/M期的转变[2]。
体内研究 (In Vivo)
由于 SR9011 表现出相当大的血浆暴露量,因此在六天内给予不同剂量 SR9011 的小鼠肝脏中研究了对 REV-ERB 敏感的基因表达。响应 SR9011,REV-ERB 靶基因纤溶酶原激活剂抑制剂 1 型 (Serpine1) 显示剂量依赖性表达抑制。甾醇反应元件结合蛋白 (Srepf1) 和胆固醇 7α-羟化酶 (Cyp7a1) 的基因同样被证明对 REV-ERB 有反应,并且通过增加 SR9011 剂量而受到剂量依赖性抑制。在 D:D 环境中 12 天后,在 CT6(Rev-erbα 表达峰值)时给小鼠注射单剂量的 SR9011 或载体。车辆注射不会干扰昼夜节律运动活动。然而,SR9011 治疗导致受试者在黑暗时期丧失运动活动能力。随后的昼夜节律周期恢复正常,这与一天内药物清除一致。 SR9011 依赖性抑制 REV-ERB 反应基因 Srebf1 的体内功效 (ED50 = 56 mg/kg) (ED50 = 67 mg/kg) 与 SR9011 依赖性减少小鼠滚轮运行的效果相当连续黑暗条件下的行为[1]。
酶活实验
在这项研究中,研究人员开发了两种REV-ERBα/β激动剂,它们具有足够的血浆/脑暴露,可以在体内评估其效果。SR9009和SR9009(图1a,补充图1)均剂量依赖性地增加了在表达嵌合Gal4 DNA结合结构域(DBD)-REV-ERB配体结合结构域α或β和Gal4反应性萤光素酶报告子的HEK293细胞中评估的REV-ERB依赖性阻遏物活性(图1b)(SR9009:REV-ERBαIC50=670 nM,REV-ERBβIC50=800 nM;SR9011:REV-ERB a IC50=790 nM,REV-ERBβIC50=560 nM)。REV-ERB配体GSK4112(补充图2)没有暴露于血浆中,其活性有限(图1b)。在使用全长REV-ERBα以及由Bmal1启动子驱动的萤光素酶报告子的共转染试验中,SR9011和SR9009均有效地抑制了转录(图1c)(SR9009 IC50=710 nM;SR9011 IC50=620 nM)。SR9011和SR9009以REV-ERBα/β依赖的方式抑制HepG2细胞中BMAL1 mRNA的表达(补充图3)。与这两种化合物作为REV-ERB的直接激动剂的作用一致,我们注意到,使用生化分析,这些化合物增加了NCoR的CoRNR盒肽片段的募集(补充图4)。SR9009与REV-ERBα的直接结合也通过圆二色谱分析得到证实(补充图5)(Kd=800 nM)。这两种化合物都没有在其他核受体上表现出活性12,13(补充图6)[1]。
细胞实验
HEK293 细胞在 96 孔板(1×106/孔)中生长,并使用 Lipofectamine 瞬时转染。每孔用总共 200 ng DNA 转染细胞,其中包含 pGL4 mIL-17 萤火虫荧光素酶报告基因构建体、pGL4 mIL-17 + CNS-5 萤火虫荧光素酶报告基因构建体或 pGL4 mIL-17 2kB RORE 突变体(100 ng/孔)、肌动蛋白启动子海肾荧光素酶报告基因(50 ng/孔)以及单独的对照载体或测试 DNA(50 ng/孔的全长 RORα 或全长 RORγ)。所有 48 种人类核受体均出现在特异性测定中,SR9009 的测试浓度为 20 μM。该测定的形式是在 HEK293 细胞中使用 Gal4 DNA 结合域-核受体融合物进行共转染测定[1]。
动物实验
For circadian gene expression experiments male C57BL6 mice (8–10 weeks of age) were either maintained on a L:D (12h:12h) cycle or on constant darkness. At circadian time (CT) 0 animals were administered a single dose of 100 mg/kg SR9009 or SR9011 (i.p.) and groups of animals (n=6) were sacrificed at CT0, CT6, CT12 and CT18. Gene expression was determined by real time QPCR.[1]
参考文献

[1]. Regulation of circadian behaviour and metabolism by synthetic REV-ERB agonists. Nature. 2012 Mar 29;485(7396):62-8.

[2]. Anti-proliferative actions of a synthetic REV-ERBα/β agonist in breast cancer cells. Biochem Pharmacol. 2015 Aug 15;96(4):315-22.

其他信息
SR-9011 is a REV-ERB agonist. SR-9011 has been demonstrated that it is specifically lethal to cancer cells and oncogene-induced senescent cells, including melanocytic naevi, and has no effect on the viability of normal cells or tissues.
Synchronizing rhythms of behaviour and metabolic processes is important for cardiovascular health and preventing metabolic diseases. The nuclear receptors REV-ERB-α and REV-ERB-β have an integral role in regulating the expression of core clock proteins driving rhythms in activity and metabolism. Here we describe the identification of potent synthetic REV-ERB agonists with in vivo activity. Administration of synthetic REV-ERB ligands alters circadian behaviour and the circadian pattern of core clock gene expression in the hypothalami of mice. The circadian pattern of expression of an array of metabolic genes in the liver, skeletal muscle and adipose tissue was also altered, resulting in increased energy expenditure. Treatment of diet-induced obese mice with a REV-ERB agonist decreased obesity by reducing fat mass and markedly improving dyslipidaemia and hyperglycaemia. These results indicate that synthetic REV-ERB ligands that pharmacologically target the circadian rhythm may be beneficial in the treatment of sleep disorders as well as metabolic diseases.[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H31CLN4O3S
分子量
479.04
精确质量
478.18
元素分析
C, 57.67; H, 6.52; Cl, 7.40; N, 11.70; O, 10.02; S, 6.69
CAS号
1379686-29-9
相关CAS号
SR9011 hydrochloride;2070014-94-5
PubChem CID
57394021
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
642.8±50.0 °C at 760 mmHg
闪点
342.6±30.1 °C
蒸汽压
0.0±1.9 mmHg at 25°C
折射率
1.595
LogP
5.74
tPSA
110
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
10
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
600
定义原子立体中心数目
0
InChi Key
PPUYOYQTTWJTIU-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H31ClN4O3S/c1-2-3-4-12-25-23(29)27-13-11-19(16-27)15-26(14-18-5-7-20(24)8-6-18)17-21-9-10-22(32-21)28(30)31/h5-10,19H,2-4,11-17H2,1H3,(H,25,29)
化学名
3-[[(4-chlorophenyl)methyl-[(5-nitrothiophen-2-yl)methyl]amino]methyl]-N-pentylpyrrolidine-1-carboxamide
别名
SR9011; SR 9011; 3-[[(4-chlorophenyl)methyl-[(5-nitrothiophen-2-yl)methyl]amino]methyl]-N-pentylpyrrolidine-1-carboxamide; VYI79FLZ6W; CHEMBL1961797; 1-Pyrrolidinecarboxamide, 3-((((4-chlorophenyl)methyl)((5-nitro-2-thienyl)methyl)amino)methyl)-n-pentyl-; SR-9011
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO:≥ 40mg/mL
Water:N/A
Ethanol:N/A
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.22 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.22 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0875 mL 10.4375 mL 20.8751 mL
5 mM 0.4175 mL 2.0875 mL 4.1750 mL
10 mM 0.2088 mL 1.0438 mL 2.0875 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • SR9011

    SR9011 and SR9009 are synthetic REV-ERB agonists with activityin vivo.2012 Mar 29;485(7396):62-8

  • SR9011

    Synthetic REV-ERB ligands alter circadian behavior and the pattern of expression of core clock genes.2012 Mar 29;485(7396):62-8.

  • SR9011

    Activation of REV-ERB by SR9011in vivoresults in an increase in energy expenditure and weight loss.2012 Mar 29;485(7396):62-8.

  • SR9011

    REV-ERB ligands alter the pattern of circadian expression of metabolic genes in the liver, skeletal muscle and adipose tissue.2012 Mar 29;485(7396):62-8.

  • SR9011

    SR9009 treatment results in a decrease in fat mass and in plasma lipids in diet-induced obese mice.2012 Mar 29;485(7396):62-8.

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