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| 5mg |
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| Other Sizes |
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| 靶点 |
REV-ERBα(IC50 = 790 nM); REV-ERBβ(IC50 = 560 nM)
SR9011 hydrochloride targets REV-ERBα and REV-ERBβ, nuclear receptors that play a central role in regulating circadian rhythm and metabolism. It exhibits IC₅₀ values of 790 nM for REV-ERBα and 560 nM for REV-ERBβ. REV-ERB receptors are transcriptional repressors that regulate the expression of genes involved in circadian rhythm, energy metabolism, lipid metabolism, and inflammation. By activating these receptors, SR9011 modulates metabolic and inflammatory pathways, potentially improving metabolic function and body weight regulation. |
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| 体外研究 (In Vitro) |
在表达嵌合型 Gal4 DNA 结合域 (DBD) - REV-ERB 配体结合域 (LBD) α 或 β 以及 Gal4 反应性荧光素酶报告基因(REV-ERBα IC50=790 nM,REV-ERBβ IC50=560 nM)的 HEK293 细胞中,SR9011 呈剂量依赖性地增强 REV-ERB 依赖性抑制活性。在与全长 REV-ERBα 和由 Bmal1 启动子驱动的荧光素酶报告基因共转染的实验中,SR9011 (IC50=620 nM) 能有效且强效地抑制转录。SR9011 以 REV-ERBα/β 依赖的方式抑制 HepG2 细胞中 BMAL1 mRNA 的表达[1]。此外,SR9011 抑制乳腺癌细胞系的生长,且与 ER 或 HER2 状态无关。 SR9011 似乎能阻止乳腺癌细胞进入 M 期。由于细胞周期蛋白 A (CCNA2) 是 REV-ERB 的直接靶基因,因此 SR9011 可能通过降低该细胞周期蛋白的表达来介导细胞周期阻滞。SR9011 处理后 G0/G1 期细胞比例增加,而 S 期和 G2/M 期细胞比例减少,这表明 REV-ERB 的激活可能导致 G1 期向 S 期和/或 S 期向 G2/M 期的转换减少[2]。体外实验表明,盐酸 SR9011 具有 REV-ERBα/β 激动剂活性,其对 REV-ERBα 的 IC₅₀ 值为 790 nM,对 REV-ERBβ 的 IC₅₀ 值为 560 nM。该化合物的活性通过基于细胞的报告基因检测进行评估,该检测使用 REV-ERB 反应元件-荧光素酶构建体。它调节昼夜节律相关基因的表达,并影响能量代谢、脂质代谢和炎症反应。SR9011能够抑制乳腺癌细胞系的生长,且不受ER或HER2状态的影响,并似乎能在乳腺癌细胞进入M期之前将其阻滞。
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| 体内研究 (In Vivo) |
由于SR9011具有可观的血浆暴露量,因此本研究检测了小鼠肝脏中对REV-ERB敏感的基因表达情况。小鼠连续六天接受不同剂量的SR9011治疗。作为REV-ERB的靶基因,纤溶酶原激活物抑制剂1型基因(Serpine1)的表达在SR9011的作用下呈剂量依赖性降低。此外,研究还表明,REV-ERB反应基因胆固醇7α-羟化酶(Cyp7a1)和甾醇调节元件结合蛋白(Srepf1)的表达也随着SR9011浓度的增加而呈剂量依赖性抑制。在昼夜节律条件下饲养12天后,小鼠在CT6(Rev-erbα表达达到峰值)单次注射SR9011或载体。注射载体后,小鼠的昼夜节律运动活性未发生改变。然而,在受试者黑暗期,单次注射SR9011即可降低其运动活性。随后,在下一个昼夜节律周期内,运动活性恢复正常,这与药物在24小时内清除相符。在永久黑暗条件下饲养的小鼠中,SR9011依赖性地降低其跑轮行为的效力(ED50=56 mg/kg)与SR9011介导的体内抑制REV-ERB反应基因Srebf1的效力(ED50=67 mg/kg)相当[1]。
公开文献中关于SR9011盐酸盐的具体体内活性数据尚不充分。作为一种REV-ERBα/β激动剂,该化合物在调节代谢、昼夜节律和炎症方面具有潜在的应用价值。它可能改善代谢功能和体重调节。该化合物抑制乳腺癌细胞生长的能力提示其在肿瘤学研究中具有潜在的应用价值。还需要进行进一步的体内研究,以充分表征其疗效和安全性。 |
| 酶活实验 |
在本研究中,研究人员开发了两种具有足够血浆/脑暴露量的 REV-ERBα/β 激动剂,以便评估其体内效应。SR9009 和 SR9011(图 1a,补充图 1)均呈剂量依赖性地增加了在表达嵌合 Gal4 DNA 结合域 (DBD) - REV-ERB 配体结合域 (LBD) α 或 β 以及 Gal4 反应性荧光素酶报告基因的 HEK293 细胞中评估的 REV-ERB 依赖性抑制活性(图 1b)(SR9009:REV-ERBα IC50=670 nM,REV-ERBβ IC50=800 nM;SR9011:REV-ERBα IC50=790 nM,REV-ERBβ IC50=560 nM)。 REV-ERB 配体 GSK4112(补充图 2)不暴露于血浆中,其活性有限(图 1b)。在以全长 REV-ERBα 和由 Bmal1 启动子驱动的荧光素酶报告基因进行共转染实验中,SR9011 和 SR9009 均能有效抑制转录(图 1c)(SR9009 IC50=710 nM;SR9011 IC50=620 nM)。SR9011 和 SR9009 以 REV-ERBα/β 依赖的方式抑制 HepG2 细胞中 BMAL1 mRNA 的表达(补充图 3)。与两种化合物均作为 REV-ERB 的直接激动剂的功能一致,我们观察到,通过生化分析(补充图 4),这些化合物增加了 NCoR 的 CoRNR 盒肽片段的募集。圆二色谱分析(补充图 5)也证实了 SR9009 与 REV-ERBα 的直接结合(Kd=800 nM)。两种化合物均未表现出对其他核受体的活性12,13(补充图 6)[1]。
SR9011 盐酸盐的体外酶/受体结合实验通常包括使用 REV-ERBα 或 REV-ERBβ 蛋白以及放射性标记或荧光标记的 REV-ERB 配体作为示踪剂的竞争性结合实验。评估了该化合物与 REV-ERBα 和 REV-ERBβ 的结合亲和力,其 IC₅₀ 值分别为 790 nM 和 560 nM。实验在生理 pH 值的缓冲溶液中进行,并使用了相应的受体制剂。通过功能性实验,检测 REV-ERB 介导的转录调控,证实了该化合物的激动剂活性。 |
| 细胞实验 |
荧光素酶活性检测[2]
HEK293 细胞在添加 10% 胎牛血清的 Dulbecco 改良 Eagle 培养基中,于 37 °C、5% CO2 条件下培养。转染前 24 小时,将细胞以 15 × 10³ 个/孔的密度接种于 96 孔板中。转染 8 小时后,用 SR9011 或 DMSO 处理细胞。处理 24 小时后,使用 Dual-Glo™ 荧光素酶检测系统测定荧光素酶活性。所示数值为三个独立转染孔的平均值 ± 标准误差。实验重复三次,图中所示为代表性实验结果。 细胞培养、化合物处理、过表达和敲低[2] MCF10A、MDA-MB-231、MCF-7、MDA-MB-361、SKBR3 和 BT474 均购自 ATCC。细胞在处理前一天接种于6孔板中。细胞用SR9011或DMSO处理24小时后收集,用于RNA提取或Western blot分析。对于过表达实验,细胞用腺病毒感染24小时后,换用常规培养基培养。24小时后收集细胞提取总RNA。对于基因敲低实验,对照siRNA和人REV-ERBβ siRNA按照制造商说明书,使用Lipofectamine™ RNAiMAX进行反向转染。24小时后收集细胞进行定量PCR分析。MTT实验[2] 根据制造商说明书进行3-(4,5-二甲基噻唑-2-基)-2,5-二苯基四唑溴化物(MTT)细胞增殖实验。简而言之,将 3 × 10³ 至 5 × 10³ 个细胞/孔接种于 96 孔板中。24 小时后,用 SR9011 或 DMSO 处理细胞。处理 72 小时后,用 1.2 mM MTT 标记细胞并孵育 4 小时。然后加入 DMSO,并在酶标仪上于 540 nm 波长处读取吸光度值。HEK293 细胞在 96 孔板中培养(1×10⁶ 个细胞/孔),并使用 Lipofectamine 进行瞬时转染。每孔细胞转染200 ng DNA,其中包含pGL4 mIL-17萤火虫荧光素酶报告基因构建体、pGL4 mIL-17 + CNS-5萤火虫荧光素酶报告基因构建体或pGL4 mIL-17 2kB RORE突变体(100 ng/孔),肌动蛋白启动子海肾荧光素酶报告基因(50 ng/孔),以及对照载体或测试DNA(全长RORα或全长RORγ,50 ng/孔)。特异性检测涵盖所有48种人类核受体,SR9009的测试浓度为20 μM。该检测方法采用HEK293细胞中Gal4 DNA结合域-核受体融合蛋白的共转染实验[1]。 SR9011盐酸盐的体外细胞实验利用表达REV-ERBα或REV-ERBβ的细胞系来评估其激动剂活性。将细胞用不同浓度的化合物处理适当的时间。使用REV-ERB反应元件-荧光素酶构建体进行报告基因检测,评估REV-ERB介导的转录活性。通过qPCR评估其对昼夜节律相关基因表达、代谢和炎症的影响。在乳腺癌细胞系中评估其抗增殖作用。采用标准细胞培养条件(37°C,5% CO₂)和合适的培养基。 |
| 动物实验 |
在昼夜节律基因表达实验中,雄性C57BL6小鼠(8-10周龄)分别置于光暗周期(12小时:12小时)或持续黑暗条件下饲养。在昼夜节律时间(CT)0,小鼠腹腔注射单剂量100 mg/kg SR9009或SR9011,并在CT0、CT6、CT12和CT18处死各组小鼠(n=6)。采用实时定量PCR(qPCR)检测基因表达。[1] SR9011盐酸盐的体内动物研究通常包括将该化合物给予啮齿动物模型,以评估其对代谢、昼夜节律和癌症的影响。潜在的研究设计包括代谢紊乱、昼夜节律紊乱或乳腺癌模型。典型的终点指标包括代谢参数的测量、昼夜节律标志物的评估、肿瘤生长的评估以及药代动力学分析。所有操作必须符合机构动物护理和使用指南。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
SR9011盐酸盐的分子量为515.50 g/mol,分子式为C₂₃H₃₂Cl₂N₄O₃S。其IUPAC名称为3-(((4-氯苄基)((5-硝基噻吩-2-基)甲基)氨基)甲基)-N-戊基吡咯烷-1-甲酰胺盐酸盐。由于其分子较小且具有合理的理化性质,因此可能具有良好的口服生物利用度,但详细的药代动力学参数尚未公布。该化合物通常储存在推荐用于研究化学品的条件下。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
SR9011盐酸盐仅供研究用途,未获准用于人体治疗。作为一种研究用化学品,公开文献中没有全面的毒理学数据。处理该化合物时应遵守标准安全预防措施,包括使用适当的个人防护装备。与所有研究用化学品一样,在考虑进行临床开发之前,必须进行全面的毒理学分析。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
同步行为和代谢过程的节律对心血管健康和预防代谢疾病至关重要。核受体REV-ERB-α和REV-ERB-β在调节驱动活动和代谢节律的核心生物钟蛋白表达中发挥着不可或缺的作用。本文描述了具有体内活性的高效合成REV-ERB激动剂的鉴定。合成REV-ERB配体的给药改变了小鼠的昼夜节律行为和核心生物钟基因的昼夜节律表达模式。肝脏、骨骼肌和脂肪组织中多种代谢基因的昼夜节律表达模式也发生了改变,导致能量消耗增加。用REV-ERB激动剂治疗饮食诱导的肥胖小鼠减少了肥胖,降低了脂肪量,并显著改善了血脂异常和高血糖。这些结果表明,针对昼夜节律的合成REV-ERB配体可能对治疗睡眠障碍和代谢疾病有益。[1]
REV-ERBα和REV-ERBβ是核受体,属于配体依赖的转录抑制因子类别。血红素是这些受体的天然配体,但近年来已经设计出多种合成激动剂和拮抗剂。基因NR1D1编码REV-ERBα,与编码HER2癌基因的ERBB2密切相关,后者在HER2(+)乳腺癌中被放大。我们研究了一种合成REV-ERB激动剂SR9011对一系列雌激素受体阳性(ER(+))、ER(-)、HER2(+)、HER2(-)和三阴性乳腺癌细胞系的影响。我们发现SR9011抑制了乳腺癌细胞系的增殖,无论其ER或HER2状态如何。SR9011对MCF10A细胞的增殖没有影响。SR9011似乎在M期之前阻止了乳腺癌细胞的细胞周期。细胞周期蛋白A(CCNA2)已被确定为REV-ERB的直接靶基因,这表明SR9011通过抑制CCNA2的表达可能介导细胞周期停滞。这些数据表明,合成REV-ERB配体可能在治疗与细胞增殖失控相关的疾病(如癌症)方面具有应用潜力。[2] \nSR9011盐酸盐(CAS#: 2070014-94-5)的分子式为C₂₃H₃₂Cl₂N₄O₃S,分子量为515.50 g/mol。它的IUPAC名称是3-(((4-氯苄基)((5-硝基噻吩-2-基)甲基)氨基)甲基)-N-戊基吡咯烷-1-羧酰胺盐酸盐。它是REV-ERBα/β激动剂,IC₅₀值分别为790 nM(REV-ERBα)和560 nM(REV-ERBβ)。它调节与昼夜节律相关的基因表达,并影响代谢和炎症。它抑制乳腺癌细胞的生长。该化合物不是药物,且未经过临床试验。 |
| 分子式 |
C23H32CL2N4O3S
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|---|---|
| 分子量 |
515.50
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| 精确质量 |
514.157
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| CAS号 |
2070014-94-5
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| 相关CAS号 |
SR9011;1379686-29-9
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| PubChem CID |
119081411
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| 外观&性状 |
Light yellow to brown solid powder
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| tPSA |
110
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| 氢键供体(HBD)数目 |
2
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| 氢键受体(HBA)数目 |
5
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| 可旋转键数目(RBC) |
10
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| 重原子数目 |
33
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| 分子复杂度/Complexity |
600
|
| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
CCCCCNC(=O)N1CCC(C1)CN(CC2=CC=C(C=C2)Cl)CC3=CC=C(S3)[N+](=O)[O-].Cl
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| InChi Key |
ADTZBBQVEUEODS-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C23H31ClN4O3S.ClH/c1-2-3-4-12-25-23(29)27-13-11-19(16-27)15-26(14-18-5-7-20(24)8-6-18)17-21-9-10-22(32-21)28(30)31;/h5-10,19H,2-4,11-17H2,1H3,(H,25,29);1H
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| 化学名 |
3-[[(4-chlorophenyl)methyl-[(5-nitrothiophen-2-yl)methyl]amino]methyl]-N-pentylpyrrolidine-1-carboxamide;hydrochloride
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| 别名 |
R9011 hydrochloride; SR9011 (hydrochloride); 2070014-94-5; 3-[[(4-chlorophenyl)methyl-[(5-nitrothiophen-2-yl)methyl]amino]methyl]-N-pentylpyrrolidine-1-carboxamide;hydrochloride;
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中,避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO: ≥ 32 mg/mL (62.08 mM)
H2O: < 0.1 mg/mL |
|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。
注射用配方
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO → 50 μL Tween 80 → 850 μL Saline)(IP/IV/IM/SC等) *生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。 注射用配方 2: DMSO : PEG300 :Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO → 400 μL PEG300 → 50 μL Tween 80 → 450 μL Saline) 注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO → 900 μL Corn oil) 示例: 以注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。 View More
注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO → 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)] 口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠) 口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素) 示例: 以口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。 View More
口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400) 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.9399 mL | 9.6993 mL | 19.3986 mL | |
| 5 mM | 0.3880 mL | 1.9399 mL | 3.8797 mL | |
| 10 mM | 0.1940 mL | 0.9699 mL | 1.9399 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。