(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride

别名: (S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2盐酸盐;(S,R,S)-AHPC-三聚乙二醇-氨基盐酸盐
目录号: V31725 纯度: ≥98%
(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 HCl 是一种配体(用于 E3 连接酶)-接头缀合物,含有基于 (S,R,S)-AHPC 的 VHL 配体和 3 个聚乙二醇 (PEG) 单元接头。
(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride CAS号: 2097971-11-2
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 HCl 是一种配体(用于 E3 连接酶)-接头缀合物,含有基于 (S,R,S)-AHPC 的 VHL 配体和 3 个聚乙二醇 (PEG) 单元接头。
生物活性&实验参考方法
靶点
The (S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride acts as the core structural unit of the VHL (Von Hippel-Lindau) ligand in the BET (Bromodomain and Extra-Terminal) degrading PROTACs (Proteolysis-Targeting Chimeras) studied. The PROTACs containing this compound simultaneously target two types of proteins:
1. VHL tumor suppressor protein (the target of the VHL ligand moiety where (S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride is located);
2. BET family proteins (e.g., Brd4, Brd2), the targets of the BET inhibitor moiety (JQ1 or I-BET726) in PROTACs.
Isothermal titration calorimetry (ITC) data for the PROTACs (containing this VHL ligand unit) showed that the VCB complex (VHL-Elongin C-Elongin B) bound to the PROTACs alone with a Kd of 110 nM, while the Kd values for VCB binding to the binary complexes of PROTACs with Brd4 BD2 (second bromodomain of Brd4) and Brd2 BD1 (first bromodomain of Brd2) were 180 nM and 330 nM, respectively [1]
体外研究 (In Vitro)
所有体外活性数据均来自含(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride(作为VHL配体部分)的PROTACs,而非该化合物单独的活性:
1. HeLa细胞中BET蛋白降解活性:将HeLa细胞用含该化合物的PROTACs处理24小时,处理后通过免疫印迹法检测BET家族蛋白(如Brd4、Brd2)的水平,并以DMSO对照组为基准进行定量。结果显示,基于三氮唑二氮䓬(JQ1)的PROTACs(含(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride)比基于四氢喹啉(I-BET726)的PROTACs表现出更强的BET蛋白降解能力 [1]
2. MV4;11急性髓系白血病(AML)细胞抗增殖活性:将MV4;11细胞用含该化合物的PROTACs或其亲本BET配体(JQ1/I-BET726)处理48小时后,对细胞活力进行定量。PROTACs的抗增殖活性由cMyc驱动,且对(连接BET抑制剂与(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride的)聚乙二醇(PEG)链接子长度表现出显著依赖性 [1]
3. MV4;11细胞中cMyc抑制活性:将MV4;11细胞用50 nM的含该化合物的PROTACs、亲本BET抑制剂或DMSO处理4小时,通过免疫印迹法检测cMyc蛋白水平。结果显示,与对照组相比,PROTACs具有显著的cMyc抑制效应 [1]
酶活实验
采用等温滴定量热法(ITC)测定含(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride的PROTACs、VCB复合物(VHL-Elongin C-Elongin B)与BET蛋白形成三元复合物的协同性,详细实验流程分为三组:
1. 将VCB复合物滴定至仅含PROTACs的溶液中,以测定VCB与PROTACs之间的结合亲和力;
2. 将VCB复合物滴定至由Brd4 BD2(Brd4的第二个溴结构域)与PROTACs组成的二元复合物溶液中,以评估VCB与Brd4 BD2-PROTAC二元复合物的结合亲和力;
3. 将VCB复合物滴定至由Brd2 BD1(Brd2的第一个溴结构域)与PROTACs组成的二元复合物溶液中,以评估VCB与Brd2 BD1-PROTAC二元复合物的结合亲和力。
根据ITC结果计算结合亲和力(Kd值):VCB与单独PROTACs结合的Kd值为110 nM,与Brd4 BD2-PROTAC、Brd2 BD1-PROTAC二元复合物结合的Kd值分别为180 nM和330 nM。这些结果表明,基于四氢喹啉(I-BET726)的PROTACs在三元复合物形成过程中表现出负协同性 [1]
细胞实验
针对含(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride的PROTACs开展了两项主要细胞实验,未对该化合物单独进行细胞实验:
1. HeLa细胞BET蛋白降解实验:将HeLa细胞接种培养至适宜密度,用不同浓度的含该化合物的PROTACs处理24小时。处理结束后,裂解细胞提取总蛋白,通过免疫印迹法检测BET家族蛋白(如Brd4、Brd2)的水平。使用相关软件对蛋白条带强度进行定量,以DMSO处理组为参照(设定为100%蛋白水平)。实验包含两次生物学重复,研究中展示了一组代表性结果 [1]
2. MV4;11细胞抗增殖与cMyc抑制实验:
- 抗增殖活性检测:将MV4;11细胞(AML细胞系)接种于适宜培养板中,用系列浓度的含该化合物的PROTACs或其亲本BET配体(JQ1/I-BET726)处理48小时。孵育结束后,采用细胞活力检测方法测定细胞活力,并根据活力数据计算PROTACs与亲本配体的半有效浓度(EC50);
- cMyc抑制活性检测:将MV4;11细胞用50 nM的含该化合物的PROTACs、亲本BET抑制剂或DMSO(对照)处理4小时,随后裂解细胞提取蛋白,通过免疫印迹法检测cMyc蛋白水平。与HeLa细胞实验类似,该实验同样包含两次生物学重复,研究中展示了一组代表性结果 [1]
参考文献

[1]. Impact of Target Warhead and Linkage Vector on Inducing Protein Degradation: Comparison of Bromodomain and Extra-Terminal (BET) Degraders Derived from Triazolodiazepine (JQ1) and Tetrahydroquinoline (I-BET726) BET Inhibitor Scaffolds. J Me.

其他信息
1. PROTACs中的结构作用:(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2盐酸盐是本研究设计的双功能BET降解PROTACs中VHL配体的核心结构组分。这些PROTACs由两个功能部分——BET溴结构域抑制剂(JQ1或I-BET726)和VHL配体(含有(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2盐酸盐)——通过特定长度的聚乙二醇(PEG)连接子连接而成[1]
2. 与连接子和协同作用相关的关键研究发现:研究发现,更有效的BET抑制剂(I-BET726)并不一定能产生更有效的PROTACs。具体而言,四氢喹啉(I-BET726)衍生的 PROTAC(含有该 VHL 配体单元)在三元复合物形成(与 VCB 和 BET 蛋白)中表现出负协同性,并且 BET 降解和抗增殖活性较弱,而三唑二氮杂卓(JQ1)衍生的 PROTAC 则表现出正协同性和更强的生物活性。该结果强调了偶联策略(包括连接BET抑制剂和(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2盐酸盐的PEG连接子的长度以及抑制剂的出口载体)在决定PROTAC疗效方面的关键作用[1]
3. 研究意义:本研究提供的二价降解剂(包括含有(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2盐酸盐的降解剂)的见解和构效关系(SAR)框架有望在未来PROTAC的设计和优化中得到广泛应用[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C30H46CLN5O7S
分子量
656.233545780182
精确质量
655.28
CAS号
2097971-11-2
PubChem CID
131704494
外观&性状
Light yellow to brown solid powder
tPSA
194
氢键供体(HBD)数目
5
氢键受体(HBA)数目
10
可旋转键数目(RBC)
17
重原子数目
44
分子复杂度/Complexity
884
定义原子立体中心数目
3
SMILES
C(N1C[C@H](O)C[C@H]1C(=O)NCC1C=CC(C2SC=NC=2C)=CC=1)(=O)[C@H](C(C)(C)C)NC(=O)COCCOCCOCCN.Cl
InChi Key
ZOYHUTRHKHRRPK-QVRKWNSCSA-N
InChi Code
InChI=1S/C30H45N5O7S.ClH/c1-20-26(43-19-33-20)22-7-5-21(6-8-22)16-32-28(38)24-15-23(36)17-35(24)29(39)27(30(2,3)4)34-25(37)18-42-14-13-41-12-11-40-10-9-31;/h5-8,19,23-24,27,36H,9-18,31H2,1-4H3,(H,32,38)(H,34,37);1H/t23-,24+,27-;/m1./s1
化学名
(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethoxy]acetyl]amino]-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]pyrrolidine-2-carboxamide;hydrochloride
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~200 mg/mL (~304.77 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 50 mg/mL (76.19 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.5239 mL 7.6193 mL 15.2386 mL
5 mM 0.3048 mL 1.5239 mL 3.0477 mL
10 mM 0.1524 mL 0.7619 mL 1.5239 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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