| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 5mg |
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| 10mg |
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| 25mg |
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| 50mg |
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| 100mg |
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| 500mg |
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| 靶点 |
The (S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride acts as the core structural unit of the VHL (Von Hippel-Lindau) ligand in the BET (Bromodomain and Extra-Terminal) degrading PROTACs (Proteolysis-Targeting Chimeras) studied. The PROTACs containing this compound simultaneously target two types of proteins:
1. VHL tumor suppressor protein (the target of the VHL ligand moiety where (S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride is located); 2. BET family proteins (e.g., Brd4, Brd2), the targets of the BET inhibitor moiety (JQ1 or I-BET726) in PROTACs. Isothermal titration calorimetry (ITC) data for the PROTACs (containing this VHL ligand unit) showed that the VCB complex (VHL-Elongin C-Elongin B) bound to the PROTACs alone with a Kd of 110 nM, while the Kd values for VCB binding to the binary complexes of PROTACs with Brd4 BD2 (second bromodomain of Brd4) and Brd2 BD1 (first bromodomain of Brd2) were 180 nM and 330 nM, respectively [1] |
|---|---|
| 体外研究 (In Vitro) |
所有体外活性数据均来自含(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride(作为VHL配体部分)的PROTACs,而非该化合物单独的活性:
1. HeLa细胞中BET蛋白降解活性:将HeLa细胞用含该化合物的PROTACs处理24小时,处理后通过免疫印迹法检测BET家族蛋白(如Brd4、Brd2)的水平,并以DMSO对照组为基准进行定量。结果显示,基于三氮唑二氮䓬(JQ1)的PROTACs(含(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride)比基于四氢喹啉(I-BET726)的PROTACs表现出更强的BET蛋白降解能力 [1] 2. MV4;11急性髓系白血病(AML)细胞抗增殖活性:将MV4;11细胞用含该化合物的PROTACs或其亲本BET配体(JQ1/I-BET726)处理48小时后,对细胞活力进行定量。PROTACs的抗增殖活性由cMyc驱动,且对(连接BET抑制剂与(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride的)聚乙二醇(PEG)链接子长度表现出显著依赖性 [1] 3. MV4;11细胞中cMyc抑制活性:将MV4;11细胞用50 nM的含该化合物的PROTACs、亲本BET抑制剂或DMSO处理4小时,通过免疫印迹法检测cMyc蛋白水平。结果显示,与对照组相比,PROTACs具有显著的cMyc抑制效应 [1] |
| 酶活实验 |
采用等温滴定量热法(ITC)测定含(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride的PROTACs、VCB复合物(VHL-Elongin C-Elongin B)与BET蛋白形成三元复合物的协同性,详细实验流程分为三组:
1. 将VCB复合物滴定至仅含PROTACs的溶液中,以测定VCB与PROTACs之间的结合亲和力; 2. 将VCB复合物滴定至由Brd4 BD2(Brd4的第二个溴结构域)与PROTACs组成的二元复合物溶液中,以评估VCB与Brd4 BD2-PROTAC二元复合物的结合亲和力; 3. 将VCB复合物滴定至由Brd2 BD1(Brd2的第一个溴结构域)与PROTACs组成的二元复合物溶液中,以评估VCB与Brd2 BD1-PROTAC二元复合物的结合亲和力。 根据ITC结果计算结合亲和力(Kd值):VCB与单独PROTACs结合的Kd值为110 nM,与Brd4 BD2-PROTAC、Brd2 BD1-PROTAC二元复合物结合的Kd值分别为180 nM和330 nM。这些结果表明,基于四氢喹啉(I-BET726)的PROTACs在三元复合物形成过程中表现出负协同性 [1] |
| 细胞实验 |
针对含(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2 hydrochloride的PROTACs开展了两项主要细胞实验,未对该化合物单独进行细胞实验:
1. HeLa细胞BET蛋白降解实验:将HeLa细胞接种培养至适宜密度,用不同浓度的含该化合物的PROTACs处理24小时。处理结束后,裂解细胞提取总蛋白,通过免疫印迹法检测BET家族蛋白(如Brd4、Brd2)的水平。使用相关软件对蛋白条带强度进行定量,以DMSO处理组为参照(设定为100%蛋白水平)。实验包含两次生物学重复,研究中展示了一组代表性结果 [1] 2. MV4;11细胞抗增殖与cMyc抑制实验: - 抗增殖活性检测:将MV4;11细胞(AML细胞系)接种于适宜培养板中,用系列浓度的含该化合物的PROTACs或其亲本BET配体(JQ1/I-BET726)处理48小时。孵育结束后,采用细胞活力检测方法测定细胞活力,并根据活力数据计算PROTACs与亲本配体的半有效浓度(EC50); - cMyc抑制活性检测:将MV4;11细胞用50 nM的含该化合物的PROTACs、亲本BET抑制剂或DMSO(对照)处理4小时,随后裂解细胞提取蛋白,通过免疫印迹法检测cMyc蛋白水平。与HeLa细胞实验类似,该实验同样包含两次生物学重复,研究中展示了一组代表性结果 [1] |
| 参考文献 | |
| 其他信息 |
1. PROTACs中的结构作用:(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2盐酸盐是本研究设计的双功能BET降解PROTACs中VHL配体的核心结构组分。这些PROTACs由两个功能部分——BET溴结构域抑制剂(JQ1或I-BET726)和VHL配体(含有(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2盐酸盐)——通过特定长度的聚乙二醇(PEG)连接子连接而成[1]
2. 与连接子和协同作用相关的关键研究发现:研究发现,更有效的BET抑制剂(I-BET726)并不一定能产生更有效的PROTACs。具体而言,四氢喹啉(I-BET726)衍生的 PROTAC(含有该 VHL 配体单元)在三元复合物形成(与 VCB 和 BET 蛋白)中表现出负协同性,并且 BET 降解和抗增殖活性较弱,而三唑二氮杂卓(JQ1)衍生的 PROTAC 则表现出正协同性和更强的生物活性。该结果强调了偶联策略(包括连接BET抑制剂和(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2盐酸盐的PEG连接子的长度以及抑制剂的出口载体)在决定PROTAC疗效方面的关键作用[1] 3. 研究意义:本研究提供的二价降解剂(包括含有(S,R,S)-AHPC-PEG3-NH2盐酸盐的降解剂)的见解和构效关系(SAR)框架有望在未来PROTAC的设计和优化中得到广泛应用[1] |
| 分子式 |
C30H46CLN5O7S
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|---|---|
| 分子量 |
656.233545780182
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| 精确质量 |
655.28
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| CAS号 |
2097971-11-2
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| PubChem CID |
131704494
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| 外观&性状 |
Light yellow to brown solid powder
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| tPSA |
194
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| 氢键供体(HBD)数目 |
5
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| 氢键受体(HBA)数目 |
10
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| 可旋转键数目(RBC) |
17
|
| 重原子数目 |
44
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| 分子复杂度/Complexity |
884
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| 定义原子立体中心数目 |
3
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| SMILES |
C(N1C[C@H](O)C[C@H]1C(=O)NCC1C=CC(C2SC=NC=2C)=CC=1)(=O)[C@H](C(C)(C)C)NC(=O)COCCOCCOCCN.Cl
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| InChi Key |
ZOYHUTRHKHRRPK-QVRKWNSCSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C30H45N5O7S.ClH/c1-20-26(43-19-33-20)22-7-5-21(6-8-22)16-32-28(38)24-15-23(36)17-35(24)29(39)27(30(2,3)4)34-25(37)18-42-14-13-41-12-11-40-10-9-31;/h5-8,19,23-24,27,36H,9-18,31H2,1-4H3,(H,32,38)(H,34,37);1H/t23-,24+,27-;/m1./s1
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| 化学名 |
(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-[2-[2-(2-aminoethoxy)ethoxy]ethoxy]acetyl]amino]-3,3-dimethylbutanoyl]-4-hydroxy-N-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]pyrrolidine-2-carboxamide;hydrochloride
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。 (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~200 mg/mL (~304.77 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: 50 mg/mL (76.19 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶。
请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案: 1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL; 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用! 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 1.5239 mL | 7.6193 mL | 15.2386 mL | |
| 5 mM | 0.3048 mL | 1.5239 mL | 3.0477 mL | |
| 10 mM | 0.1524 mL | 0.7619 mL | 1.5239 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);
4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度: mg/mL;
DMSO母液配制方法: mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。
体内配方配制方法:取 μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。