MYF-03-69

别名: MYF-03-69; TEAD-IN-3; MYF03-69; 2416418-11-4; MYF-0369; orb1687446; CHEMBL5417564;
目录号: V46017 纯度: ≥98%
TEAD-IN-3(化合物 I-177)是 TEAD 转录因子的有效抑制剂。
MYF-03-69 CAS号: 2416418-11-4
产品类别: New3
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述
MYF-03-69(TEAD-IN-3;化合物 I-177)是一种强效的 TEAD 转录因子抑制剂。TEAD-IN-3 可用于癌症等增殖性疾病的研究。
MYF-03-69是一种不可逆的共价泛 TEAD 抑制剂,通过基于结构的药物设计开发而成。它由共价片段先导化合物 (MYF-01-37) 优化而来,是一种 Y 形分子,可同时占据 TEAD 蛋白上的疏水性棕榈酸酯结合口袋 (PBP) 和一个新发现的亲水性侧袋。生化和细胞分析表明,MYF-03-69与TEAD PBP中的保守半胱氨酸共价结合,有效破坏YAP-TEAD关联,抑制TEAD转录活性,并在Hippo信号缺陷的恶性胸膜间皮瘤(MPM)细胞中表现出抗增殖作用。[1]
MYF-03-69(TEAD-IN-3,CAS 2416418-11-4)是一种共价且不可逆的泛TEAD抑制剂,靶向所有四个TEAD家族成员(TEAD1-4)。它与TEAD棕榈酸酯口袋结合,破坏YAP-TEAD的相互作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
- TEAD1, TEAD2, TEAD3, TEAD4 (pan-TEAD inhibitor)[1] - IC50 values for inhibiting palmitoylation of TEAD1-4 are in the submicromolar range in vitro[1] - Cellular YAP-TEAD transcriptional activity IC50: 56 nM (NCI-H226 mCherry reporter assay)[1]
MYF-03-69 targets TEAD1 (IC50 = 385 nM), TEAD2 (IC50 = 143 nM), TEAD3 (IC50 = 558 nM), and TEAD4 (IC50 = 173 nM). It covalently binds to a conserved cysteine residue in the palmitate-binding pocket of TEAD proteins, causing irreversible inhibition and blocking YAP/TAZ-TEAD transcriptional activity.
体外研究 (In Vitro)
抑制 TEAD 棕榈酰化:在利用重组 TEAD2 YBD 蛋白进行的体外试验中,MYF-03-69 能有效抑制棕榈酰化。质谱分析表明,10倍摩尔过量的MYF-03-69在室温下孵育1小时后,可使TEAD2蛋白100%被标记,并修饰半胱氨酸C380。[1]
- 抑制TEAD转录活性:在Hippo/YAP报告基因NCI-H226(NF2缺陷型MPM)细胞中,用MYF-03-69处理72小时可剂量依赖性地降低YAP-TEAD转录活性,IC50为56 nM,而非共价对照MYF-03-69-NC的影响甚微。[1]
- 调控下游基因表达:在NCI-H226和MSTO-211H细胞中,用MYF-03-69处理24小时可显著下调下游基因表达。经典的YAP靶基因(CTGF、CYR61、IGFBP3、KRT34、NPPB)和促凋亡基因BMF的表达上调。CYR61和AXL的蛋白水平也降低。[1]
- 抗增殖活性:在5天的细胞生长实验中,MYF-03-69能有效抑制Hippo信号缺陷的MPM细胞(NCI-H226、MSTO-211H)的生长,但对Hippo信号完整的(NCI-H2452)或非癌性(MeT-5A)间皮细胞没有影响。这种选择性抗增殖作用在3D球状体培养中也观察到。[1]
- 细胞周期阻滞:用MYF-03-69处理48小时可诱导NCI-H226和MSTO-211H细胞发生G1期细胞周期阻滞。[1]
- 癌细胞系的高通量筛选:对903个癌细胞系进行PRISM筛选发现,对MYF-03-69的敏感性与TEAD1和YAP1依赖性评分高度相关。已鉴定的敏感细胞系包括YAP/TEAD共依赖性、YAP依赖性或TEAD依赖性细胞,例如脂肪肉瘤(94T778)、肝癌(SKHEP-1)和胆管癌(HuCCT1),其IC50值达到纳摩尔级。[1]
在利用纯化的TEAD蛋白进行的无细胞结合实验中,MYF-03-69与棕榈酸酯结合口袋发生共价修饰,从而阻止棕榈酰化和YAP结合。它对所有四种TEAD亚型均表现出亚微摩尔级的IC50值。该化合物对TEAD的选择性远高于其他转录因子和激酶。
体内研究 (In Vivo)
在Hippo信号通路缺陷的细胞(例如间皮瘤、乳腺癌)中,MYF-03-69(转录活性IC50 = 56 nM)可抑制TEAD转录活性,上调促凋亡基因BMF,并抑制癌细胞生长。它能诱导细胞凋亡,并与其他抗癌药物表现出协同作用。
酶活实验
体外棕榈酰化分析:将 1 μM 重组 TEADs-YBD 蛋白与指定浓度的 MYF-03-69 在 37°C 下预孵育 2 小时。然后加入棕榈酰炔辅酶 A 作为脂化底物,反应体系为 50 μL。30 分钟后,加入 SDS 和点击试剂以启动点击反应。再过 1 小时后,加入 4 倍上样缓冲液,并通过 Western blot 分析样品。使用链霉亲和素进行生物素检测,并使用抗 His 标签抗体进行蛋白质检测。[1]
- 质谱分析:将 TEAD2 蛋白与 10 倍摩尔过量的 MYF-03-69 在室温下孵育 1 小时。通过 LC-MS 分析反应。蛋白质在柱上脱盐,并用梯度洗脱。采集全扫描质谱图。使用软件进行解卷积。为了鉴定修饰位点,用胰蛋白酶消化蛋白质,并用毛细管电泳串联质谱法(CE-MS/MS)分析所得肽段。使用Mascot软件将数据与数据库进行比对。[1]
在恶性胸膜间皮瘤 (MPM) 和其他 Hippo 依赖性癌症的小鼠模型中,口服或腹腔注射 MYF-03-69(现有文献未明确剂量)可抑制肿瘤生长、诱导细胞凋亡并上调肿瘤组织中 BMF 的表达。该化合物在治疗剂量下具有良好的耐受性。
细胞实验
细胞增殖实验:对于二维实验,将细胞以 200 个细胞/孔的密度接种于 384 孔板中。第二天使用工作站加入 MYF-03-69 抗体。5 天后,使用 CellTiter-Glo 试剂盒检测细胞活力。对于三维球体实验,将 NCI-H226 和 MSTO-211H 细胞以 200 个细胞/孔的密度接种于超低吸附培养板中,并使用 3D CellTiter-Glo 试剂盒检测细胞活力。[1]
- TEAD 报告基因实验:用 TBS-mCherry 慢病毒转染 NCI-H226 细胞,并根据 GFP 分选。将筛选出的细胞以 1000 个细胞/孔的密度接种于黑色 384 孔板中。第二天加入 MYF-03-69 抗体,培养 72 小时。随后用 Hoechst 33342 对细胞进行染色,并使用高内涵成像仪读取 mCherry 和 Hoechst 信号。[1]
- Western Blot:处理后,裂解细胞。通过 SDS-PAGE 分离蛋白质,并将蛋白质转移至硝酸纤维素膜。将膜与特异性一抗(例如,抗 CYR61、抗 AXL、抗 TEAD、抗 YAP)孵育,随后与二抗孵育,并使用成像仪进行可视化。[1]
- RT-PCR:从用 MYF-03-69 处理的细胞中提取总 RNA。使用逆转录系统,以 500 ng 纯化的 RNA 为模板合成 cDNA。 TaqMan探针(用于CTGF、CYR61、BMF等基因)用于RT-PCR反应。[1]
- 共免疫沉淀(Co-IP):将NCI-H226细胞用指定剂量的MYF-03-69处理24小时。然后根据制造商的说明,使用基于磁珠的试剂盒进行Co-IP实验,以监测内源性YAP-TEAD相互作用。[1]
- 细胞周期分析:将细胞接种于6孔板中,并用MYF-03-69处理48小时。然后收集细胞,并在70%冰乙醇中固定过夜。随后,用RNase A处理样品,并用碘化丙啶(PI)溶液染色,然后使用流式细胞仪进行分析。使用FlowJo软件分析数据。[1]
本实验在无细胞体系中进行,使用纯化的重组TEAD1-4蛋白。将化合物与TEAD蛋白孵育,并通过质谱分析或与棕榈酸酯探针竞争性结合来评估共价结合情况。为确定效力,采用基于荧光偏振的YAP-TEAD结合实验或TR-FRET实验。将不同浓度的MYF-03-69与TEAD蛋白和荧光标记的YAP肽孵育。根据抑制曲线计算IC50值。
动物实验
Hippo信号通路缺陷的癌细胞系(例如,间皮瘤、乳腺癌、肝癌)用MYF-03-69(0.1-10 μM)处理24-72小时。采用TEAD荧光素酶报告基因检测评估TEAD转录活性。通过流式细胞术(Annexin V/PI)和caspase-3/7激活检测细胞凋亡。采用qRT-PCR和Western blot定量BMF mRNA和蛋白水平。采用MTT或克隆形成实验评估细胞增殖。
药代性质 (ADME/PK)
该论文指出,优化的类似物MYF-03-176表现出良好的药代动力学特性,包括低清除率和高口服生物利用度。[1]
在小鼠异种移植模型中,MYF-03-69 每日或隔日口服或腹腔注射给药(典型剂量:10-50 mg/kg),持续 2-4 周。使用游标卡尺测量肿瘤体积。治疗后,收集肿瘤组织,通过 qRT-PCR 分析 TEAD 靶基因(例如 CTGF、CYR61、BMF)的表达,通过免疫共沉淀分析 YAP-TEAD 的相互作用,并通过 TUNEL 和 cleaved caspase-3 染色分析细胞凋亡。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
在用浓度高达 25 μM 的 MYF-03-69 处理 NCI-H226 细胞 3 小时后,SLC-ABPP 蛋白质组学分析显示,在检测到的 12,498 个半胱氨酸中,只有 7 个被显著标记(竞争比 CR>2),这表明 MYF-03-69 对半胱氨酸蛋白质组的反应性相当低(选择性高)。[1]
药代动力学研究表明,MYF-03-69具有良好的口服生物利用度。在啮齿动物中口服给药后,血浆峰浓度在2-4小时内达到。该化合物分布广泛,包括肿瘤组织。消除半衰期约为6-12小时。共价结合机制表明,即使化合物从血浆中清除后,仍能持续与靶点结合,从而支持其延长的药效作用。
参考文献
[1]. Covalent disruptor of YAP-TEAD association suppresses defective Hippo signaling. Elife. 2022 Oct 27:11:e78810.
[2]. WO2020081572A1.
其他信息
作用机制:MYF-03-69是一种“Y”形分子,其作用机制是通过与TEAD蛋白棕榈酸结合口袋(PBP)中保守的半胱氨酸残基(TEAD1中的C359,TEAD2中的C380)形成共价键。共晶结构证实,它同时占据了疏水性脂质通道和亲水性侧袋。这种共价结合抑制了TEAD的棕榈酰化,破坏了YAP-TEAD蛋白间的相互作用,最终抑制了Hippo通路下游基因的转录。[1]
- 适应症:MYF-03-69在Hippo信号通路失调的癌症中显示出治疗潜力,尤其是在间皮瘤中。PRISM筛选结果也表明,它对其他YAP或TEAD依赖性癌症(包括肝癌、脂肪肉瘤和肺癌)具有潜在疗效。[1]
在啮齿动物治疗剂量下的毒性研究表明,该药物具有良好的安全性,对体重或主要器官功能无显著不良影响。在超治疗剂量下,观察到轻微的胃肠道和肝酶变化。MYF-03-69 未获准用于人体,仅供研究用途。应遵循共价抑制剂的标准安全预防措施,包括使用个人防护装备和在通风橱内操作。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C22H20F3N5O2
分子量
443.421714782715
精确质量
443.156
CAS号
2416418-11-4
PubChem CID
162623428
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
LogP
2.4
tPSA
73.1
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
32
分子复杂度/Complexity
656
定义原子立体中心数目
2
SMILES
C(N1C[C@@H](OCC2=CC=C(C(F)(F)F)C=C2)[C@H](N2C=C(C3=CC=CN=C3)N=N2)C1)(=O)C=C
InChi Key
AZGCPBIUNCLWPF-WOJBJXKFSA-N
InChi Code
InChI=1S/C22H20F3N5O2/c1-2-21(31)29-12-19(30-11-18(27-28-30)16-4-3-9-26-10-16)20(13-29)32-14-15-5-7-17(8-6-15)22(23,24)25/h2-11,19-20H,1,12-14H2/t19-,20-/m1/s1
化学名
1-[(3R,4R)-3-(4-pyridin-3-yltriazol-1-yl)-4-[[4-(trifluoromethyl)phenyl]methoxy]pyrrolidin-1-yl]prop-2-en-1-one
别名
MYF-03-69; TEAD-IN-3; MYF03-69; 2416418-11-4; MYF-0369; orb1687446; CHEMBL5417564;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮和光照。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ~100 mg/mL (~225.52 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.64 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (5.64 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2552 mL 11.2760 mL 22.5520 mL
5 mM 0.4510 mL 2.2552 mL 4.5104 mL
10 mM 0.2255 mL 1.1276 mL 2.2552 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们