| 规格 | 价格 | 库存 | 数量 |
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| 100mg |
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| 500mg |
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| 靶点 |
The primary target is cereblon (CRBN), a substrate receptor of the CRL4 E3 ubiquitin ligase complex. The thalidomide moiety binds to CRBN, inducing a conformational change that promotes ubiquitination of neo-substrates. The C6 alkyl chain (six methylene groups) provides a flexible hydrophobic spacer between the CRBN ligand and the terminal amine, which is used to conjugate to target protein ligands. The resulting PROTAC recruits CRBN to the target protein, leading to ubiquitination and proteasomal degradation. This conjugate alone does not induce degradation; it is a synthetic intermediate.
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| 体外研究 (In Vitro) |
其中一个配体与E3泛素连接酶结合，另一个配体与靶蛋白结合；这两个配体通过连接子连接形成PROTAC。PROTAC利用细胞内泛素-蛋白酶体系统，靶向并选择性地降解靶蛋白。
体外实验表明，沙利度胺-NH-C6-NH2 TFA 可用作 PROTAC 合成的结构单元。该化合物保留了沙利度胺与 CRBN 的结合亲和力（KD 值通常在低微摩尔至纳摩尔范围内）。与 C4 或更短的连接基相比，C6 烷基连接基具有更长的连接距离，这可能对三元复合物中某些蛋白质-蛋白质相互作用最为有利。NH 连接基（仲胺）稳定；末端伯胺可通过酰胺偶联与含羧酸基团的活性基团连接。该化合物可溶于 DMSO（≥50 mM）。由于 TFA 盐的存在，其在极性有机溶剂中的溶解度可能有所提高。该化合物在未与靶配体偶联的情况下，对细胞没有直接活性。 |
| 体内研究 (In Vivo) |
在动物模型中，已对由沙利度胺-NH-C6-NH2 TFA合成的活性PROTAC进行了体内研究。C6烷基连接基在柔性和疏水性之间实现了平衡，这会影响最终PROTAC的细胞渗透性、代谢稳定性和药代动力学。带有该连接基的PROTAC已在异种移植模型中显示出疗效，其作用机制是通过降解BET蛋白、BRD4等靶点。该连接基-配体偶联物不能单独给药；它必须与靶蛋白配体偶联才能形成功能性降解剂。
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| 酶活实验 |
CRBN结合评估可采用荧光偏振（FP）或时间分辨荧光共振能量转移（TR-FRET）技术。用荧光标签（例如FITC、TAMRA）标记末端NH2基团以制备示踪剂。将重组CRBN-DDB1复合物（20-50 nM）与荧光示踪剂（5-10 nM）以及浓度递增的未标记沙利度胺-NH-C6-NH2 TFA（0.1 nM至10 uM）在测定缓冲液（50 mM Tris pH 8.0、150 mM NaCl、1 mM DTT、0.01% Triton X-100）中于室温孵育60分钟。测量FP或TR-FRET信号。计算IC₅0和Ki值。对于直接结合，可使用表面等离子共振（SPR）技术，将CRBN-DDB1固定在分子上；流动相化合物的浓度范围为1 nM至10 uM。为了进行正交验证，在表达 CRBN 的细胞中使用细胞热位移分析 (CETSA)。
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| 细胞实验 |
对于细胞降解研究，首先通过标准酰胺偶联反应（EDC/NHS、HATU 或 TBTU，溶剂为 DMF 或 DMSO）将该连接配体的末端氨基与带有羧基的目标蛋白配体偶联，合成 PROTAC。然后通过制备型 HPLC 纯化。将表达靶蛋白的细胞（例如 HEK-293、HeLa、MV-4-11 或其他癌细胞系）在含 10% FBS 的 RPMI 或 DMEM 培养基中，于 37℃、5% CO₂ 条件下培养。用 PROTAC（1 nM 至 10 μM）处理细胞 4-24 小时。收集细胞裂解液，进行靶蛋白（例如 BRD4、BET、BTK 等）的 Western blot 分析。定量降解效率（DC₅₀、Dmax）。通过与来那度胺 (1-10 μM) 联合处理或使用 CRBN 敲除细胞来确认 CRBN 依赖性。评估泛素化：免疫沉淀靶蛋白，进行泛素印迹分析。处理 48-72 小时后，通过 caspase-3/7 检测评估细胞凋亡，并通过 CellTiter-Glo 检测评估细胞活力。
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| 动物实验 |
使用源自该连接子的 PROTAC 进行体内研究：使用携带表达靶蛋白的癌细胞系皮下异种移植瘤的雌性 BALB/c 裸鼠或 NSG 小鼠（6-8 周龄，18-25 g）。每日或隔日腹腔注射 (ip) 或静脉注射 (iv) PROTAC（10-100 mg/kg）。制剂配制于 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween-80 + 45% 生理盐水或 20% SBE-β-CD 生理盐水中。每 2-3 天用游标卡尺测量肿瘤体积并监测体重。在终点（2-4 周），收集肿瘤和主要器官。通过蛋白质印迹法或免疫组化法检测肿瘤裂解液中靶蛋白的水平。在给药后 2、6、12 和 24 小时收集肿瘤，评估药物降解的药代动力学。对于血浆药代动力学研究，需在多个时间点（0.25、0.5、1、2、4、6、8、12、24 小时）采集血液样本，并采用液相色谱-串联质谱法（LC-MS/MS）定量分析 PROTAC。同时设置溶剂对照和 CRBN 竞争性对照（例如泊马度胺），以确认靶向降解。对肝脏、肾脏和脾脏进行组织病理学检查。
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| 药代性质 (ADME/PK) |
沙利度胺-NH-C6-NH2 TFA 的分子式为：游离碱 C20H24N4O4（分子量 384.43）。TFA 盐（三氟乙酸盐，CF3CO2H）分子量为 114.02，因此盐的分子量约为 498.45。该化合物包含一个沙利度胺核心、一个 NH 连接基（仲胺）和一个末端带有伯胺的 C6 烷基链（六亚甲基）。溶解性：溶于 DMSO（≥50 mM）；微溶于水。用于 PROTAC 合成时，需溶于无水 DMSO。储存：粉末需在 -20℃ 下干燥避光保存。DMSO 溶液可在 -80℃ 下保存 6 个月。TFA 盐具有吸湿性，需保持容器密封。该化合物在惰性气氛下以粉末形式至少可稳定保存 2 年。
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| 毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK) |
沙利度胺类化合物是强效致畸剂。操作时务必极其小心：佩戴双层手套、实验服、面罩，并在经认证的通风橱内操作。避免吸入、摄入和皮肤接触。孕妇或可能怀孕者禁用。仅供研究使用；不得用于人体治疗。三氟乙酸盐大量使用时具有腐蚀性，但毫克级使用时可控。操作前请查阅安全数据表。废弃物应作为危险药物废物处理。该化合物在典型的研究规模下不具有急性毒性，但基于沙利度胺核心结构，其生殖毒性是一个值得关注的问题。
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| 参考文献 | |
| 其他信息 |
Thalidomide-NH-C6-NH2 TFA 是一种基于沙利度胺的 CRBN 配体-连接子偶联物，用于 PROTAC 合成。与 C4 或 PEG 连接子相比，C6 烷基连接子（六亚甲基）提供了更长的疏水间隔。对于某些靶蛋白而言，这种长度可能是最佳的，因为在这些靶蛋白中，CRBN 与靶蛋白结合位点之间需要更长的距离才能形成三元复合物。NH 连接子（而非 O-酰胺基）提供了不同的载体几何结构。该化合物是构建 PROTAC 文库的重要结构单元，可用于降解包括 BRD4、BET、BTK、CDK 等在内的多种靶蛋白。它仅供研究使用，尚未获准用于临床。沙利度胺具有致畸性；该偶联物是一种用于靶向蛋白降解的化学工具。
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| 分子式 |
C21H25F3N4O6
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|---|---|
| 分子量 |
486.441615819931
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| 精确质量 |
486.172
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| CAS号 |
2093386-51-5
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| PubChem CID |
146047127
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| 外观&性状 |
Light yellow to yellow solid powder
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| tPSA |
159
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| 氢键供体(HBD)数目 |
4
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| 氢键受体(HBA)数目 |
11
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| 可旋转键数目(RBC) |
8
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| 重原子数目 |
34
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| 分子复杂度/Complexity |
692
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| 定义原子立体中心数目 |
0
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| SMILES |
FC(C(=O)O)(F)F.O=C1C2C(=CC=CC=2C(N1C1C(NC(CC1)=O)=O)=O)NCCCCCCN
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| InChi Key |
VUTCFPKPHCMKEA-UHFFFAOYSA-N
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| InChi Code |
InChI=1S/C19H24N4O4.C2HF3O2/c20-10-3-1-2-4-11-21-13-7-5-6-12-16(13)19(27)23(18(12)26)14-8-9-15(24)22-17(14)25;3-2(4,5)1(6)7/h5-7,14,21H,1-4,8-11,20H2,(H,22,24,25);(H,6,7)
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| 化学名 |
4-(6-aminohexylamino)-2-(2,6-dioxopiperidin-3-yl)isoindole-1,3-dione;2,2,2-trifluoroacetic acid
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| 别名 |
ThalidomideNHC6NH2 TFA; Thalidomide NH C6 NH2 TFA
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| HS Tariff Code |
2934.99.9001
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| 存储方式 |
Powder -20°C 3 years 4°C 2 years In solvent -80°C 6 months -20°C 1 month 注意： 请将本产品存放在密封且受保护的环境中（例如氮气保护），避免吸湿/受潮。 |
| 运输条件 |
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
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| 溶解度 (体外实验) |
DMSO : ~100 mg/mL (~205.58 mM)
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|---|---|
| 溶解度 (体内实验) |
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.14 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 澄清溶液。
例如，若需制备1 mL的工作液，可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中，混匀；然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80，混匀；加入450 μL生理盐水定容至1 mL。 *生理盐水的制备：将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中，得到澄清溶液。 配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (5.14 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加，逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。 例如，若需制备1 mL的工作液，可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中，混匀。 *20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备（4°C，1 周）：将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中，得到澄清溶液。 请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案： 1、请先配制澄清的储备液(如：用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液)); 2、取适量母液，按从左到右的顺序依次添加助溶剂，澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明，并不一定代表此产品 的实际溶解配方): 10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline); 假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中，混合均匀/澄清；向上述体系中加入50 μL Tween-80，混合均匀/澄清；然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL； 3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例; 4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出，可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶; 5、为保证最佳实验结果，工作液请现配现用！ 6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液，请查看说明书或联系我们; 7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。 |
| 制备储备液 | 1 mg | 5 mg | 10 mg | |
| 1 mM | 2.0558 mL | 10.2788 mL | 20.5575 mL | |
| 5 mM | 0.4112 mL | 2.0558 mL | 4.1115 mL | |
| 10 mM | 0.2056 mL | 1.0279 mL | 2.0558 mL |
1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液)：对于大多数产品，InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如：5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度），个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;
2、如果您找不到您想要的溶解度信息，或者很难将产品溶解在溶液中，请联系我们;
3、建议使用下列计算器进行相关计算（摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等）;
4、母液配好之后，将其分装到常规用量，并储存在-20°C或-80°C，尽量减少反复冻融循环。
计算结果:
工作液浓度： mg/mL；
DMSO母液配制方法： mg 药物溶于 μL DMSO溶液（母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度，请首先与我们联系。
体内配方配制方法：取 μL DMSO母液，加入 μL PEG300，混匀澄清后加入μL Tween 80，混匀澄清后加入 μL ddH2O，混匀澄清。
(1) 请确保溶液澄清之后，再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶；
(2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。
匹伐加宾
磷酸氢化可的松
BAY-784
Gly-PEG3-endo-BCN
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