SCR130

别名: SCR-130
目录号: V37348 纯度: ≥98%
SCR130 是一种基于 SCR7 的 DNA 非同源末端连接 (NHEJ) 抑制剂。
SCR130 CAS号: 2377858-38-1
产品类别: Apoptosis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
SCR130 是一种基于 SCR7 的 DNA 非同源末端连接 (NHEJ) 抑制剂。SCR130 以连接酶 IV 依赖的方式抑制 DNA 末端连接。SCR130 特异性靶向连接酶 IV,对连接酶 III 和连接酶 I 介导的连接几乎没有影响。SCR130 可诱导细胞凋亡并具有抗肿瘤活性。
SCR130 是 NHEJ 抑制剂 SCR7 的一种新型螺环衍生物,旨在以更高的效率靶向 DNA 连接酶 IV。与 SCR7 相比,SCR130 在癌细胞系中表现出低 20 倍的 IC50 值,特异性抑制连接酶 IV 依赖的 DNA 末端连接,并通过内源性和外源性途径诱导细胞凋亡。[1]
生物活性&实验参考方法
靶点
SCR130 targets DNA Ligase IV (specifically the Ligase IV/XRCC4 complex). It shows minimal or no effect on Ligase III and Ligase I at equivalent concentrations. [1]
体外研究 (In Vitro)
SCR130(7-21 μM;48 小时)可增加早期和晚期凋亡细胞的数量。SCR130 通过内源性和外源性途径诱导细胞凋亡。SCR130 可上调 p-p53、BCL2 和 MCL1 的表达,以及细胞色素 C、BAX 和 BAK 的表达。已有研究报道 SCR130 可增加 FAS 和 SMAC-DIABLO 蛋白的表达,并激活 caspase 8[1]。SCR130(48 小时)在 Reh、HeLa、CEM、Nalm6 和 N114 细胞中的 IC50 值分别为 14.1 μM、5.9 μM、6.5 μM、2.2 μM 和 11 μM。这些结果表明 SCR130 具有细胞毒性。 SCR130 与 Reh 和 Nalm6 细胞系联合给药时,可导致细胞死亡增加,从而放大辐射(0.5 和 1 Gy)的效应[1]。当 SCR130 抑制内源性非同源末端连接 (NHEJ) 时,未修复的 DNA 断裂会积累。SCR130 处理会导致 DNA 双链断裂 (DSB) 积累,因为它抑制内源性 NHEJ 并触发细胞凋亡途径,最终导致细胞死亡[1]。
SCR130 (500 µM) 以剂量依赖性方式 (100-1000 µM) 抑制大鼠睾丸和脾脏提取物催化的 DNA 末端连接 [1]。
在纯化的 Ligase IV/XRCC4 介导的末端连接实验中,SCR130 显示出浓度依赖性抑制作用 (100-1000 µM) [1]。
SCR130在测试浓度下对连接酶III或连接酶I介导的末端连接几乎没有抑制作用[1]。
在细胞毒性试验中,SCR130的IC50值如下:Nalm6细胞:2.2 µM;Reh细胞:14 µM;HeLa细胞:6 µM;CEM细胞:6 µM;与野生型Nalm6细胞(IC50 2 µM)相比,连接酶IV缺失的N114细胞的敏感性降低了5倍(IC50 ~10 µM),证实了其对连接酶IV的特异性[1]。
与γ射线(0.5和1 Gy)联合使用可增强其对Reh和Nalm6细胞的细胞毒性[1]。
SCR130处理(7、14、21 µM)以浓度依赖的方式增加Reh细胞中53BP1的聚集灶[1]。
与单独使用SCR130或SCR130联合辐射(0.5/1 Gy)显著增加了Reh、Nalm6和HeLa细胞中53BP1和γH2AX的聚集灶[1]。
HeLa细胞的中性彗星试验显示,单独使用SCR130(3、6、9 µM)或与1 Gy辐射联合使用均可增加彗星尾DNA百分比和Olive矩[1]。
SCR130(7、14、21 µM)可诱导Reh细胞线粒体膜电位丧失(JC-1试验)并增加早期/晚期凋亡细胞(Annexin V/PI染色)[1]。对用SCR130(7、14、21 µM)处理的Reh细胞进行Western blot分析显示,pATM、磷酸化p53、细胞色素C、BAX、BAK、裂解的PARP1、caspase 9、caspase 8、FAS和SMAC-DIABLO的表达呈浓度依赖性增加,而BCL2和MCL1在最高浓度下降低;KU70、连接酶IV、XRCC4和连接酶III的水平保持不变[1]。[1]
酶活实验
在无细胞DNA末端连接实验中,使用大鼠睾丸和脾脏提取物测试了SCR130。将提取物与放射性标记的双链寡聚DNA(75 bp,5'端突出)在含有ATP和不同浓度SCR130(100-1000 µM)的缓冲液中于25°C孵育1小时。终止反应,纯化产物,并在变性聚丙烯酰胺凝胶上进行分离,以检测二聚体和环状产物[1]。
在末端连接实验中,使用纯化的Ligase IV/XRCC4(在细菌或昆虫细胞中过表达),以相同的DNA底物和递增浓度的SCR130(100-1000 µM)于25°C孵育1小时;通过变性PAGE分析连接效率[1]。
纯化的连接酶III和连接酶I也进行了类似的测试,以检测SCR130对末端连接的抑制作用[1]。
采用圆二色谱(CD)光谱法研究了结合情况。将从细菌中纯化的全长连接酶IV/XRCC4或其DNA结合域(DBD)与4 µM SCR130孵育,并记录CD光谱。加入SCR130后,观察到光谱模式发生显著变化(表明β-折叠的出现),提示SCR130与连接酶IV的DBD直接结合[1]。[1]
细胞实验
细胞凋亡分析[1]
细胞类型: Reh 细胞
测试浓度: 7 μM、14 μM 和 21 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: 表明晚期和早期凋亡细胞的数量呈浓度依赖性增加。

蛋白质印迹分析[1]
细胞类型:Reh细胞
测试浓度:7 μM、14 μM和21 μM
孵育时间:48小时
实验结果:显示pATM水平呈浓度依赖性增加,并通过磷酸化激活p53。
使用台盼蓝染色排除法评估SCR130的细胞毒性。将细胞(Nalm6、Reh、HeLa、CEM、N114)用递增浓度(0.1、0.5、1、2、5、10、50、100 µM)处理48小时;IC50值根据活细胞百分比计算[1]。
对于与辐射联合治疗,Reh 和 Nalm6 细胞用 IC50 剂量的 SCR130(Reh 细胞为 14 µM,Nalm6 细胞为 2 µM)处理,并暴露于 0.5 或 1 Gy γ 射线;分别在 24 小时和 48 小时收集细胞进行台盼蓝染色 [1]。
免疫荧光:用 SCR130(7、14、21 µM)处理 Reh 或 HeLa 细胞,或与辐射(0.5/1 Gy)联合处理,固定后,用抗 53BP1 或抗 γH2AX 抗体染色,随后用 Alexa Fluor 标记的二抗染色,细胞核用碘化丙啶或 DAPI 复染;使用 ImageJ 计数荧光灶 [1]。
中性彗星试验:将 HeLa 细胞用 SCR130(3、6、9 µM)单独处理或与 1 Gy 辐射联合处理,包埋于琼脂糖中,裂解,在中性条件下进行电泳,用溴化乙锭染色;使用 CometScore 软件定量彗星尾 DNA 百分比和 Olive 矩(每个样本 ≥250 个细胞)[1]。
细胞周期分析:将 Reh 细胞用 SCR130(7、14、21 µM)处理 48 小时,用 70% 乙醇固定,用碘化丙啶 (PI) 染色,通过流式细胞术分析;定量 SubG1 期细胞群 [1]。
线粒体膜电位:将 Reh 细胞用 SCR130(7、14、21 µM)处理 48 小时,用 JC-1 染料染色,通过流式细胞术分析;缬氨霉素用作阳性对照[1]。
细胞凋亡检测:用SCR130(7、14、21 µM)处理Reh细胞48小时,用Annexin V-FITC和PI染色,通过流式细胞术分析早期凋亡、晚期凋亡和坏死细胞[1]。
蛋白质印迹:用SCR130(7、14、21 µM)处理Reh细胞48小时,裂解细胞,等量上样蛋白质,用针对pATM、ATM、p53、磷酸化p53、BCL2、MCL1、细胞色素C、BAX、BAK、裂解PARP1、caspase 9、caspase 8、FAS、SMAC-DIABLO、KU70、连接酶IV、XRCC4、连接酶III的抗体进行检测;丽春红染色用作上样对照[1]。[1]
参考文献

[1]. Identification and characterization of novel SCR7-based small-molecule inhibitor of DNA end-joining, SCR130 and its relevance in cancer therapeutics. Mol Carcinog. 2020 Jun;59(6):618-628.

其他信息
在 Ligase IV 缺失的 N114 细胞系中,SCR130 的细胞毒性(IC50 ~10 µM)比野生型 Nalm6 细胞(IC50 2 µM)低 5 倍,证实了 Ligase IV 依赖性细胞死亡 [1]。在 Reh 细胞中,SCR130 在所有测试浓度(7-21 µM)下均未诱导细胞周期阻滞,但增加了 SubG1 期细胞的比例 [1]。该化合物通过内在途径(细胞色素 C 释放、BAX/BAK 上调、caspase 9 激活)和外在途径(FAS 上调、caspase 8 激活)诱导细胞凋亡 [1]。SCR130 是在 SCR7 的核心结构中引入螺环而衍生而来,与 SCR7 相比,其在诱导癌细胞系细胞毒性方面的效力提高了 20 倍 [1]。
它具有开发为癌症治疗药物的潜力,并且由于其在低浓度下对连接酶IV具有特异性的非同源末端连接抑制作用,也可用于改进精确的基因组编辑(例如CRISPR-Cas9)[1]。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H13CL2N3O2S
分子量
418.296420812607
精确质量
417.01
CAS号
2377858-38-1
PubChem CID
146165950
外观&性状
Light yellow to brown solid powder
LogP
3.6
tPSA
103
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
27
分子复杂度/Complexity
662
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC1C=CC(=CC=1)C1CC(C2C=CC(=CC=2)Cl)=NC21C(NC(NC2=O)=S)=O
InChi Key
QEMQLCCYJLGAKB-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H13Cl2N3O2S/c20-12-5-1-10(2-6-12)14-9-15(11-3-7-13(21)8-4-11)24-19(14)16(25)22-18(27)23-17(19)26/h1-8,14H,9H2,(H2,22,23,25,26,27)
化学名
2,4-bis(4-chlorophenyl)-8-sulfanylidene-1,7,9-triazaspiro[4.5]dec-1-ene-6,10-dione
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 100 mg/mL (239.06 mM )
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.98 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3906 mL 11.9531 mL 23.9063 mL
5 mM 0.4781 mL 2.3906 mL 4.7813 mL
10 mM 0.2391 mL 1.1953 mL 2.3906 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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