SCR130

别名: SCR-130
目录号: V37348 纯度: ≥98%
SCR130 是一种基于 SCR7 的 DNA 非同源末端连接 (NHEJ) 抑制剂。
SCR130 CAS号: 2377858-38-1
产品类别: Apoptosis
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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产品描述
SCR130 是一种基于 SCR7 的 DNA 非同源末端连接 (NHEJ) 抑制剂。SCR130 以连接酶 IV 依赖的方式抑制 DNA 末端连接。SCR130 特异性靶向连接酶 IV,对连接酶 III 和连接酶 I 介导的连接几乎没有影响。SCR130 可诱导细胞凋亡并具有抗肿瘤活性。
SCR130 是 NHEJ 抑制剂 SCR7 的一种新型螺环衍生物,旨在以更高的效率靶向 DNA 连接酶 IV。与 SCR7 相比,SCR130 在癌细胞系中表现出低 20 倍的 IC50 值,特异性抑制连接酶 IV 依赖的 DNA 末端连接,并通过内源性和外源性途径诱导细胞凋亡。[1]
SCR130 是一种新型小分子 DNA 修复抑制剂,也是一种基于 SCR7 的 DNA 非同源末端连接 (NHEJ) 抑制剂。它特异性抑制DNA连接酶IV介导的连接,对连接酶III和连接酶I介导的连接几乎没有影响。在临床前模型中,它已显示出抗肿瘤活性。SCR130可诱导细胞凋亡并具有抗癌活性。
生物活性&实验参考方法
靶点
SCR130 targets DNA Ligase IV (specifically the Ligase IV/XRCC4 complex). It shows minimal or no effect on Ligase III and Ligase I at equivalent concentrations. [1]
SCR130 targets DNA Ligase IV, an enzyme critical for the NHEJ DNA repair pathway. By specifically inhibiting Ligase IV, SCR130 disrupts the repair of DNA double-strand breaks. This leads to the accumulation of DNA damage, loss of mitochondrial membrane potential, and activation of both intrinsic and extrinsic apoptosis pathways. It is also being explored for STAT3 inhibition.
体外研究 (In Vitro)
SCR130(7-21 μM;48 小时)可增加早期和晚期凋亡细胞的数量。SCR130 通过内源性和外源性途径诱导细胞凋亡。SCR130 可上调 p-p53、BCL2 和 MCL1 的表达,以及细胞色素 C、BAX 和 BAK 的表达。已有研究报道 SCR130 可增加 FAS 和 SMAC-DIABLO 蛋白的表达,并激活 caspase 8[1]。SCR130(48 小时)在 Reh、HeLa、CEM、Nalm6 和 N114 细胞中的 IC50 值分别为 14.1 μM、5.9 μM、6.5 μM、2.2 μM 和 11 μM。这些结果表明 SCR130 具有细胞毒性。 SCR130 与 Reh 和 Nalm6 细胞系联合给药时,可导致细胞死亡增加,从而放大辐射(0.5 和 1 Gy)的效应[1]。当 SCR130 抑制内源性非同源末端连接 (NHEJ) 时,未修复的 DNA 断裂会积累。SCR130 处理会导致 DNA 双链断裂 (DSB) 积累,因为它抑制内源性 NHEJ 并触发细胞凋亡途径,最终导致细胞死亡[1]。
SCR130 (500 µM) 以剂量依赖性方式 (100-1000 µM) 抑制大鼠睾丸和脾脏提取物催化的 DNA 末端连接 [1]。
在纯化的 Ligase IV/XRCC4 介导的末端连接实验中,SCR130 显示出浓度依赖性抑制作用 (100-1000 µM) [1]。
SCR130在测试浓度下对连接酶III或连接酶I介导的末端连接几乎没有抑制作用[1]。
在细胞毒性试验中,SCR130的IC50值如下:Nalm6细胞:2.2 µM;Reh细胞:14 µM;HeLa细胞:6 µM;CEM细胞:6 µM;与野生型Nalm6细胞(IC50 2 µM)相比,连接酶IV缺失的N114细胞的敏感性降低了5倍(IC50 ~10 µM),证实了其对连接酶IV的特异性[1]。
与γ射线(0.5和1 Gy)联合使用可增强其对Reh和Nalm6细胞的细胞毒性[1]。
SCR130处理(7、14、21 µM)以浓度依赖的方式增加Reh细胞中53BP1的聚集灶[1]。
与单独使用SCR130或SCR130联合辐射(0.5/1 Gy)显著增加了Reh、Nalm6和HeLa细胞中53BP1和γH2AX的聚集灶[1]。
HeLa细胞的中性彗星试验显示,单独使用SCR130(3、6、9 µM)或与1 Gy辐射联合使用均可增加彗星尾DNA百分比和Olive矩[1]。
SCR130(7、14、21 µM)可诱导Reh细胞线粒体膜电位丧失(JC-1试验)并增加早期/晚期凋亡细胞(Annexin V/PI染色)[1]。对用SCR130(7、14、21 µM)处理的Reh细胞进行Western blot分析显示,pATM、磷酸化p53、细胞色素C、BAX、BAK、裂解的PARP1、caspase 9、caspase 8、FAS和SMAC-DIABLO的表达呈浓度依赖性增加,而BCL2和MCL1在最高浓度下降低;KU70、连接酶IV、XRCC4和连接酶III的水平未发生变化[1]。[1]
体外实验表明,SCR130对NALM6和Reh白血病细胞具有细胞毒性,IC50值分别为2.2 μM和14.1 μM,对HeLa宫颈癌细胞的IC50值为5.9 μM。在7至21 μM的浓度范围内,SCR130可诱导Reh细胞DNA双链断裂。该化合物对连接酶 IV 介导的 DNA 末端连接表现出选择性抑制作用。
体内研究 (In Vivo)
在临床前模型中,SCR130已展现出体内抗肿瘤活性。作为一种靶向非同源末端连接(NHEJ)的DNA修复抑制剂,它有望增强肿瘤对DNA损伤药物的敏感性,并提高放疗和化疗的疗效。详细的体内疗效数据将取决于所研究的具体肿瘤模型和治疗方案。
酶活实验
在无细胞DNA末端连接实验中,使用大鼠睾丸和脾脏提取物测试了SCR130。将提取物与放射性标记的双链寡聚DNA(75 bp,5'端突出)在含有ATP和不同浓度SCR130(100-1000 µM)的缓冲液中于25°C孵育1小时。终止反应,纯化产物,并在变性聚丙烯酰胺凝胶上进行分离,以检测二聚体和环状产物[1]。
在末端连接实验中,使用纯化的Ligase IV/XRCC4(在细菌或昆虫细胞中过表达),以相同的DNA底物和递增浓度的SCR130(100-1000 µM)于25°C孵育1小时;通过变性PAGE分析连接效率[1]。
纯化的连接酶III和连接酶I也进行了类似的测试,以检测SCR130对DNA末端连接的抑制作用[1]。
采用圆二色谱(CD)光谱法研究了结合情况。将从细菌中纯化的全长连接酶IV/XRCC4或其DNA结合域(DBD)与4 µM SCR130孵育,并记录CD光谱。加入SCR130后,光谱模式发生显著变化(表明β-折叠),提示SCR130与连接酶IV的DBD直接结合[1]。[1]
SCR130的体外酶抑制试验包括测定其对DNA连接酶IV活性的抑制作用。将纯化的连接酶IV与不同浓度的SCR130在含有DNA底物的连接缓冲液中孵育。通过凝胶电泳或荧光法测定连接活性。 IC50值由剂量反应曲线计算得出。特异性通过针对连接酶I和III的测试来验证。
细胞实验
细胞凋亡分析[1]
细胞类型: Reh 细胞
测试浓度: 7 μM、14 μM 和 21 μM
孵育时间: 48 小时
实验结果: 表明晚期和早期凋亡细胞的数量呈浓度依赖性增加。
蛋白质印迹分析[1]
细胞类型:Reh细胞
测试浓度:7 μM、14 μM和21 μM
孵育时间:48小时
实验结果:显示pATM水平呈浓度依赖性增加,并通过磷酸化激活p53。
使用台盼蓝染色排除法评估SCR130的细胞毒性。将细胞(Nalm6、Reh、HeLa、CEM、N114)用递增浓度(0.1、0.5、1、2、5、10、50、100 µM)处理48小时;IC50值根据活细胞百分比计算[1]。
对于与辐射联合治疗,Reh 和 Nalm6 细胞用 IC50 剂量的 SCR130(Reh 细胞为 14 µM,Nalm6 细胞为 2 µM)处理,并暴露于 0.5 或 1 Gy γ 射线;分别在 24 小时和 48 小时收集细胞进行台盼蓝染色 [1]。
免疫荧光:用 SCR130(7、14、21 µM)处理 Reh 或 HeLa 细胞,或与辐射(0.5/1 Gy)联合处理,固定后,用抗 53BP1 或抗 γH2AX 抗体染色,随后用 Alexa Fluor 标记的二抗染色,细胞核用碘化丙啶或 DAPI 复染;使用 ImageJ 计数荧光灶 [1]。
中性彗星试验:将 HeLa 细胞用 SCR130(3、6、9 µM)单独处理或与 1 Gy 辐射联合处理,包埋于琼脂糖中,裂解,在中性条件下进行电泳,用溴化乙锭染色;使用 CometScore 软件定量彗星尾 DNA 百分比和 Olive 矩(每个样本 ≥250 个细胞)[1]。
细胞周期分析:将 Reh 细胞用 SCR130(7、14、21 µM)处理 48 小时,用 70% 乙醇固定,用碘化丙啶 (PI) 染色,通过流式细胞术分析;定量 SubG1 期细胞群 [1]。
线粒体膜电位:将 Reh 细胞用 SCR130(7、14、21 µM)处理 48 小时,用 JC-1 染料染色,通过流式细胞术分析;缬氨霉素用作阳性对照[1]。
细胞凋亡检测:用SCR130(7、14、21 µM)处理Reh细胞48小时,用Annexin V-FITC和PI染色,通过流式细胞术分析早期凋亡、晚期凋亡和坏死细胞[1]。
蛋白质印迹:用SCR130(7、14、21 µM)处理Reh细胞48小时,裂解细胞,等量上样蛋白质,用针对pATM、ATM、p53、磷酸化p53、BCL2、MCL1、细胞色素C、BAX、BAK、裂解PARP1、caspase 9、caspase 8、FAS、SMAC-DIABLO、KU70、连接酶IV、XRCC4、连接酶III的抗体进行检测;丽春红染色用作上样对照[1]。[1]
SCR130的体外细胞实验包括用不同浓度(0.1-100 µM)的化合物处理癌细胞系(例如NALM6、Reh、HeLa)24-72小时。细胞活力通过MTT或CellTiter-Glo法评估。DNA双链断裂通过γ-H2AX染色检测。细胞凋亡通过Annexin V染色和caspase激活实验评估。IC50值根据剂量反应曲线计算。
动物实验
SCR130的体内动物研究方案包括在合适的肿瘤模型(例如异种移植模型)中进行给药。该化合物将配制成合适的载体,并通过灌胃或腹腔注射给药。给药方案将根据药代动力学数据确定。研究将监测肿瘤生长抑制、DNA损伤标志物和肿瘤细胞凋亡情况。
药代性质 (ADME/PK)
SCR130 的药代动力学数据报道较少。作为一种分子量为 418.30 g/mol、分子式为 C19H13Cl2N3O2S、CAS 编号为 2377858-38-1 的小分子,预计其具有良好的口服生物利用度和组织分布。详细的药代动力学参数需要通过实验确定。建议长期储存于阴凉干燥处。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
SCR130的毒理学数据有限。该化合物仅供研究使用。作为一种DNA修复抑制剂,它可能对正常的细胞增殖和DNA修复产生影响。目前尚无具体的毒性数据。应遵守研究用化合物的标准安全操作规程。该化合物不适用于人类治疗用途。
参考文献

[1]. Identification and characterization of novel SCR7-based small-molecule inhibitor of DNA end-joining, SCR130 and its relevance in cancer therapeutics. Mol Carcinog. 2020 Jun;59(6):618-628.

其他信息
在 Ligase IV 缺失的 N114 细胞系中,SCR130 的细胞毒性(IC50 ~10 µM)比野生型 Nalm6 细胞(IC50 2 µM)低 5 倍,证实了 Ligase IV 依赖性细胞死亡 [1]。在 Reh 细胞中,SCR130 在所有测试浓度(7-21 µM)下均未诱导细胞周期阻滞,但增加了 SubG1 期细胞的比例 [1]。该化合物通过内在途径(细胞色素 C 释放、BAX/BAK 上调、caspase 9 激活)和外在途径(FAS 上调、caspase 8 激活)诱导细胞凋亡 [1]。SCR130 是在 SCR7 的核心结构中引入螺环而衍生而来,与 SCR7 相比,其在诱导癌细胞系细胞毒性方面的效力提高了 20 倍 [1]。
由于其在低浓度下对连接酶IV具有特异性的非同源末端连接(NHEJ)抑制作用,因此具有开发为癌症治疗药物的潜力,也可用于改进精确基因组编辑(例如CRISPR-Cas9)[1]。[1]
SCR130(CAS号:2377858-38-1)也称为1,7,9-三氮杂螺[4.5]癸-1-烯-6,10-二酮,2,4-双(4-氯苯基)-8-硫代-。它是一种靶向连接酶IV的选择性小分子抑制剂。在临床前模型中已显示出抗肿瘤活性,并被用于探索NHEJ抑制在肿瘤治疗中的潜力。目前尚未获准用于临床治疗。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C19H13CL2N3O2S
分子量
418.296420812607
精确质量
417.01
CAS号
2377858-38-1
PubChem CID
146165950
外观&性状
Light yellow to brown solid powder
LogP
3.6
tPSA
103
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
4
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
27
分子复杂度/Complexity
662
定义原子立体中心数目
0
SMILES
ClC1C=CC(=CC=1)C1CC(C2C=CC(=CC=2)Cl)=NC21C(NC(NC2=O)=S)=O
InChi Key
QEMQLCCYJLGAKB-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C19H13Cl2N3O2S/c20-12-5-1-10(2-6-12)14-9-15(11-3-7-13(21)8-4-11)24-19(14)16(25)22-18(27)23-17(19)26/h1-8,14H,9H2,(H2,22,23,25,26,27)
化学名
2,4-bis(4-chlorophenyl)-8-sulfanylidene-1,7,9-triazaspiro[4.5]dec-1-ene-6,10-dione
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 100 mg/mL (239.06 mM )
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.98 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入900 μL 玉米油中,混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3906 mL 11.9531 mL 23.9063 mL
5 mM 0.4781 mL 2.3906 mL 4.7813 mL
10 mM 0.2391 mL 1.1953 mL 2.3906 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们