AT406 (Xevinapant, SM406, ARRY334543)

别名: DeBio-1143; DeBio1143; DeBio 1143; Xevinapant; AT 406; AT-406; AT406; SM406; SM 406; N65WC8PXDD; SM-406; UNII-N65WC8PXDD; Xevinapant; ARRY-334543; ARRY 334543; ARRY334543 (5S,8S,10AR)-N-(二苯基甲基)十氢-5-[[(2S)-2-(甲基氨基)-1-氧代丙基]氨基]-3-(3-甲基-1-氧代丁基)-6-氧代吡咯并[1,2-A][1,5]二氮杂环辛烷-8-甲酰胺;AT406
目录号: V0053 纯度: = 99.44%
Xevinapant(以前称为 Debio1143;AT-406;SM-406,ARRY-334543)是同类首创且可口服生物利用的 SMAC(第二种线粒体衍生的半胱天冬酶激活剂)/DIABLO 的肽模拟物,具有潜在的抗肿瘤活性,也是 IAP 的拮抗剂。通过 E3 泛素连接酶)蛋白的凋亡蛋白抑制剂。
AT406 (Xevinapant, SM406, ARRY334543) CAS号: 1071992-99-8
产品类别: IAP
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
2mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
Other Sizes

Other Forms of AT406 (Xevinapant, SM406, ARRY334543):

  • Xevinapant (Debio1143; AT-406; SM-406, ARRY-334543) HCl
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纯度/质量控制文件

纯度: = 99.44%

纯度: = 99.1%

产品描述
Xevinapant(以前称为 Debio1143;AT-406;SM-406,ARRY-334543)是一流的、口服生物可利用的 SMAC/DIABLO 肽模拟物,具有潜在的抗肿瘤活性。它也是 IAP(通过 E3 泛素连接酶的凋亡蛋白抑制剂)蛋白的拮抗剂。 Kis 分别为 66.4 nM、1.9 nM 和 5.1 nM,它与 XIAP-BIR3、cIAP1-BIR3 和 cIAP2-BIR3 结合以发挥作用。
生物活性&实验参考方法
靶点
cIAP1 (Ki = 1.9 nM); cIAP2 (Ki = 5.1 nM); XIAP (Ki = 66.4 nM)
体外研究 (In Vitro)
AT-406 是一种 Smac 模拟物,在与 XIAP 的氢键作用和疏水相互作用方面似乎都非常模拟 AVPI 肽,并且与 XIAP 的 W323 具有额外的疏水接触。与 Smac AVPI 肽相比,AT-406(1 μM)的结合亲和力高出 50-100 倍。当 caspase-9 在无细胞环境中被 500 nM XIAP BIR3 抑制时,AT-406 会完全逆转这种效应。 AT-406 会降低细胞 XIAP 蛋白,同时还会导致 cIAP1 蛋白在 MDA-MB-231 细胞中快速降解。在 MDA-MB-231 细胞和 SK-OV-3 卵巢细胞中的 IC50 值分别为 144 和 142 nM,对 MCF-12F 细胞(类似于正常人乳腺上皮细胞)和原代人正常前列腺上皮细胞具有低毒性,AT-406有效抑制多种人类癌细胞系。 AT-406 通过激活 caspase-3 和裂解 PARP,引起 MDA-MB-231 细胞凋亡。 [1]
体内研究 (In Vivo)
在小鼠、大鼠、非人灵长类动物和狗中,AT-406 具有良好的口服生物利用度和药代动力学 (PK) 特性。 AT-406 在 100 mg/kg 剂量下可有效诱导肿瘤组织中的 cIAP1 降解、procaspase-8 加工和 PARP 裂解,即使在 200 mg/kg 剂量下,AT-406 在 MDA-MB-231 异种移植物中也具有良好的耐受性。 100 mg/kg 时,AT-406 显着抑制肿瘤生长,p 值为 0.0012。 [1]
酶活实验
FL-AT-406(荧光标记的 AT-406)用于开发一套新的 FP 测定法,用于测定 Smac 模拟物与 XIAP、cIAP-1 和 cIAP-2 BIR3 蛋白的结合亲和力。使用固定浓度的 FL-AT-406 和不同浓度的蛋白质直至完全饱和的滴定实验用于计算 FL-AT-406 对每种 IAP 蛋白质的 Kd 值。 Microflu 2 96 孔黑色圆底板用于使用 Infinite M-1000 读板器测量荧光偏振值。对于 XIAP BIR3、cIAP-1 BIR3 和 cIAP-2 BIR3 的实验,将 FL-AT-406(每孔分别为 2、1 和 1 nM)和各种蛋白质浓度添加到终体积为 125 μL 的溶液中。测定缓冲液(100 mM 磷酸钾,pH 7.5,100 g/mL 牛球蛋白,0.02% 叠氮化钠,含 4% DMSO)。彻底混合后,将板在室温下轻轻摇动两到三个小时。在 485 nm 的激发波长和 530 nm 的发射波长下,测量以毫偏振单位 (mP) 为单位的偏振值。然后,使用 Graphpad Prism 5.0 软件,通过拟合 S 形剂量依赖性 FP 增加作为蛋白质浓度的函数来计算平衡解离常数 (Kd)。在 XIAP3 BIR3 的竞争性结合测试中,AT-406 与 20 nM XIAP BIR3 蛋白和 2 nM FL-AT-406 在测定缓冲液(100 mM 磷酸钾,pH 7.5;100 μg/mL 牛 γ-球蛋白;0.02 %叠氮化钠)。实验中使用 3 nM 蛋白质和 1 nM FL-AT-406 来确定 cIAP1 BIR3 蛋白质的竞争性结合。 5 nM 蛋白质和 1 nM FL-AT-406 用于 cIAP2 BIR3 的竞争性结合测试。使用 Infinite M-1000 读板器,在孵育两到三个小时后确定每个竞争性结合实验的偏振值。使用非线性最小二乘分析,从图中提取 IC50 值或 50% 结合示踪剂被取代时的抑制剂浓度。 PRISM 程序用于拟合曲线。
细胞实验
以 (3-4) × 103 个细胞/孔的密度,将细胞接种到含有 AT-406 的 96 孔平底细胞培养板中,并孵育 4 天。将三至四个 103 个细胞/孔的 AT-406 接种细胞置于 96 孔平底细胞培养板中,然后将细胞孵育四天。通过(2-(2-甲氧基-4-硝基苯基)-3-(4-硝基苯基)-5-(2,4-二磺基苯基)测定来测定不同浓度AT-406处理后的细胞生长抑制率-2H-四唑单钠盐(WST-8)。将WST-8添加到每个孔中至终浓度10%,然后将板在37°C下孵育2−3小时。使用TECAN ULTRA读数器,计算样品在450 nm处的吸光度,通过比较未经处理的细胞和经AT-406处理的细胞的吸光度,可以确定抑制细胞生长50%(IC50)的AT-406浓度。使用TECAN ULTRA读数仪测量样品在450 nm处的吸光度,通过比较处理和未处理细胞的吸光度,可以确定AT-406抑制50%细胞生长的浓度(IC50)。
动物实验
MDA-MB-231 xenograft tumors in severe combined immune deficiency (SCID) mice
10 mg/kg (i.v.), 10 mg/kg (p.o.), 30 mg/kg (p.o.) and 100 mg/kg (p.o.)
Administered via intravenously (i.v.) or oral gavage (p.o.)
In Vivo pharmacodynamic (PD) studies[1]
For in vivo PD studies, the MDA-MB-231 xenograft tumor model was employed. To develop xenograft tumors, 5 × 106 MDA-MB-231 cancer cells with matrigel were injected subcutaneously on the dorsal side of the severe combined immunodeficient mice (SCID mice from Charles River), one tumor per mouse. Mice bearing MDA-MB-231 xenograft tumors were administered with a single dose of AT406 (Xevinapant, SM406, ARRY334543) in its HCl salt form at 100 mg/kg via oral gavage, Taxotere at 7.5 mg/kg intravenously or vehicle control. Tumor tissues were harvested at indicated time points. Tumor tissues were analyzed using Western blotting to examine levels of cIAP1 and XIAP, caspase-8 processing and PARP cleavage in tumor tissues.
In Vivo Pharmacokinetic studies in plasma and MDA-MB-231 tumor tissues in SCID mice[1]
To develop xenograft tumors, 5 × 106 MDA-MB-231 cancer cells with matrigel were injected subcutaneously on the dorsal side of the severe combined immunodeficient mice (SCID mice from Charles River), two tumors (left and right sides) per mouse. Mice bearing MDA-MB-231 xenograft tumors were administered with a single dose of compound 2 [AT406 (Xevinapant, SM406, ARRY334543)] in its HCl salt form at 100 mg/kg via oral gavage. Blood and tumor samples were collected from each mouse by terminal cardiac puncture at 0.25, 0.5, 1, 2, 4, 6, 8, 24 h post-dose. Samples were taken from three mice at each time point. Blood samples were collected into potassium heparin treated tubes and centrifuged at 2000g and 4°C for 10 min. Plasma was collected and stored at −80°C prior to analysis. Isolated tumor tissues were immediately frozen and ground with a mortar and pestle in liquid nitrogen, then stored at −80°C until analysis.
In Vivo antitumor efficacy study[1]
SCID mice (8–10 per group) bearing MDA-MB-231 xenograft tumors were treated with different doses of AT406 (Xevinapant, SM406, ARRY334543), or 7.5 mg/kg of Taxotere or vehicle control daily, 5 days a week for 2 weeks. Tumor sizes and animal weights were measured 3 times a week during the treatment and twice a week after the treatment. Data are presented as mean tumor volumes ± SEM. Statistical analyses were performed by two-way ANOVA and unpaired two-tailed t test, using Prism (version 4.0, GraphPad, La Jolla, CA). P < 0.05 was considered statistically significant. The efficacy experiment was performed under the guidelines of the University of Michigan Committee for Use and Care of Animals.
Pharmacokinetics of AT406 (Xevinapant, SM406, ARRY334543) in rats, dogs and non-human primates[1]
Pharmacokinetic (PK) studies in male Sprague Dawley rats, beagle dogs and cynomolgus monkeys (non-human primates) were performed a CRO company.
AT406 (Xevinapant, SM406, ARRY334543) in its hydrochloride salt form was used in pharmacokinetic (PK) evaluations and was dissolved in saline to yield final concentration at 25 mg/mL (pH≈7). The solution was administered to animals on preparation. The concentration of AT406 (Xevinapant, SM406, ARRY334543) in dosing solution was confirmed by HPLC.
For PK studies in rats, dogs and monkeys, animals were randomly assigned to the treatment groups and were carotid cannulated before the PK studies. The LC system comprised an Agilent liquid chromatograph equipped with an isocratic pump (1100 series), an autosampler (1100 series) and a degasser (1100 series). Mass spectrometric analysis was performed using an API3000 (triple-quadruple) instrument from AB Inc with an ESI interface. The data acquisition and control system were created using Analyst 1.4 software from ABI Inc. The concentrations in plasma below the limit of quantitation (LOQ = 5 ng/mL) were designated as zero. The pharmacokinetic data analysis was performed using noncompartmental analysis. Oral bioavailability was calculated as F(%)=(Dose(oral)×AUC(0-∞)(oral))/(Dose (iv)×AUC(0-∞) (iv))*100%.
参考文献

[1]. A potent and orally active antagonist (SM-406/AT-406) of multiple inhibitor of apoptosis proteins (IAPs) in clinical development for cancer treatment. J Med Chem. 2011;54(8):2714-2726.

其他信息
Xevinapant is an orally available mimetic of the natural second mitochondrial-derived activator of caspases (Smac) and inhibitor of Inhibitor of Apoptosis Proteins (IAPs), with potential immunomodulating, apoptotic-inducing, chemo-radio-sensitizing and antineoplastic activities. Upon oral administration,xevinapant targets and binds to the Smac binding groove on IAPs, including the direct caspase inhibitor X chromosome-linked IAP (XIAP), and the cellular IAPs 1 (c-IAP1) and 2 (c-IAP2). This inhibits the activities of these IAPs and promotes the induction of apoptosis. Additionally, as xevinapant inhibits the activity of IAPs, it may work synergistically with cytotoxic drugs and/or radiation to overcome tumor cell resistance to apoptosis. As IAPs regulate nuclear factor-kappa B (NFkB) signaling pathways, which drives the expression of genes involved in immune and inflammatory responses, xevinapant may enhance anti-tumor immune responses when administered with certain immunomodulating agents, such as immune checkpoint inhibitors. IAPs are overexpressed by many cancer cell types and suppress both intrinsic and extrinsic apoptosis by binding to and inhibiting active caspases via their baculoviral lAP repeat (BIR) domains. They contribute to chemo-radio-resistance of cancer cells to certain cytotoxic agents and radiation, promote tumor cell survival and are associated with poor prognosis in certain types of cancer. SMAC, a pro-apoptotic mitochondrial protein, is an endogenous inhibitor of the IAPs family of cellular proteins.
See also: Xevinapant Hydrochloride (is active moiety of).
Drug Indication
Treatment of head and neck epithelial malignant neoplasms
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C32H43N5O4
分子量
561.71
精确质量
561.331
元素分析
C, 68.42; H, 7.72; N, 12.47; O, 11.39
CAS号
1071992-99-8
相关CAS号
Xevinapant hydrochloride;1071992-57-8
PubChem CID
25022340
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.2±0.1 g/cm3
沸点
840.5±65.0 °C at 760 mmHg
闪点
462.1±34.3 °C
蒸汽压
0.0±3.1 mmHg at 25°C
折射率
1.603
LogP
2.09
tPSA
117.83
氢键供体(HBD)数目
3
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
9
重原子数目
41
分子复杂度/Complexity
896
定义原子立体中心数目
4
SMILES
O=C1[C@]([H])(C([H])([H])N(C(C([H])([H])C([H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H])=O)C([H])([H])C([H])([H])[C@@]2([H])C([H])([H])C([H])([H])[C@@]([H])(C(N([H])C([H])(C3C([H])=C([H])C([H])=C([H])C=3[H])C3C([H])=C([H])C([H])=C([H])C=3[H])=O)N21)N([H])C([C@]([H])(C([H])([H])[H])N([H])C([H])([H])[H])=O
InChi Key
LSXUTRRVVSPWDZ-MKKUMYSQSA-N
InChi Code
InChI=1S/C32H43N5O4/c1-21(2)19-28(38)36-18-17-25-15-16-27(37(25)32(41)26(20-36)34-30(39)22(3)33-4)31(40)35-29(23-11-7-5-8-12-23)24-13-9-6-10-14-24/h5-14,21-22,25-27,29,33H,15-20H2,1-4H3,(H,34,39)(H,35,40)/t22-,25+,26-,27-/m0/s1
化学名
(5S,8S,10aR)-N-benzhydryl-5-[[(2S)-2-(methylamino)propanoyl]amino]-3-(3-methylbutanoyl)-6-oxo-1,2,4,5,8,9,10,10a-octahydropyrrolo[1,2-a][1,5]diazocine-8-carboxamide
别名
DeBio-1143; DeBio1143; DeBio 1143; Xevinapant; AT 406; AT-406; AT406; SM406; SM 406; N65WC8PXDD; SM-406; UNII-N65WC8PXDD; Xevinapant; ARRY-334543; ARRY 334543; ARRY334543
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~100 mg/mL (~178.0 mM)
Water: <1 mg/mL (slightly soluble or insoluble)
Ethanol: N/A
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.45 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.45 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.45 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液添加到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 30% Propylene glycol , 5% Tween 80 , 65% D5W: 30mg/mL

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7803 mL 8.9014 mL 17.8028 mL
5 mM 0.3561 mL 1.7803 mL 3.5606 mL
10 mM 0.1780 mL 0.8901 mL 1.7803 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

临床试验信息
NCT Number Recruitment interventions Conditions Sponsor/Collaborators Start Date Phases
NCT01078649 Completed Drug: Debio 1143
(AT-406)
Cancer
Malignancy
Lymphoma
Debiopharm International SA March 29, 2010 Phase 1
生物数据图片
  • AT406 (SM-406, ARRY-334543)

    [1] Cai Q, et al. J Med Chem, 2011, 54(8), 2714-2726.
  • AT406 (SM-406, ARRY-334543)

    [1] Cai Q, et al. J Med Chem, 2011, 54(8), 2714-2726.
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