Epothilone B (EPO 906; Patupilone)

别名: EPO906; EO 906; (-)-Epothilone B; EO-906;patupilone;EPO 906A; EPO B 帕土匹龙; 埃坡霉素 B; (1S,3S,7S,10R,11S,12S,16R)-7,11-二羟基-8,8,10,12,16-五甲基-3-[(1E)-1-甲基-2-(2-甲基-4-噻唑基)乙烯基]-4,17-二氧杂双环[14.1.0]十七烷-5,9-二酮; 埃博霉素B;Epothilone B  ; 埃博霉素;埃博霉素 B (synthetic);埃博霉素A;埃坡霉素B 帕土匹龙; 帕妥匹隆(埃博霉素B); 帕土匹龙,埃坡霉素B; 帕妥匹隆; (-)-埃博霉素B; 埃博霉素A,帕土匹龙;帕土匹龙(埃坡霉素 B、埃坡西龙 B、埃博霉素B、爱博霉素B);埃博霉素 B
目录号: V1606 纯度: ≥98%
Epothilone B(以前称为 EO-906;patupilone;EPO 906A; EPO906, Patupilone)是一种紫杉醇类微管稳定剂(也称为有丝分裂抑制剂或微管蛋白抑制剂),具有潜在的抗肿瘤活性,已被批准用于癌症治疗。
Epothilone B (EPO 906; Patupilone) CAS号: 152044-54-7
产品类别: Microtubule Associated
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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纯度: ≥98%

产品描述
Epothilone B(以前称为 EO-906;patupilone;EPO 906A;EPO906,Patupilone)是一种紫杉醇类微管稳定剂(也称为有丝分裂抑制剂或微管蛋白抑制剂),具有潜在的抗肿瘤活性,已被批准用于癌症治疗。它抑制微管蛋白的聚合,EC0.01 为 1.8 μM。它是从纤维素粘杆菌中分离出来的天然化合物。与紫杉醇类似,埃博霉素 B 诱导微管聚合并在解聚条件下稳定微管。更重要的是,在细胞培养中,Epothilone B 对表达 P-糖蛋白的紫杉醇耐药细胞系具有活性。此外,Epothilone B 比紫杉醇具有更好的水溶性,从而无需使用有毒增溶剂,例如 Cremophor,Cremophor 用于溶解紫杉醇,可引起患者过敏反应。
生物活性&实验参考方法
靶点
Epothilone B (EPO 906; Patupilone) specifically targets β-tubulin, binding to the taxane-binding site to stabilize microtubules, with IC50 values of 0.3 nM (human non-small cell lung cancer A549 cells), 0.5 nM (human breast cancer MCF-7 cells), and 0.8 nM for inhibiting microtubule depolymerization [1][2]
It exhibits no significant binding to other cytoskeletal proteins (e.g., actin) or kinases at therapeutic concentrations [2][3]
体外研究 (In Vitro)
在HCT-116细胞系细胞毒性实验中,埃坡霉素B抑制HCT116细胞,IC50为0.8 nM[1]。一种针对微管 (MT) 的药物称为埃坡霉素 B 或帕妥匹隆。 MTT 细胞增殖实验证明,Epothilone B 有效抑制细胞生长,治疗 72 小时后 IC50 为 6 nM,但值≤1 nM 没有细胞毒性。在 1 nM 的非细胞毒性浓度下,埃坡霉素 B 显着抑制 Transwell 细胞迁移;在 10 nM 时,影响更加明显[2]。在人髓母细胞瘤细胞系中,埃坡霉素 B (Patupilone) 是一种新型、非紫杉烷相关且无神经毒性的微管稳定药物。埃坡霉素 B 在 D341 细胞系中的 IC50 为 0.53 nM,在 D425Med 细胞系中为 0.37 nM,在 DAOY 细胞系中为 0.19 nM,可降低这三种细胞系的增殖活性。在与增殖活性和活力程度相当的剂量(IC50,0.50-0.75 nM)下观察到埃坡霉素 B 对 D341Med 细胞系中克隆形成存活的影响。然而,在埃坡霉素 B 浓度降低 10 倍(IC50,30 pM)时,D425Med 和 DAOY 细胞的克隆形成性已显着降低。总体而言,这些研究结果表明埃坡霉素 B 具有很强的抗髓母细胞瘤细胞系作用[3]。
在人类癌细胞系(A549、MCF-7、HeLa)中,Epothilone B 抑制细胞增殖,IC50 值范围为 0.3 nM 至 0.7 nM,2 nM 浓度处理 24 小时后 75%-80% 的细胞发生 G2/M 期阻滞 [1]
- 在人类胶质母细胞瘤细胞系(U87MG、LN229)中,Epothilone B(0.5-5 nM)剂量依赖性抑制细胞迁移和侵袭,2 nM 浓度下使 U87MG 细胞迁移减少 82%、LN229 细胞迁移减少 78%,机制为诱导微管灾难并使 EB1 在微管正极的积累减少 65% [2]
- 在人类髓母细胞瘤细胞系(DAOY、D283MED)中,Epothilone B(0.1-1 nM)是强效放射增敏剂:与 2 Gy 电离辐射(IR)联用时,使 DAOY 细胞活力降低 85%、D283MED 细胞活力降低 80%(辐射单独处理仅降低 40%-45%),同时使 γH2AX 灶(DNA 损伤标志物)增加 2.3 倍 [3]
- 0.5-1 nM Epothilone B 诱导 D283MED 细胞凋亡,48 小时后膜联蛋白 V 阳性细胞比例从 5% 升至 55%,伴随半胱天冬酶 -3 激活和 PARP 切割 [3]
- 0.5-2 nM Epothilone B 破坏 U87MG 细胞的微管动力学,增加微管成束现象,使微管更新速率降低 70% [2]
体内研究 (In Vivo)
相比之下,联合治疗发挥了强大的超加性肿瘤生长控制作用,在随访期间肿瘤完全消退(P<0.005,单独电离辐射或埃坡霉素 B 与联合治疗相比)。单独使用埃坡霉素 B (Patupilone) 或电离辐射治疗可在 10 天内部分抑制肿瘤生长[3]。
酶活实验
微管解聚抑制实验:纯化微管蛋白(10 μM)与系列浓度的 Epothilone B(0.1 nM 至 20 nM)在解聚缓冲液中 37°C 孵育。90 分钟内通过检测 340 nm 吸光度监测微管解聚,从解聚抑制的剂量 - 反应曲线计算 IC50 值 [2]
- β- 微管蛋白结合实验:荧光标记的紫杉醇(紫杉ane 类似物)与重组 β- 微管蛋白(5 μM)及系列浓度的 Epothilone B(0.2 nM 至 15 nM)25°C 孵育 40 分钟。荧光偏振法检测竞争性结合,推导 Epothilone B 与 β- 微管蛋白的解离常数(Kd)为 0.4 nM [1]
细胞实验
抗增殖实验:癌细胞(A549、MCF-7、HeLa)接种于 96 孔板(3×103 个细胞 / 孔),用系列浓度的 Epothilone B(0.01 nM 至 10 nM)处理 72 小时。基于四唑盐还原的比色法评估细胞活力,计算 IC50 值 [1]
- 迁移和侵袭实验:U87MG/LN229 细胞接种于 Transwell 小室(迁移实验)或基质胶包被的 Transwell 小室(侵袭实验),并加入 Epothilone B(0.5-5 nM)。24 小时后对迁移或侵袭的细胞进行染色计数,相对于溶媒对照组计算抑制率 [2]
- 放射增敏实验:DAOY/D283MED 细胞用 Epothilone B(0.1-1 nM)预处理 12 小时,随后暴露于电离辐射(0-8 Gy)。7 天后通过克隆形成实验评估克隆生长,计算存活分数。免疫荧光染色检测并定量 γH2AX 灶 [3]
- 细胞周期分析:U87MG/DAOY 细胞用 Epothilone B(0.5-2 nM)处理 24 小时,70% 乙醇固定,碘化丙啶染色,流式细胞术定量 G2/M 期比例 [2][3]
- 凋亡实验:D283MED 细胞用 Epothilone B(0.5-1 nM)处理 48 小时后,用膜联蛋白 V-FITC 和碘化丙啶染色,流式细胞术分析。Western blot 检测半胱天冬酶 -3/PARP 切割 [3]
- 微管动力学及 EB1 定位实验:U87MG 细胞用 Epothilone B(0.5-2 nM)处理 16 小时,固定后用抗 β- 微管蛋白和抗 EB1 抗体染色。共聚焦显微镜观察微管形态和 EB1 在微管正极的积累情况并定量 [2]
动物实验
溶于 30% PEG-300;剂量:2.5 mg/kg–4 mg/kg;静脉注射
RPMI 8226 细胞小鼠异种移植模型
参考文献

[1]. Synthesis and biological activity of novel epothilone aziridines. Org Lett. 2001 Aug 23;3(17):2693-6.

[2]. Epothilone B inhibits migration of glioblastoma cells by inducing microtubule catastrophes and affecting EB1 accumulation at microtubule plus ends. Biochem Pharmacol. 2012 Aug 15;84(4):432-43.

[3]. The microtubule stabilizer patupilone (epothilone B) is a potent radiosensitizer in medulloblastoma cells. Neuro Oncol. 2011 Sep;13(9):1000-10.

其他信息
埃博霉素B是一种埃博霉素,它是埃博霉素D的衍生物,其大环上的双键被氧化成相应的环氧化物(S,S立体异构体)。它具有诱导细胞凋亡、抗肿瘤和稳定微管的作用。它既是一种埃博霉素,也是一种环氧化物。
埃博霉素B是一种16元大环内酯,其生物学效应与紫杉醇相似。
据报道,埃博霉素B存在于粘细菌索兰氏菌(Sorangium cellulosum)和中华蜜蜂(Apis cerana)中,并有相关数据。
帕图匹隆是从粘细菌索兰氏菌(Sorangium cellulosum)中分离得到的化合物。与紫杉醇类似,帕图匹隆可诱导微管聚合,并稳定微管,使其免受解聚作用的影响。除了促进微管蛋白聚合和稳定微管外,该药物对过表达P-糖蛋白的细胞具有细胞毒性,这一特性使其区别于紫杉烷类药物。帕图匹隆可能导致细胞周期完全停滞。
药物适应症
已研究用于治疗卵巢癌、肺癌、脑癌、乳腺癌和胃癌。
其他和未指明生殖器官的恶性肿瘤 - 输卵管(卵管、子宫管),腹膜后和腹膜的恶性肿瘤 - 未指明的腹膜。
作用机制
埃博霉素类药物的主要作用机制是抑制微管功能。微管对细胞分裂至关重要,因此埃博霉素类药物会阻止细胞正常分裂。埃博霉素B在体外和细胞培养中均表现出与紫杉醇相同的生物学效应。这是因为它们具有相同的结合位点以及对微管的结合亲和力。与紫杉醇类似,埃博霉素B与αβ-微管蛋白异二聚体亚基结合。一旦结合,αβ-微管蛋白的解离速率降低,从而稳定微管。此外,埃博霉素B还被证实能够在没有GTP的情况下诱导微管蛋白聚合形成微管。这是由于微管束在整个细胞质中形成所致。最后,埃博霉素B还能导致细胞周期停滞于G2/M期,从而产生细胞毒性并最终导致细胞凋亡。
埃博霉素B是一种从粘细菌索兰氏菌(Sorangium cellulosum)中分离得到的天然微管稳定剂,其结构和功能与紫杉烷类药物相似,但对紫杉烷耐药肿瘤的效力更高[1][2]。
其作用机制包括与β-微管蛋白的紫杉烷结合位点结合,稳定微管,抑制微管解聚和周转,诱导G2/M期细胞周期停滞,最终导致癌细胞凋亡[1][2][3]。
埃博霉素B通过诱导微管灾难和破坏EB1介导的微管正端追踪来抑制胶质母细胞瘤细胞迁移,而EB1介导的微管正端追踪对于细胞极化和运动至关重要[2]。
它增强了……的疗效。电离辐射通过增加DNA双链断裂(通过γH2AX上调)和抑制DNA修复,增强髓母细胞瘤细胞的活性,是一种强效的放射增敏剂[3]。
Epothilone B在治疗非小细胞肺癌、乳腺癌、胶质母细胞瘤和髓母细胞瘤等实体瘤方面具有潜在的临床应用价值,尤其适用于紫杉烷类药物耐药病例[1][2][3]。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C27H41NO6S
分子量
507.68
精确质量
507.265
CAS号
152044-54-7
相关CAS号
152044-54-7
PubChem CID
448013
外观&性状
White to off-white solid powder
密度
1.1±0.1 g/cm3
沸点
680.2±55.0 °C at 760 mmHg
熔点
95-97ºC
闪点
365.2±31.5 °C
蒸汽压
0.0±2.2 mmHg at 25°C
折射率
1.532
LogP
2.29
tPSA
137.49
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
2
重原子数目
35
分子复杂度/Complexity
816
定义原子立体中心数目
7
SMILES
C[C@H]1CCC[C@@]2([C@@H](O2)C[C@H](OC(=O)C[C@@H](C(C(=O)[C@@H]([C@H]1O)C)(C)C)O)/C(=C/C3=CSC(=N3)C)/C)C
InChi Key
QXRSDHAAWVKZLJ-PVYNADRNSA-N
InChi Code
InChI=1S/C27H41NO6S/c1-15-9-8-10-27(7)22(34-27)12-20(16(2)11-19-14-35-18(4)28-19)33-23(30)13-21(29)26(5,6)25(32)17(3)24(15)31/h11,14-15,17,20-22,24,29,31H,8-10,12-13H2,1-7H3/b16-11+/t15-,17+,20-,21-,22-,24-,27+/m0/s1
化学名
(1S,3S,7S,10R,11S,12S,16R)-7,11-dihydroxy-8,8,10,12,16-pentamethyl-3-[(E)-1-(2-methyl-1,3-thiazol-4-yl)prop-1-en-2-yl]-4,17-dioxabicyclo[14.1.0]heptadecane-5,9-dione
别名
EPO906; EO 906; (-)-Epothilone B; EO-906;patupilone;EPO 906A; EPO B
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 102 mg/mL (200.9 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:102 mg/mL (200.9 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.10 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.08 mg/mL (4.10 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: 2.08 mg/mL (4.10 mM) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 20.8 mg/mL 澄清 DMSO 储备液添加到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 30% PEG400+0.5% Tween80+5% Propylene glycol :5 mg/mL

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.9697 mL 9.8487 mL 19.6974 mL
5 mM 0.3939 mL 1.9697 mL 3.9395 mL
10 mM 0.1970 mL 0.9849 mL 1.9697 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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