GSK2606414

别名: GSK PERK Inhibitor; GSK2606414; GSK-2606414; GSK 2606414 7-甲基-5-[1-[[3-(三氟甲基)苯基]乙酰基]-2,3-二氢-1H-吲哚-5-基]-7H-吡咯并[2,3-D]嘧啶-4-胺
目录号: V0059 纯度: ≥98%
GSK2606414 是一种新型、有效的选择性 PERK(PRKR 样内质网激酶或蛋白激酶 R (PKR) 样内质网激酶)抑制剂,IC50 为 0.4 nM,选择性比其他测定的 EIF2AK 至少高 100 倍。
GSK2606414 CAS号: 1337531-36-8
产品类别: PERK
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
2mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
GSK2606414 是一种新型、有效的选择性 PERK(PRKR 样内质网激酶或蛋白激酶 R (PKR) 样内质网激酶)抑制剂,IC50 为 0.4 nM,选择性比其他 EIF2AK 至少高 100 倍已测试。 PERK 的另一个名称是 EIF2AK3(真核翻译起始因子 2-α 激酶 3)。 EIF2AK3 基因编码 PERK。它是 I 型膜蛋白家族的成员。它发生在内质网 (ER) 中,由 ER 应激引起,而 ER 应激是由不正确折叠的蛋白质引起的。
生物活性&实验参考方法
靶点
EIF2AK3 (PERK) (IC50 = 0.4 nM); EIF2AK1 (HRI) (IC50 = 420 nM); EIF2AK2 (PKR) (IC50 = 696 nM)
体外研究 (In Vitro)
GSK2606414 抑制细胞中 PERK 激活[1]。
GSK2606414单独抑制PK4,对响应替代应激信号的其他两种疟原虫eIF2α激酶没有影响(图S6)。重要的是,GSK2606414抑制了疟原虫eIF2α磷酸化,并消除了ART治疗后的复发(图5)。由于ER和PERK在成熟红细胞中不存在,GSK2606414很可能通过寄生虫发挥其活性。
体内研究 (In Vivo)
GSK2606414(50 和 150 mg/kg,口服)可防止小鼠肿瘤异种移植物生长[1]。
此外,化合物38(GSK2606414)被推进到小鼠的人类异种移植物功效研究中,并证明小分子抑制PERK可以抑制体内肿瘤生长,这与转化的PERK-/-小鼠胚胎成纤维细胞衍生的肿瘤生长缓慢一致。对38的物理性质和药代动力学进行进一步优化将是未来交流的主题。[1]
酶活实验
GST-PERK 胞质结构域是购买的。 6-His 全长人 eIF2 从 Sf9 昆虫细胞中的杆状病毒表达中纯化。 eIF2 蛋白通过透析到 PBS 中进行缓冲液交换,通过 NHS-LC-生物素进行化学修饰,然后通过透析到 50 mM Tris、pH 7.2、250 mM NaCl 和 5 mM DTT 中进行缓冲液交换。将蛋白质等分并保存在 80°C。将新鲜配制的淬灭溶液添加到反应中后,会产生 4 nM eIF2 磷酸 Ser51 抗体、已用 Eu-1024 标记的 4 nM 抗兔 IgG、40 nM 链霉亲和素 Surelight APC 和 15 mM 的终浓度乙二胺四乙酸。反应在黑色 384 孔聚苯乙烯低体积板中进行,最终体积为 10 μL。将所研究的化合物溶解在 DMSO 中至浓度为 1.0 mM,然后在 DMSO 中连续稀释 1-3 至 11 倍。将每个浓度以 0.1 μL 的量转移至测定板的相应孔中。结果产生 0.00017 至 10 μM 的最终化合物浓度范围。为了测定含有化合物的板,在室温下预孵育 30 分钟后添加 GST-PERK 溶液。添加 ATP 和 eIF2 底物溶液以启动反应。孵育1小时后添加淬灭溶液。在信号检测之前,将板在室温下覆盖 2 小时。在 Viewlux 阅读器上,产生的信号被量化。通过使用 APC/Eu 计算转换数据,APC 信号被归一化为铕信号。浓度响应曲线的信息绘制为使用数据缩减公式 100 × [1 – (U1 – C2)/(C1 – C2)] 与化合物浓度计算的抑制百分比,其中 U 是未知值,C1 是平均值C2 是 1% DMSO 获得的对照值,C2 是 0.1 M EDTA 获得的平均对照值。使用最小响应、最大响应、斜率因子、化合物浓度和抑制浓度 (IC50) 将数据拟合到曲线。每种化合物的结果均以 IC50 值列出。
细胞实验
PERK 抑制剂(GSK2606414,化合物 38)孵育后,用毒胡萝卜素刺激细胞。两小时后裂解细胞并检查 PERK 自磷酸化抑制。
A549细胞中的PERK磷酸化[1]
将指数生长的A549,一种人肺腺癌细胞系,在补充有10%胎牛血清(FBS)的RPMI-1640培养基中的六孔培养皿中以500000个细胞/孔的速度接种,并在37°C、5%CO2下孵育过夜。第二天早上,用DMSO或化合物(3倍稀释液0.33、0.11、0.37μM)处理细胞,并如上所述孵育1小时。然后用1μM thapsigargin刺激细胞额外1小时,以诱导ER应激。收集细胞颗粒并在冷RIPA缓冲液[150mM NaCl、50mM Tris-HCl、pH 7.5、0.25%脱氧胆酸钠、1%NP-40、蛋白酶和磷酸酶抑制剂以及100mM原钒酸钠]中裂解。通过SDS–PAGE解析澄清的裂解物,并使用Invitrogen的NuPAGE系统将其转移到硝化纤维素膜上。将印迹与总PERK和总eIF-2α的初级抗体一起孵育。使用IRDye700DX标记的山羊抗小鼠IgG和IRDye800CW驴抗山羊IgG作为二抗。奥德赛红外成像仪检测到蛋白质.
动物实验
Female nude mice have their right flank subcutaneously implanted with exponentially growing BxPC3 tumor cells (10×106 cells/mouse) cultivated in cell culture. Mice with tumors measuring less than 200 mm3 are randomly assigned to one of eight treatment groups sixteen days post-implantation. The animals are given the compound at 50 or 150 mg/kg, b.i.d., for 21 days along with a vehicle (0.5% hydoxypropylmethylcellulose, 0.1% Tween 80 in water, pH 4.8). Using calipers, the tumor volume is measured twice a week and computed. When the dosage is finished, the results are expressed as a percent inhibition, or 100[1-(average growth of the drug-treated population)/(average growth of the vehicle-treated control population)]. In statistical analysis, the two-tailed t test is employed.
Pharmacokinetic Studies[1]
All studies were conducted after review by the Institutional Animal Care and Use Committee at GSK and in accordance with the GSK Policy on the Care, Welfare and Treatment of Laboratory Animals. Pharmacokinetics were studied in male Sprague–Dawley rats, male beagle dogs, and/or male CD-1 mice following single intravenous and/or oral administration. Absolute oral bioavailability was estimated using a crossover study design (n of 2 or 3), unless otherwise indicated. Blood samples were assayed using protein precipitation followed by LC/MS/MS analysis, and the resulting concentration–time data were analyzed by noncompartmental methods (WinNonlin Professional, version 4.1).[1]
BxPC3 Human Pancreatic Xenograft Model[1]
All studies were conducted after review by the Institutional Animal Care and Use Committee at GSK and in accordance with the GSK Policy on the Care, Welfare and Treatment of Laboratory Animals. Exponentially growing BxPC3 tumor cells (10 × 106 cells/mouse) from cell culture were implanted subcutaneously into the right flank of female nude mice (Charles River). Sixteen days after implantation, mice with ∼200 mm3 tumors were randomized into various treatment groups (n = 8 mice/group). Animals were orally treated with vehicle (0.5% hydoxypropylmethylcellulose, 0.1% Tween 80 in water, pH 4.8), compound 38 at 50 or 150 mg/kg, b.i.d. for 21 days. Tumor volume was measured twice weekly with calipers and calculated using the following equation: tumor volume (mm3) = (length × width)2/2. Results are represented as percent inhibition on completion of dosing, which is 100[1 – (average growth of drug-treated population)/(average growth of vehicle-treated control population)]. Statistical analysis was performed using a two-tailed t test.
参考文献

[1]. Discovery of 7-methyl-5-(1-{[3-(trifluoromethyl)phenyl]acetyl}-2,3-dihydro-1H-indol-5-yl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine (GSK2606414), a potent and selective first-in-class inhibitor of protein kinase R (PKR)-like endoplasmic reticulu.

[2]. Inhibiting the Plasmodium eIF2α Kinase PK4 Prevents Artemisinin-Induced Latency. Cell Host Microbe. 2017 Dec 13;22(6):766-776.e4.

其他信息
See also: Gsk2606414 (annotation moved to).
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C24H20F3N5O
分子量
451.44
精确质量
451.161
元素分析
C, 63.85; H, 4.47; F, 12.63; N, 15.51; O, 3.54
CAS号
1337531-36-8
相关CAS号
1337531-36-8
PubChem CID
53469448
外观&性状
white solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
720.3±60.0 °C at 760 mmHg
闪点
389.4±32.9 °C
蒸汽压
0.0±2.3 mmHg at 25°C
折射率
1.668
LogP
4.53
tPSA
77.04
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
7
可旋转键数目(RBC)
3
重原子数目
33
分子复杂度/Complexity
721
定义原子立体中心数目
0
SMILES
FC(C1=C([H])C([H])=C([H])C(=C1[H])C([H])([H])C(N1C2C([H])=C([H])C(C3=C([H])N(C([H])([H])[H])C4C3=C(N([H])[H])N=C([H])N=4)=C([H])C=2C([H])([H])C1([H])[H])=O)(F)F
InChi Key
SIXVRXARNAVBTC-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C24H20F3N5O/c1-31-12-18(21-22(28)29-13-30-23(21)31)15-5-6-19-16(11-15)7-8-32(19)20(33)10-14-3-2-4-17(9-14)24(25,26)27/h2-6,9,11-13H,7-8,10H2,1H3,(H2,28,29,30)
化学名
1-[5-(4-amino-7-methylpyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl)-2,3-dihydroindol-1-yl]-2-[3-(trifluoromethyl)phenyl]ethanone
别名
GSK PERK Inhibitor; GSK2606414; GSK-2606414; GSK 2606414
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: 本产品在运输和储存过程中需避光。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~90 mg/mL (~199.4 mM)
Water: <1 mg/mL (slightly soluble or insoluble)
Ethanol: ~19 mg/mL (~42.1 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.54 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (5.54 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.54 mM) (饱和度未知) in 5% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 50% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。


配方 4 中的溶解度: in 5% DMSO+45% PEG 300+ddH2O: 20mg/mL

配方 5 中的溶解度: 3.33 mg/mL (7.38 mM) in 0.5% HPMC 0.2%Tween80 (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2151 mL 11.0757 mL 22.1513 mL
5 mM 0.4430 mL 2.2151 mL 4.4303 mL
10 mM 0.2215 mL 1.1076 mL 2.2151 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
+
+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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