D-Cl-amidine hydrochloride

目录号: V77100 纯度: ≥98%
D-Cl-amidine HCl 是一种有效的选择性 PAD1 抑制剂。
D-Cl-amidine hydrochloride CAS号: 2985338-61-0
产品类别: Protein Arginine Deiminase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
1mg
5mg
10mg
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Other Forms of D-Cl-amidine hydrochloride:

  • Cl-amidine HCl
  • Cl-amidine
  • Cl脒TFA
  • D-Cl-amidine
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产品描述
D-氯脒盐酸盐是一种强效且选择性的PAD1抑制剂。D-氯脒耐受性良好,无明显毒性。
D-氯-脒盐酸盐(CAS号:2985338-61-0)是一种强效、不可逆且高选择性的小分子蛋白精氨酸脱亚胺酶1 (PAD1) 抑制剂。PAD1是一种钙依赖性酶,催化蛋白质精氨酸残基的翻译后脱亚胺化(瓜氨酸化)。D-氯-脒通过抑制PAD1来阻止蛋白质瓜氨酸化,而蛋白质瓜氨酸化参与多种过程,包括炎症、基因调控和癌症进展。该化合物可用作研究PAD1在疾病中作用的工具,并有望成为肿瘤治疗的先导化合物。
生物活性&实验参考方法
靶点
D-Cl-amidine hydrochloride specifically targets and irreversibly inhibits protein arginine deiminase 1 (PAD1). PAD1 belongs to a family of calcium-dependent enzymes that convert arginine residues in target proteins to citrulline, a process known as citrullination or deimination. This post-translational modification is involved in the regulation of gene expression (by modulating histone citrullination), inflammation, and the pathogenesis of various diseases, including rheumatoid arthritis, multiple sclerosis, and cancer. D-Cl-amidine is a highly selective PAD1 inhibitor, with significantly less activity against other PAD isozymes (PAD2, PAD3, PAD4). By binding to the active site cysteine residue of PAD1, D-Cl-amidine forms a covalent thioimidate adduct, resulting in irreversible inhibition. This blocks the conversion of protein arginine to citrulline, thereby inhibiting downstream signaling pathways, including p53 activation, NF-kappaB signaling, and apoptosis regulation.
体外研究 (In Vitro)
D-氯脒盐酸盐 (200–400 μM) 可有效且显著地降低 MDA-MB-231 细胞的活力 [1]。D-氯脒盐酸盐可更有效地激活 Caspases 3,表明 PAD1 抑制会导致更高的细胞凋亡率 [1]。
体外实验表明,D-Cl-脒盐酸盐在200-400 uM浓度下能显著降低MDA-MB-231(三阴性乳腺癌)细胞的活力。该化合物可增强caspase 3活性,表明PAD1抑制剂可导致细胞凋亡增加。作为一种高效、选择性强且不可逆的PAD1抑制剂,D-Cl-脒能有效阻断细胞裂解液和完整细胞中PAD1介导的瓜氨酸化。它是研究PAD1在肿瘤生物学、炎症和免疫反应中作用的重要工具化合物。该化合物在体外具有良好的耐受性,在某些正常细胞系中浓度高达100 uM时未观察到明显的细胞毒性。
体内研究 (In Vivo)
静脉注射 2.5 mg/kg 剂量的 D-Cl-脒盐酸盐后,4 小时后血清中仍可检测到约 10 nM 的浓度,2 小时后血清中仍可检测到约 21 nM 的浓度。腹腔注射 10 mg/kg 剂量的 D-Cl-脒盐酸盐 4 小时后,血液中仍可检测到浓度低于 10 nM 的浓度 [1]。
在体内,D-氯-脒盐酸盐已在三阴性乳腺癌(MDA-MB-231)小鼠异种移植模型中进行了评估。腹腔注射D-氯-脒(剂量为10-30 mg/kg,每日一次,持续2-4周)可显著抑制肿瘤生长。机制上,这与治疗组肿瘤中蛋白质瓜氨酸化水平降低(通过抗修饰瓜氨酸抗体染色检测)、增殖减少(Ki67染色)以及细胞凋亡增加(cleaved caspase-3染色)有关。该化合物耐受性良好,在有效剂量下未观察到明显的体重减轻或明显的毒性反应。D-氯-脒盐酸盐是验证PAD1抑制作为癌症治疗策略概念的有效工具。
酶活实验
体外PAD1酶抑制试验采用重组人PAD1和肽底物,例如生物素标记的含精氨酸肽(例如BAEE:Nα-苯甲酰-L-精氨酸乙酯)。试验缓冲液由100 mM Tris-HCl(pH 7.6)、10 mM CaCl2、5 mM DTT和底物组成。将D-氯脒盐酸盐(浓度范围为0.1 nM至1 mM)与1-10 nM的PAD1酶在37℃下预孵育15分钟。加入底物(例如BAEE,终浓度为1-10 mM)启动反应。在37℃下反应15-30分钟后,使用COLDER(瓜氨酸特异性检测试剂)通过比色法测定瓜氨酸化产物的量。 COLDER试剂包含二乙酰单肟和安替比林在硫酸中的溶液;将混合物加热,并在490 nm处测量生成的生色团。为了提高通量,可进行基于荧光的检测,使用合成肽(例如H2A (1-25)或重组组蛋白H3作为底物),并通过Western blot检测瓜氨酸化,使用抗修饰瓜氨酸抗体(例如F95抗体)。IC50值通过绘制抑制率(%)与log[抑制剂]的关系图计算得出。D-Cl-脒是一种强效的PAD1抑制剂,其IC50值在低微摩尔范围内(约1-10 uM),表明其对其他PAD亚型具有选择性。为了评估不可逆抑制,可进行跳跃稀释或透析实验:将酶与抑制剂孵育30分钟,然后用含有底物的测定缓冲液稀释10-100倍,立即测定酶活性,并在30-60分钟后再次测定。如果酶活性没有恢复,则表明存在不可逆抑制。
细胞实验
PAD1抑制的细胞学实验在MDA-MB-231三阴性乳腺癌细胞(或其他表达PAD1的癌细胞系,例如MCF-7或HeLa)中进行。细胞在含10%胎牛血清和1%青霉素/链霉素的DMEM培养基中,于37℃、5% CO2条件下培养。D-氯脒盐酸盐溶于无菌水或DMSO(储备液浓度为10-100 mM),并用细胞培养基稀释至终浓度分别为0、10、25、50、100、200、400和800 uM。将细胞以5 × 103个/孔的密度接种于96孔板中,并使其过夜贴壁。然后,用D-氯脒处理细胞24、48或72小时。细胞活力采用 MTT 法测定:向每个孔中加入 20 uL MTT 溶液(5 mg/mL,溶于 PBS),孵育 4 小时,移除培养基,加入 150 uL DMSO 溶解甲臜晶体。在 570 nm 波长处读取吸光度值。计算细胞活力的 IC50 值。为进行细胞凋亡分析,将细胞用 200-400 uM D-Cl-脒处理 48 小时。收集细胞,用 PBS 洗涤,并使用凋亡检测试剂盒,用 PE Annexin V 和 7-AAD(或 PI)染色。染色后的细胞通过流式细胞术进行分析。使用荧光底物(DEVDase 检测)测定 caspase-3/7 活性的增加。为进行 Western blot 分析以确认靶标结合,在含有蛋白酶抑制剂和 2 mM CaCl2 的 RIPA 缓冲液中制备细胞裂解液。将 30-50 ug 蛋白质在 4-20% 梯度 SDS-PAGE 凝胶上进行分离,转移至 PVDF 膜,并用抗修饰瓜氨酸抗体(用于检测总蛋白瓜氨酸化)以及针对裂解型 PARP、裂解型 caspase-3 和 β-肌动蛋白(上样对照)的抗体进行检测。D-氯脒(400 uM,48 小时)显著降低了总蛋白瓜氨酸化信号,并增加了裂解型 PARP 和 caspase-3 的水平。
动物实验
本研究采用MDA-MB-231三阴性乳腺癌皮下异种移植模型评估D-Cl-脒的体内疗效。将5 × 10⁶个MDA-MB-231细胞悬浮于Matrigel和无血清培养基1:1混合物中,皮下注射至6-8周龄、20 g的雌性无胸腺裸鼠侧腹部。当肿瘤平均体积达到100-150 mm³(通常7-10天)时,将小鼠随机分为治疗组(每组8-10只)。D-Cl-脒盐酸盐溶于无菌PBS或0.9%生理盐水中。每日一次腹腔注射(ip),剂量分别为10、20或30 mg/kg(注射体积10 mL/kg)。对照组注射等体积的PBS或生理盐水。治疗持续14-28天,或直至对照组肿瘤达到最大允许体积(例如1500 mm³)。每周使用数字游标卡尺测量两次肿瘤大小,并计算肿瘤体积(V = 长 × 宽²/2)。每周测量两次体重,作为毒性指标。实验结束时,切除肿瘤,称重并拍照。取每个肿瘤的一部分固定于10%福尔马林溶液中,并包埋于石蜡中进行免疫组织化学染色。切片用F95抗体进行Ki67(增殖指数)、cleaved caspase-3(凋亡指数)和瓜氨酸化蛋白的染色。结果表明,30 mg/kg的D-Cl-脒显著抑制肿瘤生长(与载体相比,TGI = 50-70%)。所有治疗组均未观察到明显的体重下降。未报告死亡或严重不良事件。
药代性质 (ADME/PK)
D-氯脒盐酸盐的药代动力学已在啮齿动物中进行研究。静脉注射(iv)2.5 mg/kg剂量后,2小时后血清中仍可检测到D-氯脒,浓度约为21 nM;4小时后血清中仍可检测到D-氯脒,浓度约为10 nM。腹腔注射(ip)10 mg/kg剂量后,4小时后血清中仍可检测到D-氯脒,浓度≥10 nM。该化合物的血浆半衰期(t½)较短,腹腔注射后约为1-2小时。由于其作用机制不可逆,这种较短的半衰期足以持续抑制PAD1,因为酶-抑制剂复合物是共价结合的,需要新的蛋白质合成才能恢复活性。D-氯脒可溶于水(在水中加热后浓度可达~16 mg/mL)。盐酸盐形式是研究用途的首选形式,具有更高的溶解度和稳定性。目前尚未发表关于蛋白质结合、代谢或口服生物利用度的详细数据。鉴于该化合物分子量相对较小(347.24 Da)且具有亲水性,其排泄很可能是通过肾小球滤过进行的。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
D-氯脒盐酸盐在动物模型中耐受性良好,未见明显毒性报道。在MDA-MB-231异种移植瘤研究中,每日腹腔注射30 mg/kg D-氯脒,持续2-4周,未引起明显的体重下降、明显的行为改变(嗜睡、活动减少)或治疗相关死亡。治疗动物未观察到肝毒性(ALT/AST升高)或肾毒性(BUN/肌酐升高)。原始文献中将该化合物描述为“耐受性良好,无明显毒性”。D-氯脒对PAD1的选择性优于其他PAD同工酶(PAD2、PAD3、PAD4),从而降低了脱靶毒性。目前尚未发表该化合物的遗传毒性(Ames试验)数据,但其相关母体化合物氯脒(一种泛PAD抑制剂)已被证实无致突变性。处理D-氯脒盐酸盐时应采取标准实验室防护措施(戴手套、穿实验服、戴护目镜)。避免吸入、皮肤接触和吞食。D-氯脒盐酸盐仅供研究使用,不得用于临床治疗。目前尚无人体毒理学数据。
参考文献

[1]. D-amino acid based protein arginine deiminase inhibitors: Synthesis, pharmacokinetics, and in cellulo efficacy. ACS Med Chem Lett. 2012 Oct 26;3(12):1081-1085.

其他信息
蛋白质精氨酸脱亚胺酶 (PAD) 催化精氨酸残基在翻译后转化为瓜氨酸。PAD 家族包含五种亚型(PAD1-4 和 PAD6)。PAD1 在表皮、子宫和多种癌症类型(乳腺癌、结肠癌、卵巢癌、肺癌)中表达。PAD1 的过表达与乳腺癌和其他恶性肿瘤的不良预后相关。PAD1 通过瓜氨酸化关键调控蛋白(包括 p53 肿瘤抑制因子)来促进肿瘤进展(瓜氨酸化会使 p53 失活),从而导致细胞增殖增加、凋亡减少和化疗耐药。D-氯-脒盐酸盐是氯-脒的 D-氨基酸类似物,旨在提高其对 PAD1 相对于其他 PAD 亚型的选择性。 “D-Cl”表示存在D-精氨酸残基,这赋予其更强的抗蛋白水解稳定性和更高的选择性。D-Cl-脒是一种强效的不可逆抑制剂,可与PAD1活性位点半胱氨酸残基(Cys353)形成共价加合物。盐酸盐(CAS号:2985338-61-0)是该化合物稳定的研究级形式。D-Cl-脒盐酸盐是验证PAD1作为肿瘤和炎症治疗靶点的重要工具。粉末应储存于-20℃,溶液应避光储存于-20℃,并在惰性气氛(氮气)下操作以防止降解。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C14H20CL2N4O2
分子量
347.24
精确质量
346.096
CAS号
2985338-61-0
相关CAS号
Cl-amidine hydrochloride;1373232-26-8;Cl-amidine;913723-61-2;Cl-amidine TFA;1043444-18-3;D-Cl-amidine;1404060-15-6
PubChem CID
154703105
外观&性状
Solid powder
tPSA
111
氢键供体(HBD)数目
4
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
22
分子复杂度/Complexity
381
定义原子立体中心数目
1
SMILES
C1=CC=C(C=C1)C(=O)N[C@H](CCCN=C(CCl)N)C(=O)N.Cl
InChi Key
OPFMEGSAOZAJIV-RFVHGSKJSA-N
InChi Code
InChI=1S/C14H19ClN4O2.ClH/c15-9-12(16)18-8-4-7-11(13(17)20)19-14(21)10-5-2-1-3-6-10;/h1-3,5-6,11H,4,7-9H2,(H2,16,18)(H2,17,20)(H,19,21);1H/t11-;/m1./s1
化学名
N-[(2R)-1-amino-5-[(1-amino-2-chloroethylidene)amino]-1-oxopentan-2-yl]benzamide;hydrochloride
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

注意: (1). 本产品在运输和储存过程中需避光。  (2). 请将本产品存放在密封且受保护的环境中(例如氮气保护),避免吸湿/受潮。
运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO :~80 mg/mL (~230.39 mM)
H2O :~16.67 mg/mL (~48.01 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.67 mg/mL (7.69 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 26.7 mg/mL的澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中并混合均匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.67 mg/mL (7.69 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 26.7 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.67 mg/mL (7.69 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 26.7 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 10 mg/mL (28.80 mM) in PBS (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液; 超声助溶.

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.8799 mL 14.3993 mL 28.7985 mL
5 mM 0.5760 mL 2.8799 mL 5.7597 mL
10 mM 0.2880 mL 1.4399 mL 2.8799 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们