Cl-amidine TFA

别名: Clamidine TFA Cl amidine TFA
目录号: V38891 纯度: ≥98%
Cl-amidine TFA 是一种口服生物活性 PAD 抑制剂(拮抗剂),对 PAD1、PAD3 和 PAD4 的 IC50 值分别为 0.8 μM、6.2 μM 和 5.9 μM。
Cl-amidine TFA CAS号: 1043444-18-3
产品类别: New2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
500mg
1g
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Other Forms of Cl-amidine TFA:

  • Cl-amidine HCl
  • Cl-amidine
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产品描述
Cl-amidine TFA 是一种口服生物活性的 PAD 抑制剂(拮抗剂),对 PAD1、PAD3 和 PAD4 的 IC50 值分别为 0.8 μM、6.2 μM 和 5.9 μM。Cl-amidine TFA 可诱导癌细胞/肿瘤细胞凋亡。Cl-amidine TFA 可诱导 miR-16(miRNA-16,microRNA-16)的表达,从而导致细胞周期阻滞。Cl-amidine TFA 可抑制组蛋白 H3 瓜氨酸化和中性粒细胞胞外陷阱 (NET) 的形成,并提高脓毒症小鼠的存活率。Cl-amidine TFA 是一种口服生物活性的肽基精氨酸脱亚胺酶 (PAD) 抑制剂。其分子式为 C16H20ClF3N4O4,分子量为 424.80。该化合物是一种卤代乙酰胺类药物,可对所有活性 PAD 同工酶产生几乎相同的抑制效果。 Cl-amidine TFA 可诱导癌细胞凋亡,并被用于炎症、免疫系统功能和癌症生物学的研究。作为三氟乙酸盐,它具有更高的溶解度和稳定性,适用于生物测定。该化合物纯度高达 98%,可用于科研应用。
生物活性&实验参考方法
靶点
Cl-amidine TFA targets peptidylarginine deiminases (PADs), a family of calcium-dependent enzymes that catalyze the post-translational conversion of arginine residues to citrulline (citrullination). The compound inhibits PAD1, PAD3, and PAD4 with IC50 values of 0.8 μM, 6.2 μM, and 5.9 μM, respectively. PAD4 is the most extensively studied isoform, with an IC50 of 5.9±0.3 μM. By inhibiting PADs, Cl-amidine TFA blocks protein citrullination, which plays critical roles in inflammation, autoimmune diseases, and cancer. The compound’s mechanism involves covalent modification of the active site cysteine residue of PAD enzymes.
体外研究 (In Vitro)
Cl-amidine 是一种生物利用度高的卤代乙酰胺类药物,能够以几乎相同的效力抑制所有活性 PAD 同工酶(PAD4 的 kinact/KI=13,000 M-1·min-1)[1]。TK6 淋巴母细胞和 HT29 结肠癌细胞在 Cl-amidine(0、5、10、15、20、25、50 μg/mL,24 h)作用下均发生剂量依赖性凋亡。值得注意的是,Cl-amidine 诱导的凋亡并不能完全杀死结肠癌细胞系 HT29 [2]。PAD 的酶活性依赖于活性位点的半胱氨酸,而氯尼定可对该半胱氨酸进行共价修饰,使 PAD 永久失活 [4]。Cl-amidine TFA 作为一种 PAD 抑制剂,在体外表现出强效活性。它对所有活性PAD同工酶的抑制效力几乎相同(PAD4的kinact/KI=13,000 M-1·min-1)。该化合物可诱导癌细胞和肿瘤细胞凋亡。在细胞实验中,Cl-amidine TFA可抑制组蛋白H3瓜氨酸化和中性粒细胞胞外陷阱(NET)的形成。研究表明,它能抑制小鼠结肠炎模型,并提高小鼠脓毒症模型的存活率。这些体外活性证实了其作为炎症性疾病、自身免疫性疾病以及癌症治疗药物的潜力。
体内研究 (In Vivo)
Cl-amidine(75 mg/kg,腹腔注射,每日一次)可预防和治疗DSS诱导的小鼠结肠炎[2]。可乐定(5、25、75 mg/kg,灌胃,每日一次)可剂量依赖性地显著降低组织学评分[2]。Cl-amidine TFA的体内活性已在炎症性疾病动物模型中得到证实。该化合物可抑制小鼠结肠炎,表明其对胃肠道炎症有效。在小鼠脓毒症模型中,Cl-amidine TFA可提高存活率,提示其对全身炎症具有保护作用。该化合物可口服,便于临床前研究给药。其在体内抑制组蛋白H3瓜氨酸化和中性粒细胞胞外陷阱(NET)形成的能力支持了其作用机制和治疗潜力。进一步的研究已探索了其在各种炎症和自身免疫性疾病模型中的作用。
酶活实验
氯脒三氟乙酸 (Cl-amidine TFA) 的体外酶活性测定包括测量其对 PAD 酶活性的抑制作用。这些测定通常使用重组 PAD1、PAD3 或 PAD4 以及荧光或比色底物。将酶与底物和不同浓度的化合物一起孵育。通过测量底物转化率的降低来确定 IC50 值。计算抑制动力学 (kinact/KI) 以表征共价抑制机制。这些测定证实了该化合物对 PAD 同工酶的效力和选择性。
细胞实验
细胞凋亡分析[2]。
细胞类型:TK6淋巴母细胞和HT29结肠癌细胞。
测试浓度:0、5、10、15、20、25、50 μg/mL。
孵育时间:24小时。
实验结果:细胞凋亡的诱导呈剂量依赖性。
在包括癌细胞和免疫细胞在内的多种细胞类型中进行了Cl-amidine TFA的体外细胞实验。用不同浓度的化合物处理细胞,并使用抗瓜氨酸抗体通过Western blot检测蛋白质瓜氨酸化。通过Annexin V染色、caspase活性测定或PARP裂解来评估细胞凋亡。在中性粒细胞中检测中性粒细胞胞外陷阱(NET)的形成。通过ELISA或qPCR检测细胞因子生成和炎症标志物。这些检测方法可以表征该化合物的细胞效应及其作为PAD抑制剂的作用机制。
动物实验
动物/疾病模型: C57BL/6 小鼠(8-12 周龄,DSS 结肠炎小鼠模型)[2]。
剂量: 75 mg/kg。给药途径:腹腔注射,每日一次。
实验结果: 体内抑制 PAD 活性、蛋白质瓜氨酸化和结肠中 PAD 水平。
动物/疾病模型: C57BL/6 小鼠(8-12 周龄,DSS 结肠炎小鼠模型)[2]。
剂量: 5、25、75 mg/kg。
给药途径: 灌胃,每日一次。
实验结果: 组织学评分显著降低。
在啮齿动物炎症疾病模型中进行了Cl-amidine TFA的体内动物实验。结肠炎模型用于评估该化合物在胃肠道炎症中的疗效。脓毒症模型用于评估其生存获益。该化合物以不同剂量口服或注射给药。终点指标包括疾病严重程度评分、组织学分析和炎症标志物测量。通过评估组织中的蛋白质瓜氨酸化来确认靶点结合情况。这些研究确定了该化合物的体内疗效及其治疗炎症和自身免疫性疾病的潜力。
药代性质 (ADME/PK)
Cl-amidine TFA 的药代动力学数据表明,该化合物具有口服活性和生物利用度。其分子量为 424.80,可溶于 DMSO。临床前研究已对该化合物的吸收、分布、代谢和排泄 (ADME) 特性进行了表征。其良好的口服生物利用度使其在动物模型中易于给药。该化合物通常储存于 -20°C,在推荐条件下稳定。更多详细的药代动力学研究可参见相关文献。
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
Cl-amidine TFA 已在临床前研究中进行了安全性评估。该化合物在治疗剂量下通常耐受性良好。在动物模型中,有效剂量下给药未见明显不良反应。然而,尚未有大量文献发表全面的毒理学评估。该化合物仅供研究使用,尚未获准用于人体治疗。处理该化合物时应遵循标准的实验室安全预防措施。任何潜在的临床开发都需要进一步的毒性研究支持。
参考文献

[1]. Inhibitors and Inactivators of Protein Arginine Deiminase 4: Functional and Structural Characterization. Biochemistry. 2006 Oct 3; 45(39): 11727–11736.

[2]. Suppression of colitis in mice by Cl-amidine: a novel peptidylarginine deiminase inhibitor. Am J Physiol Gastrointest Liver Physiol. 2011 Jun;300(6):G929-38.

[3]. Molecular targeting of protein arginine deiminases to suppress colitis and prevent colon cancer. Oncotarget. 2015 Nov 3;6(34):36053-62.

[4]. Cl-Amidine Prevents Histone 3 Citrullination and Neutrophil Extracellular Trap Formation, and Improves Survival in a Murine Sepsis Model. J Innate Immun. 2017;9(1):22-32.

[5]. Substrate Specificity and Kinetic Studies of PADs 1, 3, and 4 Identify Potent and Selective Inhibitors of Protein Arginine Deiminase 3. Biochemistry. 2010 Jun 15;49(23):4852-63.

其他信息
Cl-amidine TFA 是一种强效的口服活性肽基精氨酸脱亚胺酶 (PAD) 抑制剂。它对 PAD1、PAD3 和 PAD4 的抑制 IC50 值分别为 0.8 μM、6.2 μM 和 5.9 μM。该化合物可诱导癌细胞凋亡,并抑制组蛋白 H3 瓜氨酸化和中性粒细胞胞外陷阱 (NET) 的形成。它已被证实能有效抑制结肠炎并提高脓毒症模型中的生存率。Cl-amidine TFA 又名 (2S)-5-(2-氯乙酰胺基)-2-(苯基甲酰胺基)戊酰胺三氟乙酸盐。它以高纯度 (98%) 供应,可用于炎症、免疫学和癌症生物学等领域的研究。
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C₁₆H₂₀CLF₃N₄O₄
分子量
424.80
精确质量
424.112
CAS号
1043444-18-3
相关CAS号
Cl-amidine hydrochloride;1373232-26-8;D-Cl-amidine hydrochloride;Cl-amidine;913723-61-2
PubChem CID
57402549
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
tPSA
148
氢键供体(HBD)数目
4
氢键受体(HBA)数目
8
可旋转键数目(RBC)
8
重原子数目
28
分子复杂度/Complexity
465
定义原子立体中心数目
1
SMILES
ClC/C(/N)=N\CCC[C@@H](C(N)=O)NC(C1C=CC=CC=1)=O.FC(C(=O)O)(F)F
InChi Key
WUSNMVYWOLUWDD-MERQFXBCSA-N
InChi Code
InChI=1S/C14H19ClN4O2.C2HF3O2/c15-9-12(16)18-8-4-7-11(13(17)20)19-14(21)10-5-2-1-3-6-10;3-2(4,5)1(6)7/h1-3,5-6,11H,4,7-9H2,(H2,16,18)(H2,17,20)(H,19,21);(H,6,7)/t11-;/m0./s1
化学名
N-[(2S)-1-amino-5-[(1-amino-2-chloroethylidene)amino]-1-oxopentan-2-yl]benzamide;2,2,2-trifluoroacetic acid
别名
Clamidine TFA Cl amidine TFA
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.3540 mL 11.7702 mL 23.5405 mL
5 mM 0.4708 mL 2.3540 mL 4.7081 mL
10 mM 0.2354 mL 1.1770 mL 2.3540 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

联系我们