ML240

别名: ML240; ML 240; ML-240
目录号: V4007 纯度: ≥98%
ML240 是一种新型有效的 p97 抑制剂,可抑制 p97 ATP 酶,IC50 值为 100 nM。
ML240 CAS号: 1346527-98-7
产品类别: p97
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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纯度: ≥98%

产品描述
ML240 是一种新型有效的 p97 抑制剂,可抑制 p97 ATP 酶,IC50 值为 100 nM。 ML240 抑制双报告细胞系中 p97 依赖性蛋白酶体底物的降解,但不抑制 p97 独立蛋白酶体底物的降解。 ML240 还损害内质网相关降解 (ERAD) 途径。 AAA ATPase p97 是维持真核细胞蛋白质稳态的关键因素,其在促进蛋白酶体降解泛素化蛋白质和自噬体成熟中发挥作用。 ML241具有治疗癌症的潜力。
生物活性&实验参考方法
靶点
p97 ATPase ( IC50 = 0.11 μM ); p97 ATPase ( Ki = 0.22 μMM )
ML240 has an IC50 of 100 nM, making it a strong p97 inhibitor. In the UbG76V-GFP stabilization assay, ML240 exhibits activity (IC50, 0.9 μM). ML240 has a 0.22 μM Ki value and inhibits p97 in a competitive manner in relation to ATP. Furthermore, when tested at 20 μM, ML240 inhibits by more than 50% the labeling of just three protein kinase domains: DNAPK (DNA-dependent protein kinase), JAK1 JH2 (N-terminal pseudokinase domain of JAK1), and PIP5 K3 (phosphoinositide-3 kinase family). Independent of apical caspases 8 and 9, ML240 (1.1, 3.3, 10, or 20 μM) induces executioner caspases 3 and 7 and causes cell death[1].With GI50s of 0.76 and 0.5 μM after treatment for 24 hours, and 0.54 and 0.5 μM after treatment for 72 hours, respectively, ML240 is cytotoxic to HCT15 and SW403 cells[2].
体外研究 (In Vitro)
ML240 的 IC50 为 100 nM,使其成为强效 p97 抑制剂。在 UbG76V-GFP 稳定测定中,ML240 表现出活性(IC50,0.9 μM)。 ML240 的 Ki 值为 0.22 μM,以与 ATP 竞争的方式抑制 p97。此外,在 20 μM 浓度下进行测试时,ML240 仅抑制三个蛋白激酶结构域的标记超过 50%:DNAPK(DNA 依赖性蛋白激酶)、JAK1 JH2(JAK1 的 N 端假激酶结构域)和 PIP5 K3(磷酸肌醇) -3激酶家族)。独立于顶端半胱天冬酶 8 和 9,ML240(1.1、3.3、10 或 20 μM)可诱导刽子手半胱天冬酶 3 和 7 并导致细胞死亡[1]。处理 24 小时后,GI50 分别为 0.76 和 0.5 μM,处理 24 小时后,GI50 分别为 0.76 和 0.5 μM,处理 24 小时后,GI50 分别为 0.76 和 0.5 μM,0.54 和 0.54 μM。 0.5 μM ML240分别处理72小时后,对HCT15和SW403细胞具有细胞毒性[2]。
ML240 在酶学实验中抑制 p97 ATP酶活性,IC50 为 0.11 µM。它对 ATP 呈竞争性抑制,Ki 为 0.22 µM。[1]
ML240 在基于细胞的降解实验中稳定 p97 依赖性报告蛋白 UbG76V-GFP,IC50 为 0.9 µM,表明其在细胞中具有靶向抑制作用。它对 p97 非依赖性的蛋白酶体底物 ODD-Luc 显示出超过 10 倍的选择性 (IC50 > 28 µM)。[1]
ML240 损害内质网相关降解途径,表现为 TCRα-GFP 和 CFTR 报告蛋白的积累。[1]
ML240 在几分钟内强力刺激脂化自噬标志物 LC3-II 的积累,表明其抑制自噬体成熟。[1]
ML240 在多种结肠癌细胞系中快速诱导效应 caspase 3 和 7 的激活及细胞凋亡。这种激活是 caspase 特异性的,且不依赖于起始 caspase 8 或 9。[1]
ML240 对 NCI-60 肿瘤细胞系面板显示出广泛的抗增殖活性,在 10 µM 浓度下平均生长百分比为 -30.11。与正常人乳腺上皮细胞相比,它对永生化细胞和肿瘤源性细胞的抑制作用稍强。[1]
ML240 与蛋白酶体抑制剂 MG132 在杀伤多种结肠癌细胞系中具有协同作用。[1]
ML240 快速诱导未折叠蛋白反应,表现为 ATF4 的积累。[1]
使用基于活性的蛋白质组学平台的激酶谱分析显示,在 20 µM 浓度下,ML240 仅对三种蛋白激酶的标记抑制超过 50%:PIP5K3、JAK1 JH2 假激酶结构域和 DNAPK,表明其具有高选择性。[1]
针对 43 个 CNS 相关靶点的结合亲和力筛选显示,ML240 仅对 5HT5a 受体具有显著结合 (Ki = 2.5 µM)。[1]
酶活实验
p97 ATP酶抑制实验:在含有 50 mM Tris pH 7.4、20 mM MgCl2、1 mM EDTA、0.5 mM TCEP 和 0.01% Triton X-100(防止化合物形成胶体)的 assay 缓冲液中测定 p97 ATP酶活性。通过添加检测无机磷酸盐释放的绿色试剂来测量 ATP酶活性。IC50 值通过三次重复测量确定。[1]
抑制机制研究:在不同 ATP 浓度下,在 ML240 存在时评估 ATP 水解速率。数据拟合米氏方程以推导 Ki 值,证实其对 ATP 的竞争性抑制。[1]
激酶谱分析实验:使用基于活性的蛋白质组学平台。将天然细胞裂解物与 ML240 孵育,然后加入可共价标记活性激酶结构域的广谱反应性 ATP 酰基磷酸探针。通过比较处理组与对照组的标记水平来测量抑制率。[1]
细胞实验
将 ODD-荧光素酶表达稳定的 HeLa 细胞(5000 个细胞/孔)接种到 96 孔白色实心底板上,并使其生长 16 小时。用含有 MG132 (4 μM) 的 DMEM 处理一小时后,用 100 μL PBS 清洗细胞两次。在孔中添加放线菌酮 (50 μg/mL)、ML240 和含有 2.5% FBS 的 DMEM。在每个时间间隔(70、90、120)从培养箱中取出已准备好的 4 个 96 孔板之一。 ,或 150 分钟)。每个孔可容纳 50 μL 培养基。添加荧光素(50 μL,1 mg/mL,溶于 PBS)并在室温下以 500 rpm 摇动孵育 5 分钟。 Synergy HT 酶标仪使用 0.1 ms 的积分时间来确定发光强度[2]。
UbG76V-GFP 和 ODD-Luc 降解实验:使用稳定表达 p97 依赖性 UbG76V-GFP 和 p97 非依赖性 ODD-Luc 的双报告基因 HeLa 细胞系。用化合物处理细胞,测量报告蛋白的稳定情况。对于 ODD-Luc,同时进行 Western blot 分析以确认结果并非由于荧光素酶抑制引起。[1]
抗增殖/细胞活力实验:用化合物处理结肠癌细胞系 24 或 72 小时。使用测量 ATP 含量的发光法细胞活力检测试剂盒测定细胞活力。[1]
凋亡/Caspase 激活实验:用 ML240 处理细胞,使用荧光底物测量细胞裂解物中的 caspase-3/7 活性。使用泛 caspase 抑制剂 Z-VAD(OMe)FMK 验证特异性。[1]
Western Blot 通路分析:用化合物处理细胞,分离胞质和核加膜组分,通过免疫印迹分析泛素结合物、LC3-II、TCRα-GFP、CFTR、ATF4、CHOP、p21、p27、PARP 切割等标志物。[1]
ERAD 报告基因实验:用化合物处理稳定表达 TCRα-GFP 或转染 CFTR cDNA 的 HEK293 细胞。通过 Western blot 分析细胞组分中的蛋白积累。[1]
siRNA 敲低:用 p97 siRNA 或对照 siRNA 转染 U2OS 细胞 72 小时。在放线菌酮 chase 后,通过 Western blot 监测 UPS 底物的降解。[1]
药代性质 (ADME/PK)
In vitro pharmacokinetic properties were assessed.
Aqueous Solubility: ML240 showed poor solubility across pH ranges tested: 0.35 µg/mL at pH 5.0, 0.33 µg/mL at pH 6.2, and 0.27 µg/mL at pH 7.4.[1]
Parallel Artificial Membrane Permeability Assay (PAMPA): Effective permeability (Pe) values were 357 x 10-6 cm/s at pH 5.0, 628 x 10-6 cm/s at pH 6.2, and < 60.3 x 10-6 cm/s at pH 7.4.[1]
Plasma Protein Binding (PPB): ML240 was highly bound to plasma proteins: 99.53% (human, 1 µM), 99.71% (human, 10 µM), 99.73% (mouse, 1 µM), 99.63% (mouse, 10 µM).[1]
Plasma Stability (PS): ML240 was 100% stable in both human and mouse plasma after 3 hours of incubation.[1]
Hepatic Microsomal Stability (HMS): 54.2% of ML240 remained after 1 hour in human microsomes, and 0.63% remained in mouse microsomes.[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
Hepatocyte Toxicity: The LC50 of ML240 towards Fa2N-4 immortalized human hepatocytes was 8.5 µM.[1]
Plasma Protein Binding: As above, indicates high binding which may influence free drug concentration.[1]
参考文献

[1]. Structure-activity relationship study reveals ML240 and ML241 as potent and selective inhibitors of p97 ATPase. ChemMedChem, 2013 Feb, 8(2):297-312.

[2]. Selective, reversible inhibitors of the AAA ATPase p97. Probe Reports from the NIH Molecular Libraries Program. April 14, 2011.

其他信息
ML240 is a member of the class of quinazolines that is quinazoline which is substituted at positions 2, 5 and 8 by 2-amino-1H-benzimidazol-1-yl, benzylnitrilo and methoxy groups, respectively. It is a ATP-competetive inhibitor of AAA ATPase p97, also known as valosin-containing protein (VCP). It has a role as an antineoplastic agent. It is a member of quinazolines, a member of benzimidazoles, a secondary amino compound, an aromatic amine, an aromatic ether and a primary amino compound.
ML240 is a potent and selective ATP-competitive inhibitor of the AAA+ ATPase p97 (VCP). It was developed from a quinazoline scaffold via structure-activity relationship (SAR) optimization.[1]
Unlike its analog ML241, ML240 uniquely inhibits the autophagy pathway and rapidly induces apoptosis via executioner caspase-3/7 activation, independent of initiator caspases 8 and 9.[1]
The differential activity between ML240 and ML241 suggests that rapid apoptosis may be linked to simultaneous inhibition of p97 functions in both the ubiquitin-proteasome and autophagy pathways, or inhibition of a novel p97 function.[1]
ML240 is proposed as a promising chemical probe for studying p97 biology and as a starting point for developing novel cancer chemotherapeutic agents.[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C23H20N6O
分子量
396.45
精确质量
396.17
元素分析
C, 69.68; H, 5.09; N, 21.20; O, 4.04
CAS号
1346527-98-7
相关CAS号
1346527-98-7
PubChem CID
49830258
外观&性状
Light yellow to yellow solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
沸点
696.6±65.0 °C at 760 mmHg
闪点
375.1±34.3 °C
蒸汽压
0.0±2.2 mmHg at 25°C
折射率
1.718
LogP
3.75
tPSA
91.61
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
30
分子复杂度/Complexity
558
定义原子立体中心数目
0
SMILES
O(C([H])([H])[H])C1=C([H])C([H])=C([H])C2=C1N=C(N=C2N([H])C([H])([H])C1C([H])=C([H])C([H])=C([H])C=1[H])N1C(N([H])[H])=NC2=C([H])C([H])=C([H])C([H])=C12
InChi Key
NHAMBLRUUJAFOY-UHFFFAOYSA-N
InChi Code
InChI=1S/C23H20N6O/c1-30-19-13-7-10-16-20(19)27-23(28-21(16)25-14-15-8-3-2-4-9-15)29-18-12-6-5-11-17(18)26-22(29)24/h2-13H,14H2,1H3,(H2,24,26)(H,25,27,28)
化学名
2-(2-aminobenzimidazol-1-yl)-N-benzyl-8-methoxyquinazolin-4-amine
别名
ML240; ML 240; ML-240
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : 12.5~79 mg/mL ( 31.5~199.3 mM )
Ethanol : < 1 mg/mL
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: 2.5 mg/mL (6.31 mM) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浮液;超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (6.31 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (6.31 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.5224 mL 12.6119 mL 25.2239 mL
5 mM 0.5045 mL 2.5224 mL 5.0448 mL
10 mM 0.2522 mL 1.2612 mL 2.5224 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • ML240 and ML241 impair the endoplasmic-reticulum-associated degradation (ERAD) pathway, and only ML240 impairs the autophagy pathway and induces apoptosis. a) SW403 cells were treated with DMSO or compounds for 2 h. [1]. ChemMedChem, 2013 Feb, 8(2):297-312.
  • Michaelis–Menten plots for inhibition of p97 ATPase activity by a) ML240 and b) ML241. [1]. ChemMedChem, 2013 Feb, 8(2):297-312.
  • ML240 induces activation of caspases 3 and 7 and apoptosis. a) MIN and CIN colon cancer lines were treated with ML240 (1.1, 3.3, 10, or 20 μm) for 7 h prior to determination of caspase 3 and 7 activities in cell extract. [1].ChemMedChem, 2013 Feb, 8(2):297-312.
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