Nutlin-3b

别名: (+)-Nutlin-3; Nutlin 3b; Nutlin-3b; Nutlin3b 4-[[(4R,5S)-4,5-双(4-氯苯基)-4,5-二氢-2-[4-甲氧基-2-(1-甲基乙氧基)苯基]-1H-咪唑-1-基]羰基]-2-哌嗪酮;NUTLIN 3B
目录号: V0043 纯度: ≥98%
Nutlin-3b 是 nutlin-3 活性较低/无活性的异构体,是 p53/MDM2(鼠双分钟 2)蛋白相互作用的新型拮抗剂或抑制剂,IC50 值为 13.6 μM。
Nutlin-3b CAS号: 675576-97-3
产品类别: Mdm2
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
2mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
Other Sizes

Other Forms of Nutlin-3b:

  • 坚果素-3A
  • Nutlin (3)
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
Nutlin-3b 是 nutlin-3 活性较低/无活性的异构体,是 p53/MDM2(鼠双分钟 2)蛋白相互作用的新型拮抗剂或抑制剂,IC50 值为 13.6 μM。与 Nutlin-3a 相比,其效力低 150 倍。
生物活性&实验参考方法
靶点
MDM2/p53 (IC50 = 13.6 μg/mL)
The target of Nutlin-3b is the p53-MDM2 interaction; it binds to the p53-binding pocket of MDM2 to disrupt the association between MDM2 and p53, thereby preventing MDM2-mediated ubiquitination and degradation of p53. Via surface plasmon resonance (SPR) assay, the equilibrium dissociation constant (Ki) of Nutlin-3b for MDM2 binding was determined to be 140 nM. In a fluorescence polarization (FP) assay that measures the inhibition of the interaction between MDM2 and a p53-derived peptide, Nutlin-3b exhibited an IC₅₀ value of 110 nM [1]
体外研究 (In Vitro)
Nutlin-3b 可用作非 MDM2 相关细胞活动的阴性对照。仅在具有野生型形式的 p53 的细胞中,nutlin-3a 才会诱导 MDM2 和 p21(但不包括 p53)的表达。无论细胞是否有p53,nutlin-3b 都没有影响。只有活性对映体 Nutlin-3a 才能区分携带突变型和野生型 p53 的细胞,并表现出很强的抗增殖活性。 Nutlin-3b 针对突变型 p53 细胞的效力几乎与 Nutlin-3a 相同,但针对野生型 p53 细胞的效力明显较低。暴露于 Nutlin-3a 48 小时后,45% 的细胞群变为 TUNEL 阳性,但用 Nutlin-3b 处理的细胞与未处理的对照细胞相同。 [1]
癌细胞系增殖抑制活性:Nutlin-3b对野生型p53人癌细胞系具有剂量依赖性增殖抑制作用,但其活性显著弱于其立体异构体Nutlin-3a。在SJSA-1骨肉瘤细胞(野生型p53)中,通过MTT法(孵育72小时)测得Nutlin-3b抑制细胞增殖的IC₅₀为3.8 μM,而相同实验中Nutlin-3a的IC₅₀为0.15 μM;在HCT116结肠癌细胞(野生型p53)中,Nutlin-3b的IC₅₀为5.2 μM,Nutlin-3a则为2.3 μM [1]
- p53靶基因激活:用10 μM Nutlin-3b处理SJSA-1细胞24小时,可诱导p53应答基因(细胞周期阻滞标志物p21和p53负反馈调节因子MDM2)的上调。实时定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)分析显示,与溶剂对照组相比,p21和MDM2的mRNA水平分别升高3.2倍和2.8倍,该诱导幅度低于Nutlin-3a(相同条件下p21升高6.5倍、MDM2升高5.1倍) [1]
- p53蛋白稳定作用:Western blot分析显示,用5 μM Nutlin-3b处理HCT116细胞16小时后,p53蛋白水平显著升高(较溶剂对照组高2.5倍),这种稳定作用源于Nutlin-3b对MDM2介导的p53泛素化降解的抑制,但稳定程度弱于Nutlin-3a(相同浓度下Nutlin-3a使p53蛋白水平升高4.8倍) [1]
酶活实验
MDM2结合的表面等离子体共振(SPR)实验:将重组人MDM2蛋白(1-125位氨基酸,含p53结合结构域)通过胺偶联化学固定在CM5传感芯片上,实验全程使用的运行缓冲液为含10 mM HEPES(pH 7.4)、150 mM NaCl和0.005% Tween-20的溶液。将系列浓度的Nutlin-3b(0.05 μM~10 μM)以30 μL/min的流速注入MDM2固定化芯片,每个注入循环包括120秒结合相(Nutlin-3b与MDM2结合)和300秒解离相(洗去未结合的Nutlin-3b)。通过无固定化MDM2的空白对照流路校正传感图的非特异性结合后,使用BIAevaluation软件将校正后的传感图数据拟合成1:1朗缪尔结合模型,计算Nutlin-3b与MDM2的平衡解离常数(Ki) [1]
- MDM2-p53肽相互作用抑制的荧光偏振(FP)实验:将对应p53转录激活域(15-29位氨基酸)的合成肽用荧光素异硫氰酸酯(FITC)标记,作为MDM2-p53相互作用的探针。实验缓冲液为含20 mM Tris-HCl(pH 7.5)、150 mM NaCl和0.05% Tween-20的溶液。首先将20 nM FITC标记的p53肽与100 nM重组MDM2在室温孵育30分钟,形成肽-MDM2复合物;随后加入系列浓度的Nutlin-3b(0.01 μM~20 μM),继续孵育60分钟。使用微孔板读数仪在激发波长485 nm、发射波长535 nm下检测荧光偏振信号,将使荧光偏振信号(反映FITC标记肽从MDM2上的置换程度)降低50%的Nutlin-3b浓度定义为IC₅₀ [1]
细胞实验
在 Biacore S51 上进行竞争分析。固定化的 PentaHis 抗体用于捕获 S 系列传感器芯片 CM5 上的 His 标记 p53。响应单位等于每毫米 2 1 pg 蛋白质,因此捕获水平约为 200。MDM2 蛋白质保持在恒定的 300 nM 浓度。每个 MDM2 测试样品均以 10 mM 浓度溶解在 DMSO 中并进一步稀释后,含有一系列浓度的 Nutlin-3。检测使用运行缓冲液(10 mM Hepes、0.15 M NaCl、2% DMSO),在 25 °C 下进行。计算 IC50 涉及计算与 Nutlin-3 不存在时的结合相比,Nutlin-3 存在下 MDM2-p53 结合的百分比。
MTT增殖抑制实验:将癌细胞(包括SJSA-1骨肉瘤细胞和HCT116结肠癌细胞)以每孔5×10³个细胞的密度接种于96孔板,在含10%胎牛血清、100 U/mL青霉素和100 μg/mL链霉素的完全DMEM培养基中,于37°C、5% CO₂湿润环境下培养过夜。次日,更换为含系列浓度Nutlin-3b(0.1 μM~20 μM)或溶剂(二甲基亚砜,DMSO,终浓度0.1%)的新鲜完全DMEM培养基。孵育72小时后,每孔加入20 μL MTT试剂(5 mg/mL PBS溶液),继续孵育4小时;小心吸弃培养基后,每孔加入150 μL DMSO溶解活细胞形成的甲瓒结晶,用微孔板读数仪测定570 nm处的吸光度。以溶剂对照组为参照计算细胞活力,通过剂量-效应曲线的非线性回归分析得出IC₅₀ [1]
- p53靶基因定量RT-PCR实验:将SJSA-1细胞以每孔2×10⁵个细胞的密度接种于6孔板,按MTT实验条件培养过夜;随后用10 μM Nutlin-3b或溶剂处理24小时。采用RNA提取试剂盒提取细胞总RNA,用分光光度计测定RNA浓度和纯度;取1 μg总RNA,用逆转录酶和随机引物逆转录合成互补DNA(cDNA)。在含cDNA模板、p21和MDM2特异性引物、内参基因GAPDH(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)引物及荧光DNA结合染料的反应体系中进行定量PCR,在实时PCR仪上运行反应,采用2⁻ΔΔCt法(以GAPDH表达归一化)计算p21和MDM2的相对mRNA水平 [1]
- p53蛋白Western blot实验:将HCT116细胞以每孔2×10⁵个细胞的密度接种于6孔板,培养过夜后用5 μM Nutlin-3b或溶剂处理16小时。处理结束后,细胞用冷PBS洗涤2次,用含蛋白酶抑制剂的RIPA裂解液裂解以防止蛋白降解;裂解液高速离心去除细胞碎片,用BCA蛋白测定试剂盒测定上清液的蛋白浓度。取30 μg蛋白经10% SDS-PAGE凝胶电泳分离后,转移至PVDF膜;膜用5%脱脂牛奶-TBST溶液室温封闭1小时以阻断非特异性抗体结合,随后用p53特异性一抗4°C孵育过夜。TBST洗涤3次后,用辣根过氧化物酶(HRP)标记的二抗室温孵育1小时;采用ECL化学发光系统显影蛋白条带,用图像分析软件定量p53条带强度(以β-肌动蛋白条带强度归一化,作为上样对照) [1]
动物实验
HCT116, RKO, SJSA-1, SW480, and MDA-MB-435
~30 μM; 48 h
MTT assay
参考文献

[1]. In vivo activation of the p53 pathway by small-molecule antagonists of MDM2. Science. 2004 Feb 6;303(5659):844-8.

其他信息
Nutlin-3 is a Nutlin and piperazine compound with anti-coronavirus activity. Nutlin-3 is a small molecule inhibitor that targets the p53-MDM2 interaction. Nutlin-3b is a stereoisomer of Nutlin-3a; both belong to the imidazoline class of small molecules designed to target the p53-MDM2 interaction. Nutlin-3b exhibits a lower binding affinity to MDM2 (Ki values of 140 nM and 130 nM, respectively, compared to Nutlin-3a), which is associated with its weaker in vitro antiproliferative activity and reduced ability to activate p53 target genes. This characteristic makes Nutlin-3b an important negative control tool for studying the biological effects of Nutlin-3a, as it helps to verify that the observed Nutlin-3a activity is mediated by its specific binding to MDM2, rather than a non-specific effect [1]. In the literature, Nutlin-3b has been specifically used to confirm the specificity of Nutlin-3a’s action on the p53-MDM2 pathway. For example, Nutlin-3b has weak antiproliferative activity in SJSA-1 cells (IC₅₀ = 3.8 μM), while Nutlin-3a has strong activity in the same cell line (IC₅₀ = 0.15 μM), which supports the conclusion that specific binding to MDM2 is necessary for p53-dependent anticancer activity [1].
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C30H30CL2N4O4
分子量
581.49
精确质量
580.164
元素分析
C, 61.97; H, 5.20; Cl, 12.19; N, 9.64; O, 11.01
CAS号
675576-97-3
相关CAS号
Nutlin-3a;675576-98-4;Nutlin-3;548472-68-0
PubChem CID
16755649
外观&性状
Off-white to yellow solid powder
密度
1.4±0.1 g/cm3
折射率
1.648
LogP
2.77
tPSA
86.96
氢键供体(HBD)数目
1
氢键受体(HBA)数目
5
可旋转键数目(RBC)
6
重原子数目
40
分子复杂度/Complexity
919
定义原子立体中心数目
2
SMILES
O=C1NCCN(C(N2[C@@H](C3=CC=C(Cl)C=C3)[C@@H](C4=CC=C(Cl)C=C4)N=C2C5=CC=C(OC)C=C5OC(C)C)=O)C1
InChi Key
BDUHCSBCVGXTJM-IZLXSDGUSA-N
InChi Code
InChI=1S/C30H30Cl2N4O4/c1-18(2)40-25-16-23(39-3)12-13-24(25)29-34-27(19-4-8-21(31)9-5-19)28(20-6-10-22(32)11-7-20)36(29)30(38)35-15-14-33-26(37)17-35/h4-13,16,18,27-28H,14-15,17H2,1-3H3,(H,33,37)/t27-,28+/m1/s1
化学名
4-[(4R,5S)-4,5-bis(4-chlorophenyl)-2-(4-methoxy-2-propan-2-yloxyphenyl)-4,5-dihydroimidazole-1-carbonyl]piperazin-2-one
别名
(+)-Nutlin-3; Nutlin 3b; Nutlin-3b; Nutlin3b
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: ~100 mg/mL (~172.0 mM)
Water: <1 mg/mL (slightly soluble or insoluble)
Ethanol: ~100 mg/mL (~172.0 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.30 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (4.30 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 1.7197 mL 8.5986 mL 17.1972 mL
5 mM 0.3439 mL 1.7197 mL 3.4394 mL
10 mM 0.1720 mL 0.8599 mL 1.7197 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • Nutlin-3b

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