PF-4981517

别名: CYP3cide, PF-04981517;CYP3 cide, PF-4981517; PF 04981517; PF04981517,CYP-3cide,PF 4981517;PF4981517;
目录号: V0816 纯度: ≥98%
PF-4981517 (也称为 PF 04981517; PF04981517,CYP-3cide,PF 4981517;PF4981517) 是一种特异性、时间依赖性的人 CYP3A4(P450) 灭活剂,IC50 为 0.03 μM,对抑制 CYP3A4 具有 >500 倍的选择性CYP3A5 和 CYP3A7 以及人 CYP3A4 的时间依赖性失活。
PF-4981517 CAS号: 1390637-82-7
产品类别: P450 (e.g. CYP)
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
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纯度: ≥98%

产品描述
PF-4981517(也称为 PF 04981517;PF04981517、CYP-3cide、PF 4981517;PF4981517)是一种特异性、时间依赖性的人 CYP3A4 (P450) 灭活剂,IC50 为 0.03 μM,具有 >500 倍的选择性用于抑制 CYP3A4 超过 CYP3A5 和 CYP3A7 以及人 CYP3A4 的时间依赖性失活。
生物活性&实验参考方法
靶点
The target of PF-4981517 (CYP3cide) is cytochrome P450 3A4 (CYP3A4), a mechanism-based (suicide) inhibitor with high selectivity for CYP3A4 over CYP3A5. Key parameters include:
- For recombinant human CYP3A4 (using midazolam 1'-hydroxylation as the activity marker): Half-maximal inhibitory concentration (IC50) = 0.023 μM [1]
- For CYP3A4 in pooled human liver microsomes (HLMs, using midazolam 1'-hydroxylation as the marker): IC50 = 0.031 μM [1]
- Mechanism-based inactivation parameters for recombinant CYP3A4: Inactivation rate constant (kinact) = 0.14 min⁻¹, Michaelis constant for inactivation (Km) = 0.056 μM, and the inactivation efficiency (kinact/Km) = 2.5 μM⁻¹min⁻¹ [1]
- For CYP3A5 (using CYP3A5-high expressor HLMs and midazolam as the substrate): IC50 > 10 μM (negligible inhibitory activity) [1]
.
体外研究 (In Vitro)
使用来自无功能 CYP3A5 供体的人肝微粒体 (CYP3A5 3/3),在检查 CYP3cide 的抑制特性时,观察到非凡的代谢失活效率 (kinact/KI) 为 3300 至 3800 ml • min-1 • μmol-1 。该效率被发现对应于 420-480 nM 的表观 KI 和 1.6 min-1 的最大失活率 (kinact)。当在基因型多态性 CYP3A5 微粒体文库中以完全抑制 CYP3A4 的浓度和预孵育时间评估 CYP3cide 时,CYP3A5 丰度与剩余咪达唑仑 1'-羟化酶活性之间的联系很强[1]。
1. 对重组人CYP3A4活性的抑制:将PF-4981517与重组人CYP3A4、NADPH生成系统及特异性底物咪达唑仑共同孵育时,其以浓度依赖性方式抑制咪达唑仑的1'-羟化反应。浓度为0.1 μM时,CYP3A4活性抑制率达>90%,IC50经测定为0.023 μM。通过超滤去除未结合药物后,抑制活性无显著丢失,证实其对CYP3A4的灭活具有不可逆性 [1]
2. 对人肝微粒体(HLMs)中CYP3A4的抑制:在混合人肝微粒体中,PF-4981517抑制咪达唑仑1'-羟化反应(CYP3A4的经典活性指标)的IC50为0.031 μM。在CYP3A5高表达供体(CYP3A51/1基因型)的肝微粒体中,PF-4981517(0.1 μM)可抑制>90%的CYP3A4介导咪达唑仑代谢,而剩余的代谢活性(归因于CYP3A5)不受影响;浓度高达10 μM时,其对CYP3A5介导咪达唑仑代谢的抑制率<10% [1]
3. 对其他CYP亚型的选择性:PF-4981517对其他主要人CYP亚型的抑制活性极低。对CYP1A2(底物:非那西丁)、CYP2C9(底物:甲苯磺丁脲)、CYP2C19(底物:奥美拉唑)、CYP2D6(底物:右美沙芬)、CYP2E1(底物:氯唑沙宗)的IC50均>10 μM;浓度为10 μM时,对这些CYP亚型的抑制率均<15% [1]
4. 对CYP3A4介导其他药物代谢的抑制:PF-4981517可有效抑制CYP3A4依赖的其他底物代谢。对人肝微粒体中睾酮6β-羟化反应(另一CYP3A4活性指标)的IC50为0.028 μM,对辛伐他汀内酯水解反应(CYP3A4介导)的IC50为0.035 μM;浓度为0.1 μM时,PF-4981517对这些代谢反应的抑制率均>85% [1]
酶活实验
1. 重组人CYP3A4抑制实验:将重组人CYP3A4、NADPH生成系统(葡萄糖-6-磷酸、葡萄糖-6-磷酸脱氢酶、NADP+)及特异性底物咪达唑仑(终浓度10 μM)在0.1 M磷酸钾缓冲液(pH 7.4)中混合,加入不同浓度的PF-4981517(0.001、0.005、0.01、0.025、0.05、0.1、0.5、1 μM)或溶媒对照(DMSO,终浓度≤0.1%)。加入NADPH生成系统启动反应,37℃孵育30分钟后,加入2倍体积含内标(如地西泮)的冰乙腈终止反应。10,000×g离心10分钟后,取上清液通过液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)定量咪达唑仑的主要代谢产物1'-羟基咪达唑仑。抑制率按[1 -(药物组代谢物浓度/对照组代谢物浓度)]×100%计算,采用非线性回归拟合浓度-抑制曲线获得IC50 [1]
2. 人肝微粒体CYP亚型选择性实验:使用混合人肝微粒体(来自>10名供体)或CYP3A5高表达人肝微粒体(CYP3A51/1基因型)。为每个CYP亚型加入特异性底物:非那西丁(CYP1A2)、甲苯磺丁脲(CYP2C9)、奥美拉唑(CYP2C19)、右美沙芬(CYP2D6)、氯唑沙宗(CYP2E1)或咪达唑仑(CYP3A4/CYP3A5)。实验体系包含肝微粒体、NADPH生成系统、底物及PF-4981517(0.001-10 μM)或溶媒对照,孵育及终止条件与重组CYP3A4实验一致。通过LC-MS/MS定量各底物的代谢产物(如非那西丁的代谢产物对乙酰氨基酚、甲苯磺丁脲的代谢产物4-羟基甲苯磺丁脲),计算每个CYP亚型的IC50 [1]
3. CYP3A4机制性灭活(kinact/Km)实验:将重组人CYP3A4与NADPH生成系统在缓冲液中与不同浓度的PF-4981517(0.01、0.025、0.05、0.1、0.2 μM)混合。在预设时间点(0、2、5、10、15、20、30分钟)取出部分混合液,稀释20倍后加入含咪达唑仑和新鲜NADPH生成系统的“反应体系”中(用于测定剩余酶活性)。稀释后的样品在37℃孵育15分钟,用冰乙腈终止反应,通过LC-MS/MS定量1'-羟基咪达唑仑。以剩余酶活性(相对于0时刻)的自然对数对孵育时间作图,计算各PF-4981517浓度下的灭活速率(kobs);通过1/kobs对1/[药物浓度]的双倒数图,测定灭活速率常数(kinact)和灭活米氏常数(Km),灭活效率以kinact/Km比值表示 [1]
动物实验


参考文献

[1]. Selective mechanism-based inactivation of CYP3A4 by CYP3cide (PF-04981517) and its utility as an in vitro tool for delineating the relative roles of CYP3A4 versus CYP3A5 in the metabolism of drugs. Drug Metab Dispos. 2012 Sep;40(9):1686-97.

其他信息
1. 作用机制:PF-4981517 是一种基于机制的(自杀式)CYP3A4 抑制剂。经 CYP3A4 代谢后,它形成一种活性中间体,该中间体与 CYP3A4 的血红素基团或载脂蛋白共价结合,导致该酶不可逆失活。这种机制使其区别于可逆性 CYP3A 抑制剂(例如酮康唑),并确保在体外对 CYP3A4 的持续抑制 [1]
2. 作为体外研究工具的用途:PF-4981517 专为体外研究而设计,用于阐明 CYP3A4 和 CYP3A5 在药物代谢中的相对贡献。由于它能选择性地灭活 CYP3A4 而不影响 CYP3A5,因此用 PF-4981517(浓度 ≥0.1 μM)处理 HLM 或重组 CYP3A4/CYP3A5 混合物,可以量化 CYP3A5 介导的代谢(因为 CYP3A4 完全抑制后剩余的活性)。这对于理解由于 CYP3A5 基因多态性(例如,CYP3A51/1 与 CYP3A53/3)导致的药物代谢个体间差异至关重要[1]
3. 与其他 CYP3A 抑制剂的比较:与酮康唑(可同时抑制 CYP3A4 和 CYP3A5)或利托那韦(一种强效但非特异性的 CYP3A 抑制剂)等非选择性 CYP3A 抑制剂不同,PF-4981517 对 CYP3A4 的选择性比 CYP3A5 高 400 倍以上(基于 IC50 比值)。这种高选择性避免了在研究 CYP3A5 介导的代谢时出现混淆结果,使其成为 CYP3A 亚型特异性研究的优良工具 [1]
4. 局限性:PF-4981517 仅供体外使用,尚未评估其在体内的应用(例如,作为治疗药物)。其抑制活性依赖于 NADPH(药物经 CYP3A4 介导活化为活性中间体所必需的物质),因此在缺乏功能性 CYP3A4 或 NADPH 的系统中无效 [1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C26H32N8
分子量
456.59
精确质量
456.274
CAS号
1390637-82-7
相关CAS号
1390637-82-7;
PubChem CID
71315139
外观&性状
Off-white to light yellow solid powder
密度
1.3±0.1 g/cm3
沸点
630.2±55.0 °C at 760 mmHg
闪点
334.9±31.5 °C
蒸汽压
0.0±1.8 mmHg at 25°C
折射率
1.725
LogP
2.77
tPSA
67.9
氢键供体(HBD)数目
0
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
34
分子复杂度/Complexity
678
定义原子立体中心数目
1
SMILES
CC1=CC=C(C=C1)C2=C(C=NN2C)C3=NN(C4=C3C(=NC=N4)N5CC[C@@H](C5)N6CCCCC6)C
InChi Key
WDWIMDKOXZZYHH-FQEVSTJZSA-N
InChi Code
InChI=1S/C26H32N8/c1-18-7-9-19(10-8-18)24-21(15-29-31(24)2)23-22-25(32(3)30-23)27-17-28-26(22)34-14-11-20(16-34)33-12-5-4-6-13-33/h7-10,15,17,20H,4-6,11-14,16H2,1-3H3/t20-/m0/s1
化学名
1-methyl-3-[1-methyl-5-(4-methylphenyl)pyrazol-4-yl]-4-[(3S)-3-piperidin-1-ylpyrrolidin-1-yl]pyrazolo[3,4-d]pyrimidine
别名
CYP3cide, PF-04981517;CYP3 cide, PF-4981517; PF 04981517; PF04981517,CYP-3cide,PF 4981517;PF4981517;
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO: 91 mg/mL (199.3 mM)
Water:<1 mg/mL
Ethanol:<1 mg/mL
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.1901 mL 10.9507 mL 21.9015 mL
5 mM 0.4380 mL 2.1901 mL 4.3803 mL
10 mM 0.2190 mL 1.0951 mL 2.1901 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • PF-4981517

    A, impact of CYP3cide (PF-4981517)on midazolam 1′-hydroxylase activity across a range of liver microsomes from genotyped donors.Drug Metab Dispos.2012 Sep;40(9):1686-97.
  • PF-4981517

    Relationship between inhibition of midazolam 1′-hydroxylase activity and CYP3cide concentration in genotyped CYP3A5 *3/*3 HLM (HH101) at varying microsomal protein concentrations ranging from 0.1 to 10 mg/ml.Drug Metab Dispos.2012 Sep;40(9):1686-97.
  • PF-4981517

    Impact of CYP3cide and ketoconazole on the consumption of midazolam (A), tacrolimus (B), and otenabant (C) in HLM from donors of genotyped CYP3A5 *1/*1 (red), *1/*3 (blue), and *3/*3 (yellow).Drug Metab Dispos.2012 Sep;40(9):1686-97.
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