R-GNE-140

别名: R-GNE-140; (R)-GNE-140; (R)-GNE-140; 2003234-63-5; (R)-3-((2-chlorophenyl)thio)-4-hydroxy-6-(4-morpholinophenyl)-6-(thiophen-3-yl)-5,6-dihydropyridin-2(1H)-one; (2R)-5-(2-chlorophenyl)sulfanyl-4-hydroxy-2-(4-morpholin-4-ylphenyl)-2-thiophen-3-yl-1,3-dihydropyridin-6-one; R-GNE-140; (2~{r})-5-(2-Chlorophenyl)sulfanyl-2-(4-Morpholin-4-Ylphenyl)-4-Oxidanyl-2-Thiophen-3-Yl-1,3-Dihydropyridin-6-One; inhibitor GNE-140; GNE 140; GNE140.
目录号: V4546 纯度: ≥98%
(R)-GNE-140 是 GNE-140 的 S-对映体,是一种新型有效的乳酸脱氢酶 (LDHA) 抑制剂,具有潜在的抗癌活性。
R-GNE-140 CAS号: 2003234-63-5
产品类别: Dehydrogenase
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
10 mM * 1 mL in DMSO
1mg
5mg
10mg
25mg
50mg
100mg
250mg
500mg
Other Sizes

Other Forms of R-GNE-140:

  • GNE-140 racemate
  • S-GNE-140
  • GNE-140外消旋体
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纯度/质量控制文件

纯度: ≥98%

产品描述
(R)-GNE-140 是 GNE-140 的 S-对映体,是一种新型有效的乳酸脱氢酶 (LDHA) 抑制剂,具有潜在的抗癌活性。它抑制 LDHA/B,IC50 分别为 3 nM 和 5 nM。肿瘤中的代谢重编程代表了潜在的治疗靶点。在此,我们使用 shRNA 去除和新型乳酸脱氢酶 (LDHA) 抑制剂 GNE-140 来探讨 LDHA 在体外和体内肿瘤生长中的作用。在 MIA PaCa-2 人胰腺细胞中,LDHA 抑制迅速影响整体代谢,尽管细胞死亡仅在连续 LDHA 抑制 2 天后发生。利用氧化磷酸化 (OXPHOS) 而不是糖酵解的胰腺细胞系本质上对 GNE-140 具有抗性,但可以通过 OXPHOS 抑制剂苯乙双胍重新对 GNE-140 敏感。对 GNE-140 的获得性耐药是由 AMPK-mTOR-S6K 信号通路的激活驱动的,这会导致 OXPHOS 增加,而针对该通路的抑制剂可以防止耐药性。因此,将 LDHA 抑制剂与靶向线粒体或 AMPK-S6K 信号轴的化合物相结合,不仅可以将 LDHA 抑制剂的临床用途扩大到糖酵解依赖性肿瘤之外,还可以减少对 LDHA 抑制的耐药性的出现。
生物活性&实验参考方法
靶点
LDHA (IC50 = 3 nM); LDHB (IC50 = 5 nM)
At a dose of 5 μM, (R)-GNE-140 demonstrated cell proliferation in 37 out of 347 pancreatic lineages that were evaluated. With an IC50 of 0.8 μM, (R)-GNE-140 inhibits two chondroma (bone) hexane lines expressing IDH1 dimming [1].
(R)-GNE-140 proved to possess the optimal combination of strong enzymatic and MiaPaca2 cellular potency, moderate permeability, and reduced plasma protein binding compared to other potent compounds in this series.
体外研究 (In Vitro)
在 5 μM 剂量下,(R)-GNE-140 在所评估的 347 个胰腺谱系中的 37 个中显示出细胞增殖。 (R)-GNE-140 抑制两种表达 IDH1 的软骨瘤(骨)己烷系,IC50 为 0.8 μM [1]。
与该系列中的其他强效化合物相比,(R)-GNE-140被证明具有强酶和MiaAca2细胞效力、中等渗透性和降低血浆蛋白结合的最佳组合。
R-GNE-140 在MiaPaca2胰腺癌细胞系中显示出强大的细胞活性,抑制乳酸产生的IC₅₀为 0.67 µM。[1]
在包含347种癌细胞系的广泛筛选中,R-GNE-140 在5 µM的效力阈值下,抑制了37种细胞系(11%)的增殖。两个IDH1突变型软骨肉瘤细胞系对其特别敏感,IC₅₀为 0.8 µM。[1]
体内研究 (In Vivo)
在小鼠中,(R)-GNE-140 (5 mg/kg) 表现出高生物利用度。在之前的枪模拟中,(R)-GNE-140 显示暴露量增加为 50 至 200 mg/kg。
酶活实验
体外药物治疗实验。[1]
所有细胞系均来自我们的内部组织培养细胞库(原始来源为ATCC)。通过短串联重复序列(STR)鉴定品系,并在重新扩增时进行基因分型。将细胞维持在补充有10%FBS的RPMI 1640培养基中。使用RPMI、5%FBS、100微克/毫升青霉素和100单位/毫升链霉素在384孔板中以最佳接种密度接种细胞。为每个细胞系建立最佳接种密度,以便在测定结束时达到75-80%的汇合。第二天,使用6pt剂量滴定方案用化合物29处理细胞。72小时后,使用CellTiter-Glo®发光细胞活力测定法评估细胞活力。使用四参数logistic曲线拟合计算绝对抑制浓度(IC)值。
使用生化分析法测定化合物对LDHA和LDHB的酶抑制活性。将重组人LDHA或LDHB蛋白与测试化合物、底物NADH和丙酮酸(用于正向反应)一起孵育。通过监测340 nm处吸光度的降低(对应NADH氧化为NAD⁺)来跟踪反应进程。根据剂量反应曲线计算IC₅₀值。实验至少进行两次独立运行,结果报告为几何平均值。[1]
细胞实验
GNE-140表型LDHA/B在LS174T和B16细胞系中的双重遗传破坏处理[2]
最近,Boudreau等人证明了GNE-140(一种特定的LDHA和LDHB抑制剂)在高度糖酵解的胰腺癌症细胞系(如MiaPaca2)中引起生长停滞的能力。因此,我们很好奇这种抑制剂是否能立即重新激活OXPHOS,并维持WT LS174T和B16细胞系的生存能力和生长。我们用不同浓度的GNE-140处理WT和LDHA/B-DKO细胞,结果显示,10μm的浓度(已知会破坏LDHA和B活性)降低了WT的生长,但没有降低本文报道的两种LDHA/B-DKO细胞系的生长。该长期实验(9至12天)证明了在所用浓度下该化合物没有脱靶作用。此外,我们分析了海马生物分析仪对野生型细胞进行短期GNE-140处理的代谢后果。如图6所示,8,用10μm GNE-140处理E–H,1小时足以表型观察LDHA/B-DKO细胞在抑制糖酵解和OXPHOS再激活方面的作用。因此,DLHA/B-DKO细胞的生长表型不是由遗传破坏的两个步骤中的长期生长选择引起的。这一发现基于遗传和LDHA和LDHB的特异性药理学破坏,有力地证明,在正常缺氧条件下,Warburg效应对体外肿瘤生长是可有可无的。
使用MiaPaca2细胞系的乳酸产生实验评估细胞活性。培养细胞并用测试化合物的系列稀释液处理。孵育一段时间后,对培养上清液中的乳酸水平进行定量(通常使用比色法或酶学检测方法)。确定抑制50%乳酸产生的化合物浓度(IC₅₀)。实验至少进行两次独立运行,结果报告为几何平均值。[1]
通过癌细胞系面板评估抗增殖活性。用R-GNE-140(例如,5 µM)处理细胞,并在规定时间(例如,72-96小时)后使用CellTiter-Glo等方法测量细胞活力/增殖。计算敏感细胞系的IC₅₀值。[1]
动物实验
小鼠药代动力学研究[1]
在雌性CD-1小鼠(N=3)中,评估了化合物29((R)-GNE-140)单次静脉注射(IV)1.0 mg/kg和口服(PO)5 mg/kg溶液/无定形混悬液后的药代动力学。静脉注射所用的溶剂为10/50/40 EtOH/PEG400/50mM柠檬酸盐pH3(v/v,10/50/40),口服所用的溶剂为0.5%甲基纤维素:0.2%吐温水溶液(MCT)。静脉注射组分别于给药后0.033、0.25、1、2、4和6小时采集血样。口服给药组的血样分别于给药后0.25、0.5、1、2、4和6小时采集。高剂量口服药代动力学研究(50、100和200 mg/kg)的血样分别于给药后0.25、0.5、1、2、4、6和8小时采集。血样采集后29分钟内离心,分离血浆。血浆样本储存于约-70℃,直至采用液相色谱-串联质谱法(LCMS/MS)分析化合物浓度。药代动力学参数采用WinNonlin软件的非房室模型方法测定。体内药代动力学研究在小鼠中进行。 R-GNE-140分别以1 mg/kg的剂量通过静脉注射(IV)和5、50、100和200 mg/kg的剂量通过灌胃(PO)给药。文中未描述具体的给药制剂或载体。在给药后不同时间点采集血样进行血浆浓度分析。[1]
药代性质 (ADME/PK)
(R)-GNE-140 在肝微粒体中稳定,基于人、大鼠和小鼠微粒体,其预测肝清除率 (Clp) 分别为 3.3、8.1 和 14 mL/min/kg。我们对 (R)-GNE-140 进行了小鼠体内药代动力学实验,欣喜地发现该化合物具有较低的 Clp,与预测的肝清除率一致,并且在 5 mg/kg 口服剂量下具有较高的生物利用度(表 5;浓度-时间曲线见图 S2)。在较高的口服剂量(50 至 200 mg/kg)下,(R)-GNE-140 显示出更高的暴露量(表 5 和图 S3),证实了 (R)-GNE-140 可作为小鼠体内药效研究的工具化合物。[1]
在小鼠药代动力学研究中,静脉注射 1 mg/kg 后,(R)-GNE-140 的 AUC 为 1.5 µM·h,Cₘₐₓ 为 2.5 µM,血浆清除率 (Cₗ) 与预测的肝清除率一致。[1]
口服给药后,暴露量呈剂量依赖性:5 mg/kg 口服:AUC = 5.1 µM·h,Cₘₐₓ = 1.7 µM; 50 mg/kg 口服:AUC = 125 µM·h,Cₘₐₓ = 60.7 µM;100 mg/kg 口服:AUC = 250 µM·h,Cₘₐₓ = 224 µM;200 mg/kg 口服:AUC = 403 µM·h,Cₘₐₓ = 440 µM。[1]
R-GNE-140 在小鼠体内表现出较高的口服生物利用度(口服给药后暴露量显著,但文中未计算具体的 F%)。[1]
其在微粒体中的预测肝清除率较低:人 (3.3 mL/min/kg)、大鼠 (8.1 mL/min/kg)、小鼠 (14 mL/min/kg)。[1]
该化合物在 MDCK 细胞渗透性试验中显示出中等渗透性。 [1]
小鼠血浆蛋白结合率为99.1%。[1]
LogD₇.₄值为0.6。[1]
参考文献

[1]. Cell Active Hydroxylactam Inhibitors of Human Lactate Dehydrogenase with Oral Bioavailability in Mice. ACS Med Chem Lett. 2016 Aug 26;7(10):896-901.

其他信息
一系列三取代羟基内酰胺被鉴定为人类乳酸脱氢酶A的强效酶促和细胞抑制剂。利用基于结构的设计和物理性质优化,在MiaPaca2细胞系中发现了多个乳酸IC50<10 μM的抑制剂。对该系列化合物进行优化后,得到了化合物29,它是一种强效的细胞活性分子(MiaPaca2 IC50 = 0.67 μM),并且在小鼠口服给药后也具有良好的暴露量。[1]
R-GNE-140(化合物29)是一种通过基于结构的设计发现的三取代羟基内酰胺。与之前的二酮/二氢吡喃酮骨架相比,它具有酸性较弱的羟基内酰胺核心(pKₐ ~4.1),旨在改善其理化性质。 [1]
它是一种泛LDH抑制剂,对LDHA和LDHB两种亚型均具有低纳摩尔级的抑制活性。[1]
它是首个报道的具有亚微摩尔级细胞活性(MiaPaca2 IC₅₀ = 0.67 µM)且药代动力学性质良好(小鼠体内清除率低、口服暴露量高)的LDHA抑制剂,使其成为一种合适的体内研究工具化合物。[1]
其作用机制是抑制糖酵解酶LDHA,从而阻断丙酮酸转化为乳酸的过程,而乳酸是许多癌症中观察到的瓦博格效应的关键步骤。[1]
它在部分癌细胞系中表现出选择性抗增殖活性,尤其在IDH1突变型软骨肉瘤模型中表现出显著的敏感性,提示其在代谢脆弱型肿瘤的治疗中具有潜在的应用价值。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C25H23CLN2O3S2
分子量
499.0447
精确质量
498.083
元素分析
C, 60.17; H, 4.65; Cl, 7.10; N, 5.61; O, 9.62; S, 12.85
CAS号
2003234-63-5
相关CAS号
GNE-140 racemate;1802977-61-2;(S)-GNE-140;2003234-64-6; 1809794-70-4 (racemate)
PubChem CID
121225870
外观&性状
Light yellow to yellow solid
LogP
4.8
tPSA
115Ų
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
6
可旋转键数目(RBC)
5
重原子数目
33
分子复杂度/Complexity
739
定义原子立体中心数目
1
SMILES
C1COCCN1C2=CC=C(C=C2)[C@]3(CC(=C(C(=O)N3)SC4=CC=CC=C4Cl)O)C5=CSC=C5
InChi Key
SUFXXEIVBZJOAP-RUZDIDTESA-N
InChi Code
InChI=1S/C25H23ClN2O3S2/c26-20-3-1-2-4-22(20)33-23-21(29)15-25(27-24(23)30,18-9-14-32-16-18)17-5-7-19(8-6-17)28-10-12-31-13-11-28/h1-9,14,16,29H,10-13,15H2,(H,27,30)/t25-/m1/s1
化学名
(R)-3-((2-Chlorophenyl)thio)-4-hydroxy-6-(4-morpholinophenyl)-6-(thiophen-3-yl)-5,6-dihydropyridin-2(1H)-one
别名
R-GNE-140; (R)-GNE-140; (R)-GNE-140; 2003234-63-5; (R)-3-((2-chlorophenyl)thio)-4-hydroxy-6-(4-morpholinophenyl)-6-(thiophen-3-yl)-5,6-dihydropyridin-2(1H)-one; (2R)-5-(2-chlorophenyl)sulfanyl-4-hydroxy-2-(4-morpholin-4-ylphenyl)-2-thiophen-3-yl-1,3-dihydropyridin-6-one; R-GNE-140; (2~{r})-5-(2-Chlorophenyl)sulfanyl-2-(4-Morpholin-4-Ylphenyl)-4-Oxidanyl-2-Thiophen-3-Yl-1,3-Dihydropyridin-6-One; inhibitor GNE-140; GNE 140; GNE140.
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
DMSO : ≥ 50 mg/mL (~100.19 mM)
溶解度 (体内实验)
配方 1 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.01 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 45% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入到400 μL PEG300中,混匀;然后向上述溶液中加入50 μL Tween-80,混匀;加入450 μL生理盐水定容至1 mL。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

配方 2 中的溶解度: 2.5 mg/mL (5.01 mM) in 10% DMSO + 90% (20% SBE-β-CD in Saline) (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL澄清DMSO储备液加入900 μL 20% SBE-β-CD生理盐水溶液中,混匀。
*20% SBE-β-CD 生理盐水溶液的制备(4°C,1 周):将 2 g SBE-β-CD 溶解于 10 mL 生理盐水中,得到澄清溶液。

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配方 3 中的溶解度: ≥ 2.5 mg/mL (5.01 mM) (饱和度未知) in 10% DMSO + 90% Corn Oil (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 澄清溶液。
例如,若需制备1 mL的工作液,可将 100 μL 25.0 mg/mL 澄清 DMSO 储备液加入到 900 μL 玉米油中并混合均匀。


配方 4 中的溶解度: 2.5 mg/mL (5.01 mM) in 5% DMSO + 40% PEG300 + 5% Tween80 + 50% Saline (这些助溶剂从左到右依次添加,逐一添加), 悬浊液; 超声助溶。
*生理盐水的制备:将 0.9 g 氯化钠溶解在 100 mL ddH₂O中,得到澄清溶液。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.0038 mL 10.0192 mL 20.0385 mL
5 mM 0.4008 mL 2.0038 mL 4.0077 mL
10 mM 0.2004 mL 1.0019 mL 2.0038 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
+
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+

计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

生物数据图片
  • R-GNE-140


    Overlay of previously disclosed X-ray structures of LDHA/diketone-containing inhibitor complexes 4QO7 (cyan) and 4QO8 (white).Hydrogen bonds from 4QO7 are shown as yellow dashed lines.2016 Aug 26;7(10):896-901.

  • R-GNE-140


    Compound9(cyan) cocrystallized with LDHA (white) [PDB: 5IXS]. The NADH cofactor is shown in green sticks, the crystallographic water as a red sphere, and hydrogen bonds are yellow dashed lines.2016 Aug 26;7(10):896-901.

  • R-GNE-140


    Overlay of the crystal structures29(white) [PDB: 4ZVV] and30(cyan) [PDB: 5IXY] bound to LDHA. Hydrogen bonds are shown as yellow dashed lines.2016 Aug 26;7(10):896-901.

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