2',3'-cGAMP sodium

目录号: V37554 纯度: ≥98%
2',3'-cGAMP (2'-3'-环状 GMP-AMP) 是哺乳动物细胞中发现的内源性 cGAMP 分子,它以高亲和力与 STING 结合,是干扰素-β (IFNβ) 的有效诱导剂。
2',3'-cGAMP sodium 产品类别: STING
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
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产品描述

描述:2',3'-cGAMP(2'-3'-环状GMP-AMP)是一种存在于哺乳动物细胞中的内源性cGAMP分子,它能以高亲和力与STING结合,并且是干扰素-β (IFNβ) 的强效诱导剂。它含有两个不同的磷酸二酯键,一个连接在GMP的2'-OH和AMP的5'-磷酸之间,另一个连接在AMP的3'-OH和GMP的5'-磷酸之间。2',3'-cGAMP在哺乳动物细胞中响应细胞质中的DNA而产生,它能以高亲和力与STING结合,并且是干扰素-β (IFNβ) 的强效诱导剂。


2',3'-cGAMP钠(以内源性游离酸2'3'-cGAMP的形式存在)是一种环状二核苷酸第二信使,由哺乳动物细胞在胞质DNA刺激下由cGAS产生,含有混合的2'-5'和3'-5'磷酸二酯键。它能以高亲和力与STING结合,并能有效诱导I型干扰素(如IFNβ)的产生。STING与2'3'-cGAMP结合的晶体结构揭示了配体诱导的构象重排,这可能是STING激活的基础。[1]
生物活性&实验参考方法
靶点
STING (stimulator of interferon genes); Kd of cGAS product (endogenous 2',3'-cGAMP sodium) = 4.59 nM; Kd of synthetic 2',3'-cGAMP sodium = 3.79 nM (determined by ITC competition assay).[1]
体外研究 (In Vitro)
2',3'-cGAMP 钠(cGAS 产物)在洋地黄皂苷透化的 L929 细胞中诱导 IFNβ,EC50 约为 20 nM;所有 cGAMP 异构体的 EC50 值均在 15 至 42 nM 之间,而 c-di-GMP 的 EC50 值大于 500 nM。[1]
2',3'-cGAMP 钠与 STING CTD 的结合亲和力 (Kd) 对于 cGAS 产物为 4.59 nM,对于合成的 2'3'-cGAMP 为 3.79 nM,比 c-di-GMP (Kd 1.21 μM)、3'2'-cGAMP (Kd 1.61 μM) 和 3'3'-cGAMP (Kd 1.04 μM) 低约 300 倍,比 2'2'-cGAMP (Kd 287 nM) 低约 75 倍。[1]
在 STING 突变体检测中,表达野生型人 STING 的 L929 细胞诱导了 IFNβ 的产生。响应 DNA 或 2',3'-cGAMP 钠,而 R232A 或 R232H 突变体则存在缺陷。表达野生型 STING 的 HEK293T 细胞支持 cGAS 诱导 IFNβ,但 R232A 突变体则不支持。[1]
酶活实验
采用等温滴定量热法 (ITC),使用 VP-ITC 微量热仪测定 STING CTD(残基 139-379)与 2',3'-cGAMP 钠盐或其他环状二核苷酸的结合亲和力。滴定在 20°C 下进行,缓冲液为 25 mM Hepes(pH 7.8)、150 mM NaCl。为了研究紧密结合,将化合物作为竞争物滴定到 STING-c-di-GMP 复合物中(摩尔比为 3.55:1)。进样 32 次,每次间隔 4 分钟;使用 NITPIC 积分图谱,并使用 SEDFIT 拟合曲线。[1]
使用 Q-Exactive 质谱仪进行高分辨率 MS 和 MS/MS 分析。全扫描质谱图的 m/z 范围为 300-700,分辨率为 70,000;MS/MS 谱图的分辨率为 35,000,采用数据依赖模式;在归一化碰撞能量为 30 时,HCD 碎裂的前 5 个母离子。[1]
在 30 mM NaH2PO4/Na2HPO4/D2O 缓冲液(pH 7.4)中,于 50°C 下进行 1H 和 31P 核磁共振波谱分析,以比较 cGAS 产物与合成的 cGAMP 异构体。端基质子 (H1) 单峰表明存在 3'-磷酸基团;双峰表明存在 2'-磷酸基团。[1]
使用反相高效液相色谱 (HPLC) 和圆二色谱 (CD) 分析共洗脱物并确认核糖构型。[1]
细胞实验
内源性2',3'-cGAMP钠由L929小鼠细胞或转染鲱鱼睾丸DNA(HT-DNA)的THP1人单核细胞制备。4小时后,将约3×10^7个细胞在低渗缓冲液(10 mM Tris-HCl pH 7.4,10 mM KCl,1.5 mM MgCl2)中裂解。裂解液在95°C加热5分钟,并在17,000 g下离心10分钟;上清液用0.1%甲酸/甲醇梯度在C-18柱上进行分级分离;用MS/MS分析具有峰值活性的组分。[1]
为了诱导IFNβ,将不同量的cGAMP异构体或c-di-GMP递送到经洋地黄皂苷透化的L929细胞中。 4 小时后,采用 qRT-PCR 检测 IFNβ RNA。EC50 值使用 GraphPad Prism 5.0 计算。[1]
对于 STING 功能分析,将内源性 STING 被 shRNA 敲低的 L929 细胞稳定重组野生型、R232A 或 R232H 人 STING。将细胞转染 HT-DNA 或用 2',3'-cGAMP 钠处理,然后采用 qRT-PCR 检测 IFNβ RNA;以 poly(I:C) 作为对照。将稳定表达 STING-Flag 突变体的 HEK293T 细胞(内源性 STING 和 cGAS 无法检测)转染人 cGAS 或 MAVS;24 小时后检测 IFNβ RNA。使用抗 STING 和抗 β-微管蛋白抗体进行免疫印迹分析,证实了其表达。[1]
参考文献

Zhang X, et al. Cyclic GMP-AMP containing mixed phosphodiester linkages is an endogenous high-affinity ligand for STING. Mol Cell. 2013 Jul 25;51(2):226-35.

其他信息
cGAS(环状GMP-AMP合成酶)是一种胞质DNA传感器,在DNA存在的情况下,催化ATP和GTP合成2',3'-cGAMP钠。2',3'-cGAMP钠与STING(内质网衔接蛋白)结合,激活IKK和TBK1,进而激活NF-κB和IRF3,最终导致I型干扰素的产生。[1] STING CTD(残基139-379)与cGAS产物(2',3'-cGAMP钠)结合的晶体结构已在1.88 Å分辨率下解析(空间群C2)。STING二聚体呈蝴蝶状;配体结合后,两个亚基发生内旋(臂间距约为20 Å),并在结合口袋上方形成一个新的四链反平行β折叠盖(残基219-249)。关键相互作用:鸟嘌呤碱基与Glu260、Thr263和Val239接触;GMP的游离3'-OH与Ser162接触;α-磷酸基团与Arg238(两个亚基)和Arg232(一个亚基)接触。R232A或R232H突变严重损害IFNβ的诱导,凸显了Arg232(人类常见等位基因)对STING功能的重要性。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
外观&性状
White to off-white solid powder
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
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配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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