360A

别名: 360-A 360A 360 A
目录号: V9476
360A 是一种有效的选择性 G-四链体稳定剂,它还能抑制端粒酶活性,在 TRAP-G4 测定中端粒酶的 IC50 为 300 nM。
360A CAS号: 794458-56-3
产品类别: New1
产品仅用于科学研究,不针对患者销售
规格 价格 库存 数量
5mg
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产品描述

描述: 360A 是一种高效且选择性的 G-四链体稳定剂,同时还能抑制端粒酶活性,在 TRAP-G4 检测中,其对端粒酶的 IC50 值为 300 nM。它对端粒 3' 突出端的 G-四链体结构具有很强的选择性。


生物活性&实验参考方法
靶点
Telomeric G-quadruplex (G4) structures. [1]
Telomerase (indirectly, by stabilizing G4). In vitro telomerase inhibition IC50 = 0.31 μM (measured by TRAP-G4 assay). Selectivity ratio for telomerase vs. Taq polymerase inhibition > 50-100. [1]
G-quadruplex stabilization: ΔTm > 21°C (measured by G4 FRET assay). Selectivity index for G4 over B-DNA > 50-100. [1]
体外研究 (In Vitro)
化合物 360A 可抑制端粒酶活性并稳定 G-四链体,在 TRAP-G4 测试中,其对端粒酶的 IC50 值为 300 nM。化合物 360A 可降低包括 T98G、CB193、U118-MG、SAOS-2 和原代星形胶质细胞在内的多种胶质瘤细胞系的活力,其 IC50 值分别为 4.8 ± 1.1 μM、3.9 ± 0.4 μM、8.4 ± 0.5 μM、> 15 μM 和 17.4 ± 1.2 μM[1]。 360A 会导致依赖于 DNA PKcs 的姐妹端粒融合,并产生 Rad51 依赖性的端粒异常,优先影响滞后链端粒,例如端粒丢失或端粒双联体 [2]。
在三种端粒酶阳性胶质瘤细胞系(T98G、CB193 和 U118-MG)以及 ALT 细胞系 SAOS-2 中,经数天处理后,360A 以剂量依赖的方式抑制细胞增殖并诱导大量细胞凋亡。处理 72 小时后未观察到任何作用。[1]
- 在 T98G 细胞中,1 μM 360A 处理可显著降低 G0/G1 期细胞比例,并显著增加 S 期细胞比例(从对照组的 21% 增加到 9 天后的 >55%),随后在 12 天后,亚 G1 期细胞比例(凋亡)显著增加。 [1]
- 在 CB193 细胞中,5 μM 360A 处理诱导 S 期阻滞,随后发生大量细胞凋亡,表现为亚 G1 期细胞比例增加、TUNEL 阳性细胞比例 >20%(第 11 天为 20.6%,第 14 天为 39%)以及含有裂解型 caspase-3 的细胞比例(第 11 天为 21.9%,第 14 天为 35.2%)。[1]
- 在 SAOS-2 细胞中,360A 诱导细胞凋亡,并伴有 S 期和 G2/M 期细胞比例的适度增加。[1]
- 对用 1 μM 360A 处理 7 天的 T98G 细胞进行延时视频显微镜观察,结果显示中期持续时间显著延长(部分细胞阻滞超过 500 分钟,而正常细胞分裂约为 200 分钟),且胞质分裂发生重大改变。 [1]
- 用 360A 处理 T98G 或 CB193 细胞并未诱导衰老程序(未检测到 SA-β-半乳糖苷酶阳性细胞)。[1]
- 用 1 μM 360A 持续处理 T98G 细胞导致端粒 G 突出端信号轻微但显著降低(10 天后降低 27%)。[1]
- 360A 诱导 T98G 和 CB193 细胞端粒不稳定,表现为频繁检测到双着丝粒染色体、环状染色体和后期桥。[1]
酶活实验
G-四链体稳定性测定 (G4-FRET):使用荧光共振能量转移 (FRET) 熔解测定法评估了 360A 稳定端粒 G-四链体的能力。实验采用荧光标记的端粒寡核苷酸 (F21T)。测量了加入配体后 G-四链体熔解温度的变化 (ΔTm)。360A 的 ΔTm > 21°C,表明其与 G4 结构具有强相互作用。[1]
- 端粒酶抑制测定 (TRAP-G4):使用改进的 TRAP(端粒重复序列扩增方案)测定法(称为 TRAP-G4)来测量端粒酶抑制作用。该测定法增加了一个步骤,即在 PCR 步骤中将端粒酶产物与配体孵育,以强制 G-四链体形成,从而使该测定法对 G4 配体敏感。化合物 360A 对端粒酶的抑制 IC50 值为 0.31 μM。通过比较其对端粒酶的抑制 IC50 值与对内部 Taq 聚合酶 PCR 对照的抑制 IC50 值,评估了该化合物的选择性。选择性比值大于 50-100。[1]
细胞实验
细胞活力检测(WST-1):将细胞接种于96孔板中,并用不同浓度的360A(0.1-20 μM)或DMSO对照处理,于37℃培养7天。第3天更换培养基。7天后,加入WST-1试剂,检测细胞活力/增殖情况。计算IC50值(抑制50%细胞增殖的浓度)。T98G细胞的IC50值为4.8±1.1 μM;CB193细胞的IC50值为3.9±0.4 μM;U118-MG细胞的IC50值为8.4±0.5 μM;原代星形胶质细胞的IC50值为17.4±1.2 μM;SAOS-2细胞的IC50值大于15 μM。 [1]
- 长期群体倍增实验:将细胞(5×10⁵)接种于75 cm²培养瓶中,并用360A或DMSO处理。每隔3-4天,用胰蛋白酶消化细胞,用台盼蓝染色计数以评估细胞活力,然后以5×10⁵个细胞/瓶的密度重新接种。计算随时间推移的累积群体倍增数。该实验表明,360A处理1-3周后,可降低T98G、U118-MG、CB193和SAOS-2细胞的增殖速率,并诱导细胞生长停滞和细胞死亡。[1]
- 流式细胞术细胞周期分析:将细胞(0.5-1×10⁶)固定于70%乙醇中,然后用碘化丙啶和RNase染色。采用流式细胞术分析细胞悬液,以确定处于亚G1期、G0/G1期、S期和G2/M期的细胞百分比。360A处理可诱导胶质瘤细胞系发生S期阻滞并随后发生细胞凋亡。[1]
- TUNEL凋亡检测:采用TUNEL(末端脱氧核苷酸转移酶dUTP缺口末端标记)法检测凋亡细胞。对细胞进行染色,并通过流式细胞术或荧光显微镜进行分析。每个样本至少检测200个细胞,计算TUNEL阳性细胞的百分比。360A可显著增加胶质瘤细胞系中TUNEL阳性细胞的比例(例如,CB193细胞中>20%)。 [1]
- 裂解型 caspase-3 检测:细胞经固定、透化处理后,与针对裂解型(活性)caspase-3 的兔抗体孵育。洗涤后,细胞与荧光标记的二抗孵育,并用 DAPI 复染。通过荧光显微镜测定活化 caspase-3 细胞的百分比。360A 处理增加了 CB193 培养物中裂解型 caspase-3 阳性细胞的比例(例如,第 14 天为 35.2%)。[1]
- 端粒长度分析(Southern 印迹):高分子量基因组 DNA 用 HinfI 限制性内切酶消化。消化后的 DNA 通过琼脂糖凝胶电泳分离,转移至尼龙膜,并与 32P 标记的端粒探针 (CCCTAA)4 杂交。分析平均端粒限制性片段 (TRF) 长度。在用 360A 处理的细胞中未检测到明显的端粒缩短。[1]
- 端粒 G 突出端分析(非变性杂交):将未消化的基因组 DNA (2.5 μg) 与 33P 标记的 21C 寡核苷酸探针在钠/镁缓冲液中进行杂交。将样品在含有溴化乙锭的琼脂糖凝胶上进行电泳。凝胶干燥后,扫描溴化乙锭的荧光和放射性。将相对 G 突出端信号标准化至溴化乙锭信号。用 360A 处理 10 天后,G 突出端信号下降了 27%。[1]
- 中期和后期染色体分析:制备胶质瘤细胞的中期染色体涂片,并用吉姆萨染液进行复染。将后期细胞培养在腔室载玻片上,用甲醛固定,并用吉姆萨染液染色。对染色体端粒连接(双着丝粒染色体和环状染色体)和后期桥进行计数。360A 处理诱导了这些端粒不稳定标记(例如,在 T98G 细胞中,用 1 μM 360A 处理 10 天后,55% 的中期细胞含有双着丝粒染色体)。[1]
- 延时视频显微镜:将细胞置于倒置显微镜的培养箱中,在 37°C 下培养。每 10 分钟拍摄一次相差图像,持续 18 小时。用 1 μM 360A 处理 7 天的 T98G 细胞显示出中期持续时间显著延长(>500 分钟)和胞质分裂缺陷。[1]
毒性/毒理 (Toxicokinetics/TK)
与癌细胞系相比,360A(浓度高达 20 μM)对原代人星形胶质细胞培养物的作用较弱(7 天后 IC50 = 17.4±1.2 μM),表明这些端粒酶阴性的正常细胞对该化合物的敏感性较低。[1]
- 360A 处理并未在 T98G 或 CB193 胶质瘤细胞系中诱导衰老程序(未检测到 SA-β-半乳糖苷酶阳性细胞)。[1]
参考文献

[1]. Apoptosis related to telomere instability and cell cycle alterations in human glioma cells treated by new highly selective G-quadruplex ligands. Oncogene. 2005 Apr 21;24(18):2917-28.

[2]. Rad51 and DNA-PKcs are involved in the generation of specific telomere aberrations induced by the quadruplex ligand 360A that impair mitotic cell progression and lead to cell death. Cell Mol Life Sci. 2012 Feb;69(4):629-40.

其他信息
360A 是一种 2,6-吡啶二甲酰胺衍生物,因其与端粒 G-四链体结构而非双链 DNA 具有高度选择性相互作用,以及其强效的端粒酶抑制作用而被选中。[1]
- 360A 的细胞效应(生长停滞和细胞凋亡)被认为与端粒处 G-四链体结构的稳定有关,导致端粒不稳定(染色体末端融合、后期桥)和细胞周期改变(S 期阻滞、中期延长、胞质分裂缺陷),而非整体端粒缩短。[1]
- 360A 对端粒酶阳性胶质瘤细胞和 ALT(端粒替代延长)细胞系 (SAOS-2) 均有效。 [1]
- 该化合物可诱导p53突变(例如T98G)的胶质瘤细胞系发生凋亡。[1]
- 这些基于吡啶的G-四链体配体,包括360A,被认为是治疗包括恶性胶质瘤在内的多种肿瘤的潜在药物。[1]
*注: 文献方法仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些方法的准确性
化学信息 & 存储运输条件
分子式
C27H23N5O2
分子量
449.503825426102
精确质量
449.185
CAS号
794458-56-3
相关CAS号
360A iodide;737763-37-0
PubChem CID
11430774
外观&性状
Typically exists as solid at room temperature
LogP
4
tPSA
78.8
氢键供体(HBD)数目
2
氢键受体(HBA)数目
3
可旋转键数目(RBC)
4
重原子数目
34
分子复杂度/Complexity
674
定义原子立体中心数目
0
SMILES
C[N+]1=CC(=CC2=CC=CC=C21)NC(=O)C3=NC(=CC=C3)C(=O)NC4=CC5=CC=CC=C5[N+](=C4)C
InChi Key
KPOOEJJPTYXNTN-UHFFFAOYSA-P
InChi Code
InChI=1S/C27H21N5O2/c1-31-16-20(14-18-8-3-5-12-24(18)31)28-26(33)22-10-7-11-23(30-22)27(34)29-21-15-19-9-4-6-13-25(19)32(2)17-21/h3-17H,1-2H3/p+2
化学名
3,3'-((pyridine-2,6-dicarbonyl)bis(azanediyl))bis(1-methylquinolin-1-ium) iodide (2,6-N,N′-Methyl-quinolinio-3-yl)-pyridine dicarboxamide
别名
360-A 360A 360 A
HS Tariff Code
2934.99.9001
存储方式

Powder      -20°C    3 years

                     4°C     2 years

In solvent   -80°C    6 months

                  -20°C    1 month

运输条件
Room temperature (This product is stable at ambient temperature for a few days during ordinary shipping and time spent in Customs)
溶解度数据
溶解度 (体外实验)
May dissolve in DMSO (in most cases), if not, try other solvents such as H2O, Ethanol, or DMF with a minute amount of products to avoid loss of samples
溶解度 (体内实验)
注意: 如下所列的是一些常用的体内动物实验溶解配方,主要用于溶解难溶或不溶于水的产品(水溶度<1 mg/mL)。 建议您先取少量样品进行尝试,如该配方可行,再根据实验需求增加样品量。

注射用配方
(IP/IV/IM/SC等)
注射用配方1: DMSO : Tween 80: Saline = 10 : 5 : 85 (如: 100 μL DMSO 50 μL Tween 80 850 μL Saline)
*生理盐水/Saline的制备:将0.9g氯化钠/NaCl溶解在100 mL ddH ₂ O中,得到澄清溶液。
注射用配方 2: DMSO : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL DMSO 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)
注射用配方 3: DMSO : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL DMSO 900 μL Corn oil)
示例: 注射用配方 3 (DMSO : Corn oil = 10 : 90) 为例说明, 如果要配制 1 mL 2.5 mg/mL的工作液, 您可以取 100 μL 25 mg/mL 澄清的 DMSO 储备液,加到 900 μL Corn oil/玉米油中, 混合均匀。
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注射用配方 4: DMSO : 20% SBE-β-CD in Saline = 10 : 90 [如:100 μL DMSO 900 μL (20% SBE-β-CD in Saline)]
*20% SBE-β-CD in Saline的制备(4°C,储存1周):将2g SBE-β-CD (磺丁基-β-环糊精) 溶解于10mL生理盐水中,得到澄清溶液。
注射用配方 5: 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin : Saline = 50 : 50 (如: 500 μL 2-Hydroxypropyl-β-cyclodextrin (羟丙基环胡精) 500 μL Saline)
注射用配方 6: DMSO : PEG300 : Castor oil : Saline = 5 : 10 : 20 : 65 (如: 50 μL DMSO 100 μL PEG300 200 μL Castor oil 650 μL Saline)
注射用配方 7: Ethanol : Cremophor : Saline = 10: 10 : 80 (如: 100 μL Ethanol 100 μL Cremophor 800 μL Saline)
注射用配方 8: 溶解于Cremophor/Ethanol (50 : 50), 然后用生理盐水稀释。
注射用配方 9: EtOH : Corn oil = 10 : 90 (如: 100 μL EtOH 900 μL Corn oil)
注射用配方 10: EtOH : PEG300Tween 80 : Saline = 10 : 40 : 5 : 45 (如: 100 μL EtOH 400 μL PEG300 50 μL Tween 80 450 μL Saline)


口服配方
口服配方 1: 悬浮于0.5% CMC Na (羧甲基纤维素钠)
口服配方 2: 悬浮于0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
示例: 口服配方 1 (悬浮于 0.5% CMC Na)为例说明, 如果要配制 100 mL 2.5 mg/mL 的工作液, 您可以先取0.5g CMC Na并将其溶解于100mL ddH2O中,得到0.5%CMC-Na澄清溶液;然后将250 mg待测化合物加到100 mL前述 0.5%CMC Na溶液中,得到悬浮液。
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口服配方 3: 溶解于 PEG400 (聚乙二醇400)
口服配方 4: 悬浮于0.2% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 5: 溶解于0.25% Tween 80 and 0.5% Carboxymethyl cellulose (羧甲基纤维素)
口服配方 6: 做成粉末与食物混合


注意: 以上为较为常见方法,仅供参考, InvivoChem并未独立验证这些配方的准确性。具体溶剂的选择首先应参照文献已报道溶解方法、配方或剂型,对于某些尚未有文献报道溶解方法的化合物,需通过前期实验来确定(建议先取少量样品进行尝试),包括产品的溶解情况、梯度设置、动物的耐受性等。

请根据您的实验动物和给药方式选择适当的溶解配方/方案:
1、请先配制澄清的储备液(如:用DMSO配置50 或 100 mg/mL母液(储备液));
2、取适量母液,按从左到右的顺序依次添加助溶剂,澄清后再加入下一助溶剂。以 下列配方为例说明 (注意此配方只用于说明,并不一定代表此产品 的实际溶解配方):
10% DMSO → 40% PEG300 → 5% Tween-80 → 45% ddH2O (或 saline);
假设最终工作液的体积为 1 mL, 浓度为5 mg/mL: 取 100 μL 50 mg/mL 的澄清 DMSO 储备液加到 400 μL PEG300 中,混合均匀/澄清;向上述体系中加入50 μL Tween-80,混合均匀/澄清;然后继续加入450 μL ddH2O (或 saline)定容至 1 mL;

3、溶剂前显示的百分比是指该溶剂在最终溶液/工作液中的体积所占比例;
4、 如产品在配制过程中出现沉淀/析出,可通过加热(≤50℃)或超声的方式助溶;
5、为保证最佳实验结果,工作液请现配现用!
6、如不确定怎么将母液配置成体内动物实验的工作液,请查看说明书或联系我们;
7、 以上所有助溶剂都可在 Invivochem.cn网站购买。
制备储备液 1 mg 5 mg 10 mg
1 mM 2.2247 mL 11.1235 mL 22.2469 mL
5 mM 0.4449 mL 2.2247 mL 4.4494 mL
10 mM 0.2225 mL 1.1123 mL 2.2247 mL

1、根据实验需要选择合适的溶剂配制储备液 (母液):对于大多数产品,InvivoChem推荐用DMSO配置母液 (比如:5、10、20mM或者10、20、50 mg/mL浓度),个别水溶性高的产品可直接溶于水。产品在DMSO 、水或其他溶剂中的具体溶解度详见上”溶解度 (体外)”部分;

2、如果您找不到您想要的溶解度信息,或者很难将产品溶解在溶液中,请联系我们;

3、建议使用下列计算器进行相关计算(摩尔浓度计算器、稀释计算器、分子量计算器、重组计算器等);

4、母液配好之后,将其分装到常规用量,并储存在-20°C或-80°C,尽量减少反复冻融循环。

计算器

摩尔浓度计算器可计算特定溶液所需的质量、体积/浓度,具体如下:

  • 计算制备已知体积和浓度的溶液所需的化合物的质量
  • 计算将已知质量的化合物溶解到所需浓度所需的溶液体积
  • 计算特定体积中已知质量的化合物产生的溶液的浓度
使用摩尔浓度计算器计算摩尔浓度的示例如下所示:
假如化合物的分子量为350.26 g/mol,在5mL DMSO中制备10mM储备液所需的化合物的质量是多少?
  • 在分子量(MW)框中输入350.26
  • 在“浓度”框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在“体积”框中输入5,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案17.513 mg出现在“质量”框中。以类似的方式,您可以计算体积和浓度。

稀释计算器可计算如何稀释已知浓度的储备液。例如,可以输入C1、C2和V2来计算V1,具体如下:

制备25毫升25μM溶液需要多少体积的10 mM储备溶液?
使用方程式C1V1=C2V2,其中C1=10mM,C2=25μM,V2=25 ml,V1未知:
  • 在C1框中输入10,然后选择正确的单位(mM)
  • 在C2框中输入25,然后选择正确的单位(μM)
  • 在V2框中输入25,然后选择正确的单位(mL)
  • 单击“计算”按钮
  • 答案62.5μL(0.1 ml)出现在V1框中
g/mol

分子量计算器可计算化合物的分子量 (摩尔质量)和元素组成,具体如下:

注:化学分子式大小写敏感:C12H18N3O4  c12h18n3o4
计算化合物摩尔质量(分子量)的说明:
  • 要计算化合物的分子量 (摩尔质量),请输入化学/分子式,然后单击“计算”按钮。
分子质量、分子量、摩尔质量和摩尔量的定义:
  • 分子质量(或分子量)是一种物质的一个分子的质量,用统一的原子质量单位(u)表示。(1u等于碳-12中一个原子质量的1/12)
  • 摩尔质量(摩尔重量)是一摩尔物质的质量,以g/mol表示。
/

配液计算器可计算将特定质量的产品配成特定浓度所需的溶剂体积 (配液体积)

  • 输入试剂的质量、所需的配液浓度以及正确的单位
  • 单击“计算”按钮
  • 答案显示在体积框中
动物体内实验配方计算器(澄清溶液)
第一步:请输入基本实验信息(考虑到实验过程中的损耗,建议多配一只动物的药量)
第二步:请输入动物体内配方组成(配方适用于不溶/难溶于水的化合物),不同的产品和批次配方组成不同,如对配方有疑问,可先联系我们提供正确的体内实验配方。此外,请注意这只是一个配方计算器,而不是特定产品的确切配方。
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计算结果:

工作液浓度 mg/mL;

DMSO母液配制方法 mg 药物溶于 μL DMSO溶液(母液浓度 mg/mL)。如该浓度超过该批次药物DMSO溶解度,请首先与我们联系。

体内配方配制方法μL DMSO母液,加入 μL PEG300,混匀澄清后加入μL Tween 80,混匀澄清后加入 μL ddH2O,混匀澄清。

(1) 请确保溶液澄清之后,再加入下一种溶剂 (助溶剂) 。可利用涡旋、超声或水浴加热等方法助溶;
            (2) 一定要按顺序加入溶剂 (助溶剂) 。

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